陳思敏,凌期盛,張賽龍,繆朝玉 (海軍軍醫(yī)大學(xué)藥學(xué)系藥理學(xué)教研室, 上海, 200433)
潰瘍性結(jié)腸炎(ulceractive colitis, UC)屬于炎癥性腸病的一種,有著較高的發(fā)病率,其特征為損傷性炎癥,近年來有關(guān)其病因及發(fā)病機(jī)制的研究受到廣泛關(guān)注,但至今仍不明確[1]。對于潰瘍性結(jié)腸炎的治療目前多采用手術(shù)、抗感染、糖皮質(zhì)激素及免疫抑制劑等治療,但上述治療手段均為對癥治療,且藥物長期使用的不良反應(yīng)很容易造成疾病復(fù)發(fā)[2]。因此,探究潰瘍性結(jié)腸炎的發(fā)病機(jī)制,將為今后治療藥物的研發(fā)提供理論基礎(chǔ)。
Metrnl(Meteorin-like)是近年來新發(fā)現(xiàn)的神經(jīng)營養(yǎng)因子,也叫Cometin, Subfatin 或是IL-39[3-4]。Jorgensen 等[4]在2012 年將Metrnl 描述為類似于Meteorin(Metrn)的神經(jīng)營養(yǎng)因子。Metrnl 基因開放閱讀框包含4 個外顯子,由936 個堿基對編碼311 個氨基酸。Metrnl 蛋白包含45 個N 端信號肽序列,切除信號肽后的266 個氨基酸構(gòu)成分子量約為30 000 的成熟蛋白分子,整個蛋白分子沒有穿膜區(qū)域,是一種分泌蛋白。到目前為止,關(guān)于Metrnl功能的研究較少,我們前期針對該蛋白相關(guān)研究確認(rèn)Metrnl 為一種新的細(xì)胞因子,闡明了Metrnl 通過PPARγ 信號通路介導(dǎo)胰島素的增敏作用的重要機(jī)制[5]。Jorgensen 等[4]報道了Metrnl 在神經(jīng)突觸生長和成神經(jīng)細(xì)胞遷移中的神經(jīng)營養(yǎng)活性。Watanabe等[6]報道,Metrnl 是潛伏過程(Latent process,LP)基因,可用于細(xì)胞分化和神經(jīng)突觸延伸。脂肪組織Metrnl 能促進(jìn)脂肪細(xì)胞分化、改善代謝、抑制炎癥從而調(diào)節(jié)脂肪功能,對抗肥胖引起的胰島素抵抗[7]。通過檢測Metrnl 在各種組織中的表達(dá),我們發(fā)現(xiàn)Metrnl 在人和小鼠胃腸組織中,特別是在腸上皮細(xì)胞中都高度表達(dá),并發(fā)現(xiàn)腸上皮Metrnl 敲除后可以通過抑制腸上皮細(xì)胞的自噬而加重潰瘍性結(jié)腸炎,提示 Metrnl 是潰瘍性結(jié)腸炎的治療靶點[8]。
腸道微環(huán)境形成了良好的微生物群棲息地,腸道微生物群被認(rèn)為是人體的重要器官,越來越多的研究將這種微生物環(huán)境與胃腸道疾病聯(lián)系起來。腸道菌群在潰瘍性結(jié)腸炎中起著重要作用,如在無菌狀態(tài)下,無法制備出某些小鼠結(jié)腸炎模型(如IL-10 缺陷型小鼠等)[9-10]。也有研究報道,在治療潰瘍性結(jié)腸炎患者時,聯(lián)合使用抗生素也顯示出了較好療效[11]。此外,與健康人群相比,潰瘍性結(jié)腸炎患者的腸道菌群組成也發(fā)生了顯著變化[12]。但由于人類腸道菌群的復(fù)雜性和多樣性,目前尚未清楚某些特定菌屬與潰瘍性結(jié)腸炎發(fā)病機(jī)制的關(guān)系。
因此,本研究聚焦?jié)冃越Y(jié)腸炎,從腸道微生態(tài)角度出發(fā),探究腸上皮Metrnl 對于潰瘍性結(jié)腸炎的作用以及對腸道菌群調(diào)節(jié)機(jī)制的影響。
