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        多種抑癌基因在食管鱗狀細(xì)胞癌中的甲基化狀態(tài)及其臨床意義*

        2012-05-15 07:35:04王長(zhǎng)春毛偉敏凌志強(qiáng)
        胃腸病學(xué) 2012年1期
        關(guān)鍵詞:癌基因家族史甲基化

        王長(zhǎng)春 毛偉敏 凌志強(qiáng)

        浙江省腫瘤醫(yī)院 浙江省腫瘤研究所腫瘤分子遺傳實(shí)驗(yàn)室

        浙江省胸部腫瘤(肺、食管、乳腺)診治技術(shù)研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(310022)

        腫瘤的表觀遺傳學(xué)研究已成為近年腫瘤研究的熱點(diǎn)問題。有研究發(fā)現(xiàn)多種腫瘤包括胃癌、食管癌中可見基因啟動(dòng)子區(qū)5’CpG島異常甲基化[1,2],食管癌前病變Barrett食管中抑癌基因APC基因啟動(dòng)子區(qū)亦存在高甲基化[3]。大量研究已證實(shí)抑癌基因甲基化與食管癌相關(guān),但多種抑癌基因啟動(dòng)子區(qū)5’CpG島甲基化與腫瘤家族史的研究鮮見報(bào)道。本研究通過檢測(cè)食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)患者中多種抑癌基因的甲基化狀態(tài),旨在探討其與腫瘤家族史和預(yù)后的相關(guān)性,為進(jìn)一步研究腫瘤易感家族提供依據(jù)。

        對(duì)象與方法

        一、研究對(duì)象

        選取2010年2~7月浙江省腫瘤醫(yī)院76例經(jīng)病理檢查確診的ESCC患者,均為首診病例,術(shù)前未接受過放、化療以及其他任何治療。其中男61例,女15例,年齡40~76歲,中位年齡60歲。食管上/中段病變46例,下段30例;高/中分化60例,低分化16例。有腫瘤家族史(定義為兩代以內(nèi)有直系親屬曾患有惡性腫瘤)者16例,其中食管癌5例,結(jié)腸癌2例,胰腺癌2例,肺癌2例,淋巴瘤2例,白血病、胃癌和腎癌各1例;無腫瘤家族史者60例。按照國(guó)際抗癌聯(lián)盟(UICC)和美國(guó)腫瘤聯(lián)合會(huì)(AJCC)2009第7版TNM分期標(biāo)準(zhǔn),Ⅰ期5例,Ⅱ期30例,Ⅲ期40例,Ⅳ期1例。本研究方案經(jīng)浙江省腫瘤醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)同意,患者均簽署知情同意書。

        二、方法

        1.組織DNA提取:手術(shù)切除標(biāo)本后,由專人負(fù)責(zé)取組織標(biāo)本。腫瘤組織標(biāo)本取自癌巢,癌旁正常組織取自距腫瘤邊緣5 cm處,切取后立即置于液氮-76℃保存。采用苯酚/氯仿法提取基因組DNA(杭州化學(xué)試劑有限公司),置于-20℃保存待測(cè)。

        2.DNA亞硫酸氫鹽修飾:以紫外分光光度計(jì)(型號(hào)NanoDrop ND-1000)測(cè)定DNA濃度和純度,A260nm/A280nm比值≥1.8的DNA判定為合格樣本?;蚪MDNA行亞硫酸氫鹽修飾和純化,具體步驟按EpiTect Bisulfite Kits(Qiagen)說明書操作。

        3.MSP 檢測(cè):參照 APC、RARβ2、CDH1、p16INK4a和RASSF1A基因序列,分別設(shè)計(jì)5’CpG島特異性甲基化和非甲基化引物,所有引物由Invitrogen公司合成(見表1)。PCR反應(yīng)體系20μl,反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性 10 min;95℃變性 15 s,60℃退火1 min,72℃延伸1 min,共40個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min[2]。采用2-△CT法定量分析各抑癌基因的甲基化狀態(tài)。以體外經(jīng)SssⅠ甲基轉(zhuǎn)移酶處理過的人類基因組DNA作為陽(yáng)性對(duì)照。

        三、統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

        采用SPSS 17.0統(tǒng)計(jì)軟件。計(jì)數(shù)資料的比較采用χ2檢驗(yàn);生存分析采用Kaplan-Meier分析,終點(diǎn)事件為腫瘤復(fù)發(fā)或死亡,觀察無進(jìn)展生存期(progression-free survival,PFS)。P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        結(jié) 果

        一、基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化狀態(tài)

