趙宗正,涂加鋼,張文婷,胡 勇,周紅波,金梅林
(華中農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院 農(nóng)業(yè)微生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,武漢 430070)
流感病毒屬于正粘病毒科,其全基因組由8個(gè)分節(jié)段的負(fù)鏈RNA片段組成,共編碼11種蛋白。2009年4月份爆發(fā)于墨西哥的甲型H1N1流感在短短幾個(gè)月內(nèi)迅速在全球范圍內(nèi)傳播,引起了人們的廣泛關(guān)注。甲型H1N1流感病毒是三源重配病毒,PB2、PA來(lái)自H1N1禽流感病毒,PB1來(lái)自H3N2人流感病毒,HA、NP、NS來(lái)自北美經(jīng)典H1N1豬流感病毒,而NA、M來(lái)自歐系禽源H1N1豬流感病毒[1,2]。
流感病毒的NS1是流感病毒的重要毒力因子,也是流感病毒唯一的非結(jié)構(gòu)蛋白[3]。NS1蛋白起初在宿主細(xì)胞漿合成,然后很快轉(zhuǎn)移到細(xì)胞核,并在感染早期積聚在細(xì)胞核,感染后期則積聚于核仁中,形成致密的包涵體[4],是病毒復(fù)制和傳播的重要調(diào)節(jié)蛋白。NS1蛋白是一個(gè)多功能蛋白,對(duì)宿主細(xì)胞蛋白質(zhì)合成具有抑制作用,能夠拮抗宿主干擾素的產(chǎn)生,并可以上調(diào)“凋亡閾值”來(lái)延緩宿主細(xì)胞啟動(dòng)凋亡程序[4,5]。Skehel[6]研究發(fā)現(xiàn),NS1蛋白在病毒復(fù)制的早期就大量表達(dá),僅出現(xiàn)于被流感病毒感染的細(xì)胞中,而在病毒粒子內(nèi)部不存在NS1蛋白,因此通過(guò)血清學(xué)方法可以用來(lái)區(qū)別滅活苗免疫與野毒感染的動(dòng)物。甲型流感病毒的NS1蛋白含有202~237個(gè)氨基酸,不同的毒株之間存在著長(zhǎng)度差異,一般為230個(gè)氨基酸。NS1蛋白有兩個(gè)核定位信 號(hào)(nuclear localization signal,lNSL),N末 端的35~41位是第一個(gè)核定位信號(hào)(NLS1),C末端203~237含有第二個(gè)核定位信號(hào)(NLS2),同時(shí)含有一個(gè)核仁定位信號(hào)。2009年甲型H1N1流感病毒NS1蛋白只有219個(gè)氨基酸,存在11個(gè)氨基酸的截短現(xiàn)象。為了研究這種截短現(xiàn)象是否影響其核仁定位情況,本試驗(yàn)利用表達(dá)不同長(zhǎng)度NS1(NS1-219、NS1-230、NS1-237)的3種重組流感病毒感染哺乳動(dòng)物細(xì)胞(A549),對(duì)其NS1蛋白的核仁定位情況進(jìn)行了研究,進(jìn)而探究NS1的截短是否對(duì)甲流的核仁定位有影響。
1.1 載體 細(xì)胞和病毒 PEGX-KG(以下簡(jiǎn)稱KG)載體購(gòu)自全式金生物技術(shù)有限公司;甲型H1N1流感病毒由武漢生物制品研究所提供;rPR8-甲(NS1-219)、rPR8-甲(NS1-230) 和rPR8-甲(NS1-237)為表達(dá)不同長(zhǎng)度NS1蛋白的重組流感病毒,是本實(shí)驗(yàn)室涂加鋼博士通過(guò)PCR定點(diǎn)突變的方法在甲型H1N1流感病毒的NS基因上讓終止密碼子后移,得到表達(dá)不同長(zhǎng)度NS1蛋白的基因片段,然后通過(guò)感染性克隆技術(shù)以毒株A/Puerto Rico/8/34 H1N1(PR8)為背景,替換甲型H1N1流感病毒的NS基因構(gòu)建重組病毒;大腸桿菌BL21和DH5α及A549細(xì)胞均由本實(shí)驗(yàn)室保存;日本大白兔(體重約1.5 kg)購(gòu)自湖北省疾病防治與控制中心。
1.2 主要的試劑工具酶 各種限制性內(nèi)切酶、T4 DNA連接酶、RNA-SOLV? Reagent RNA Isolation Solvent購(gòu)自O(shè)MEGA公司;UNIQ-10柱式離心式DNA凝膠回收試劑盒購(gòu)自上海生工生物工程公司;質(zhì)粒提取試劑盒購(gòu)自北京全式金公司;核酸分子量標(biāo)準(zhǔn)物(DL2000、DL15000)、One step RNA PCR kit(AMV)及高保真Taq酶primerstar購(gòu)自大連寶生物工程(TaKaRa)公司;酵母浸出粉及胰蛋白胨(Tryptone Soya Agar)購(gòu)自英國(guó)OXOID公司;DAB顯色試劑盒購(gòu)自中山金橋;綠色熒光二抗購(gòu)自博士德生物工程有限公司;瓊脂粉購(gòu)自北京原平皓生物技術(shù)公司,日本進(jìn)口分裝;所需其他各種試劑、藥品均為分析純。
