亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        基于轉(zhuǎn)錄組的洋蔥bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族鑒定與生物信息學(xué)分析

        2023-06-30 10:44:44陳微潘美紅惠林沖李威亞郇國(guó)磊何林玉繆美華陳振泰楊海峰
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2023年5期
        關(guān)鍵詞:轉(zhuǎn)錄因子生物信息學(xué)分析洋蔥

        陳微 潘美紅 惠林沖 李威亞 郇國(guó)磊 何林玉 繆美華 陳振泰 楊海峰

        摘要:bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族是真核生物中重要的轉(zhuǎn)錄因子家族,在植物生長(zhǎng)發(fā)育、次生代謝和逆境應(yīng)答中發(fā)揮重要作用。本研究利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)對(duì)洋蔥基因家族成員進(jìn)行篩選和鑒定,并對(duì)家族成員進(jìn)行理化性質(zhì)、保守基序、亞細(xì)胞定位、系統(tǒng)發(fā)育和蛋白互作生物信息學(xué)分析,同時(shí)對(duì)bHLH基因家族在洋蔥幼苗中的表達(dá)情況進(jìn)行分析。結(jié)果表明,從洋蔥轉(zhuǎn)錄組共鑒定到36個(gè)bHLH基因,預(yù)測(cè)編碼蛋白質(zhì)含有的氨基酸數(shù)量為127~610個(gè),且均為親水性蛋白,系統(tǒng)發(fā)育分析表明,洋蔥bHLH基因家族分為12個(gè)亞族,同一亞族的大多數(shù)基因具有相似的保守基序,大多數(shù)bHLH 基因在洋蔥幼苗中表達(dá),不同基因的表達(dá)量水平差異較大。本研究結(jié)果為進(jìn)一步研究洋蔥bHLH 轉(zhuǎn)錄因子家族的生物學(xué)功能奠定了基礎(chǔ)。

        關(guān)鍵詞:洋蔥;bHLH;轉(zhuǎn)錄因子;生物信息學(xué)分析

        中圖分類號(hào):S633.201文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

        文章編號(hào):1002-1302(2023)05-0011-08

        轉(zhuǎn)錄因子是真核生物中重要的調(diào)節(jié)因子,可以與順式元件相互作用,調(diào)節(jié)特定基因的表達(dá),來(lái)響應(yīng)環(huán)境脅迫。bHLH( basic helix-loop-helix)轉(zhuǎn)錄因子家族是植物中最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一[1],具有高度保守的 bHLH 結(jié)構(gòu)域,由大約50~60個(gè)保守氨基酸組成,包含2個(gè)功能區(qū):一個(gè)是N端的堿性氨基酸區(qū),長(zhǎng)度約為15個(gè)氨基酸,另一個(gè)是 HLH 區(qū)[2]。bHLH 蛋白調(diào)節(jié)許多生理過(guò)程,在黃酮類生物合成[3-4]、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)[5]和植物生長(zhǎng)發(fā)育[6-8]等方面發(fā)揮著重要作用。

        隨著不同物種全基因組和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的完成,多個(gè)物種中鑒定到bHLH 基因家族。目前,已從擬南芥[9]、毛竹[10]、胡蘿卜[11]、人參[12]、梨[13]、蘋果[14]、葡萄[15]等植物物種鑒定和分析了大量bHLH基因家族。隨著 bHLH 蛋白功能的確定,bHLH 的分類不斷得到改進(jìn)。根據(jù)序列相似性和進(jìn)化關(guān)系以及結(jié)合 DNA的能力,bHLH通常分為從A到F的6個(gè)主要組[16-17]。

