豆 玲
(甘肅省動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心,甘肅 蘭州730046)
布魯氏菌主要侵害動(dòng)物生殖系統(tǒng),引起流產(chǎn),而病原體能夠以精液、流產(chǎn)胎衣、乳腺分泌液等排出,人是終末宿主。目前,動(dòng)物布魯氏菌病的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)主要以RBPT和SAT等2種免疫學(xué)方法檢測(cè)為主。上述兩種方法抗原與血清用量較大,易感染人,且SAT檢測(cè)時(shí)間相對(duì)較長(zhǎng),現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)難以實(shí)現(xiàn)。人類通過(guò)直接或間接接觸炭疽芽孢桿菌可引起傳染,對(duì)畜牧業(yè)的發(fā)展和公共衛(wèi)生安全亦具有嚴(yán)重威脅。炭疽主要以細(xì)菌和血清檢測(cè)為主,細(xì)菌學(xué)檢測(cè)操作復(fù)雜,費(fèi)時(shí)費(fèi)力,存在一定的生物安全風(fēng)險(xiǎn)。血清學(xué)檢測(cè)目前尚無(wú)商品化診斷試劑盒,因而僅限于一些專門的實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行。牛結(jié)核病目前以皮內(nèi)變態(tài)反應(yīng)診斷為主。該方法費(fèi)時(shí),操作難度大,必須進(jìn)行現(xiàn)場(chǎng)操作,誤差大,假陽(yáng)性較多。甘肅省歷來(lái)就是布病、炭疽、結(jié)核病的頻發(fā)地區(qū)。因此,尋求并建立一種簡(jiǎn)單,迅速,系統(tǒng)準(zhǔn)確的檢測(cè)方法,是保障畜牧業(yè)發(fā)展以及人類健康的迫切需要。PCR方法具有很高的檢出率,并且克服了常規(guī)方法耗時(shí)的缺點(diǎn),被廣泛應(yīng)用于動(dòng)物疫病診斷中。本研究通過(guò)建立可一次性檢測(cè)三種病原的三重PCR檢測(cè)方法,并通過(guò)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證該方法靈敏度高、特異性強(qiáng)、重復(fù)性好,為動(dòng)物及動(dòng)物產(chǎn)品混合病菌的快速診斷提供了技術(shù)支撐。
1.1.1 菌株 結(jié)核病、布魯氏菌病陽(yáng)性滅活菌、炭疽芽孢疫苗來(lái)源同文后參考文獻(xiàn)第二和第九條提供的出處。
1.1.2 主要試劑 所購(gòu)買試劑同文后參考文獻(xiàn)第二和第九條提供的出處。
1.1.3 主要儀器 小型高速離心機(jī)(sigma)、梯度PCR儀(德國(guó)Biometra T1)、凝膠成像處理系統(tǒng)(UVIvpro)等。
1.2.1 設(shè)計(jì)與合成引物 布氏菌序列為BM21、結(jié)核菌序列為IS6110、炭疽質(zhì)粒PXO1,利用Primer6.0軟件,設(shè)計(jì)三對(duì)特異性引物,由上海生工生物合成,其堿基序列、序列與擴(kuò)增產(chǎn)物長(zhǎng)度見表1。
表1 多重 PCR 引物
1.2.2 細(xì)菌基因組DNA的提取 對(duì)布魯氏菌液、炭疽芽孢疫苗和結(jié)核桿菌液進(jìn)行滅活后各取100 μL,用一管式口腔拭子試劑盒提取模板DNA。
1.2.3 擴(kuò)增目的基因片段 以提取的三種模板DNA,進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng),對(duì)擴(kuò)增后的產(chǎn)物進(jìn)行2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),并使用棋盤法對(duì)反應(yīng)條件進(jìn)行優(yōu)化,篩選出最適合的擴(kuò)增程序見表2。
表2 多重 PCR 反應(yīng)程序
1.2.4 對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行鑒定 回收電泳產(chǎn)物,參照文后參考文獻(xiàn)第二和第九條〗中提供的方法進(jìn)行鑒定。對(duì)陽(yáng)性菌株進(jìn)行測(cè)序,并與在GenBank已登錄的序列進(jìn)行比對(duì),根據(jù)同源性高低來(lái)鑒定PCR產(chǎn)物的正確性。
1.2.5 特異性試驗(yàn) 建立好的三重PCR方法,對(duì)常見的巴氏桿菌、沙門氏菌等基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,比對(duì)特異性。
1.2.6 敏感性試驗(yàn) 測(cè)定標(biāo)準(zhǔn)陽(yáng)性DNA濃度,對(duì)其按10倍倍比稀釋后進(jìn)行PCR方法檢測(cè)。
