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        市售鹿鞭的DNA指紋鑒定研究

        2014-03-31 13:58:11劉洋張麗華
        中國(guó)醫(yī)藥科學(xué) 2014年2期

        劉洋 張麗華

        [摘要] 目的 探討鹿鞭及牛鞭線粒體細(xì)胞色素b基因(Cytb)部分序列片段特征,建立中藥材鹿鞭敏感、特異的DNA分子標(biāo)記學(xué)鑒定方法。方法 對(duì)市售鹿鞭進(jìn)行樣本處理,模板制備,采用鹿鞭特異性引物進(jìn)行PCR反應(yīng),對(duì)市售鹿鞭樣本采取DNA指紋鑒定。結(jié)果 對(duì)市售鹿鞭中藥材進(jìn)行mtDNA鑒定,有三個(gè)樣本為正品。結(jié)論 此方法對(duì)市售鹿鞭鑒定,可準(zhǔn)確辨別正品與偽品。重現(xiàn)性、穩(wěn)定性好,簡(jiǎn)便準(zhǔn)確而可行,說(shuō)明鹿鞭mtDNA具有特異性指紋特征,所得鹿鞭D(zhuǎn)NA指紋特征圖譜可用于市售鹿鞭的鑒定。

        [關(guān)鍵詞] 市售鹿鞭;線粒體DNA;DNA指紋鑒定

        [中圖分類號(hào)] R282.5 [文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼] B [文章編號(hào)] 2095-0616(2014)02-50-03

        20世紀(jì)80年代,由于分子分類學(xué)的出現(xiàn),使人們從研究生物形態(tài)表征進(jìn)入到生物的DNA遺傳物質(zhì)。人們可以根據(jù)DNA系列的差異來(lái)鑒定生物物種,是因?yàn)橥N生物體有相同的DNA系列,不同種生物有不同DNA系列。除了礦物類藥材外大多數(shù)藥材是從動(dòng)植物中得到,動(dòng)植物藥材一般從死亡的干燥生物或者其組織器官中來(lái)。隨著生物體的逐漸死亡,DNA會(huì)被核酸酶大量降解,使藥材中DNA的分析有一定難度。近些年,分子生物學(xué)發(fā)展速度很快,尤其是微量DNA提取技術(shù)與PCR擴(kuò)增技術(shù),使從藥材中提取分析微量的DNA成為可能,也為藥材進(jìn)行DNA技術(shù)鑒定提供了可能。DNA分析技術(shù)使中藥材和與其容易混淆品種之間如何更好地鑒定找到了一個(gè)好辦法。mtDNA是遺傳信息的載體,它被認(rèn)為是動(dòng)物起源進(jìn)化的研究和分析群體遺傳的最佳對(duì)象,Cytb進(jìn)化速度適中,是分析種內(nèi)、種間遺傳多樣性和進(jìn)化關(guān)系的適當(dāng)?shù)腄NA片段,可以應(yīng)用于生物的分類、系統(tǒng)發(fā)育和遺傳多樣性的研究 。本研究旨在探索將DNA指紋鑒定技術(shù)應(yīng)用于市售鹿鞭鑒定中,以此提高其鑒定準(zhǔn)確性[1]。

        1 材料與儀器

        1.1 一般材料

        1.1.1 樣本 市售的鹿鞭由吉林市參茸市場(chǎng)隨機(jī)購(gòu)買,共2批,抽取6個(gè)樣本,編號(hào)為:1、2、3、4、5、6。干品牛鞭樣本,編號(hào)為7。鹿鞭及其偽充藥材均經(jīng)吉林市食品藥品檢驗(yàn)所鑒定。

        1.1.2 酶及DNA分子量標(biāo)準(zhǔn) Taq酶:購(gòu)自北京鼎國(guó)公司,λDNA/HindⅢ:購(gòu)自TIANGEN公司,DNA MarkerⅠ:購(gòu)自TIANGEN公司。

        1.1.3 主要化學(xué)試劑 瓊脂糖:購(gòu)England,dNTP及PCR緩沖液:購(gòu)自北京置鼎國(guó)公司,其他常用化學(xué)試劑:國(guó)產(chǎn)或進(jìn)口分析純。

        1.2 主要儀器設(shè)備

        TGL-16G臺(tái)式高速離心機(jī):上海醫(yī)用分析儀器廠,H-2050R型臺(tái)式低溫高速離心機(jī):美國(guó)Becman公司。

