趙天奇,盧徐斌,朱 浩,姜 惠,陸體富,丁俞建,卞紅春,蘇衍菁,孫雨佳,毛永江,楊章平*
(1.揚州大學(xué)動物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,江蘇揚州 225009;2.江蘇銀寶光明牧業(yè)有限公司,江蘇鹽城 224399;3.鹽城市動物疫病預(yù)防控制中心,江蘇鹽城 224500;4.光明牧業(yè)有限公司,上海 201103)
娟姍牛原產(chǎn)于英吉利海峽的娟姍島,以“易順產(chǎn)、奶質(zhì)優(yōu)和抗逆性強”3 大優(yōu)點躋身世界五大奶牛品種,是畜牧業(yè)發(fā)達(dá)國家青睞的引種對象。近年來,我國多家奶業(yè)種業(yè)龍頭企業(yè)和研究機構(gòu)為促進(jìn)現(xiàn)代畜禽種業(yè)發(fā)展,提高自身奶源競爭力,以市場為導(dǎo)向,廣泛引進(jìn)優(yōu)質(zhì)娟姍牛。產(chǎn)學(xué)研結(jié)合開展娟姍牛選育,培育本土化的奶牛新品系,豐富我國奶牛品種資源,生產(chǎn)高檔優(yōu)質(zhì)奶制品,既是產(chǎn)業(yè)和市場的需求,也是提升我國奶牛種業(yè)核心競爭力的需要。
目前乳制品行業(yè)的競爭方向是高端市場的持續(xù)創(chuàng)新,戰(zhàn)略重點之一是奶牛品種。娟姍牛奶營養(yǎng)價值高,口感濃醇鮮甜,但市場供應(yīng)稀缺,是目前較高端的牛奶。自2016 年起,國內(nèi)多家牧場為提升自身奶源競爭力,搶占牛奶高端市場,從新西蘭和澳大利亞等國家廣泛引進(jìn)純種娟姍母牛,建設(shè)娟姍牛養(yǎng)殖基地。河北省三河市百宏牧場2022 年引進(jìn)3000 多頭澳大利亞娟姍牛;張掖市甘州區(qū)畜牧產(chǎn)業(yè)園建設(shè)萬頭娟姍牛牧場,2023年5 月底初具規(guī)模;燕山南麓娟姍牧場自2020年起共引進(jìn)了3600 頭娟姍牛;優(yōu)然牧業(yè)2019 至今在內(nèi)蒙古投資的3 家娟姍牛牧場皆已進(jìn)入擠奶期。此外首農(nóng)集團新綠洲農(nóng)業(yè)循環(huán)園區(qū)二期牧場、西海大牧場、利芙德娟姍牧場等規(guī)模牧場均已投產(chǎn)娟姍牛,江蘇、廣西、廣東、西藏、云南、河北、湖南等地也已建設(shè)娟姍牛奶源基地。江蘇射陽銀寶光明牧業(yè)有限公司所屬牧場自2020年起,分批從澳大利亞和新西蘭引進(jìn)娟姍牛約2800 頭,目前,該牧場共擁有娟姍牛近4500 頭,其中產(chǎn)奶母牛2500 頭,是國內(nèi)養(yǎng)殖娟姍牛單體規(guī)模較大的牧場。
面對奶牛新品種娟姍牛的大批量引進(jìn),國內(nèi)牧場大多延用中國荷斯坦牛與引進(jìn)地娟姍牛群體的飼養(yǎng)管理模式,并采購美國和加拿大等國的娟姍牛凍精,進(jìn)行繁殖選育。該養(yǎng)殖模式雖可以保證娟姍牛正常生產(chǎn)和繁殖,但仍出現(xiàn)了一些問題,例如:種源系譜不清,后續(xù)選育措施跟不上;娟姍牛營養(yǎng)需要和采食量不明確,牛群營養(yǎng)代謝疾病發(fā)生頻繁,2 胎以上牛只產(chǎn)后代謝疾病發(fā)病率上升;泌乳曲線不規(guī)律,部分牧場娟姍牛150d 產(chǎn)量跌幅較大等。目前,揚州大學(xué)、廣西畜牧研究所、廣州奶牛研究所、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)等多家研究單位針對娟姍牛本土適應(yīng)性問題和飼養(yǎng)管理方法展開了深入研究,近5 年發(fā)表相關(guān)研究中文期刊40 余篇,但娟姍牛在國內(nèi)的本土化選育仍處于初級階段。
