摘要:目的運用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究方法探究加味二至丸“異病同治”絕經(jīng)綜合征和原發(fā)性失眠的作用機制。方法通過TCMSP(traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform)數(shù)據(jù)庫獲取女貞子、墨旱蓮、淫羊藿的主要化學(xué)成分及其靶點,根據(jù)ADME篩選中藥活性組分,通過GeneCards、OMIM、DisGeNET、DrugBank數(shù)據(jù)庫分別獲取絕經(jīng)綜合癥和原發(fā)性失眠主要靶點,采用Cytoscape3.9.0軟件構(gòu)建“加味二至丸-成分-靶點-疾病”網(wǎng)絡(luò),利用STRING11.5平臺進行蛋白質(zhì)相互作用分析,構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)并篩選網(wǎng)絡(luò)中得分較高基因探析。最后采用Metascape平臺進行生物過程及通路分析。結(jié)果加味二至丸調(diào)治絕經(jīng)綜合征和原發(fā)性失眠的核心活性成分為槲皮素、山柰酚、木犀草素、熊果酸等,核心靶點有PTGS2、ESR1、NOS2、 ADRB2、 GABRA1等,加味二至丸調(diào)治絕經(jīng)綜合征和原發(fā)性失眠的生物學(xué)通路主要作用于AGE-RAGE信號通路、脂質(zhì)與動脈粥樣硬化、流體剪切應(yīng)力與動脈粥樣硬化、PI3K-Akt信號通路、HIF-1信號通路、腫瘤壞死因子信號通路、神經(jīng)活性配體受體相互作用等通路。結(jié)論加味二至丸可能通過調(diào)節(jié)神經(jīng)-內(nèi)分泌-免疫系統(tǒng)、炎癥反應(yīng)、雌激素代謝等多種途徑發(fā)揮治療絕經(jīng)綜合征和原發(fā)性失眠的作用。
關(guān)鍵詞:網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué);異病同治;加味二至丸;絕經(jīng)綜合征;原發(fā)性失眠;作用機制
中圖分類號:R271.11+6文獻標志碼:A文章編號:1007-2349(2024)03-0052-12
絕經(jīng)期綜合征(menopausal Syndrome,MPS)是指婦女由于卵巢始基卵泡功能逐步耗竭,在絕經(jīng)前或后時,激素水平失穩(wěn)引起的一系列軀體、精神、心理癥狀[1]。我國婦女自然絕經(jīng)平均年齡49.9歲,圍絕經(jīng)期綜合征發(fā)生率為44.1%[2],伴隨人口老齡化,60歲以上人口的比例增加,患病率隨之上升[3]。原發(fā)性失眠(Primary Insomnia)是表現(xiàn)為入睡困難、睡眠深度或頻度過短、早醒及睡眠時間不足或質(zhì)量差的一種疾?。?]?;疾÷矢哌_ 23.2%[5]。青年發(fā)病率高于老年[6],女性發(fā)病率約為男性的1.5倍[7-8]。中醫(yī)理論中“異病同治”即是對于不同的疾病,病機相同者,采用相同的措施進行醫(yī)治[9]。MPS與原發(fā)性失眠比較,有不同的病因,病理機制,及臨床表現(xiàn),但中醫(yī)病因病機可相同,都可以是“肝腎虧損”、 “陰陽兩虛”或“心腎不交”。滋補腎之陰陽是針對該病機的重要法則。本研究運用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法,建立藥物-靶點-疾病網(wǎng)絡(luò),探究加味二至丸治療更年期綜合征和原發(fā)性失眠“異病同治”的作用機制,以期為臨床研究提供參考依據(jù)。
