鄧志瑞, 孫晶晶, 張文舉, 陳 沁
(上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,上海200444)
蘇丹草(Sorghum sudanense)原產(chǎn)于非洲北部的蘇丹高原,在歐洲、北美洲及亞洲大陸的熱帶和亞熱帶均有栽培,是世界各國(guó)栽培最普遍的一年生禾本科牧草之一,被稱(chēng)為禾本科牧草中的“牧草之王”[1].由于種子質(zhì)量管理技術(shù)和相關(guān)制度的缺失,我國(guó)蘇丹草種子生產(chǎn)上的種質(zhì)非?;靵y,因此,對(duì)蘇丹草品種真實(shí)性和純度進(jìn)行鑒定十分重要[2].種子醇溶蛋白是種子胚乳中的主要貯藏蛋白質(zhì),該蛋白質(zhì)不受種植環(huán)境等的影響,是植物基因類(lèi)型的表現(xiàn)特征之一[3],其指紋研究在品種真實(shí)性和資源鑒定評(píng)價(jià)中具有重要的應(yīng)用價(jià)值[4].許多學(xué)者已經(jīng)將醇溶蛋白分析技術(shù)廣泛應(yīng)用于植物種類(lèi)鑒別、基因標(biāo)記、種子純度檢驗(yàn)、遠(yuǎn)緣雜種鑒定、體細(xì)胞無(wú)性變異鑒定等方面[5-8].醇溶蛋白電泳圖譜不僅可以表現(xiàn)植物種間的差異,也可表現(xiàn)種內(nèi)類(lèi)型的差異.建立每種植物的醇溶蛋白指紋圖譜,可以為植物資源的廣泛利用提供實(shí)驗(yàn)和理論依據(jù)[9-10].本實(shí)驗(yàn)通過(guò)研究影響醇溶蛋白提取和SDS-PAGE電泳效果的主要因素,優(yōu)化了蘇丹草種子醇溶蛋白提取和SDS-PAGE電泳條件,為蘇丹草種子分子水平的鑒定奠定了研究基礎(chǔ).
本實(shí)驗(yàn)所用的蘇丹草(Sorghum sudanense)產(chǎn)自湖南,高粱(Sorghum bicolor)產(chǎn)自河北泊頭,玉米(Zea may)產(chǎn)自美國(guó),大麥(Hordeum vulgare)產(chǎn)自加拿大.
1.2.1 不同提取劑對(duì)蘇丹草醇溶蛋白提取的影響
用液氮研磨蘇丹草種子至粉末狀,稱(chēng)取100 mg轉(zhuǎn)移到1.5 mL Eppendorf管中,分別加入600 μL 70%乙醇、70%正丙醇、70%異丁醇、70%異丙醇、70%叔丁醇和70%乙二醇,振蕩混勻后,37℃水浴提取過(guò)夜.然后,8 000 r/min離心15 min,采用考馬斯亮藍(lán)G-250方法測(cè)定上清液蛋白濃度.把蛋白質(zhì)濃度稀釋至12 μg/μL,取5 μL蛋白溶液加入等體積的2×電泳上樣緩沖液,95℃處理5 min后上樣,以12%的分離膠進(jìn)行電泳檢測(cè)[11-16].
1.2.2 樣品/提取劑比例對(duì)蘇丹草種子醇溶蛋白提取的影響
分別按種子粉末質(zhì)量與提取劑體積比(g/mL)為1∶2,1∶4,1∶6,1∶8,1∶10,1∶12,1∶15,1∶20加入提取劑提取醇溶蛋白,以12%的分離膠進(jìn)行電泳檢測(cè).
1.2.3 還原劑DTT的濃度對(duì)蘇丹草種子醇溶蛋白提取的影響
配制含不同終濃度DTT(0%,0.1%,0.2%,0.3%,0.4%,0.5%,1.0%,1.5%,3.0%)的70%正丙醇提取劑,以12%的分離膠進(jìn)行電泳檢測(cè).