        ESCC患者腫瘤組織APC、RARβ2、CDH1、p16INK4a、RASSF1A的甲基化率分別為44.7%、72.4%、72.4%、86.8%、55.3%,均顯著高于相應(yīng)癌旁正常組織,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.000)(見表 2)。

        表2 ESCC患者腫瘤組織和癌旁正常組織中各抑癌基因甲基化率的比較 n(%)

        二、甲基化與腫瘤家族史

        16例有腫瘤家族史的ESCC患者中,腫瘤組織 APC、RARβ2、CDH1、p16INK4a、RASSF1A的甲基化率分別為75.0% (12/16)、100% (16/16)、93.8%(15/16)、93.8%(15/16)、100%(16/16);60 例無腫瘤家族史者中,甲基化率分別為36.7%(22/60)、65.0%(39/60)、66.7%(40/60)、85.0%(51/60)和 43.3%(26/60),兩組相比差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。

        表1 各抑癌基因甲基化特異性PCR反應(yīng)引物和片段長(zhǎng)度

        三、生存分析

        66例ESCC患者有隨訪結(jié)果,其中18例復(fù)發(fā)或死亡,另有10例失訪。經(jīng)Kaplan-Meier分析,CDH1和RASSF1A非甲基化患者的平均生存期均明顯高于甲基化患者(P=0.015、P=0.016),其余 3種抑癌基因甲基化與否對(duì)預(yù)后的影響無明顯差異(見表 3、圖 1)。

        討 論

        腫瘤的病因和發(fā)病機(jī)制復(fù)雜,其中抑癌基因起重要調(diào)控作用。APC基因涉及調(diào)節(jié)細(xì)胞黏附、細(xì)胞遷移乃至細(xì)胞凋亡,其調(diào)控方式是與微管結(jié)合,調(diào)節(jié)胞液中β-catenin蛋白水平;RARβ2是一種抑癌基因,定位于染色體3p24,通過在靶細(xì)胞中轉(zhuǎn)化成視黃酸而發(fā)揮作用,其啟動(dòng)子區(qū)甲基化可引起癌癥的發(fā)生[4];p16基因主要通過調(diào)節(jié)細(xì)胞周期來參與腫瘤的發(fā)生,其調(diào)節(jié)機(jī)制可能通過Rb基因依賴途徑實(shí)現(xiàn)[5];CDH1基因參與同型細(xì)胞間黏附;RASSF1A除具有調(diào)節(jié)細(xì)胞周期的作用之外,還可促進(jìn)凋亡和調(diào)節(jié)微管穩(wěn)定性[6]。

        業(yè)已證實(shí)抑癌基因在食管癌的發(fā)生、發(fā)展中起重要作用[7],其表遺傳沉默與腫瘤侵襲、生長(zhǎng)、新生血管生成、轉(zhuǎn)移行為密切相關(guān),可能是食管癌發(fā)生、發(fā)展以及治療后復(fù)發(fā)的重要因素之一,并影響患者的總體生存率。多項(xiàng)研究證實(shí)ESCC組織中存在多種抑癌基因的高甲基化。且在癌變過程中,不同組織類型的基因甲基化狀態(tài)亦不相同[8]。Zare等[9]發(fā)現(xiàn)44.4%的ESCC患者發(fā)生APC啟動(dòng)子區(qū)高甲基化,其兩年生存率更低,而正常組織中未發(fā)生甲基化;Kim等[10]的研究結(jié)果顯示50例ESCC患者中,APC、RARβ2、p16、RASSF1A 的 甲 基 化 率 分 別 為46%、34%、10%和 14%;Kuroki等[11]的研究發(fā)現(xiàn)ESCC細(xì)胞株和 ESCC組織中均可見 RARβ2、RASSF1A高甲基化,且腫瘤組織的甲基化率高于癌旁組織;Lee等[12]發(fā)現(xiàn)251例ESCC患者中p16、RARβ2、CDH1 的甲基化率分別為 52%、25%和43%,且CDH1高甲基化可作為TNM分期Ⅰ期患者的復(fù)發(fā)指標(biāo);Taghavi等[13]發(fā)現(xiàn)ESCC患者腫瘤組織p16INK4a甲基化率顯著高于相鄰癌旁組織。本研究中,ESCC 患者腫瘤組織中 APC、RARβ2、CDH1、p16INK4a、RASSF1A的甲基化率分別為44.7%、72.4%、72.4%、86.8%、55.3%,均顯著高于相應(yīng)癌旁正常組織。由此可見,各種抑癌基因甲基化可能在ESCC的發(fā)生、發(fā)展中起重要作用。