1資料與方法
1.1加味二至丸活性成分和相關(guān)靶點濾選通過TCMSP檢索女貞子、墨旱蓮、淫羊藿的化學(xué)成分,依據(jù)ADME,開啟過濾器設(shè)定類藥性數(shù)值(DL)≥ 0.18、生物利用度(OB)≥20%,以此選擇活性成分。再經(jīng)過TCMSP數(shù)據(jù)庫檢索活性成分相對應(yīng)的靶點,并根據(jù)已發(fā)表的文獻報道及利用PharmMapper預(yù)測補充活性化合物的靶點。利用 UniProt,將取得靶點轉(zhuǎn)換為對應(yīng)國際標準基因名。
1.2絕經(jīng)綜合癥和原發(fā)性失眠相關(guān)靶點濾選絕經(jīng)綜合癥以“menopausal syndrome”、“climacteric syndrome”、“ perimenopausal syndrome”等為關(guān)鍵詞;原發(fā)性失眠以(primary Insomnia”、“sleep disorder”、“Chronic Insomnia”等為關(guān)鍵詞于GeneCards數(shù)據(jù)庫、OMIM數(shù)據(jù)庫、DisGeNET數(shù)據(jù)庫中采集調(diào)治絕經(jīng)綜合癥和原發(fā)性失眠的潛在靶點,進入DrugBanK數(shù)據(jù)庫尋找調(diào)治絕經(jīng)綜合癥和原發(fā)性失眠的臨床一線西藥作用靶點予以補充。若靶點過多則按照Score從大到小排序,取前1/4目標靶點為研究疾病的潛在靶點。合并4個疾病數(shù)據(jù)庫靶點后,去除重復(fù)值分別得到絕經(jīng)綜合癥和原發(fā)性失眠靶點數(shù)據(jù)集。將兩疾病靶點數(shù)據(jù)集與藥物成分靶點相匹配。
1.3加味二至丸成分-靶點-疾病網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建運用將獲得的交集靶點與加味二至丸的活性成分輸入Cytoscape3.9.0構(gòu)建成分-靶點-疾病網(wǎng)絡(luò)圖,使用Cytoscape3.9.0內(nèi)置的Analyze Network進行拓撲分析,運算度值(Degree)及介數(shù)中心性(Betweenness Centrality),核心靶點及發(fā)揮藥用的主要活性成分用網(wǎng)絡(luò)拓撲學(xué)參數(shù)進行推斷。
1.4加味二至丸蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建為明晰加味二至丸藥物相關(guān)靶點與絕經(jīng)綜合癥和原發(fā)性失眠靶點間的相互作用。將藥物-MPS與藥物-Primary Insomnia兩交集分別提交至STRING11.5數(shù)據(jù)庫進行PPI網(wǎng)絡(luò)模型構(gòu)建,設(shè)置生物種類為“Homo sapiens”,設(shè)置最小互相作用閾值為“highest confidence”(gt;0.9),剩余設(shè)定均選為默認,PPI網(wǎng)絡(luò)從頁面上獲得,并使用CytoScape3.9.0 的插件(cytoHubba)遴選出重要基因,采用最大團中心性算法(Maximal Clique Centrality MCC),擇取得分排前10位的節(jié)點并進行可視化分析。