        洋蔥是全球范圍內(nèi)種植的蔬菜之一,具有豐富的營(yíng)養(yǎng)成分,很多國(guó)家視其為一種非常重要的蔬菜。迄今為止,bHLH轉(zhuǎn)錄因子的研究主要在擬南芥、葡萄、水稻等植物中,在洋蔥中未見bHLH轉(zhuǎn)錄因子功能及理化性質(zhì)的報(bào)道。本研究利用洋蔥轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的數(shù)據(jù)庫(kù),在轉(zhuǎn)錄水平上對(duì)bHLH基因家族進(jìn)行鑒定,并對(duì)其基本理化性質(zhì)、保守基序、蛋白互作、系統(tǒng)進(jìn)化以及基因表達(dá)情況等進(jìn)行生物信息學(xué)分析,此外,還篩選到一些可能參與洋蔥黃酮生物合成途徑的bHLH基因,結(jié)果可為洋蔥AcbHLH基因功能的研究提供理論參考。

        1 材料與方法

        1.1 植物材料

        本試驗(yàn)所用的材料來(lái)自江蘇省連云港市農(nóng)業(yè)科學(xué)院東辛基地,在苗期,選取長(zhǎng)勢(shì)相近的3株紫皮洋蔥和3株黃皮洋蔥,選取幼嫩鱗莖的表皮,液氮速凍后,-80 ℃冰箱保存?zhèn)溆茫糜谵D(zhuǎn)錄組測(cè)序(轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)已發(fā)表)。

        1.2 數(shù)據(jù)來(lái)源及bHLH基因的鑒定

        將測(cè)序得到的原始序列進(jìn)行過(guò)濾,去除接頭污染、低質(zhì)量、N比例大于5%的Reads,得到質(zhì)量較高的Clean Reads,利用Trinity軟件對(duì)高質(zhì)量序列進(jìn)行混合組裝,共獲到77 474條Unigene[18]。分別從擬南芥數(shù)據(jù)庫(kù) ( https://www.arabidopsis.org)和水稻數(shù)據(jù)庫(kù)(http://rapdb.dna.affrc.go.jp/download/irgsp1.html)下載擬南芥bHLH家族蛋白序列和水稻bHLH家族蛋白序列。然后使用HMMER 3.0軟件對(duì)獲取的已知bHLH蛋白家族序列構(gòu)建隱馬爾可夫模型,以此模型搜尋洋蔥轉(zhuǎn)錄組所有編碼蛋白序列,找出洋蔥轉(zhuǎn)錄組蛋白序列中潛在的bHLH家族序列。使用BLASTP把洋蔥轉(zhuǎn)錄組所有蛋白的序列比對(duì)獲取的bHLH家族參考序列,e-value設(shè)為1e-10,比對(duì)上的序列用作候選的bHLH家族序列。

        1.3 bHLH 生物信息學(xué)分析

        利用在線軟件ExPASy-ProtParam(http://web.expasy.org/protparam/)對(duì)洋蔥bHLH蛋白序列的氨基酸數(shù)目、分子量、等電點(diǎn)、不穩(wěn)定系數(shù)等理化性質(zhì)進(jìn)行預(yù)測(cè)。利用MEME軟件(http://meme.nbcr.net/meme)分析洋蔥bHLH家族的保守基序,保守基序的數(shù)目選擇15,其他參數(shù)均采用默認(rèn)值。利用ProtComp(http://www.softberry.com/berry.phtml?topic=protcomppl&group=programs &subgroup=proloc)網(wǎng)站對(duì)洋蔥 bHLH家族成員的亞細(xì)胞定位進(jìn)行預(yù)測(cè)。

        1.4 洋蔥bHLH 基因的系統(tǒng)發(fā)育

        構(gòu)建方法:用MAFFT進(jìn)行多序列比對(duì),然后用MEGA6.0軟件對(duì)鑒定得到的洋蔥、擬南芥的bHLH蛋白家族序列構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。使用鄰接法(neighbor-joining)和P-distance 模型構(gòu)建進(jìn)化樹,校驗(yàn)參數(shù)Bootstrap設(shè)置為重復(fù)1 000次。

        1.5 洋蔥bHLH 蛋白功能聯(lián)系網(wǎng)絡(luò)

        利用 String 蛋白相互作用的數(shù)據(jù)庫(kù)(http://string-db.org/)分析洋蔥bHLH 蛋白的互作網(wǎng)絡(luò),以模式植物擬南芥作為參考物種。

