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        菜籽品種可見近紅外光譜鑒別研究

        2013-05-02 14:47:00董小玲
        食品與機(jī)械 2013年2期
        關(guān)鍵詞:菜籽貢獻(xiàn)率線性

        董小玲

        DONG Xiao-ling

        (華東交通大學(xué)外國語學(xué)院,江西 南昌 330013)

        (School of Foreign Languages,East China Jiaotong University,Nanchang,Jiangxi330013,China)

        菜籽品種是決定蔬菜品質(zhì)、制約蔬菜產(chǎn)量的主要因素之一[1]。一些不法商販往往混淆品種,以次充好,謀取暴利,嚴(yán)重影響了市場秩序及菜農(nóng)權(quán)益。形態(tài)學(xué)方法、農(nóng)藝性狀法、蛋白質(zhì)電泳技術(shù)檢驗(yàn)法、DNA分子標(biāo)記技術(shù)檢驗(yàn)法等傳統(tǒng)菜籽品種評(píng)價(jià)方法,耗時(shí)、費(fèi)力、準(zhǔn)確性差。隨著消費(fèi)者對(duì)蔬菜數(shù)量及品質(zhì)要求的不斷提高,迫切要求采用快速檢測手段,現(xiàn)場識(shí)別菜籽的品種及優(yōu)劣,維護(hù)市場秩序、保障菜農(nóng)權(quán)益。

        經(jīng)過物料漫射的可見近紅外光譜中含有豐富的含氫基團(tuán)信息,可表征物料的物理及化學(xué)信息,具有快速、綠色、無損等優(yōu)點(diǎn),利用農(nóng)產(chǎn)品種子的可見近紅外光譜信息,可進(jìn)行種子品種鑒別。國內(nèi)科技人員建立了枇杷[2]、奶茶[3]、茶葉[4]、小麥[5]、葡萄[6]、草莓[7]、玉米[8-10]、大米[11]、人參[12]、稻米[13]、鮮棗[14]、大豆[15]等農(nóng)作物種子品種識(shí)別研究,并建立了相應(yīng)的數(shù)學(xué)模型。在建模過程中,可見近紅外光譜包含上千個(gè)波長點(diǎn)甚至更多的信息,若將全部光譜作為分類算法的輸入變量,會(huì)影響算法的收斂速度和收斂性。通常做法是將光譜數(shù)據(jù)壓縮成幾個(gè)主成分,作為輸入變量訓(xùn)練數(shù)學(xué)模型,預(yù)測未知樣品。筆者在前期白菜籽品種識(shí)別試驗(yàn)[16]中,采用了若干主成分(PCA)表征原光譜信息的方法。該方法雖可表征絕大多數(shù)光譜信息,但因線性變換過程少量信息會(huì)自然損失,原光譜信息并未充分利用。所以,采用部分主成分表征原光譜信息的方法,在一定程度上影響了品種識(shí)別的精度[17]。線性判別分析(LDA)是以樣本的可分性為目標(biāo),尋找一組線性變換,使樣本類內(nèi)離散度最小而類間離散度最大的分類方法[18]。LDA方法高效、便捷,可較為有效地解決光譜分類問題[19,20]。但LDA光譜數(shù)據(jù)分類應(yīng)用報(bào)道較少,主要是LDA面對(duì)高維小樣數(shù)據(jù)時(shí),易產(chǎn)生過擬合現(xiàn)象,面對(duì)不同試驗(yàn)數(shù)據(jù),需優(yōu)選適宜的特征變量,更易發(fā)揮LDA算法特長。

        為了提高菜籽品種可見近紅外光譜識(shí)別率,提出了一種基于主成分載荷向量和LDA的菜籽品種識(shí)別方法。根據(jù)主成分載荷向量峰谷變化趨勢,篩選特征光譜變量,作為LDA的輸入向量,進(jìn)行6種菜籽品種的判別分析,并與PCA-LAD的分類判別結(jié)果對(duì)比,驗(yàn)證方法的可靠性。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)儀器