        2 方法

        2.1 樣本的前處理

        將市售鹿鞭中藥材6個(gè)樣本及干品牛鞭的龜頭及陰莖部分,用粉碎機(jī)粉碎處理,將粉碎后的干燥纖維置于4℃保存,備用。

        2.2 模板的制備

        取粉碎后的市售鹿鞭6個(gè)樣本及干品牛鞭1個(gè)樣本各1.0g,徹底清洗后紫外照射30min,分別轉(zhuǎn)入25mL離心管中,加入10倍左右的0.5mol/L EDTA(pH 8.0),56℃保溫72h。4000rpm 4℃離心15min,倒掉上清液。加入裂解液5mL,56℃水浴中保溫過(guò)夜,至組織完全消化溶解。消化液用等體積飽和酚抽提1次,等體積酚-氯仿抽提2次,氯仿-異戊醇(24∶1)抽提1次。加入2倍體積的-20℃的無(wú)水乙醇,混勻放于冰箱中過(guò)夜。15000rpm 4℃離心30min,真空干燥,溶解于TE緩沖液。

        2.3 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)

        以提取的市售鹿鞭和干品牛鞭mtDNA為模板,滅菌雙蒸水作為陰性對(duì)照進(jìn)行PCR。反應(yīng)體系30μL,在0.5mL PCR反應(yīng)管中依次加入10×PCR buffer 5μL,1.25mmol/L dNTP 4μL,10pmol/L引物1和引物2各2.0μL,Taq DNA聚合酶(1U)1μL,模板2μL,雙蒸水補(bǔ)至30μL(總反應(yīng)體系為30?L)。反應(yīng)程序:94℃預(yù)變性5min,94℃變性30s,58℃退火30s,72℃延伸30s,28個(gè)循環(huán)后于72℃延伸5min[2]。

        2.4 電泳鑒定

        將PCR產(chǎn)物各取6?L,加2?L 6×loading Buffer,混勻后點(diǎn)樣于2%瓊脂糖凝膠中,DNA MarkerⅠ為參照,60V,30min,成像并拍照。

        3 結(jié)果

        4 討論

        線粒體DNA基因組的優(yōu)點(diǎn)很多,比如分子結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單、嚴(yán)格的母系遺傳、無(wú)重組、與核DNA基因組無(wú)共同序列、多拷貝、進(jìn)化速率快、分子鐘理論等,和核DNA相比更容易檢測(cè),親緣關(guān)系相關(guān)或相近的物種都能得到區(qū)分和鑒定。采用mtDNA作為分子標(biāo)記的研究工作已被廣泛地展開(kāi),而且比同等長(zhǎng)度的核DNA基因研究更為深入?,F(xiàn)在常用的分子標(biāo)記物有Cytb基因、16SrRNA基因、12S rRNA基因、Co基因、D-loop 控制區(qū)、NP基因等,其間Cytb基因由于其獨(dú)具的優(yōu)勢(shì)而廣泛研究應(yīng)用。Cytb起源很古老,發(fā)現(xiàn)于許多原核生物的細(xì)胞和幾乎所有的真核生物中。它不僅在屬間、種間存在多樣性,而且在品種內(nèi)、品種間個(gè)體間都存在多樣性。所以對(duì)闡明生物間的親緣關(guān)系和物種鑒定方面都具有極其重要的意義[3]。Cytb基因和其余線粒體基因比較,進(jìn)化速度適中,容易被一些通用引物擴(kuò)增和測(cè)序,從結(jié)構(gòu)和功能方面看也是當(dāng)前研究最為清楚的基因之一,常用作科以上分類單位和種間的進(jìn)化研究。Cytb基因是線粒體功能區(qū),在物種進(jìn)化研究中,線粒體功能區(qū)的序列測(cè)定作為重要依據(jù)得到廣泛應(yīng)用。在進(jìn)化過(guò)程中,基因序列變異率相對(duì)較高,種間差異較大,是當(dāng)今脊椎動(dòng)物中被測(cè)序得最廣泛的基因。Cytb基因是研究種間進(jìn)化關(guān)系最好的基因,越來(lái)越廣泛地應(yīng)用,有可能成為分類學(xué)的標(biāo)準(zhǔn)片段,在物種鑒定中可將Cytb基因檢測(cè)作為一種重要的手段。

        在實(shí)驗(yàn)操作中,我們應(yīng)從反應(yīng)的模板DNA濃度、反應(yīng)體系中dNTP濃度、Mg2+濃度、Taq酶用量以及引物的選擇這幾方面進(jìn)行反復(fù)摸索,找到反應(yīng)的最佳條件,使反應(yīng)后的擴(kuò)增產(chǎn)物具有高度重復(fù)性。在進(jìn)行鑒定前,應(yīng)將藥材進(jìn)行徹底清洗后紫外照射30min,避免結(jié)果失真。