        1.6 洋蔥bHLH 基因的表達(dá)分析

        利用洋蔥轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)分析bHLH基因的表達(dá)特征。以FPKM 值表示轉(zhuǎn)錄本豐度,通過(guò)對(duì)數(shù)據(jù)均一化處理,利用Heml 工具做熱圖。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 洋蔥bHLH 基因家族的鑒定及理化性質(zhì)分析

        為了從洋蔥轉(zhuǎn)錄組中獲得bHLH家族基因,使用擬南芥和水稻的bHLH蛋白序列進(jìn)行隱馬爾可夫模型和BLASTP搜索,對(duì)獲得的候選序列利用軟件pfamscan和Pfam A數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)目標(biāo)序列進(jìn)行結(jié)構(gòu)域注釋,確定將只含有保守結(jié)構(gòu)域bHLH 基序(PF00010)的序列作為最終的bHLH序列,最終獲得36個(gè)bHLH基因,根據(jù)轉(zhuǎn)錄組編號(hào)順序?qū)⑵涿麨锳cbHLH1~AcbHLH36(表1)。

        對(duì)洋蔥36 個(gè)bHLH基因編碼蛋白質(zhì)的基本理化性質(zhì)進(jìn)行分析(表1),結(jié)果顯示,bHLH 基因編碼的氨基酸數(shù)目為127~610個(gè),平均長(zhǎng)度為297個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)其相對(duì)分子量大小為14 718.73~66 957.14 u;等電點(diǎn)在4.84~9.44范圍內(nèi)。從整體看,有67%的洋蔥bHLH家族蛋白質(zhì)等電點(diǎn)小于7,等電點(diǎn)處于酸性范圍內(nèi),蛋白質(zhì)分子含有豐富的酸性氨基酸。蛋白質(zhì)疏水性分析結(jié)果表明,洋蔥中36個(gè)bHLH家族蛋白總平均親水性均小于0,說(shuō)明該家族蛋白質(zhì)均屬于親水性蛋白質(zhì),但是不同蛋白質(zhì)之間親水性存在差異。不穩(wěn)定指數(shù)在38.84~80.53之間,其中94.44%是不穩(wěn)定蛋白(Ⅱ>40),只有2個(gè)屬于穩(wěn)定蛋白(Ⅱ<40),脂肪系數(shù)介于55.70~94.32之間。亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,AcbHLH1等27個(gè)蛋白定位于細(xì)胞核,其余的9個(gè)定位于細(xì)胞外。

        2.2 洋蔥bHLH蛋白保守基序分析

        洋蔥bHLH蛋白中的保守基序用在線軟件MEME分析(圖1),結(jié)果表明,36個(gè)bHLH基因家族成員中保守基序的數(shù)目及種類有差異,除AcbHLH5外, 所有的bHLH都含有基序motif 1和motif 2, 而且motif1和motif2 總是相鄰,二者共同構(gòu)成了bHLH 結(jié)構(gòu)域。9個(gè)成員含有motif 3,6個(gè)成員基序數(shù)目和構(gòu)成一樣,都是motif 1、motif 2 和motif 4,AcbHLH8、AcbHLH12、AcbHLH33和AcbHLH34含有7個(gè)基序,是基序最多的bHLH蛋白。

        2.3 洋蔥bHLH 蛋白家族進(jìn)化關(guān)系分析

        對(duì)擬南芥的bHLH蛋白序列和篩選的36條洋蔥bHLH蛋白序列構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖2)。根據(jù)擬南芥中bHLH 轉(zhuǎn)錄因子的分類系統(tǒng)和洋蔥bHLH轉(zhuǎn)錄因子的進(jìn)化樹分類情況,36個(gè)bHLH可以劃分為12個(gè)亞族,其中數(shù)量最多的是H亞族,共13個(gè),J亞族含有的bHLH數(shù)量次之,有9個(gè),A、C、E和G亞族僅含有1個(gè)bHLH。