1.5加味二至丸成分-疾病靶點功能與通路的富集分析將加味二至丸調(diào)治絕經(jīng)綜合征和原發(fā)性失眠的靶點分別導(dǎo)入Metascape平臺,設(shè)定Plt;0.01,解析其主要的生物學(xué)過程與代謝通路并進行富集分析,保存數(shù)據(jù)結(jié)果并采用線上作圖軟件(www.bioinformatics.com.cn)對數(shù)據(jù)進行可視化。
2結(jié)果
2.1加味二至丸的活性成分與靶點經(jīng)過TCMSP數(shù)據(jù)庫檢索及ADME濾選,共獲得加味二至丸活性成分36種,其包括女貞子11種、墨旱蓮6種、淫羊藿19種,見表1。于TCMSP數(shù)據(jù)庫中應(yīng)用活性成分檢索對應(yīng)靶蛋白,并通過UniProt數(shù)據(jù)庫搜索對應(yīng)靶蛋白基因名,去重并校對后得到957個作用蛋白靶點及其基因名。女貞子成分對應(yīng)靶點177個、墨旱蓮成分對應(yīng)靶點 146個、淫羊藿成分對應(yīng)靶點205個,合并去除重復(fù)值后共得到靶點228個。
共同靶點72個(圖1(C)),見圖 1。圖中八邊形節(jié)點代表加味二至丸所含中藥,圓形節(jié)點代表藥物活性成分,菱形節(jié)點代表有效成分作用的靶點,三角形節(jié)點代表疾病,其中粉紅色菱形代表絕經(jīng)綜合征與原發(fā)性失眠的公共靶點,灰色菱形代表的絕經(jīng)綜合征獨有靶點,粉紅菱形代表原發(fā)性失眠的獨有靶點。邊代表成分與靶點之間彼此作用的關(guān)系,某一個節(jié)點散發(fā)的邊越多,說明其度值越高,在網(wǎng)絡(luò)中占據(jù)重要地位。從圖2化合物-靶點-疾病相互作用網(wǎng)絡(luò)圖可以看出,加味二至丸的有效成分大多作用于一個以上靶點,而同一疾病靶點大多也會對應(yīng)多個成分。加味二至丸治療疾病是通過多個潛在成分,成分作用于多個不同靶點產(chǎn)生生物效應(yīng)。根據(jù)度值的大小由高到低進行排序,取度值排名前4名的藥物為主要活性成分,為槲皮素、山奈酚、木犀草素、熊果酸,具體參數(shù)見表2;加味二至丸作用的部分靶點是疾病特有的,NCOA2、AR、SCN5A是加味二至丸治療MPS的度值排名前三的獨有靶點,度值分別為22、18、9;PTGS1、GSK3B、ACHE是加味二至丸治療原發(fā)性失眠度值排名前三的獨有靶點度值分別為20、10、8;PTGS2、ESR1、NOS2 ADRB2 GABRA1則是加味二至丸治療兩種疾病的度值排名前五得共同靶點,也是加味二至丸調(diào)治絕經(jīng)綜合征與原發(fā)性失眠的主要的靶點,具體參數(shù)見表3。
圖2加味二至丸化合物-靶點-疾病作用網(wǎng)絡(luò)2.4加味二至丸成分-疾病靶點PPI網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建將加味二至丸治療絕經(jīng)綜合征107個靶點與加味二至丸治療原發(fā)性失眠的104 個靶點分別導(dǎo)入 STRING 11.5平臺,將得到蛋白互作數(shù)據(jù)后重新采用可視化作圖,見圖3。圖中蛋白與蛋白的作用關(guān)系是相互影響的,所以不區(qū)分方向。經(jīng)過相關(guān)度gt;0.9 篩選后得到加味二至丸干預(yù)絕經(jīng)綜合征的節(jié)點數(shù) 為 107 個,邊有 1731 條,平均節(jié)點度值為32.4;加味二至丸干預(yù)原發(fā)性失眠的節(jié)點數(shù)為 104 個,邊有 1224 條,平均節(jié)點度值為 23.5。