1.2.4 不同上樣量、不同分離膠濃度對(duì)電泳的影響
分別使用8%,10%,12%,15%的分離膠,以上述最佳提取條件下得到的蘇丹草種子醇溶蛋白為樣品,稀釋?zhuān)沟貌煌蠘涌自谙嗤蠘芋w積(10 μL)中含有的醇溶蛋白分別為10,20,30,35,40,50,60,70 μg.
1.2.5 優(yōu)化條件對(duì)其他禾本科種子醇溶蛋白分析的可行性研究
根據(jù)上述實(shí)驗(yàn)得到的蘇丹草種子醇溶蛋白提取和電泳優(yōu)化條件,對(duì)幾種常見(jiàn)的禾本科種子醇溶蛋白進(jìn)行提取和電泳分析,檢驗(yàn)所建立的優(yōu)化條件是否適用于其他禾本科種子.
用不同提取劑提取的醇溶蛋白電泳圖譜如圖1所示,其中1為標(biāo)準(zhǔn)蛋白,2~7為分別用70%乙醇、70%正丙醇、70%異丁醇、70%異丙醇、70%叔丁醇和70%乙二醇提取的醇溶蛋白.可見(jiàn),使用不同提取劑得到的醇溶蛋白電泳圖譜存在差異,主要表現(xiàn)在譜帶豐富度和帶型不同,其中以乙醇、正丙醇和叔丁醇提取得到的電泳圖譜豐富度最好,而用乙二醇和異丁醇只能得到少量的譜帶.因此,本實(shí)驗(yàn)選擇70%正丙醇作為蘇丹草種子醇溶蛋白的提取劑.
圖1 不同提取劑對(duì)蘇丹草醇溶蛋白提取的影響Fig.1 Effects of different extracting agents on prolamin extraction from Sorghum sudanense seeds
提取劑用量不同對(duì)提取蘇丹草種子醇溶蛋白有明顯影響(見(jiàn)圖2,其中1為標(biāo)準(zhǔn)蛋白,2~9分別為樣品/提取劑比例為1∶2,1∶4,1∶6,1∶8,1∶10,1∶12, 1∶15,1∶20所提取的醇溶蛋白圖譜).由圖2可見(jiàn),條帶的強(qiáng)度隨提取劑用量的增加而減弱,其中以1∶4~1∶8提取的醇溶蛋白具有豐富的譜帶,而以1∶12和1∶15提取的蛋白譜帶清晰度明顯下降,當(dāng)以1∶20提取時(shí)幾乎看不到蛋白譜帶.
圖3為不同提取劑用量,相同蛋白含量對(duì)蘇丹草種子醇溶蛋白提取的影響,其中1為標(biāo)準(zhǔn)蛋白; 2~9分別為樣品/提取劑比例為1∶2,1∶4,1∶6,1∶8,1∶10,1∶12,1∶15,1∶20所提取的醇溶蛋白,調(diào)整使得每孔上樣等量蛋白質(zhì)(15 μg/加樣孔).可見(jiàn),取相同質(zhì)量的醇溶蛋白為上樣量,提取劑的比例越大,得到的圖譜條帶越豐富,提取效果越好.考慮到電泳圖的清晰程度,蛋白濃度測(cè)定的結(jié)果,以及實(shí)驗(yàn)的操作性,本實(shí)驗(yàn)選擇1∶8作為最佳提取劑比例.