        2.4 洋蔥bHLH蛋白互作關(guān)系

        利用在線軟件STRING,預(yù)測(cè)洋蔥bHLH家族成員在擬南芥中同源蛋白的互作關(guān)系(圖3、圖4)。

        結(jié)果顯示,洋蔥bHLH家族成員和多個(gè)蛋白相互作用。其中光敏色素互作蛋白PIL5和PIF3共同作用來(lái)調(diào)節(jié)光形態(tài)發(fā)生。

        2.5 洋蔥bHLH基因家族表達(dá)分析

        利用洋蔥(紫皮和黃皮)的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù),找到候選的 36個(gè)bHLH基因?qū)?yīng)轉(zhuǎn)錄本的RPKM 值,通過(guò)對(duì)RPKM 值取對(duì)數(shù)值轉(zhuǎn)換,利用Heml 熱圖軟件作熱圖(圖5)。結(jié)果顯示,36個(gè)bHLH基因在紫皮和黃皮洋蔥中展現(xiàn)出不同的表達(dá)水平,AcbHLH7、AcbHLH32、AcbHLH33、AcbHLH22、AcbHLH6、AcbHLH35、AcbHLH5、AcbHLH19和AcbHLH26在紫皮洋蔥中的表達(dá)量較高。

        3 討論與結(jié)論

        作為植物中最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,bHLH基因家族在植物的生長(zhǎng)發(fā)育、新陳代謝以及應(yīng)對(duì)脅迫方面起著重要的作用?;谌蚪M研究的深入,越來(lái)越多物種的bHLH基因家族被陸續(xù)鑒定出來(lái),其中擬南芥中鑒定出162個(gè)bHLH基因[19],水稻中167個(gè),番茄中152個(gè)[20],葡萄中發(fā)現(xiàn)94個(gè)bHLH基因[15],黃花蒿中鑒定出99個(gè)bHLH基因[21],桃中有95個(gè)bHLH基因[22],陳紅霖等從綠豆轉(zhuǎn)錄組中鑒定到122個(gè)bHLH轉(zhuǎn)錄因子[23],Zhu等在龍血樹中發(fā)現(xiàn)了62個(gè)bHLH基因[24]。因?yàn)槿狈蚪M,目前尚未見洋蔥bHLH 基因家族鑒定及其功能分析的報(bào)道,本研究利用洋蔥幼苗轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù),對(duì)洋蔥中bHLH基因家族成員進(jìn)行鑒定,并對(duì)AcbHLH基因家族中各蛋白的基本理化性質(zhì)、保守基序、亞細(xì)胞定位、系統(tǒng)進(jìn)化、基因表達(dá)等方面進(jìn)行了分析,為bHLH基因家族成員在結(jié)構(gòu)和功能以及基因表達(dá)調(diào)控等方面的研究提供參考。

        通過(guò)分析鑒定,去除冗余,在洋蔥中鑒定出36個(gè)bHLH基因家族成員,根據(jù)轉(zhuǎn)錄組編號(hào)順序,將洋蔥36個(gè)bHLH基因分別命名為AcbHLH1~AcbHLH36。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組在洋蔥中鑒定到的bHLH蛋白數(shù)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于擬南芥、水稻和番茄中bHLH蛋白數(shù)量,這種情況可能與洋蔥基因組數(shù)據(jù)未獲得和轉(zhuǎn)錄組取樣時(shí)期有關(guān),又或者測(cè)序組裝的條件限制有尚未發(fā)現(xiàn)的洋蔥bHLH基因家族成員。

        洋蔥中36個(gè)bHLH基因的保守基序利用線軟件 MEME進(jìn)行分析,共找到15個(gè)高度保守基序,motif 1和motif 2 幾乎存在于所有的AcbHLH 蛋白中,它們總是彼此相鄰,共同構(gòu)成bHLH 結(jié)構(gòu)域,具有相似motif組成的洋蔥bHLH基因家族成員在聚類分析中距離較近,推測(cè)這些bHLH 保守基序在同一亞家族具有保守性及功能獨(dú)特性,而其他的保守基序也在每個(gè)亞家族發(fā)揮著不同的功能。