將 STRING 軟件導(dǎo)出的加味二至丸治療絕經(jīng)綜合癥和原發(fā)性失眠 tsv 格式文件導(dǎo)入 Cytoscape 3.9.0 軟件進行網(wǎng)絡(luò)拓撲參數(shù)分析。MCC 在高級和低級蛋白質(zhì)中都捕獲了更多的必需蛋白質(zhì)[10],故最大團中心性算法在評估靶點重要性上有較好優(yōu)勢。使用cytoHubba插件,運用MCC評分算法對相互作用關(guān)系進行評析,選取蛋白作用網(wǎng)絡(luò)圖中重要性排前10的基因進行可視化。其中顏色越深表示該節(jié)點地位越重要,連線越多,代表兩個節(jié)點的相關(guān)性越強。篩選得到加味二至丸治療絕經(jīng)綜合征的關(guān)鍵靶基因包括VEGFA、IL6、MMP9、STAT3、CASP3、PTGS2、AKT1、IL1B、CXCL8、CCL2,見圖 3(D);加味二至丸治療原發(fā)性失眠的靶基因包括IL1B、TNF、VEGFA、IL6、AKT1、PTGS2、IL10、MMP9、CXCL8、CCL2,見圖3(B);上兩者靶點取交集的得分前8位的靶基因有VEGFA、IL6、MMP9、PTGS2、AKT1、IL1B、CXCL8、CCL2。
3.1加味二至丸組方分析方中女貞子,《神農(nóng)本草經(jīng)》載其“味苦性平,可補中益氣,充實五臟,調(diào)養(yǎng)精神,消除百病”。墨旱蓮,性寒,《本草正義》有言:“補陰且入腎經(jīng),助毛發(fā)生長,入血分方可涼血止血?!?二至丸中加入淫羊藿便成方加味二至丸,方義一是取獨陽不長,獨陰不生,人之陰陽互根互藏互用,補陽不忘陰,滋陰要溫陽之意;二是《本草綱目》載淫羊藿有“益精氣,堅筋骨,實腰膝,強心力”之功效,可加強原方益腎培元之功。中醫(yī)學(xué)認為絕經(jīng)綜合征與原發(fā)性失眠病機皆可為肝腎陰陽虛損,治法宜平補肝腎,滋陰養(yǎng)陽,以女貞子、墨旱蓮、淫羊藿三藥合用,可共生調(diào)和陰陽之效。研究表明,女貞子-墨旱蓮具有抗細胞凋亡、抗氧化應(yīng)激、減低炎癥因子釋放、抗骨質(zhì)疏松、抗老年癡呆、抗衰老、保肝等多種藥理作用[11]。加味二至丸中具有的植物雌激素樣作用,是其抗絕經(jīng)期骨質(zhì)疏松癥、絕經(jīng)期肥胖癥等作用的生物學(xué)基礎(chǔ)[12],且其在調(diào)治MPS及原發(fā)性失眠上的療效不遜色甚至佳于西藥對照,尤其在改善癥狀減少藥物副作用方面表現(xiàn)不凡[13-14]。
3.2加味二至丸成分分析分析得加味二至丸治療絕經(jīng)綜合征與原發(fā)性失眠的活性成分36個,重要成分包括槲皮素(quercetin)、山奈酚(kaempfero)、木犀草素(luteolin)、熊果酸(ursolic acid)等。其中槲皮素、山柰酚、木犀草素為黃酮類化合物,具有抗炎,調(diào)節(jié)免疫、抗氧化應(yīng)激等神經(jīng)、血管保護作用[15-17]。槲皮素作為黃酮類化合物重要的一種,具有降血壓、抗高血脂、抗高血糖、抗氧化、抗炎、神經(jīng)保護和心臟保護作用等多種特性[18]。研究表明,槲皮素表現(xiàn)出抗炎和免疫增強作用,可能通過阻斷 IL-12 信號傳導(dǎo)和 Th1 分化,減少TNF-α 和一氧化氮的產(chǎn)生,下調(diào)一氧化氮合酶(NOS)的表達,干擾促炎(TNF-α 和 IL-17)和/或抗炎(IL-10)細胞因子達成[19]。有動物實驗表明[20]槲皮素可能通過5-羥色胺能系統(tǒng)的介導(dǎo)增強小鼠睡眠或通過γ-氨基丁酸能(GABAergic)途徑提高小鼠睡眠數(shù)量和質(zhì)量[21]。