揚州大學(xué)牛遺傳資源與健康養(yǎng)殖創(chuàng)新團隊系統(tǒng)測定了江蘇銀寶光明牧業(yè)有限公司娟姍牛群體的體型外貌、生產(chǎn)性能和繁殖性能,比較了國內(nèi)外娟姍牛生產(chǎn)性能差異,分析了娟姍牛品種的種質(zhì)特征。
為闡明娟姍牛體型外貌特征,豐富表型測定數(shù)據(jù),以銀寶光明牧場1~3 胎娟姍母牛群體為研究對象,在產(chǎn)犢后30~150d 對其體軀容量、尻部、肢蹄、泌乳系統(tǒng)和乳用特征等5 種類型共20 個體型外貌特征進(jìn)行原始數(shù)據(jù)測定和評分[1],數(shù)據(jù)的測定由3 位專業(yè)人員同時進(jìn)行,避免主觀因素造成的誤差(圖1a、1b)。體型測定數(shù)據(jù)的描述性統(tǒng)計結(jié)果如表1 所示。
圖1 專業(yè)人員測定娟姍牛體型外貌性狀
表1 牧場1~3 胎次娟姍牛產(chǎn)后30~150d 體型性狀描述性統(tǒng)計
體型外貌數(shù)據(jù)分析結(jié)果表明,娟姍牛群體體型性狀遺傳穩(wěn)定,品種外貌特征明顯。犢牛初生平均體重25.6kg,成母牛一般體高110~135cm,體深47~86cm,整體側(cè)望呈楔形,體態(tài)緊致飽滿。體軀被毛多為褐色,淺褐色居多,也有極少部分全黑和褐白花存在,嘴和眼周圍多有淺色毛環(huán)繞,毛大多細(xì)短光滑,尾毛黑色居多,部分白色。娟姍牛頭部輕秀,耳大而薄,額部稍凹,額頂著生鬢毛,眼大有神,頸部纖細(xì),皺褶鮮明。中軀胸深而寬,平均胸寬26.43cm,背腰平直,頸背腰薦結(jié)合良好,四肢端正,骨骼細(xì)而有力;后軀發(fā)達(dá),尻部飽滿;蹄黑色,蹄踵小而堅實,平均蹄踵深度3.52cm,蹄角度35.23°。娟姍牛的乳房形狀美觀,質(zhì)地柔軟,乳頭略小,前乳頭平均長度3.97cm。一胎娟姍牛乳房發(fā)育勻稱,多為盆形,乳房底部大多高于飛節(jié),前乳房附著角度大于其他胎次娟姍牛。2 胎及以上娟姍牛乳房大而飽滿,乳靜脈暴露,泌乳系統(tǒng)較為發(fā)達(dá)。
娟姍牛生產(chǎn)壽命長,乳蛋白、乳脂肪含量豐富,一般平均年產(chǎn)奶量4000~5500kg,乳脂率5.0%~6.0%,乳蛋白4.0%[2]。收集銀寶光明牧場娟姍牛2022 年夏季至2023 年春季DHI 記錄,并對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)控(日產(chǎn)奶量1~50kg、乳脂率1%~10%、乳蛋白率1%~6%),分析娟姍牛主要生產(chǎn)性能指標(biāo),結(jié)果如表2 所示。娟姍牛平均日產(chǎn)奶量18.54kg,乳脂率5.42%,乳蛋白4.21%,在南方同時期娟姍牛群體中屬于較高水平[3,4]。冬季,娟姍牛乳蛋白率和乳脂率最高,但產(chǎn)奶量屬于中低水平,且每毫升牛乳的體細(xì)胞數(shù)量也相對較高,這可能與季節(jié)和泌乳階段有關(guān)。一般來說,奶牛耐寒不耐熱,當(dāng)環(huán)境溫度在8~20℃時,奶??梢园l(fā)揮最佳生產(chǎn)性能。銀寶光明牧場位于鹽城沿海地區(qū),2022—2023 年冬季平均氣溫7℃,風(fēng)速13km/h,引進(jìn)娟姍牛受降雨和海風(fēng)影響,部分牛有時會出現(xiàn)腹瀉感冒等癥狀,對冷環(huán)境表現(xiàn)出一定的不適應(yīng)性,體細(xì)胞數(shù)可能因此升高。