        擬南芥和洋蔥bHLH蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化結(jié)果表明,36個(gè)bHLH劃分為12個(gè)亞族,而擬南芥、水稻中的bHLH蛋白被劃分為21、22個(gè)亞族[24-25],由于目前對(duì)洋蔥bHLH蛋白的功能了解較少,無(wú)法更深入的分析其原因。

        目前,對(duì)洋蔥bHLH基因家族的研究遠(yuǎn)不如擬南芥、水稻等植物深入,bHLH 轉(zhuǎn)錄因子可以作為轉(zhuǎn)錄激活因子或抑制因子,在代謝和發(fā)育過(guò)程中起重要作用[26]。在擬南芥中已對(duì)大多數(shù)鑒定的 bHLH 蛋白進(jìn)行了功能鑒定。如轉(zhuǎn)錄因子PIF3 作為光感受器信號(hào)的直接光敏色素反應(yīng)伙伴,參與控制光調(diào)節(jié)基因的表達(dá)[9]。花青素是類黃酮中最大的一類[27],是最重要的次級(jí)代謝產(chǎn)物之一。相關(guān)研究表明,MYB 和 WD40 轉(zhuǎn)錄因子可以與 bHLH 相互作用,參與花青素和黃酮醇的生物合成。bHLH2 和 bHLH46 在龍血樹中可能參與茉莉酸(JA)調(diào)節(jié)的黃酮類生物合成[28]。本研究中,通過(guò)網(wǎng)絡(luò)共表達(dá)發(fā)現(xiàn)bHLH 轉(zhuǎn)錄因子PIF3與HY5相互作用,HY5在花青素的合成中具有一定的作用,因此,推測(cè)PIF3可能在洋蔥花青素的合成中起到一定的作用,但具體的作用仍需進(jìn)一步驗(yàn)證。

        由于缺少基因組,目前在洋蔥分子生物學(xué)方面的研究相對(duì)滯后,未見洋蔥中bHLH 家族基因的報(bào)道,對(duì)該家族基因的功能和分類還缺乏系統(tǒng)深入的研究。本研究通過(guò)對(duì)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序得到的洋蔥bHLH家族基因進(jìn)行鑒定,并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)、保守基序、系統(tǒng)進(jìn)化分析以及基因表達(dá)分析,為進(jìn)一步篩選洋蔥bHLH家族基因,揭示該家族基因參與植物生長(zhǎng)發(fā)育的調(diào)控機(jī)制奠定理論基礎(chǔ)。

        參考文獻(xiàn):

        [1]Hong Y Q,Ahmad N,Tian Y Y,et al. Genome-wide identification,expression analysis,and subcellular localization of Carthamus tinctorius bHLH transcription factors[J]. International Journal of Molecular Sciences,2019,20(12):3044.

        [2]Wang J Y,Hu Z Z,Zhao T M,et al. Genome-wide analysis of bHLH transcription factor and involvement in the infection by yellow leaf curl virus in tomato (Solanum lycopersicum)[J]. BMC Genomics,2015,16(1):1-14.

        [3]Xu W J,Dubos C,Lepiniec L. Transcriptional control of flavonoid biosynthesis by MYB-bHLH-WDR complexes[J]. Trends in Plant Science,2015,20(3):176-185.

        [4]Zhao M,Li J,Zhu L,et al. Identification and characterization of MYB-bHLH-WD40 regulatory complex members controlling anthocyanidin biosynthesis in blueberry fruits development[J]. Genes,2019,10(7):496.

        [5]Zhu E G,You C J,Wang S S,et al. The DYT1-interacting proteins bHLH010,bHLH089 and bHLH091 are redundantly required for Arabidopsis anther development and transcriptome[J]. The Plant Journal,2015,83(6):976-990.

        [6]Lu R,Zhang J,Liu D,et al. Characterization of bHLH/HLH genes that are involved in brassinosteroid (BR) signaling in fiber development of cotton (Gossypium hirsutum)[J]. BMC Plant Biology,2018,18(1):304.