雄性C57 小鼠(8 周齡,20 只,16~20 g),上海西普爾-必凱實驗動物有限公司(生產(chǎn)許可證號:SCXK(滬)2013-0016)。Villin-cre 小 鼠[B6.Cg-Tg(Vil1in-cre)1000Gum/J,021504],2 只,16~20 g,美國JAX 公司(北京澄天生物科技有限公司代理),生產(chǎn)許可證號:SYXK(京)2018-0016),用于產(chǎn)生腸上皮細(xì)胞特異性Metrnl 基因敲除小鼠(Metrnl(-/-))。所有小鼠飼養(yǎng)于相對潔凈環(huán)境下,使用獨立通風(fēng)系統(tǒng)(individual ventilated cages, IVC)動物房,溫度恒定(22~26 ℃),室內(nèi)明暗交替12 h(08:00 至20:00照明),相對濕度為40%~70%,籠內(nèi)維持正壓20~25 Pa,每小時換氣60~70 次。所有實驗動物的使用,都經(jīng)過海軍軍醫(yī)大學(xué)動物管理機(jī)構(gòu)的同意和認(rèn)證,符合實驗動物飼養(yǎng)及相關(guān)管理規(guī)定。所有動物實驗均按照美國國家衛(wèi)生研究院實驗動物的護(hù)理和使用指南進(jìn)行,并得到海軍軍醫(yī)大學(xué)動物倫理委員會的批準(zhǔn)。IVC 系統(tǒng)購自上海鳴勵實驗室科技發(fā)展有限公司。TRIzol 試劑(15 596 026),美國Invitrogen 公司;葡聚糖硫酸鈉鹽(dextran sodium sulfate,DSS),MFCD00081551,分子量36 000~50 000,美國MP 公司,引物,生工生物工程有限公司;包埋機(jī)(JB- L5,德國徠卡有限公司);切片機(jī)(RM2126,德國徠卡有限公司);RT-PCR 儀器(ABI 7500 系統(tǒng),美國賽默飛公司);糞便DNA 提取試劑盒(QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit,Qiagen,Hilden, 德國);紫外微量分光光度計(NanoDrop 2000,Thermo Scientific, 美國);DNA 凝膠回收試劑 盒(AxyPrep DNA GelExtraction Kit,Axygen Biosciences, 美國);微型熒光計(QuantiFluor-ST,Promega, 美國);測序儀(Illumina MiSeq,Illumina,美國)。
首先按照本課題組已報道的方法[5]制備Metrnlloxp/loxp小鼠。根據(jù)報道的Metrnl(-/-)小鼠的繁殖策略[13],即將Metrnlloxp/loxp小鼠與購買的Villin-Cre 小鼠進(jìn)行交配,產(chǎn)下后代小鼠基因型為Metrnlloxp/wtVillin-Cre。將Metrnlloxp/wtVillin-Cre 小鼠和Metrnlloxp/loxp小鼠交配,產(chǎn)生下一代Metrnlloxp/loxpVillin-Cre 小鼠。繼續(xù)與Metrnlloxp/loxp交配,產(chǎn)下的后代,經(jīng)基因型鑒定分別為Metrnlloxp/loxpVillin-Cre(Metrnl(-/-))和Metrnlloxp/loxp(Metrnl(+/+))。