圖2 不同提取劑用量(蛋白含量不同)對(duì)蘇丹草種子醇溶蛋白提取的影響Fig.2 Effects of different reagent dosages(different prolamin quality)on prolamin extraction from Sorghum sudanense seeds
圖3 不同提取劑用量(蛋白含量相同)對(duì)蘇丹草種子醇溶蛋白提取的影響Fig.3 Effects of different reagent dosages(same prolamin quality)on prolamin extraction from Sorghum sudanense seeds
用含有不同濃度DTT的70%正丙醇作為提取劑,提取到的醇溶蛋白電泳圖譜如圖4所示,其中1為標(biāo)準(zhǔn)蛋白,2~10分別為加入還原劑DTT濃度為0%,0.1%,0.2%,0.3%,0.4%,0.5%,1.0%,1.5%,3.0%的70%正丙醇.由圖可知,DTT可以提高醇溶蛋白的提取效率,且隨著DTT濃度的升高,提取效率也相應(yīng)地提高.但當(dāng)DTT濃度超過(guò)0.2%后,已沒(méi)有顯著劑量關(guān)系.考慮到成本的因素,本實(shí)驗(yàn)選取0.2%DTT濃度的70%正丙醇作為最佳提取劑.
圖4 DTT濃度對(duì)蘇丹草種子醇溶蛋白提取的影響Fig.4 Effects of different reduction reagent concentrations on prolamin extraction from Sorghum sudanense seeds
隨著分離膠濃度的提高,醇溶蛋白的譜帶清晰度逐漸提高,并且不同濃度的分離膠得到的電泳條帶的數(shù)目也不相同(見(jiàn)圖5,其中1為標(biāo)準(zhǔn)蛋白;2~9分別為上樣孔醇溶蛋白量為10,20,30,35,40,50,60,70 μg的蛋白圖譜).同一分離膠,在一定的濃度范圍內(nèi),隨著上樣蛋白含量的增多,電泳條帶也逐漸清晰.但當(dāng)醇溶蛋白的上樣蛋白量達(dá)到一定程度時(shí),蛋白條帶開(kāi)始堆積,譜帶的清晰度也開(kāi)始下降,以至于難以區(qū)分.由圖5可知,12%或者15%的分離膠可以產(chǎn)生較好的分辨率,但當(dāng)凝膠濃度高于15%時(shí),膠片韌性較差,容易碎裂,因此,本實(shí)驗(yàn)選取12%作為最佳分離膠濃度.在本實(shí)驗(yàn)所用電泳條件下(膠板大小為73 mm×83 mm,膠厚度為0.75 mm,共15個(gè)上樣孔),每孔最佳上樣量為40 μg.
圖5 上樣量、分離膠濃度對(duì)電泳結(jié)果的影響Fig.5 Effects of prolamin amount per well volume and separation gel concentration on SDS-PAGE
取分離膠濃度為12%,大麥、玉米、蘇丹草、高粱種子醇溶蛋白的上樣量為每孔40 μg,進(jìn)行電泳檢測(cè),結(jié)果如圖6所示,其中1為標(biāo)準(zhǔn)蛋白,2~5分別為所提取的大麥、玉米、蘇丹草、高粱的醇溶蛋白.可見(jiàn),在該實(shí)驗(yàn)條件下,幾種禾本科種子醇溶蛋白電泳圖譜的譜帶清晰,說(shuō)明本實(shí)驗(yàn)所建立的條件不僅可以用于蘇丹草醇溶蛋白的研究,也可以用于其他禾本科植物.
一般來(lái)說(shuō),醇類(lèi)的極性隨著碳鏈的增長(zhǎng)而降低,但因?yàn)橐粋€(gè)分子內(nèi)羥基上的氧可以和另外一個(gè)分子上的氫形成氫鍵,所以容易造成極性的增加.種子醇溶蛋白提取劑的選擇早期以乙醇為主,后來(lái)漸漸轉(zhuǎn)變?yōu)檎己褪宥〈迹?7].本實(shí)驗(yàn)除了選擇上述3種試劑外,還同時(shí)研究了另外3種醇類(lèi)試劑對(duì)蘇丹草種子醇溶蛋白提取的影響.結(jié)果表明,不同的醇類(lèi)試劑具有不同的提取效果,其中效果較好的是正丙醇、叔丁醇,這可能是由于組成蘇丹草種子醇溶蛋白的氨基酸殘基疏水性較強(qiáng),相對(duì)于極性稍大的乙二醇和異丙醇,極性較弱的正丙醇和叔丁醇更有利于蘇丹草種子醇溶蛋白的提取.