槲皮素還可增加絕經(jīng)大鼠卵巢中的過氧化氫酶和谷胱甘肽合成酶,防止H2O2-誘導(dǎo)氧化應(yīng)激相關(guān)細胞活力下降和蛋白表達的降低[22]。木犀草素通過紅細胞核因子2-相關(guān)因子途徑發(fā)揮抗氧化和細胞保護特性[23]。木犀草素擁有強大的抗炎活性,這源于其對轉(zhuǎn)錄因子如 STAT3、NF-κB 和 AP-1 的調(diào)節(jié)[24]。山柰酚具備抗氧化、抗炎、神經(jīng)保護、抗骨質(zhì)疏松、雌激素/抗雌激素、抗焦慮、鎮(zhèn)痛的作用[25]。其抗炎作用主要通過降低細胞因子 IL-6、IL-1β 和 TNF-α 以及抗氧化酶超氧化物歧化酶(SOD)的血漿水平實現(xiàn)[26]。有動物實驗表明[27],山柰酚的雌激素作用可以有效調(diào)節(jié)睡眠[28]。熊果酸具有抗炎、抗氧化、抗癌等多種生物活性[29]。有實驗表明,熊果酸對雌激素相關(guān)的更年期皮膚變化效果良好[30]。熊果酸可激活 GABAA 受體從而延長睡眠時間[31]。
3.3關(guān)鍵靶點分析加味二至丸”異病同治”的關(guān)鍵基因有PTGS2、ESR1、NOS2、 ADRB2、 GABRA1。ESR1基因編碼產(chǎn)物 ER-α 可與雌激素結(jié)合產(chǎn)生刺激促性腺激素分泌、調(diào)節(jié)卵泡生成的生理效用。ESR1 通過負向調(diào)節(jié)NOS2A可影響血管內(nèi)NO等血管舒縮因子的合成與釋放[32-33]。有動物實驗表明,雌激素可改善絕經(jīng)小鼠骨 ER 的表達和密度降低[34-35]。二至丸能顯著上調(diào)ERα和ERβ表達,升高血清E2含量,發(fā)揮雌激素樣作用[36]。環(huán)氧合酶2(COX-2)的表達受雌激素、促炎細胞因子的調(diào)節(jié)[37]可說明ESR1可調(diào)控PTGS2。由上可知,加味二至丸發(fā)揮的雌激素樣作用可能是其防治絕經(jīng)綜合征重要因素之一[38-39]。GABRA1編碼γ-氨基丁酸(GABA)受體,GABA在神經(jīng)細胞中是主要的抑制性神經(jīng)遞質(zhì),它作用于GABA-A受體,與保持睡眠-覺醒機制的穩(wěn)態(tài)有關(guān)[40]。 有實驗表明[41],作用于GABRA1受體的配體可增強小鼠的慢波睡眠和反常睡眠。ADRB2參與的機體免疫、炎癥調(diào)節(jié)[42]。
本研究通過對加味二至丸治療絕經(jīng)綜合征和原發(fā)性失眠PPI網(wǎng)絡(luò)進行最大團中心性(MMC)分析得出了其中排名的前10個共有基因,其中包含IL1B、TNF、VEGFA、IL6、AKT1、PTGS2、IL10、CCL2等炎癥相關(guān)因子。圍絕經(jīng)期會促炎并破壞雌激素調(diào)節(jié)的神經(jīng)系統(tǒng),雌激素受體-β 已被證明可調(diào)節(jié)稱為炎性體的先天免疫反應(yīng)的關(guān)鍵成分[43]。絕經(jīng)后婦女雌激素缺乏的免疫系統(tǒng)變化表現(xiàn)于促炎血清標志物增加等[44]。破骨細胞活化導(dǎo)致骨重吸收過程中白細胞介素6(IL-6)為關(guān)鍵因素[45]。非快速眼動睡眠可由促炎細胞因子 IL-1、IL-6 與 TNF 增加,由抗炎細胞因子如 IL-4 和 IL-10 減少[46]。實驗表明[47],TNF可增進動物大腦中5-HT的合成而影響睡眠。血管內(nèi)皮生長因子(VEGF)可增強血管內(nèi)皮通透性,有助于炎癥的發(fā)展和持續(xù)存在[48]。說明加味二至丸具有一定的抗炎作用且可能通過抑制炎癥反應(yīng)和免疫反應(yīng)發(fā)揮作用。
