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        DNA修復(fù)基因XRCC3-18067C>T多態(tài)性與頭頸部腫瘤易感性關(guān)系的系統(tǒng)評(píng)價(jià)

        2011-07-27 05:32:08柯為洵曹岐新
        醫(yī)學(xué)研究雜志 2011年11期
        關(guān)鍵詞:純合子易感性頭頸部

        柯為洵 李 杰 曹岐新 嵇 冰

        人類DNA修復(fù)基因X線修復(fù)交叉互補(bǔ)因子3,首先從中國倉鼠卵細(xì)胞的突變體irslSF株中分離出來得到的,該基因全長為19843 bp,編碼1個(gè)346個(gè)氨基酸殘基的蛋白質(zhì)[1]。XRCC3基因有11個(gè)外顯子,位于該基因第7外顯子18067位核苷酸C>T的突變使得第241位密碼子編碼的蘇氨酸(Thr)替換為蛋氨酸(Met),前者可能對維持蛋白的正常構(gòu)象起重要作用,因此該位點(diǎn)的突變可能對該基因的正常功能有一定的影響,有研究顯示,攜帶基因型Met/Met突變純合子的個(gè)體外周淋巴細(xì)胞的DNA加合物水平明顯升高,提示具有該基因型的個(gè)體DNA修復(fù)能力降低,該基因的多態(tài)性在腫瘤發(fā)生中可能起著重要作用[2]。

        資料與方法

        1.資料來源:檢索 CNKI、CBM、Pubmed、EMBASE 數(shù)據(jù)庫,收集公開發(fā)表的關(guān)于XRCC3-18067C>T單核苷酸多態(tài)性與頭頸部腫瘤易感性的研究,中文文獻(xiàn)檢索詞為:“X線修復(fù)交叉互補(bǔ)因子3”、“XRCC3”、“頭頸部腫瘤”;英文文獻(xiàn)檢索詞為:“XRCC3”“x-ray cross-complementing group 3”、“head and neck cancer”,分別作為主題詞、自由詞進(jìn)行檢索。

        2.文獻(xiàn)納入標(biāo)準(zhǔn):病理學(xué)確診為頭頸部腫瘤與DNA修復(fù)基因XRCC3-18067C>T單核苷酸多態(tài)性的病例對照研究或隊(duì)列研究;研究方法相似,且均符合流行病學(xué)要求;文獻(xiàn)提供基因型頻數(shù),優(yōu)勢比(odds ratio,OR)及95%CI,或4個(gè)表資料用以計(jì)算OR;對同一人群或亞群進(jìn)行的多次研究選擇質(zhì)量較高的最近發(fā)表的文獻(xiàn)作為研究對象。

        3.統(tǒng)計(jì)學(xué)方法:按照要求整理原始文獻(xiàn)并摘錄數(shù)據(jù),對各研究的基因分布進(jìn)行Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗(yàn)。首先,以野生型純合子C/C為參照,評(píng)估突變型純合子T/T個(gè)體患頭頸部腫瘤的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(T/T)vs(C/C);其次,假設(shè)突變基因型為隱性基因,采用隱性模式(recessive genetic model)對(T/T)vs(C/C+C/T)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析;第三,假設(shè)突變基因型為顯性基因,采用顯性模式(dominint genetic model)對(T/T+C/T)vs(C/C)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。應(yīng)用統(tǒng)計(jì)分析軟件 STATA11.0分析計(jì)算合并OR值及95%可信區(qū)間(95%confidence interval,95%CI),繪制OR值分布森林圖。統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性采用I2檢驗(yàn)來分析,雙側(cè)P>0.05不存在異明顯的異質(zhì)性,采用固定效應(yīng)模型,反之采用隨機(jī)效應(yīng)模型。STATA軟件的線性回歸模型(Egger法)檢驗(yàn)漏斗圖的對稱性,評(píng)估發(fā)表偏倚。

        結(jié) 果

        1.一般資料:共納入文獻(xiàn)9篇,其中病例組1872例,對照組3521例[3~11]。來自歐洲高加索人群報(bào)道6 篇[3,4,6,8,9,11],亞洲人群報(bào)道 2 篇[7,10],1 篇文獻(xiàn)[5]未對人種進(jìn)行說明。病例診斷均符合WHO診斷標(biāo)準(zhǔn),基因分型均使用公認(rèn)的、科學(xué)的檢測方法(表1)。所有納入的研究中只有1篇來自美國的研究結(jié)果顯示在顯性基因模式下突變個(gè)體患頭頸部腫瘤的易感性明顯增加,OR=2.10(95%CI:1.31 ~3.38)。其余各研究均未顯示出XRCC3-18067C>T單核苷酸多態(tài)性與頭頸部腫瘤易感性之間的關(guān)系。