按照本課題組已報道的方法[3],使用TRIzol 試劑從腸道組織中提取總RNA,并使用ABI 7 500 系統(tǒng)進(jìn)行RT-PCR。最終的20 μl 反應(yīng)混合物包括10 μl SYBR Green,2 μl cDNA 模板和1 μl 引物。通過重復(fù)反應(yīng)確定平均閾值循環(huán)(Ct),將靶基因表達(dá)標(biāo)準(zhǔn)化為GAPDH,并使用ΔΔCT 方法獲得定量測量結(jié)果。Metrnl 上游引物(F)CTGGAGCAGGGAGG CTTATTT,下游引物(R)GGACAACAAAGTCACT GGTACAG;GAPDH 上游引物(F)GTATGACTC CACTCACGGCAAA,下游引物(R)GGTCTCGCTC CTGGAAGATG。
雄性C57 小鼠(8 周齡)于實驗室適應(yīng)2 周后,按照本課題組已報道的方法進(jìn)行模型制備[7],將DSS 溶于水中,分別至終濃度為3%和1%,讓小鼠自由飲用。
小鼠潰瘍性結(jié)腸炎疾病程度評分,按照我們之前已報道的的評分標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行評分[8],對體重下降程度、大便性狀、血便情況共3 部分分別進(jìn)行評分,然后進(jìn)行加和,計算總分?jǐn)?shù)。具體評分標(biāo)準(zhǔn)如下(表1)。
表1 小鼠潰瘍性結(jié)腸炎疾病程度評分表
小鼠處死后,取整個結(jié)腸部位,測量長度進(jìn)行比較。然后將結(jié)腸下段部位組織用4%多聚甲醛固定,石蠟包埋,切片機(jī)切至4 μm 的切片,按照之前的實驗方法[14],進(jìn)行HE 染色,染色后在光學(xué)顯微鏡下觀察炎癥細(xì)胞浸潤情況,組織損傷情況并拍照記錄。
使用16S 核糖體RNA 基因測序技術(shù)檢測腸道菌群。為了進(jìn)行樣品收集和DNA 提取,從實驗小鼠中收集糞便樣品,并在取樣后3h 內(nèi)將其冷凍在-80°C 下。使用QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit 進(jìn)行DNA 提取。使用NanoDrop 2000 測量細(xì)菌DNA的濃度。然后,將16S 核糖體RNA 基因測序用于檢測細(xì)菌DNA?;虻腣3-V4 區(qū)域使用FastPfu聚合酶通過條形碼索引引物(338F 和806R)進(jìn)行PCR 擴(kuò)增。然后通過AxyPrep DNA GelExtraction Kit,凝膠提取純化擴(kuò)增子,并使用QuantiFluor-ST 進(jìn)行定量。將純化的擴(kuò)增子以等摩爾濃度合并,并使用Illumina MiSeq 儀器進(jìn)行末端配對測序。
16S rRNA 測序數(shù)據(jù)由Quantitative Insights Into Microbial Ecology 平臺(V.1.9.1)處理,并進(jìn)行了MegaBLAST 搜索,將生物分類單位的讀數(shù)(OTU)與國家生物技術(shù)信息中心16S rRNA 數(shù)據(jù)庫中的參考序列比對。按照文獻(xiàn)報道的方法[15]進(jìn)行宏基因組學(xué)分析,從16S rRNA 序列推算腸道微生物組的基因組,并且對每個樣品的基因含量進(jìn)行了預(yù)測。
我們構(gòu)建了腸上皮細(xì)胞特異性Metrnl基因敲除(Metrnl(-/-))小鼠,并檢測了MetrnlmRNA 在大腸和小腸組織中的表達(dá)。結(jié)果表明,Metrnl(-/-)小鼠中MetrnlmRNA 的表達(dá)在結(jié)腸和小腸組織中極低(圖1A)。HE 結(jié)腸切片顯示Metrnl(-/-)和Metrnl(+/+)小鼠之間均無組織損傷和炎癥細(xì)胞浸潤(圖1B)。以上結(jié)果表明,腸上皮細(xì)胞特異性Metrnl 基因敲除后不會誘發(fā)潰瘍性結(jié)腸炎。