        光譜儀:Handheld Field SpecPro,美國Analytical Spectral Devices公司。

        性能參數(shù):光譜范圍325~1 075 nm,采樣間隔1.5 nm,探頭視場角20°,光源鹵鎢燈14.5 V。試驗(yàn)中采用漫反射方式,使用儀器自帶ASD ViewSpec Pro軟件采集光譜。

        1.2 試驗(yàn)材料

        菜籽:鑫豐70白菜籽,青麻葉白菜籽,山東五號(hào)白菜籽,四季抗熱芥菜籽,特選大坪埔芥菜籽,芥菜筍籽,港種四九菜心籽,十月紅菜心籽,九月鮮菜心籽,廣東四九菜心籽,白皮苦瓜籽,長綠苦瓜籽,春華苦瓜籽,金禾萵筍籽,花紅柳綠萵筍籽,金發(fā)萵筍籽,漢城白玉蘿卜籽,廣東短葉蘿卜籽,浙大長蘿卜籽,馬耳蘿卜籽,南昌某種子公司;試驗(yàn)樣品的具體品種及數(shù)量見表1。

        采用直徑60 mm的培養(yǎng)皿裝樣,盛滿壓實(shí)后供試驗(yàn)使用。每個(gè)品種的菜籽樣品攪拌均勻后等分若干份。采集光譜前,將每份樣品置于約30℃的室溫環(huán)境中約24 h,達(dá)到室溫后采集可見近紅外光譜。

        表1 不同品種菜籽樣品統(tǒng)計(jì)結(jié)果Table1 Statistical result of the different varieties of vegetable seeds

        1.3 光譜采集

        采用漫反射方式,采集菜籽樣品的可見近紅外光譜。采集樣品光譜前,先采集聚四氟乙烯標(biāo)準(zhǔn)白板光譜,作為參比光譜,采集參比及樣品的積分時(shí)間均為272ms。每份菜籽樣品采集10條可見近紅外光譜取平均,并利用ASD ViewSpec Pro軟件轉(zhuǎn)化成反射率光譜,供后續(xù)數(shù)據(jù)分析使用。試驗(yàn)中共采集660份樣品光譜,即660條光譜。

        1.4 數(shù)據(jù)處理

        菜籽的可見近紅外光譜數(shù)據(jù)處理采用unscrambler X10.1和Matlab 2010a軟件。數(shù)據(jù)讀取、轉(zhuǎn)換均在Matlab 2010a中完成。PCA和LDA均在unscrambler X10.1中完成,采用誤判率評(píng)價(jià)品種鑒別結(jié)果的準(zhǔn)確性。

        2 結(jié)果與討論

        2.1 菜籽光譜響應(yīng)特性

        不同品種菜籽的可見近紅外光譜響應(yīng)特性見圖1。試驗(yàn)中采集到的菜籽原始光譜范圍是325~1 075 nm,因?yàn)?25~450 nm和1 000~1 075 nm處于檢測器的兩端,信噪比較低,在數(shù)據(jù)分析中予以剔除,故數(shù)據(jù)分析中選用450~1 000 nm波段的光譜數(shù)據(jù)。由圖1可知,不同品種菜籽形態(tài)各異,在光譜上體現(xiàn)為不同品種菜籽在相同波長點(diǎn)處的反射率不同,苦瓜籽粒最大,反射率也最大,菜心籽粒最小,反射率也最小。不同菜籽色澤各異,也會(huì)導(dǎo)致光譜趨勢變化,700 nm處是拐點(diǎn),700 nm后不同品種的可見近紅外反射率光譜差異變大,其中苦瓜籽和萵筍籽與其余菜籽的光譜變化趨勢略有不同,后續(xù)分析中,苦瓜籽和萵筍籽也未被誤分入其它種類中。

        圖1 不同品種菜籽的可見近紅外反射率光譜曲線Figure 1 Visible near-infrared reflectance spectral curves of the different varieties for vegetable seeds