        鑒定市售鹿鞭所用的特異性引物,是選擇了正品鹿鞭和牛鞭有顯著差異的一段Cyb基因序列,而正品鹿鞭和牛鞭的基因序列均來(lái)自GenBank中正品鹿鞭和牛鞭的基因序列,此引物在新鮮品鹿鞭與牛鞭鑒定中曾使用,新鮮品鹿鞭擴(kuò)增出306bp基因片段,而牛鞭未擴(kuò)增出相同的基因片段[4-6]。本實(shí)驗(yàn)采用此鹿鞭特異性引物對(duì)市售鹿鞭進(jìn)行的DNA指紋鑒定,與新鮮品鹿鞭和牛鞭鑒定結(jié)果一致,和吉林省吉林市食品藥品檢驗(yàn)所的鑒定結(jié)果相符。該結(jié)果表明:本課題組設(shè)計(jì)的特異性鑒別引物,可以用于市售鹿鞭與偽品的鑒別。從研究的結(jié)果來(lái)看,將分子生物學(xué)技術(shù)引入到動(dòng)物類藥材的鑒定中是可行的,說(shuō)明用以上技術(shù)鑒定動(dòng)物類藥材的有效性和可靠性[7-8]。

        [參考文獻(xiàn)]

        [1] 張麗華,李明成,王冰梅,等.貂心線粒體mtDNA鑒定及特征分析[J].中國(guó)藥學(xué)雜志,2008,43(22):1694-1696.

        [2] 劉洋,張麗華,薄艷,等.鹿鞭線粒體DNA指紋鑒定[J].中國(guó)醫(yī)藥科學(xué),2011,19(2):30-31.

        [3] 李慧珍,李水福.鹿鞭的真?zhèn)蝺?yōu)劣鑒定[J].中國(guó)藥業(yè),2008,17(10):66-69.

        [4] 張麗華,李明成,王冰梅.貂組織線粒體DNA及細(xì)胞色素b鑒定及特征[J].吉林大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版),2008,34(5):790-793.

        [5] Zhang Li-hua,Yang Ming-yan,Wang Bing-mei,et al.Application of molecular biology Techniques on the Identification of Martes zibellina L.Hearts and its Counterfeits[C].CNPTM,2009:448-451.

        [6] 劉洋,楊明妍,張麗華,等.梅花鹿鞭與偽品牛鞭細(xì)胞色素bDNA指紋鑒定[J].時(shí)珍國(guó)醫(yī)國(guó)藥,2010,184(21):3274-3275.

        [7] Crimi M ,Rigolio R.The mitochondrial genome ,a growing interest inside an organelle[J].Int J Nanomedicine,2008,3(1):51-57.

        [8] 劉洋,張麗華,薄艷,等.鹿鞭線粒體DNA指紋鑒定[J].中國(guó)醫(yī)藥科學(xué),2011,19(1):112-113.

        (收稿日期:2013-10-12)

        在實(shí)驗(yàn)操作中,我們應(yīng)從反應(yīng)的模板DNA濃度、反應(yīng)體系中dNTP濃度、Mg2+濃度、Taq酶用量以及引物的選擇這幾方面進(jìn)行反復(fù)摸索,找到反應(yīng)的最佳條件,使反應(yīng)后的擴(kuò)增產(chǎn)物具有高度重復(fù)性。在進(jìn)行鑒定前,應(yīng)將藥材進(jìn)行徹底清洗后紫外照射30min,避免結(jié)果失真。

        鑒定市售鹿鞭所用的特異性引物,是選擇了正品鹿鞭和牛鞭有顯著差異的一段Cyb基因序列,而正品鹿鞭和牛鞭的基因序列均來(lái)自GenBank中正品鹿鞭和牛鞭的基因序列,此引物在新鮮品鹿鞭與牛鞭鑒定中曾使用,新鮮品鹿鞭擴(kuò)增出306bp基因片段,而牛鞭未擴(kuò)增出相同的基因片段[4-6]。本實(shí)驗(yàn)采用此鹿鞭特異性引物對(duì)市售鹿鞭進(jìn)行的DNA指紋鑒定,與新鮮品鹿鞭和牛鞭鑒定結(jié)果一致,和吉林省吉林市食品藥品檢驗(yàn)所的鑒定結(jié)果相符。該結(jié)果表明:本課題組設(shè)計(jì)的特異性鑒別引物,可以用于市售鹿鞭與偽品的鑒別。從研究的結(jié)果來(lái)看,將分子生物學(xué)技術(shù)引入到動(dòng)物類藥材的鑒定中是可行的,說(shuō)明用以上技術(shù)鑒定動(dòng)物類藥材的有效性和可靠性[7-8]。

        [參考文獻(xiàn)]

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        [2] 劉洋,張麗華,薄艷,等.鹿鞭線粒體DNA指紋鑒定[J].中國(guó)醫(yī)藥科學(xué),2011,19(2):30-31.