圖6 幾種禾本科種子醇溶蛋白電泳圖Fig.6 Electrophoresis of prolamins of several common gramineae seeds
提取劑用量是影響醇溶蛋白提取的主要因素之一[14].司學(xué)芝等[15]在研究麥醇溶蛋白和谷蛋白的提取條件時(shí),選擇固液比在1∶6~1∶30之間.結(jié)果表明,隨著提取劑的增加,提取的醇溶蛋白總量增高,但隨后出現(xiàn)下降,說(shuō)明提取劑的用量并非越多越好.本實(shí)驗(yàn)的結(jié)果也表明,隨著提取劑的加入,提取到的醇溶蛋白總量增加,但提取效率呈現(xiàn)先上升后下降的趨勢(shì).綜合考慮蛋白含量和濃度對(duì)SDS-PAGE條帶的影響,最終選擇固液比為1∶8.
研究表明,高粱屬種子醇溶蛋白中含有較高水平的半胱氨酸殘基和巰基[7,18].因此,還原劑的加入可增加醇溶蛋白的提取量,同時(shí)提高蛋白的多態(tài)性.DTT可用于蛋白質(zhì)中二硫鍵的還原,阻止蛋白質(zhì)中半胱氨酸之間形成的分子內(nèi)或分子間二硫鍵.由本實(shí)驗(yàn)結(jié)果可知,加入DTT后譜帶顏色加深,說(shuō)明蘇丹草種子醇溶蛋白的提取量變大.
傳統(tǒng)的SDS-PAGE分離蛋白的方法較成熟,凝膠韌性好,易于剝離,電泳圖譜較清晰[2,12].本實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,分離膠濃度對(duì)電泳圖譜的影響較大.隨著分離膠濃度的升高,醇溶蛋白特征譜帶的清晰度也相應(yīng)提高.12%和15%范圍的凝膠可以得到比較清晰的電泳譜帶,但在譜帶的帶型以及凝膠的后處理方面,12%的凝膠較好.根據(jù)蘇丹草醇溶蛋白分子量大小,相對(duì)于8%濃度的分離膠,10%的凝膠譜帶更加清晰可辨.10%凝膠的電泳時(shí)間雖短,但膠的牢固程度較低,易破裂;15%的凝膠的分辨效率較好,凝膠的質(zhì)量也較好,但成膠的時(shí)間較長(zhǎng),實(shí)驗(yàn)時(shí)間跨度大.比較發(fā)現(xiàn),可以根據(jù)不同的實(shí)驗(yàn)?zāi)康牟捎貌煌姆蛛x膠濃度,如為了快速鑒定可采用10%的分離膠,若要準(zhǔn)確分辨特征譜帶可采用12%的分離膠.
醇溶蛋白的上樣量也會(huì)影響電泳檢測(cè)蛋白的結(jié)果.當(dāng)?shù)鞍琢枯^小時(shí),蛋白質(zhì)各組分含量少,所結(jié)合的考馬斯亮藍(lán)少,著色淺,效果不好;相反,過(guò)高的上樣量會(huì)使蛋白質(zhì)含量過(guò)高,電泳條帶顏色變深、帶型變寬,相近的條帶會(huì)出現(xiàn)重疊,不便識(shí)別.本實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,蘇丹草醇溶蛋白的上樣量以40 μg時(shí)合適.
本實(shí)驗(yàn)中的禾本科醇溶蛋白圖譜表明,通過(guò)蘇丹草種子優(yōu)化的醇溶蛋白提取和電泳條件是可以應(yīng)用于其他幾種禾本科植物的,并可得到良好的分離效果.
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