銀寶光明牧場娟姍牛產(chǎn)犢主要集中在秋冬兩季,結(jié)合牧場生產(chǎn)信息,牧場娟姍牛泌乳天數(shù)在30~60d 時產(chǎn)奶量達(dá)到高峰,隨后平穩(wěn)下降,這與王澳等[5]擬合的北方娟姍牛泌乳曲線相似。但牧場娟姍牛泌乳天數(shù)達(dá)到150d 后,產(chǎn)奶量呈現(xiàn)較大幅度的下跌,且年產(chǎn)奶量低于7t。相對于高峰期后逐步降低的產(chǎn)奶量,娟姍牛乳脂率和乳蛋白率則呈現(xiàn)隨泌乳天數(shù)增加小幅上升的趨勢。此外,娟姍牛泌乳表現(xiàn)為高峰奶越高,全泌乳期產(chǎn)奶量越高的特點[6],針對娟姍牛高峰奶和泌乳持續(xù)力進(jìn)行選種,對提高娟姍牛的終身產(chǎn)奶量水平有重要意義。
表2 娟姍牛2022 年夏季至2023 年春季生產(chǎn)性能描述性統(tǒng)計
娟姍牛性成熟早、受胎率高,當(dāng)青年牛達(dá)體重250kg,體高116cm,月齡13 個月時適宜配種,24 月齡前產(chǎn)犢最為理想。目前,銀寶光明牧場發(fā)情監(jiān)測手段以人工觀察為主,自動揭發(fā)情為輔;娟姍牛具有較長的發(fā)情持續(xù)期(12.7h)和更多的站立發(fā)情時間,現(xiàn)有手段雖能較為準(zhǔn)確的鑒定發(fā)情并進(jìn)行配種,但發(fā)情檢測的及時性和準(zhǔn)確性仍有提升空間。統(tǒng)計牧場2022 年下半年產(chǎn)犢的娟姍牛,青年牛平均復(fù)配指數(shù)2.33,成母牛平均為2.29,未達(dá)到加拿大娟姍牛協(xié)會公布的平均配種次數(shù)1.8 次的水平。截至2023 年4 月,牧場娟姍牛平均初產(chǎn)月齡26.05 個月,與巴西娟姍牛育種協(xié)會公布的平均初產(chǎn)月齡24.60 個月仍有一定差距[7]。有研究表明,初產(chǎn)月齡對娟姍牛產(chǎn)量、生育能力和長壽性狀有顯著負(fù)相關(guān)影響,初產(chǎn)月齡的降低會顯著增加娟姍牛的終生產(chǎn)奶量和存活率,并縮短娟姍牛的產(chǎn)犢間隔,當(dāng)初產(chǎn)月齡處于25.8 個月時,娟姍牛5 歲存活率可達(dá)45%,顯著高于同期荷斯坦牛(26.8 月齡,38%存活率)[5,8]。娟姍牛一般平均產(chǎn)犢間隔為390~399d,牧場引進(jìn)娟姍牛產(chǎn)犢間隔為392d,達(dá)到平均水平,并顯著低于國內(nèi)荷斯坦牛產(chǎn)犢間隔平均水平[9],因此結(jié)合娟姍牛泌乳特征,研究并控制與娟姍牛生產(chǎn)水平匹配的適宜產(chǎn)犢間隔,對提高娟姍牛養(yǎng)殖經(jīng)濟效益具有重要實際意義[10]。
現(xiàn)有娟姍牛生產(chǎn)性能分析的結(jié)果表明,引進(jìn)的娟姍牛群體存在生長發(fā)育、生產(chǎn)性能和適應(yīng)性參差不齊等問題。因此,有必要通過現(xiàn)代育種技術(shù)手段持續(xù)開展娟姍牛良種繁育工作,加快娟姍牛的本土化選育進(jìn)展。這對豐富江蘇奶牛品種資源,推動江蘇奶業(yè)高質(zhì)量發(fā)展具有重要作用。目前,長三角地區(qū)娟姍牛本土化選育的主要目標(biāo)是在保持乳品質(zhì)和抗熱應(yīng)激及乳腺炎性能的基礎(chǔ)上提高產(chǎn)奶量水平,同時進(jìn)一步改進(jìn)體型性狀。主要育種策略是在生產(chǎn)性能、體型、系譜及基因組等數(shù)據(jù)采集的基礎(chǔ)上,建立娟姍牛基因組育種數(shù)據(jù)平臺,進(jìn)而開展良種登記,融合基因組選擇、優(yōu)化選配和MOET 技術(shù),實現(xiàn)整體的遺傳改良,培育高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)娟姍牛本土化新品系。