1.3 NS1基因的克隆 根據(jù)NCBI公布的2009年甲型H1N1流感病毒的NS基因序列設(shè)計(jì)引物。上游引物:5'-CGAATTCATGGACTCCAACACCATG-3'(引入EcoR I酶切位點(diǎn));下游引物:5'-CCGTCGACTCATTTCTGCTCTGGAGG-3'(引入SalI酶切位點(diǎn))。首先將病毒在9日齡雞胚上增值并自尿囊液提取病毒RNA,利用通用引物U12(5'-AGCAAAAGCAGG-3')反轉(zhuǎn)錄制備cDNA,然后經(jīng)PCR擴(kuò)增NS1基因。PCR擴(kuò)增程序:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s, 72℃延伸2.5 min,運(yùn)行30個(gè)循環(huán);最后 72℃再延伸10 min,然后降溫到16 ℃。反應(yīng)結(jié)束后,PCR產(chǎn)物各取5 μL,在1.0%瓊脂糖凝膠上進(jìn)行電泳分析,剩余置4 ℃保存?zhèn)溆谩CR產(chǎn)物和載體經(jīng)EcoR I和SalI雙酶切,克隆至KG載體,構(gòu)建重組質(zhì)粒KG-NS1,并進(jìn)行酶切、測(cè)序鑒定。
1.4 表達(dá)和純化NS1蛋白 將鑒定正確的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到表達(dá)菌BL21中,并進(jìn)行酶切、測(cè)序鑒定。分別以1 mmol/L和0.1 mmol/L IPTG(16 ℃)誘導(dǎo)表達(dá)過(guò)夜,并進(jìn)行SDS-PAGE分析。將NS1重組蛋白大量表達(dá),采用GST柱親和層析純化。
1.5 NSI多克隆抗體的制備 以純化后的NS1蛋白為抗原免疫日本大白兔。采用頸部皮下多點(diǎn)注射的方法分3次免疫,每次免疫所用的抗原量分別為300、500、500 μg。初次免疫采用完全弗氏佐劑,二免和三免采用不完全弗氏佐劑,按照1:1與抗原混合,每次免疫間隔14 d。第三次免疫后14 d心臟采血,分離血清并用Western blot 檢測(cè)抗體。
1.6 表達(dá)不同長(zhǎng)度NS1蛋白的核仁定位 rPR8-Mex(NS1-219)、rPR8-Mex(NS1-230) 和 rPR8-Mex(NS1-237)三種重組流感病毒以3 MOI分別感染A549細(xì)胞,感染6 h后,用PBS洗3次;再以1%多聚甲醛室溫固定15 min,PBS洗3次;加1%BSA 37℃封閉1 h,以200倍稀釋NS1多抗37℃孵育2 h,PBS洗3次然后用熒光二抗(抗兔)37℃孵育1 h,PBS洗3次,在奧林巴斯顯微鏡下觀察。
2.1 NS1基因RT-PCR擴(kuò)增產(chǎn)物 瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果顯示,擴(kuò)增產(chǎn)物為650 bp,與目的片段大小相符,說(shuō)明已成功擴(kuò)增NS1基因,如圖1所示。
圖1 NS1基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig.1 PCR results of NS1 gene
2.2 重組質(zhì)粒酶切鑒定結(jié)果 將重組質(zhì)粒KG-NS1轉(zhuǎn)化到DH5α和BL21后搖菌提質(zhì)粒,產(chǎn)物經(jīng)EcoR I和SalI雙酶切鑒定,瓊脂糖電泳凝膠結(jié)果顯示,得到的兩個(gè)目的片段大小分別為650 bp和5000 bp,與預(yù)期相符,如圖2 所示,且測(cè)序也證明構(gòu)建成功。
圖2 重組KG-NS1載體的酶切鑒定結(jié)果Fig.2 Recombinant vector digested with EcoRⅠand SalⅠ
2.3 目的蛋白的表達(dá)與純化 將菌體37 ℃振蕩培養(yǎng)3 h后,分別加至終濃度為1 mmol/L和0.1 mmol/L IPTG,16 ℃誘導(dǎo)過(guò)夜。SDS-PAGE結(jié)果顯示在IPTG終濃度為1 mmol/L的條件下目的蛋白在上清和沉淀中都有融合表達(dá),大小為46 kDa(圖3),而在0.1 mmol/L IPTG和未誘導(dǎo)條件下均無(wú)此蛋白帶。以1 mmol/L的IPTG誘導(dǎo)大量表達(dá)目的蛋白,采用GST柱親和層析純化(圖4)。