        [3] 李慧珍,李水福.鹿鞭的真?zhèn)蝺?yōu)劣鑒定[J].中國(guó)藥業(yè),2008,17(10):66-69.

        [4] 張麗華,李明成,王冰梅.貂組織線粒體DNA及細(xì)胞色素b鑒定及特征[J].吉林大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版),2008,34(5):790-793.

        [5] Zhang Li-hua,Yang Ming-yan,Wang Bing-mei,et al.Application of molecular biology Techniques on the Identification of Martes zibellina L.Hearts and its Counterfeits[C].CNPTM,2009:448-451.

        [6] 劉洋,楊明妍,張麗華,等.梅花鹿鞭與偽品牛鞭細(xì)胞色素bDNA指紋鑒定[J].時(shí)珍國(guó)醫(yī)國(guó)藥,2010,184(21):3274-3275.

        [7] Crimi M ,Rigolio R.The mitochondrial genome ,a growing interest inside an organelle[J].Int J Nanomedicine,2008,3(1):51-57.

        [8] 劉洋,張麗華,薄艷,等.鹿鞭線粒體DNA指紋鑒定[J].中國(guó)醫(yī)藥科學(xué),2011,19(1):112-113.

        (收稿日期:2013-10-12)

        在實(shí)驗(yàn)操作中,我們應(yīng)從反應(yīng)的模板DNA濃度、反應(yīng)體系中dNTP濃度、Mg2+濃度、Taq酶用量以及引物的選擇這幾方面進(jìn)行反復(fù)摸索,找到反應(yīng)的最佳條件,使反應(yīng)后的擴(kuò)增產(chǎn)物具有高度重復(fù)性。在進(jìn)行鑒定前,應(yīng)將藥材進(jìn)行徹底清洗后紫外照射30min,避免結(jié)果失真。

        鑒定市售鹿鞭所用的特異性引物,是選擇了正品鹿鞭和牛鞭有顯著差異的一段Cyb基因序列,而正品鹿鞭和牛鞭的基因序列均來(lái)自GenBank中正品鹿鞭和牛鞭的基因序列,此引物在新鮮品鹿鞭與牛鞭鑒定中曾使用,新鮮品鹿鞭擴(kuò)增出306bp基因片段,而牛鞭未擴(kuò)增出相同的基因片段[4-6]。本實(shí)驗(yàn)采用此鹿鞭特異性引物對(duì)市售鹿鞭進(jìn)行的DNA指紋鑒定,與新鮮品鹿鞭和牛鞭鑒定結(jié)果一致,和吉林省吉林市食品藥品檢驗(yàn)所的鑒定結(jié)果相符。該結(jié)果表明:本課題組設(shè)計(jì)的特異性鑒別引物,可以用于市售鹿鞭與偽品的鑒別。從研究的結(jié)果來(lái)看,將分子生物學(xué)技術(shù)引入到動(dòng)物類藥材的鑒定中是可行的,說(shuō)明用以上技術(shù)鑒定動(dòng)物類藥材的有效性和可靠性[7-8]。

        [參考文獻(xiàn)]

        [1] 張麗華,李明成,王冰梅,等.貂心線粒體mtDNA鑒定及特征分析[J].中國(guó)藥學(xué)雜志,2008,43(22):1694-1696.

        [2] 劉洋,張麗華,薄艷,等.鹿鞭線粒體DNA指紋鑒定[J].中國(guó)醫(yī)藥科學(xué),2011,19(2):30-31.

        [3] 李慧珍,李水福.鹿鞭的真?zhèn)蝺?yōu)劣鑒定[J].中國(guó)藥業(yè),2008,17(10):66-69.

        [4] 張麗華,李明成,王冰梅.貂組織線粒體DNA及細(xì)胞色素b鑒定及特征[J].吉林大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版),2008,34(5):790-793.

        [5] Zhang Li-hua,Yang Ming-yan,Wang Bing-mei,et al.Application of molecular biology Techniques on the Identification of Martes zibellina L.Hearts and its Counterfeits[C].CNPTM,2009:448-451.

        [6] 劉洋,楊明妍,張麗華,等.梅花鹿鞭與偽品牛鞭細(xì)胞色素bDNA指紋鑒定[J].時(shí)珍國(guó)醫(yī)國(guó)藥,2010,184(21):3274-3275.

        [7] Crimi M ,Rigolio R.The mitochondrial genome ,a growing interest inside an organelle[J].Int J Nanomedicine,2008,3(1):51-57.

        [8] 劉洋,張麗華,薄艷,等.鹿鞭線粒體DNA指紋鑒定[J].中國(guó)醫(yī)藥科學(xué),2011,19(1):112-113.

        (收稿日期:2013-10-12)

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