3.4通路結(jié)果分析加味二至丸有較多基因靶點富集在AGE-RAGE信號通路、脂質(zhì)與動脈粥樣硬化、PI3K-Akt信號通路、HIF-1信號通路、腫瘤壞死因子信號通路、神經(jīng)活性配體受體相互作用等與神經(jīng)-內(nèi)分泌-免疫相關(guān)的信號通路和疾病通路。
AGE-RAGE通路與更年期動脈粥樣硬化有關(guān),糖基化終產(chǎn)物受體(RAGE)表達水平和循環(huán)可溶性受體(sRAGE)水平與雌二醇相關(guān)[49]。血管炎癥的潛在因素是與性激素-免疫系統(tǒng)相互作用相關(guān)細胞和分子信號通路[50]表示加味二至丸可能以雌激素樣作用通過AGE-RAGE通路影響炎癥因子表達而治療絕經(jīng)綜合征。流體剪切應(yīng)力與動脈粥樣硬化通路可傳導(dǎo)剪切引力啟動信號使內(nèi)皮細胞表現(xiàn)出增殖和促炎基因表達的激活,致使一氧化氮(NO)減少生成,白細胞黏附和滲透性增加,產(chǎn)生絕經(jīng)期動脈病變[51]。HIF-1信號通路參與了絕經(jīng)后骨質(zhì)疏松的病理演變,抑制HIF-1可顯著改善絕經(jīng)后骨質(zhì)疏松癥[52]。調(diào)整HIF-1的表達可以改變冠狀動脈疾病的易感性[53]。PI3K/AKT信號通路在調(diào)節(jié)細胞增殖、凋亡、代謝和血管生成等生物學(xué)過程中作用重要,是BDNF/TrkB的下游信號通路,與中樞神經(jīng)系統(tǒng)調(diào)節(jié)相關(guān),其可能通過調(diào)節(jié)BDNF/TrkB從而改善睡眠[54-55]。腫瘤壞死因子 α 可以調(diào)節(jié)睡眠和腦部發(fā)育[56]。白細胞介素1 和 6、腫瘤壞死因子α和β是神經(jīng)-內(nèi)分泌-免疫網(wǎng)絡(luò)中的重要樞紐因子,研究表明,白細胞介素1可通過調(diào)節(jié)炎癥反應(yīng)、免疫反應(yīng)等發(fā)揮治療絕經(jīng)綜合征[57-58],過高的TNF-α 、白細胞介素1 和 6可抑制睡眠,誘導(dǎo)中樞神經(jīng)系統(tǒng)產(chǎn)生某些神經(jīng)毒性分子,導(dǎo)致認知功能障礙及記憶力減退[59]。神經(jīng)活性配體-受體相互作用信號通路上富集有GABRA1,其是平衡睡眠機制的重要靶點之一。綜上所述,加味二至丸可能通過調(diào)節(jié)炎癥信號相關(guān)通路、雌激素相關(guān)信號通路、神經(jīng)-內(nèi)分泌-免疫相關(guān)等信號通路呈現(xiàn)相應(yīng)作用。
綜上所述,加味二至丸通過作用于PTGS2、ESR1、NOS2、ADRB2、GABRA1等多個靶點,調(diào)節(jié)AGE-RAGE信號通路、脂質(zhì)與動脈粥樣硬化、流體剪切應(yīng)力與動脈粥樣硬化、PI3K-Akt信號通路、HIF-1信號通路、腫瘤壞死因子信號通路、神經(jīng)活性配體受體相互作用等通路,從而實現(xiàn)調(diào)節(jié)神經(jīng)-內(nèi)分泌-免疫、炎癥反應(yīng),雌激素代謝等作用網(wǎng)絡(luò)以“異病同治”絕經(jīng)綜合征與原發(fā)性失眠。該研究為深入探討加味二至丸”異病同治”絕經(jīng)綜合征和原發(fā)性失眠的作用機制提供了參考。參考文獻:
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