長三角地區(qū)娟姍牛群體的選育雖處于起步階段,但已具有較好的育種基礎(chǔ)。形成了規(guī)范的DHI 數(shù)據(jù)測定系統(tǒng),建立母牛體型測定標(biāo)準(zhǔn),并定期測定,為娟姍牛生產(chǎn)管理和繁殖配種提供了參考依據(jù)。此外,已梳理出娟姍牛群體完整的系譜信息(圖2)及與配公牛各項經(jīng)濟指標(biāo)的估計育種值,為奶牛遺傳改良技術(shù)環(huán)節(jié)中品種登記、遺傳評估、科學(xué)選配、減少近交衰退等多項技術(shù)手段提供有效信息,大大提高場內(nèi)娟姍牛群體的選育速度[11]。
圖2 牧場牛只系譜深度圖
與配公牛精液主要來自于美國和加拿大的優(yōu)秀種公牛(表3),進(jìn)口精液品質(zhì)合格,且與牧場牛群無血緣關(guān)系,育種基礎(chǔ)良好。外來優(yōu)良血緣的引入豐富了牛群遺傳資源,增加了娟姍牛優(yōu)良性狀的基因豐度,減少了近交衰退,提高了牛群品質(zhì)。此外,為避免近交,排除5 代內(nèi)有親緣關(guān)系的牛只交配,為娟姍牛選育后期固定優(yōu)良性狀,選育良種公牛奠定了基礎(chǔ)。
表3 與配娟姍牛公牛精液性狀指數(shù)描述性統(tǒng)計(n=18)
目前場內(nèi)已有200 余頭F1代牛開始泌乳,截至2023 年,預(yù)計共有1000 余頭自繁F1代娟姍牛進(jìn)入泌乳期(F1代娟姍牛已建立完整的飼養(yǎng)管理及疾病繁殖記錄檔案)?!氨就痢本陫櫯5某掷m(xù)擴繁為本土化的持續(xù)選育提供了更為豐富的育種素材。不斷補充的優(yōu)質(zhì)娟姍牛育種核心群,為挖掘娟姍牛產(chǎn)奶、體型、繁殖,健康和適應(yīng)等重要性狀相關(guān)的功能基因和SNP 位點,選育生產(chǎn)水平高、乳品質(zhì)優(yōu)、適應(yīng)性廣的娟姍牛新品系奠定了育種基礎(chǔ)。
基因型信息是開展品種特征分析、遺傳評估、功能位點挖掘及基因組選擇的重要信息來源。目前,揚州大學(xué)牛遺傳資源與健康養(yǎng)殖創(chuàng)新團隊已通過采集血液或尾根部毛囊樣品,開展了娟姍牛群體100K 芯片基因分型檢測、1×基因組低覆蓋測序和20×基因組測序等。所有測序數(shù)據(jù)下機后,使用NGSQCToolkit 和BWA 軟件進(jìn)行原始過濾,參考基因組索引,建立數(shù)據(jù)庫,接著利用samtools 軟件進(jìn)行文件格式轉(zhuǎn)換,并使用picard 軟件將bam 文件進(jìn)行重排序,并標(biāo)記完全相同的reads,同時基于bam 格式文件生成新的索引。最后,使用GATK 軟件進(jìn)行VCF 文件生成及SNP 捕獲,運行分為4 步:①生成原始vcf 文件;②SNP 選擇;③索引選擇;④SNP 過濾。基因型數(shù)據(jù)的統(tǒng)計結(jié)果見表4 所示。接著,將娟姍?;蚪M信息與江蘇荷斯坦牛群體的基因組數(shù)據(jù)開展選擇信號分析(圖3),挖掘一批娟姍牛品種形成的特有功能基因及SNP 位點(表4)。下一步,團隊計劃根據(jù)CattleGTEx 提供的參考面板為模板將所有基因型數(shù)據(jù)填充到全基因組測序水平,并通過全基因組關(guān)聯(lián)分析鑒定進(jìn)一步挖掘一批與產(chǎn)奶、體型、繁殖和健康相關(guān)的功能基因和SNP 位點(表5)。
圖3 娟姍牛與荷斯坦牛群體分化指數(shù)分析(FST)
表4 娟姍牛群體基因型數(shù)據(jù)統(tǒng)計
表5 娟姍牛品種特異性SNP 位點及功能基因的GO 分析