圖3 NS1基因融合蛋白的SDS-PAGE結(jié)果分析Fig.3 SDS-PAGE analysis of the expression of NS1 fusion protein
圖4 純化以后的NS1蛋白Fig.4 Purif i ed NS1 protein
2.4 抗體的檢測(cè) 將純化后的蛋白跑SDS-PAGE并電轉(zhuǎn)至NC膜,5%脫脂奶粉4 ℃封閉過(guò)夜,將兔血清(一抗)37 ℃孵育1 h,HRP標(biāo)記的羊抗兔IgG為二抗,37 ℃孵育1 h,DAB顯色(圖5)。
圖5 NS1基因融合蛋白Western blot檢測(cè)Fig.5 Western blot analysis of the expression of NS1 fusion protein
2.5 核仁定位rPR8-甲(NS1-219)、rPR8-甲(NS1-230)和rPR8-甲(NS1-237)三種重組流感病毒在A549細(xì)胞的定位,通過(guò)間接免疫熒光結(jié)果顯示都能定位于細(xì)胞核,但不能定位于核仁(圖6)。
圖6 rPR8-甲(NS1-219)、 rPR8-甲(NS1-230)和rPR8-甲(NS1-237)流感病毒的核定位Fig.6 The localizations of Inf l uenza virus rPR8-(NS1-219),rPR8-(NS1-230)and rPR8-(NS1-237)
2009年甲型H1N1流感病毒能夠在人與人之間迅速傳播,并呈現(xiàn)暴發(fā)流行。NS1蛋白可能在其致病機(jī)制上發(fā)揮了重要作用。
流感病毒的NS1蛋白有兩個(gè)NSL,NS1在N末端的35~41位是第一個(gè)核定位信號(hào)(NLS1),C末端203~237位含有一個(gè)核定位信號(hào)(NLS2),同時(shí)也是一個(gè)核仁定位信號(hào)[7]。 核仁是細(xì)胞內(nèi)核糖體RNA加工與成熟的地方。核仁定位信號(hào)是病毒蛋白調(diào)節(jié)細(xì)胞基因表達(dá)、細(xì)胞增殖、編程性死亡的重要因素[8-10]。已經(jīng)證實(shí)流感病毒NS1蛋白的核仁定位抑制rRNA的合成[11]。Melen等[7]的研究表明流感病毒A/Udorn/72(H3N2)的NS1蛋白有237個(gè)氨基酸,能定位于核仁,缺失其C末端231~237位氨基酸后仍可以定位于核仁,但是缺失221~237位氨基酸就不能定位于核仁。2009年甲型H1N1流感病毒NS1蛋白只有219個(gè)氨基酸,存在11個(gè)氨基酸的截短現(xiàn)象。Hale等[12]對(duì)H1N1豬流感病毒NS1蛋白進(jìn)行序列分析發(fā)現(xiàn)從20世紀(jì)60年代中期分離的H1N1豬流感病毒都存在這樣的11個(gè)氨基酸的截短現(xiàn)象。那么這種自然存在的截短是不是H1N1豬流感病毒的一種進(jìn)化特征?我們猜想是否這種截短的NS1蛋白不能定位于核仁,而將其延伸到230或237個(gè)氨基酸時(shí)就能定位于核仁?因此本研究通過(guò)原核表達(dá)甲型H1N1流感病毒的NS1蛋白并制備多克隆抗體,利用本實(shí)驗(yàn)室涂加鋼博士通過(guò)感染性克隆技術(shù)構(gòu)建的表達(dá)不同長(zhǎng)度(219、230、237個(gè)氨基酸)NS1蛋白的重組流感病毒rPR8-甲(NS1-219)、rPR8-甲(NS1-230)和rPR8-甲(NS1-237)進(jìn)行核仁定位研究。結(jié)果發(fā)現(xiàn)三種重組病毒都不能定位于核仁。Melen等[7]的進(jìn)一步研究證明,只要在C末端的224和229位分別為精氨酸(R)和賴氨酸(K),就可以定位于核仁。而2009年的甲型H1N1流感病毒在224和229位分別是精氨酸(R)和谷氨酸(E),不是堿性氨基酸R和K[7]。如果甲型H1N1流感病毒在224和229位分別為精氨酸(R)和賴氨酸(K),其NS1蛋白是否可以核仁定位還有待于進(jìn)一步研究。
總之,了解2009年甲型H1N1流感病毒的NS1蛋白核仁定位情況,將有助于我們進(jìn)一步了解甲型H1N1流感病毒的復(fù)制和傳播機(jī)制以及其毒力和致病機(jī)理。
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