圖1 Metrnl(-/-)小鼠未表現(xiàn)出結(jié)腸炎表型
在建立DSS 誘發(fā)的潰瘍性結(jié)腸炎模型之前,為了選擇最佳的觀察時間和DSS 給藥濃度,我們分別選擇3%DSS 和1%DSS 進(jìn)行造模,并觀察了不同DSS 濃度下C57 小鼠的存活時間。結(jié)果顯示,在3%DSS 組的第6 天,出現(xiàn)了小鼠死亡;直至給藥10 d,全部小鼠死亡(圖2A)。在1%DSS 組中,未觀察到小鼠死亡。與對照組相比,3%DSS 組的小鼠體重在第5 天時顯著性降低(P<0.05),而1%DSS 組的體重并無顯著改變(圖2B)。同樣,與對照組相比,3%DSS 組小鼠DAI 增加(P<0.05),結(jié)腸長度顯著性縮短(P<0.05),而1%DSS 組在疾病活動指數(shù)、結(jié)腸長度方面均無明顯變化(圖2CD)。組織形態(tài)學(xué)方面,3%DSS 組表現(xiàn)出結(jié)腸炎表型,具有明顯的組織損傷,而對照組并無明顯變化(圖2E)。因此,我們選擇3%DSS 和5 d 的給藥時間作為后續(xù)實驗條件。
圖2 潰瘍性結(jié)腸炎模型條件的選擇
給予Metrnl(-/-)和Metrnl(+/+)小鼠3%DSS 后,兩組小鼠均表現(xiàn)出潰瘍性結(jié)腸炎癥狀,其特征為持續(xù)的體重減輕、疾病活動指數(shù)增加、血性腹瀉、結(jié)腸長度縮短以及結(jié)腸炎癥(圖3)。在此過程中,在給藥后第5 天時,與Metrnl(+/+)小鼠體重減輕(-8.27±1.32)%相比,Metrnl(-/-)小鼠的體重減輕(-14.92±1.05)%,具有統(tǒng)計學(xué)差異(P<0.05,圖3A);與Metrnl(+/+)小鼠的疾病活動指數(shù)(6.00±1.63)相比,Metrnl(-/-)小鼠顯著增加至(9.67±1.38)(P<0.05,圖3B);與Metrnl(+/+)小 鼠 結(jié) 腸 長 度(7.08±0.89 cm)相 比,Metrnl(-/-)小鼠結(jié)腸更短(5.77±0.58 cm)(P<0.05)(圖3D);為了排除上述差異不是由小鼠攝入不同量的3%DSS 引起的,我們還檢測了兩組小鼠的飲水量。結(jié)果顯示兩組小鼠飲水量之間并無顯著差異(圖3C)。
圖3 Metrnl 敲除后對DSS 誘導(dǎo)的潰瘍性結(jié)腸炎的影響
我們通過高通量16S rRNA 基因測序,檢測了Metrnl 對DSS 誘導(dǎo)的潰瘍性結(jié)腸炎小鼠模型中腸道菌群的影響。應(yīng)用Chao1 豐度估計量(chao1 richness estimator),香農(nóng)多樣性指數(shù)(shannon diversity index),辛普森多樣性指數(shù)(simpson diversity index)三種指標(biāo)評價各組小鼠中菌群的Alpha 多樣性(圖4A-C)。結(jié)果顯示,在未進(jìn)行DSS造模之前,Metrnl(-/-)和Metrnl(+/+)小鼠的Alpha 多樣性并無顯著差異;而進(jìn)行3%DSS 造模后,Metrnl(-/-)和Metrnl(+/+)小鼠出現(xiàn)了差異,其中Metrnl(-/-)小鼠多樣性顯著下降(圖4A-C)。主成分分析顯示,在給予3%DSS 造模后的Metrnl(-/-)和Metrnl(+/+)小鼠之間微生物的組成顯著不同(圖4D)。檢測小鼠糞便微生物組成,結(jié)果顯示,在“門”這一層面,給予3%DSS 后擬桿菌門(Bacteroidetes)、厚壁菌門(Firmicutes)和變形桿菌門(Proteobacteria)在Metrnl(-/-)和Metrnl(+/+)小鼠間存在顯著的不同(圖4E)。