目前揚州大學(xué)牛遺傳資源與健康養(yǎng)殖創(chuàng)新團隊聯(lián)合江蘇銀寶光明牧業(yè)有限公司,將培育具有自主知識產(chǎn)權(quán)的優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)、適應(yīng)性廣的本土化娟姍牛新品系確定為長三角地區(qū)娟姍牛群體選育目標(biāo),并以此設(shè)計選育方案,大致分為5 個步驟:①完善娟姍牛群體的生產(chǎn)性能測定流程,持續(xù)采集娟姍牛體型及系譜等數(shù)據(jù)信息,以此確定娟姍牛各項性狀的遺傳特征,并基于此制定奶牛娟姍牛品種標(biāo)準(zhǔn)及體型測定標(biāo)準(zhǔn),規(guī)范表型信息的采集;②建立娟姍?;蚪M數(shù)據(jù)庫,估計乳脂率、乳蛋白率、體細(xì)胞評分、305d 產(chǎn)奶量、初產(chǎn)日齡、產(chǎn)犢間隔和體況評分等性狀的遺傳參數(shù),評估群體現(xiàn)有育種水平;③結(jié)合娟姍牛的現(xiàn)有育種水平及本土化選育目標(biāo),制定娟姍牛群體選擇指數(shù),進(jìn)而評估出所有青年母牛個體的綜合育種值,選留高產(chǎn)奶量、高乳脂率、高乳蛋白和適應(yīng)性廣的娟姍牛群體;④結(jié)合超數(shù)排卵和胚胎移植技術(shù),進(jìn)一步加快群體的選擇進(jìn)展;⑤持續(xù)開展選種選配,控制近交系數(shù),研發(fā)娟姍牛飼養(yǎng)管理,繁殖配種、疾病防控等信息化智能管理體系,集成娟姍牛高產(chǎn)高效繁育飼養(yǎng)管理體系,實現(xiàn)娟姍牛在長三角地區(qū)的高水平本土化。
目前,團隊已采集長三角地區(qū)1630 頭娟姍牛群體的體型線性評分?jǐn)?shù)據(jù)及2022 年至今的DHI 數(shù)據(jù),制定了娟姍牛品種標(biāo)準(zhǔn)及體型測定標(biāo)準(zhǔn),組建了1600 頭的參考群體。同時選取了2000 頭以上有完整DHI 記錄(每胎記錄數(shù)不小于6 次)和系譜記錄(可追溯至少3 代)的娟姍牛,采集其血液或尾根部毛囊樣品進(jìn)行100K 芯片基因分型檢測、1×基因組低覆蓋測序、20×基因組測序和RNA-seq 分析,初步構(gòu)建了娟姍牛育種平臺,并完成了所有牛群的各項經(jīng)濟性狀的育種值評估,劃分良種群體600 頭。后續(xù)將以CattleGTEx 提供的參考面板為模板將低覆蓋度測序數(shù)據(jù)和SNP 芯片數(shù)據(jù)填充到全基因組測序水平,并通過全基因組關(guān)聯(lián)分析及比較基因組學(xué)等手段,鑒定并挖掘一批與產(chǎn)奶、體型、繁殖和健康等重要經(jīng)濟性狀的分子調(diào)控元件,加強創(chuàng)新利用,并探究關(guān)鍵位點優(yōu)化基因組預(yù)測的新算法,為后續(xù)育種選擇提供技術(shù)支撐。
奶牛良種是奶業(yè)生產(chǎn)的根基,直接影響到行業(yè)的核心競爭力。長三角地區(qū)娟姍牛群體的良種選育需瞄準(zhǔn)長三角奶業(yè)發(fā)展和市場需求,充分發(fā)揮引進(jìn)品種娟姍牛適應(yīng)性強、生乳品質(zhì)高的特點,制定科學(xué)有效的育種方案。探究娟姍?,F(xiàn)有群體的種質(zhì)性能,研發(fā)基于基因組選擇的育種技術(shù),開展本土化選育,對實現(xiàn)長三角地區(qū)娟姍牛品種的遺傳改良和種質(zhì)資源創(chuàng)新利用具有重要意義,也將為我國奶牛核心種源自主培育提供技術(shù)支撐。