        [7]Xing B C,Yang D F,Yu H Z,et al. Overexpression of SmbHLH10 enhances tanshinones biosynthesis in Salvia miltiorrhiza hairy roots[J]. Plant Science,2018,276:229-238.

        [8]Zhu Z G,Liang H L,Chen G P,et al. The bHLH transcription factor SlPRE2 regulates tomato fruit development and modulates plant response to gibberellin[J]. Plant Cell Reports,2019,38(9):1053-1064.

        [9]Toledo-Ortiz G,Huq E,Quail P H. The Arabidopsis basic/Helix-loop-Helix transcription factor family[J]. The Plant Cell,2003,15(8):1749-1770.

        [10]Cheng X R,Xiong R,Liu H L,et al. Basic helix-loop-helix gene family:genome wide identification,phylogeny,and expression in Moso bamboo[J]. Plant Physiology and Biochemistry,2018,132:104-119.

        [11]Chen Y Y,Li M Y,Wu X J,et al. Genome-wide analysis of basic helix-loop-helix family transcription factors and their role in responses to abiotic stress in carrot[J]. Molecular Breeding,2015,35(5):125.

        [12]Chu Y,Xiao S M,Su H,et al. Genome-wide characterization and analysis of bHLH transcription factors in Panax ginseng[J]. Acta Pharmaceutica Sinica B,2018,8(4):666-677.

        [13]Jin C,Huang X S,Li K Q,et al. Overexpression of a bHLH1 transcription factor of Pyrus ussuriensis confers enhanced cold tolerance and increases expression of stress-responsive genes[J]. Frontiers in Plant Science,2016,7:441.

        [14]Mao K,Dong Q L,Li C,et al. Genome wide identification and characterization of apple bHLH transcription factors and expression analysis in response to drought and salt stress[J]. Frontiers in Plant Science,2017,8(12):480.

        [15]Wang P F,Su L,Gao H H,et al. Genome-wide characterization of bHLH genes in grape and analysis of their potential relevance to abiotic stress tolerance and secondary metabolite biosynthesis[J]. Frontiers in Plant Science,2018,9:64.

        [16]Atchley W R,F(xiàn)itch W M. A natural classification of the basic helix-loop-helix class of transcription factors[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,1997,94(10):5172-5176.

        [17]Simionato E,Ledent V,Richards G,et al. Origin and diversification of the basic helix-loop-helix gene family in metazoans:insights from comparative genomics[J]. BMC Evolutionary Biology,2007,7:33.

        [18]陳 微,潘美紅,惠林沖,等. 洋蔥轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及黃酮類化合物合成相關(guān)基因的分析[J/OL].分子植物育種:1-6[2022-10-17].http://kns.cnki.net/kcms/detail/46.1068.S.20210816.1540.010.html.

        [19]Carretero-Paulet L,Galstyan A,Roig-Villanova I,et al. Genome-wide classification and evolutionary analysis of the bHLH family of transcription factors in Arabidopsis,poplar,rice,moss,and algae[J]. Plant Physiology,2010,153(3):1398-1412.

        [20]Sun H,F(xiàn)an H J,Ling H Q. Genome-wide identification and characterization of the bHLH gene family in tomato[J]. BMC Genomics,2015,16(1):9.

        [21]甘 雨,吳 端,張 棟,等. 黃花蒿bHLH轉(zhuǎn)錄因子基因家族鑒定及光調(diào)控分析[J]. 中國(guó)現(xiàn)代中藥,2021,23(3):441-452.

        [22]Zhang C H,F(xiàn)eng R C,Ma R J,et al. Genome-wide analysis of basic helix-loop-helix superfamily members in peach[J]. PLoS One,2018,13(4):e0195974.

        [23]陳紅霖,胡亮亮,王麗俠,等. 綠豆bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定與生物信息學(xué)分析[J]. 植物遺傳資源學(xué)報(bào),2017,18(6):1159-1167.