1.2.7 多重PCR檢測(cè)方法的臨床應(yīng)用 對(duì)臨床上采集的23份病料進(jìn)行多重PCR方法檢測(cè),并與常規(guī)檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行比較,計(jì)算其符合率。符合率=(陽(yáng)性數(shù)/總數(shù))×100%
單一PCR產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳可見,退火溫度在56℃時(shí),PCR擴(kuò)增出布魯氏菌核酸DNA約255 bp,炭疽桿菌核酸DNA約329 bp,結(jié)核桿菌核酸DNA約129 bp三條特異性目的片段,大小與預(yù)期相符(如圖1),確定了三重PCR的擴(kuò)增條件為:預(yù)變性95℃5min,變性94℃ 30S,退火56℃ 30S,延伸72℃ 60S,共35個(gè)循環(huán),72℃終延伸7 min。
M:DNA標(biāo)準(zhǔn)物;1:結(jié)核;2:布氏菌;3:炭疽
分析結(jié)果顯示,PCR陽(yáng)性質(zhì)粒與參照的炭疽、布氏菌、結(jié)核的苷酸序列同源性在98.0%以上,表明產(chǎn)物為預(yù)期擴(kuò)增的目的片段。
用建立的三重PCR方法檢測(cè)三種基因組DNA,均能擴(kuò)增出相應(yīng)的特異性目的條帶,但對(duì)巴氏桿菌、沙門氏菌以及鏈球菌混合作為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,均未檢測(cè)到任何擴(kuò)增產(chǎn)物,從而證實(shí)了所建多重PCR方法具有很好的特異性。結(jié)果如圖2所示。
M:DNA標(biāo)準(zhǔn)物;1:炭疽、布魯氏菌、結(jié)核菌;2:沙門氏菌、巴氏桿菌;3:鏈球菌、結(jié)核桿菌;4:巴氏桿菌、布魯氏菌;5:炭疽桿菌、鏈球菌;6:布氏菌、結(jié)核桿菌、沙門氏菌;7:炭疽桿菌、布魯氏菌、巴氏桿菌;8:炭疽桿菌、鏈球菌、結(jié)核桿菌;9:沙門氏菌、巴氏桿菌、鏈球菌;10:鏈球菌、沙門氏菌
對(duì)三種病菌的濃度進(jìn)行測(cè)定,再分別進(jìn)行10倍梯度的倍比稀釋,經(jīng)多重PCR方法擴(kuò)增凝膠電泳結(jié)果如圖3所示,該多重PCR方法對(duì)三種病菌的敏感性分別可達(dá)313fg/μL、345fg/μL以及322fg/μL以下。
M:DNA標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì); 1:未稀釋;2:10倍稀釋;3:102倍稀釋;4:103倍稀釋;5: 104倍稀釋;6: 105倍稀釋7:106倍稀釋
對(duì)倍比稀釋的三種DNA梯度重復(fù)檢測(cè)5次,并對(duì)相同樣品分別進(jìn)行5次三PCR與單一PCR擴(kuò)增檢測(cè),所有檢測(cè)結(jié)果一致。
對(duì)三重PCR擴(kuò)增產(chǎn)物同源性進(jìn)行分析比較,可達(dá)99%~100%,充分證明了該三重PCR方法的可靠性。
用建立的多重PCR檢測(cè)臨床上的23份病料,其結(jié)果如圖4。第7、16、20號(hào)三重PCR檢測(cè)結(jié)果樣品為陽(yáng)性,這與布病試管凝集試驗(yàn)檢測(cè)結(jié)果符合率為100%;第20、22、23、24號(hào)樣品多重PCR檢測(cè)結(jié)果試驗(yàn)呈陽(yáng)性,與PPD結(jié)果符合率為100%;同時(shí)第20號(hào)臨床病料布魯氏菌核酸和結(jié)核桿菌核酸雙重陽(yáng)性。
M:DNA 標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì); 1:炭疽桿菌、布魯氏菌、結(jié)核桿菌;2~24:臨床病料
布病、炭疽、結(jié)核這三種人獸共患病不但給甘肅省養(yǎng)殖畜牧業(yè)的發(fā)展帶來(lái)威脅與巨大的損失,且對(duì)人類的健康威脅嚴(yán)重。病原的分離鑒定培養(yǎng)或者傳統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)耗時(shí)長(zhǎng),操作繁瑣,單一PCR方法具有特異性強(qiáng)的特點(diǎn),但是對(duì)多種病毒混合感染的鑒定不能實(shí)現(xiàn)。
本研究通過(guò)優(yōu)化PCR擴(kuò)增程序,建立三重PCR方法,通過(guò)試驗(yàn)均顯示檢測(cè)結(jié)果準(zhǔn)確可靠??梢淮涡钥焖贆z測(cè)鑒別布氏菌病、炭疽和結(jié)核三種病原體,這對(duì)于鑒別診斷臨床多種病原體混合感染的病料上具有獨(dú)特優(yōu)勢(shì)和實(shí)用價(jià)值。在采樣時(shí)僅用采集鼻腔棉拭子,相比于傳統(tǒng)的采集發(fā)病動(dòng)物血清和組織樣本的生物安全風(fēng)險(xiǎn)較低,并能夠較好的避免獸醫(yī)工作人員感染上述人獸共患病。