        表3 ESCC患者各抑癌基因甲基化Kaplan-Meier分析

        圖1 CDH1和RASSF1A甲基化和非甲基化患者的生存曲線

        Abbaszadegan等[14]在ESCC患者家族成員中發(fā)現(xiàn),p16啟動(dòng)子區(qū)異常甲基化率為64.3%,而健康志愿者為0,說明p16異常甲基化可作為高危ESCC家族成員腫瘤的早期鑒別標(biāo)記。本研究發(fā)現(xiàn)ESCC患者 APC、RARβ2、CDH1、RASSF1A 基因甲基化與腫瘤家族史顯著相關(guān),而p16INK4a基因甲基化與腫瘤家族史無關(guān)。

        目前抑癌基因甲基化與ESCC患者預(yù)后關(guān)系的報(bào)道少見。本研究中,CDH1和RASSF1A甲基化患者的生存期明顯低于非甲基化患者,但因隨訪時(shí)間過短,故不能肯定其臨床意義,尚需進(jìn)一步隨訪并重新分析才能得出可信的結(jié)果。

        由此可見,對(duì)具有腫瘤家族史的健康家庭成員行多種抑癌基因甲基化檢測(cè),并密切隨訪甲基化陽(yáng)性者,可在一定程度上早期診斷和治療ESCC等疾病。但該結(jié)論尚需擴(kuò)大樣本量進(jìn)一步驗(yàn)證。

        1 張斌,曹俊,陳敏,等.死亡相關(guān)蛋白激酶基因高甲基化在胃癌形成過程中作用的初步研究.胃腸病學(xué),2008,13(12):737-740.

        2 鄭秋青,凌志強(qiáng),李沛,等.RASSF1A在食管鱗癌組織中的表達(dá)、甲基化狀態(tài)及其與預(yù)后之間的關(guān)系.世界華人消化雜志,2010,18(29):3134-3139.

        3 宋明全,常英,朱金水.質(zhì)子泵抑制劑治療對(duì)Barrett食管APC基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化的影響.胃腸病學(xué),2009,14(9):536-539.

        4 許旭,孫敬巖,顧林,等.從表觀遺傳學(xué)角度探討RAR-β2基因在乳腺癌發(fā)生中的作用.中國(guó)腫瘤臨床,2010,37(23):1326-1329,1333.

        5 孫樹漢主編.遺傳與疾病.第1版.北京:人民衛(wèi)生出版社,2009.157-179.

        6 周紹榮,徐美榮,陳云.RASSF1A基因甲基化與腫瘤關(guān)系的研究進(jìn)展.實(shí)用癌癥雜志,2008,23(5):540-542.

        7 Raja S,Godfrey TE,Luketich JD.The role of tumor suppressor genes in esophageal cancer.Minerva Chir,2002,57(6):767-780.

        8 Yang HH,Hu N,Wang C,et al.Influence of genetic background and tissue types on global DNA methylation patterns.PLoS One,2010,5(2):e9355.

        9 Zare M,Jazii FR,Alivand MR,et al.Qualitative analysis of Adenomatous Polyposis Coli promoter: hypermethylation,engagementand effectson survivalof patients with esophageal cancer in a high risk region of the world,a potential molecular marker.BMC Cancer,2009,9:24.

        10 Kim YT,Park JY,Jeon YK,et al.Aberrant promoter CpG island hypermethylation of the adenomatosis polyposis coli gene can serve as a good prognostic factor by affecting lymph node metastasis in squamous cell carcinoma of the esophagus.Dis Esophagus,2009,22(2):143-150.

        11 Kuroki T,Trapasso F,Yendamuri S,et al.Allele loss and promoter hypermethylation of VHL, RAR-beta,RASSF1A,and FHIT tumorsuppressorgeneson chromosome 3p in esophageal squamous cell carcinoma.Cancer Res,2003,63(13):3724-3728.

        12 Lee EJ,Lee BB,Han J,et al. CpG island hypermethylation of E-cadherin (CDH1)and integrin alpha4 is associated with recurrence of early stage esophageal squamous cell carcinoma.Int J Cancer,2008,123(9):2073-2079.

        13 Taghavi N,Biramijamal F,Sotoudeh M,et al.p16INK4ahypermethylation and p53,p16 and MDM2 protein expression in Esophageal Squamous Cell Carcinoma.BMC Cancer,2010,10:138.

        14 Abbaszadegan MR,Raziee HR,Ghafarzadegan K,et al.Aberrant p16 methylation,a possible epigenetic risk factor in familial esophageal squamous cell carcinoma.Int J Gastrointest Cancer,2005,36(1):47-54.

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