        [24]Zhu J H,Xia D N,Xu J,et al. Identification of the bHLH gene family in Dracaena cambodiana reveals candidate genes involved in flavonoid biosynthesis[J]. Industrial Crops and Products,2020,150:112407.

        [25]Heim M A. The basic helix-loop-helix transcription factor family in plants:a genome-wide study of protein structure and functional diversity[J]. Molecular Biology and Evolution,2003,20(5):735-747.

        [26]Li X X,Duan X P,Jiang H X,et al. Genome-wide analysis of basic/helix-loop-helix transcription factor family in rice and Arabidopsis[J]. Plant Physiology,2006,141(4):1167-1184.

        [27]Feller A,Machemer K,Braun E L,et al. Evolutionary and comparative analysis of MYB and bHLH plant transcription factors[J]. The Plant Journal,2011,66(1):94-116.

        [28]Welch C R,Wu Q L,Simon J E. Recent advances in anthocyanin analysis and characterization[J]. Current Analytical Chemistry,2008,4(2):75-101.

        收稿日期:2022-04-21

        基金項(xiàng)目:江蘇省農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新資金[編號(hào):CX(20)3164];連云港市財(cái)政專項(xiàng)(編號(hào):QNJJ2005)。

        作者簡(jiǎn)介:陳 微(1990—),女,山東菏澤人,碩士,助理研究員,主要從事蔬菜育種和栽培研究。E-mail:1135050599@qq.com。

        通信作者:楊海峰,副研究員,主要從事蔬菜育種和栽培研究。E-mail:13775492959@163.com。

        猜你喜歡
        轉(zhuǎn)錄因子生物信息學(xué)分析洋蔥
        洋蔥寫檢討
        切洋蔥
        雷公藤貝殼杉烯酸氧化酶基因的全長(zhǎng)cDNA克隆與表達(dá)分析
        NF—κB信號(hào)通路抗肝纖維化的研究進(jìn)展
        羊種布氏桿菌3型Omp25基因序列及其表達(dá)蛋白生物信息學(xué)分析
        西藏牦牛NGB基因克隆及生物信息學(xué)分析
        植物Trihelix轉(zhuǎn)錄因子家族的分類、結(jié)構(gòu)和功能研究進(jìn)展
        轉(zhuǎn)錄因子Foxd3、Sox2在宮頸上皮內(nèi)瘤樣病變中的表達(dá)臨床意義
        地黃纖維素合酶基因的克隆與生物信息學(xué)分析
        剝開心的洋蔥
        亚洲乱码av中文一区二区第八页| 97se在线观看| 国产chinese在线视频| 亚洲一区二区视频免费看| 国产亚洲视频在线播放| 亚洲国产成人精品无码一区二区| 一本一本久久a久久精品| 亚洲一区二区av偷偷| 国产成人精品人人做人人爽97| 精品久久人妻av中文字幕| 少妇人妻偷人精品无码视频| 日韩人妻无码精品系列专区无遮| 亚洲中文字幕一区二区在线| 午夜免费视频| 精品国产亚洲AⅤ麻豆| 免费人成黄页网站在线观看国内| 中文字幕中文字幕在线中二区| 丰满人妻一区二区三区视频53| 国产久视频国内精品999| 国产啪啪视频在线观看| 成人影片麻豆国产影片免费观看| 国产高清在线精品一区| 91精品久久久久含羞草| 日本免费播放一区二区| 精品精品国产自在97香蕉| 亚洲av之男人的天堂| 亚洲一区二区三区偷拍自拍| 国产精品内射久久一级二| 国产熟人av一二三区| 国产av专区一区二区三区| 中文字幕有码在线人妻| 又色又爽又高潮免费视频国产| 综合网自拍| 91青青草视频在线播放| 日韩在线永久免费播放| 精品国产18久久久久久| 人妻少妇精品一区二区三区| 日韩av一区二区三区激情在线| 永久免费av无码入口国语片| 国产精品久久婷婷婷婷| 成av人片一区二区久久|