        表1 納入研究的基本特征

        2.野生型純合子(C/C)為參照:以野生型純合子(C/C)基因型為參照,評(píng)估突變型純合子(T/T)基因型與頭頸部腫瘤易感性的關(guān)系。異質(zhì)性檢驗(yàn):I2=0.00% <50%,不存在明顯的統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性,采用固定效應(yīng)模型分析(圖1)。圖中可見,合并分析結(jié)果OR=1.16(95%CI:0.95 ~1.43,P=0.150),表明突變純合子基因型T/T與頭頸部腫瘤的易感性無關(guān)連。

        3.隱性模式:假設(shè)突變基因?yàn)殡[性基因,采用隱性模式(recessive genetic model)對(T/T)vs(C/C+C/T)進(jìn)行分析,評(píng)估突變型純合子(T/T)與頭頸部腫瘤易感性間的關(guān)系。異質(zhì)性檢驗(yàn)I2=0.00% <50%,不存在明顯的統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性,采用固定效應(yīng)模型分析(圖1)。圖中可見,合并分析結(jié)果OR=1.16(95%CI:0.96 ~1.40,P=0.124),表明在隱性模式下,突變基因型(T/T)與頭頸部腫瘤易感性無關(guān)連。

        4.顯性模式:假設(shè)突變基因?yàn)轱@性基因,采用顯性模式(dominint genetic model)對(T/T+C/T))vs(C/C)進(jìn)行分析,評(píng)估突變型(包括突變純合子T/T,和突變雜合子C/T)與頭頸部腫瘤易感性間的關(guān)系。異質(zhì)性檢驗(yàn)I2=45.90% <50%,不存在明顯的統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性,采用固定效應(yīng)模型(圖1)。圖中可見,合并分析結(jié)果 OR=1.05(95%CI:0.93 ~ 1.19,P=0.426),表明在顯性模式下,突變基因型(T/T+C/T)與頭頸部腫瘤的易感性無關(guān)連。

        5.發(fā)表偏倚識(shí)別:Stata軟件的線性回歸模型(Egger法),評(píng)估發(fā)表偏倚。以各研究的OR自然對數(shù)值logOR與其標(biāo)準(zhǔn)誤SelogOR的比值為應(yīng)變量,以標(biāo)準(zhǔn)誤的倒數(shù)為自變量,進(jìn)行線性回歸分析。回歸分析Y 軸的截距為 1.11,其 95%CI為(-0.41~2.27),t=1.99,P=0.058,按 α =0.05 水準(zhǔn),提示不存在明顯發(fā)表偏倚。

        討 論

        XRCC3是重要的DNA損傷修復(fù)基因,其表達(dá)產(chǎn)物是Rad-51相關(guān)蛋白家族的成員之一,并與Rad-51相互作用,參與同源序列的重組,因此該基因正常表達(dá)產(chǎn)物對保持染色體的穩(wěn)定性和損傷DNA的修復(fù)起重要作用[12]。目前有關(guān)XRCC3多態(tài)性的研究在歐美國家中的高加索人群較多,東亞人群較少,同時(shí)研究結(jié)果也不完全一致。因此我們對XRCC3基因第7外顯子18067位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性與頭頸部腫瘤易感性關(guān)系進(jìn)行了系統(tǒng)分析。我們將該基因單核苷酸位點(diǎn)多態(tài)性的所有情況進(jìn)行了假設(shè)考慮,包括突變純合子個(gè)體(T/T)與野生純合子個(gè)體(C/C)之間的比較;隱性模式下突變個(gè)體(T/T)與野生型個(gè)體(C/C+C/T)之間的比較;顯性模式下突變個(gè)體(T/T+C/T)與野生型個(gè)體(C/C)之間的比較。結(jié)果,所有情況下XRCC3基因18067位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性與頭頸部腫瘤易感性間均存不在明顯相關(guān)性。理論上,腫瘤的遺傳方式并不符合孟德爾單基因遺傳的遺傳規(guī)律,而是屬于多基因遺傳,即多個(gè)微小效應(yīng)的基因,在某個(gè)或某些環(huán)境因子的作用下產(chǎn)生一個(gè)總效應(yīng)從而導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生,腫瘤的遺傳并非腫瘤的本身,而是個(gè)體對腫瘤的遺傳易感性。因此單個(gè)基因單核苷酸多態(tài)性與腫瘤易感性之間的關(guān)系可能不足以在較小樣本的情況下顯現(xiàn)出來,這種理論上的相關(guān)性可能在一定程度上被較大效應(yīng)的其他相關(guān)因素所覆蓋,這種相關(guān)性在一定程度上被弱化了。因此,需要進(jìn)一步加大研究的樣本量,同時(shí)進(jìn)行多基因多位點(diǎn)聯(lián)合檢測,根據(jù)聯(lián)合檢測結(jié)果建立生物統(tǒng)計(jì)模型,篩查腫瘤易感人群,從而為實(shí)現(xiàn)腫瘤的三級(jí)預(yù)防提供理論上的可行性依據(jù),真正做到早期發(fā)現(xiàn)易感人群,對易感人群進(jìn)行早期干預(yù),做到早期預(yù)防,早期診斷,早期治療,從根本上解決目前腫瘤診斷治療過程中的被動(dòng)局面。

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