在Metrnl(-/-)小鼠中,Bacteroidetes和Proteobacteria顯著降低,而Firmicutes顯著升高。在“綱”這一層面,發(fā)現(xiàn)給予DSS 后,Metrnl(-/-)和Metrnl(+/+)小鼠間擬桿菌綱(Bacteroidia)和梭菌綱(Clostridia)具有顯著差異。值得注意的是,擬桿菌綱(Bacteroidia)屬于擬桿菌門(Bacteroidetes);梭菌綱(Clostridia)屬于厚壁菌門(Firmicutes)(圖4F)。為了進(jìn)一步探究影響給予DSS 后造成Metrnl(-/-)和Metrnl(+/+)小鼠間狀態(tài)的原因,我們又在“目”層面進(jìn)行了檢測,結(jié)果顯示(圖4G),擬桿菌目(Bacteroidales),屬于桿菌綱(Bacteroidia);梭菌目(Clostridiales),屬于梭菌綱(Clostridia)發(fā)生了顯著改變。
本研究用DSS 誘導(dǎo)潰瘍性結(jié)腸炎小鼠模型并從對腸道微生物影響的角度出發(fā),探究腸上皮Metrnl 特異性敲除對于腸道菌群調(diào)節(jié)的影響以及對潰瘍性結(jié)腸炎的作用。發(fā)現(xiàn)Metrnl 在潰瘍性結(jié)腸炎小鼠模型中具有保護(hù)的功能,該效應(yīng)可能是Metrnl 通過對腸道菌群的調(diào)節(jié)所致。
近期有一篇關(guān)于Metrnl 改善克羅恩氏?。–D)的報道,該研究表明腸系膜脂肪組織與腸道存在交互作用,發(fā)現(xiàn)小鼠在給予Metrnl 后,可通過激活STAT5/PPARγ 信號通路,從而達(dá)到促進(jìn)脂肪細(xì)胞分化來減輕腸系膜脂肪組織病變的作用[16]。該研究表明Metrnl 確實可以影響炎癥性腸病的發(fā)生發(fā)展。除此以外,我們進(jìn)一步證實了,腸上皮特異性Metrnl 敲除后可以加重DSS 誘導(dǎo)的潰瘍性結(jié)腸炎,并且該作用是通過抑制AMPK-mTOR-p70S6K通路,下調(diào)了腸上皮細(xì)胞自噬水平產(chǎn)生的[7]。
腸道微環(huán)境形成了合適的微生物群棲息地,已證明會影響多種消化系統(tǒng)疾病的發(fā)生[17]。腸道菌群穩(wěn)態(tài)的紊亂已被廣泛認(rèn)為與炎癥性腸病的發(fā)病機(jī)制和進(jìn)展密切相關(guān)[8]。腸道菌群主要有三種功能,分別是代謝作用,保護(hù)作用和營養(yǎng)作用[18-19]。正常人腸道中在“門”這一層面,主要有四類微生物群,包括擬桿菌門(Bacteroidetes)、厚壁菌門(Firmicutes)、放線菌門(Actinobacteria)和變形桿菌門(Proteobacteria)[20-21]。
潰瘍性結(jié)腸炎的主要特征是有益細(xì)菌的減少。擬桿菌門(Bacteroidetes)是革蘭陰性厭氧細(xì)菌,構(gòu)成了哺乳動物胃腸道中主要微生物群[22]。目前認(rèn)為,擬桿菌門可以通過免疫調(diào)節(jié)和維持體內(nèi)平衡而對宿主發(fā)揮有益作用。據(jù)報道,擬桿菌門可以通過分泌多糖A(polysaccharide A, PSA)來增強(qiáng)抗炎因子IL-10 的mRNA 表達(dá)[23-24]。本研究結(jié)果顯示出類似趨勢,在給予3%DSS 進(jìn)行潰瘍性結(jié)腸炎造模后,Metrnl(-/-)小鼠癥狀更加嚴(yán)重,與Metrnl(+/+)小鼠相比,其擬桿菌門的成分顯著下降。然而,擬桿菌門在潰瘍性結(jié)腸炎中并不完全有益。