        2.2 菜籽光譜主成分分析

        可見近紅外光譜通常包含上千個(gè)波長點(diǎn)以上的數(shù)據(jù),若將所有數(shù)據(jù)都作為輸入訓(xùn)練熟悉模型,勢必導(dǎo)致計(jì)算速度和收斂性變差。通常采用將原光譜數(shù)據(jù)壓縮成若干個(gè)主成分,表征原光譜數(shù)據(jù)信息。試驗(yàn)中采用PCA方法將菜籽的可見近紅外光譜壓縮成20個(gè)主成分因子,得到20個(gè)主成分累積貢獻(xiàn)率曲線,因第8主成分后累計(jì)貢獻(xiàn)率曲線基本不變,故繪制了前7個(gè)主成分貢獻(xiàn)率曲線見圖2。由圖2可知,增加主成分因子數(shù),主成分累積貢獻(xiàn)率也隨之增加,當(dāng)增加到第4主成分時(shí),累積貢獻(xiàn)率基本保持不變,在圖上呈現(xiàn)為一條水平直線。前4個(gè)主成分累積貢獻(xiàn)率為99.99%,較為全面地包含了原始光譜信息,剩余16個(gè)主成分累積貢獻(xiàn)率為0.01%,所包含原始光譜信息極少。試驗(yàn)中分別采用前4、7和21個(gè)主成分因子作為LDA的輸入變量。

        不同品種菜籽可見近紅外光譜的第1和第2主成分得分圖見圖3,其中第1和第2主成分貢獻(xiàn)率分別為94.97%和4.22%。由圖3可知,6個(gè)品種菜籽在主成分得分圖上大致分成三類,其中苦瓜籽(KG)、萵筍籽(WS)和其他菜籽分成三類,除KG和WS外,其余菜籽混在一起,從圖3中難以分辨出來。

        圖2 不同品種菜籽可見近紅外光譜主成分累計(jì)貢獻(xiàn)率曲線Figure 2 Cumulative contribution rate curve of principal component for different varieties of vegetable seeds

        圖3 不同品種菜籽可見近紅外光譜第一和第二主成分得分圖Figure 3 Score plots of first and second principal components for different varieties of vegetable seeds

        2.3 菜籽可見近紅外光譜變量選擇

        菜籽可見近紅外光譜的前7個(gè)主成分因子載荷曲線見圖4,其中載荷曲線的波峰和波谷處,表示不同品種引起的光譜載荷變化較大處。由圖4可知,第1主因子(PC1)主要反映不同菜籽反射率大小引起的載荷曲線變化,其中673 nm為峰值,被選為特征光譜變量。第2、3、4、5、6和7載荷曲線主要反映了不同品種菜籽在 507,518,545,569,586,611,668,673,721,734,748,754,804,851,881,918,966 nm 處的差異較為明顯。507,518,545,569,586 nm 可能是由于菜籽表皮的黃綠色變化引起的,611,668,673 nm可能是由于菜籽表皮的紅色變化引起的,734和748 nm可能與菜籽中某些成分的C—H鍵4倍頻振動(dòng)有關(guān),918和966 nm可能由菜籽中某些成分的C—H鍵3倍頻和O—H伸縮振動(dòng)引起。507,518,545,569,586,611,668,673,721,734,748,754,804,851,881,918,966 nm共17個(gè)光譜變量與菜籽的外觀或內(nèi)部特征相關(guān)聯(lián),也作為線性判別分析的輸入變量。

        圖4 不同品種菜籽的主成分載荷向量曲線Figure 4 Cures of principal components for different varieties of vegetable seeds

        2.4 菜籽品種線性判別分類

        圖5 不同主成分和變量輸入的菜籽品種線性判別分析結(jié)果(PCs:主成分)Figure 5 Results of linear discriminantanalysiswith the input vectors of principal components(PCs)and variables