有報道顯示,擬桿菌門可以侵入腸道組織并引起個別患者的腸道損傷[25]。因此針對該類菌屬的作用還有待進(jìn)一步驗證。除此以外,由于SCFA 具有增強(qiáng)腸壁屏障和免疫系統(tǒng)的作用,從而有助于抵抗病原體,因此產(chǎn)生SCFA 的菌群目前認(rèn)為對人體是有益的,例如Faecalibacterium prausnitzii,Roseburia或Eubacterium[26-28]。放線菌門(Actinobacteria)中的雙歧桿菌屬(Bifidobacterium)也是有益菌群[29-30]。然而,在該屬中發(fā)現(xiàn)了有爭議的結(jié)果,因為有研究報道顯示,與對照組相比,潰瘍性結(jié)腸炎患者的Bifidobacterium增加了[31-32],其原因可能是疾病程度的造成的。因此,需要進(jìn)一步的研究來闡明該有益菌群在潰瘍性結(jié)腸炎中的作用。
相反的,目前很多研究顯示菌群在潰瘍性結(jié)腸炎中顯著增加,如變形桿菌門(Proteobacteria)下的黏附侵入性大腸桿菌屬(adherent-invasiveEscherichia coli)和巴斯德桿菌屬(Pasteurellaceae),厚 壁 菌 門(Firmicutes) 下 的 韋 榮 氏 球 菌 屬(Veillonellaceae)和瘤胃球菌屬(Ruminococcus gnavus),梭桿菌屬(Fusobacterium)。我們的研究結(jié)果也顯示出類似趨勢,在給予DSS 后,與Metrnl(+/+)小鼠相比,Metrnl(-/-)小鼠的厚壁菌的成分顯著上升。除此以外,以下菌屬也被認(rèn)為具有潛在致病性,如大腸桿菌屬(Escherichia),沙門菌屬(Salmonella),耶爾森菌屬(Yersinia),脫硫弧菌屬(Desulfovibrio),幽門螺桿菌屬(Helicobacter),弧菌屬(Vibrio)[31,33-36]。目前報道較多的是黏附侵入性大腸桿菌,此種細(xì)菌能夠黏附并穿過腸道黏液屏障,侵入腸道上皮層,促進(jìn)TNFα 分泌和炎癥的發(fā)生[37-38]。本研究表明,腸上皮特異性Metrnl 敲除后,在3%DSS 誘導(dǎo)的潰瘍性結(jié)腸炎模型中,導(dǎo)致腸道菌群動態(tài)平衡的進(jìn)一步紊亂,表明恢復(fù)菌群動態(tài)平衡對于治療潰瘍性結(jié)腸炎至關(guān)重要。
需要注意的是,大量研究表明,目前并沒有明確具體的哪一種微生物群對人體是有益的,因為每個人的菌群特征都不同。一般而言,只有相對平衡的微生物群,才能最佳地維持人體的代謝和免疫功能以及預(yù)防疾病的發(fā)展。在健康的腸道中,病原菌和共生菌群可以共存而不會出現(xiàn)問題。但是,這種平衡的任何紊亂都會導(dǎo)致營養(yǎng)不良,從而改變微生物與宿主之間的相互作用[39]。盡管目前普遍認(rèn)為潰瘍性結(jié)腸炎中腸環(huán)境平衡的破壞是顯著發(fā)生的,但是造成腸道平衡紊亂的生物學(xué)機(jī)制的仍然未知,并且不清楚這種紊亂究竟是造成潰瘍性結(jié)腸炎的原因還是結(jié)果。
本研究仍存在不足。首先,腸道微生態(tài)對潰瘍性結(jié)腸炎的保護(hù)作用的詳細(xì)機(jī)制仍未探究清楚,特別是腸道中存在的主要4 類微生物群(擬桿菌,厚壁菌,放線菌,變形桿菌)對潰瘍性結(jié)腸炎的作用還有待證實。其次,腸上皮特異性Metrnl 敲除后通過調(diào)節(jié)腸道菌群的組成,從而加重3%DSS 誘導(dǎo)的潰瘍性結(jié)腸炎的作用證據(jù)仍不十分充分,需要今后在進(jìn)一步的研究中加以闡明。