        LDA是基于Fisher判別準(zhǔn)則的判別方法,通過最大化類間距離和最小化類內(nèi)距離的方法,提高了類別間的區(qū)分能力。然而,LDA難以適應(yīng)高維數(shù)據(jù),且要求輸入變量是非奇異的。試驗(yàn)中的光譜范圍450~1 000 nm,共551個(gè)光譜變量,難以直接作為LDA的輸入變量。試驗(yàn)采用PCA將光譜數(shù)據(jù)壓縮成20個(gè)主成分因子,且主成分因子間線性無關(guān)。但主成分分析過程中,保留了大量的光譜共性信息,損失了部分的樣本類別差異信息。為此,數(shù)據(jù)處理中采用主成分載荷向量峰谷變化,選擇了17個(gè)與類別信息相關(guān)的光譜變量,作為LDA的輸入變量,同時(shí)作為對(duì)比組,分別選擇20、7和4個(gè)主成分因子作為LDA的輸入變量,進(jìn)行對(duì)比,結(jié)果見圖5。由圖5可知,隨著輸入LDA的主成分?jǐn)?shù)的增加(4,7,20),誤判率逐步下降(12.27%,5.00%,2.42%),20個(gè)主成分時(shí)誤判率最小為2.42%。但從主成分貢獻(xiàn)率曲線上看,從第5個(gè)主成分開始,貢獻(xiàn)率基本沒有變化,故使用20個(gè)主成分作為LDA的輸入變量,發(fā)生了過擬合現(xiàn)象。采用17個(gè)光譜變量作為LDA輸入變量的判別結(jié)果與20個(gè)主成分時(shí)一致,誤判率都達(dá)到了2.42%,但優(yōu)于7和4個(gè)主成分作為LDA輸入變量的判別結(jié)果。由此,可采用主成分載荷曲線圖選擇光譜變量,而不是將主成分因子直接作為LDA的輸入變量,可以提高LDA判別的精度。

        表2 不同品種菜籽的線性判別分析結(jié)果Table2 Results of linear discriminant analysis for different varieties of vegetable seeds

        表2 不同品種菜籽的線性判別分析結(jié)果Table2 Results of linear discriminant analysis for different varieties of vegetable seeds

        a:主成分?jǐn)?shù)為20,b:主成分?jǐn)?shù)為7,c:主成分?jǐn)?shù)為4,d:17個(gè)變量,*表示正確判別,**表示誤判,例如90a*表示某種菜籽在主成分?jǐn)?shù)為20時(shí)的90個(gè)樣品被正確判別,9c**表示某種菜籽在主成分?jǐn)?shù)為4時(shí)9個(gè)樣品被誤判。

        品種BC CX JC KG LB WS BC 90a*/90b*/75c*/90d*KG LB WS 6c**9c**CX 1b**/2c**76a*/72b*/67c*/76d*14a**/17b**/21c**/14d**JC 1b**/10c**2a**/14b**/30c**/2d**118a*/105b*/80c*/118d*000 90a*/90b*/87c*/90d*0 0 0 0 0 00000 150a*/150b*/150c*/150d*000 000 000 3c**120a*/120b*/120c*/120d*0

        不同品種菜籽的LDA判別結(jié)果見表2,其中上標(biāo)標(biāo)注a、b、c和d的結(jié)果,分別為20、7、4個(gè)主成分和17個(gè)光譜變量作為LDA輸入的判別結(jié)果,*表示樣品被正確判別個(gè)數(shù),**表示樣品被誤判個(gè)數(shù)。采用17個(gè)光譜變量作為LDA輸入變量的判別結(jié)果最優(yōu),其中白菜籽(BC)、苦瓜籽(KG)、蘿卜籽(LB)和萵筍籽(WS)均未發(fā)生誤判,2份芥菜籽(JC)樣品被誤判為菜心籽(CX),14份菜心籽被誤判為芥菜籽,總的誤判率為2.42%。

        3 結(jié)論

        本試驗(yàn)采用可見近紅外光譜技術(shù)和LDA方法進(jìn)行了6種菜籽品種鑒別研究。根據(jù)主成分載荷曲線峰谷變化趨勢篩選出17個(gè)光譜變量,作為LDA的輸入變量,解決了PCA壓縮光譜矩陣損失類別信息的問題,提高了菜籽品種的判別精度,誤判率達(dá)到2.42%,試驗(yàn)結(jié)果表明可見近紅外光譜結(jié)合LDA的菜籽品種鑒別方法具有簡單、快速、準(zhǔn)確、無損等優(yōu)點(diǎn),在農(nóng)產(chǎn)品種子鑒別和質(zhì)量控制方面具有參考價(jià)值。

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