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        結(jié)直腸癌中SAA2表達(dá)與腫瘤免疫微環(huán)境的關(guān)系

        2023-01-17 11:55:50張新燕劉英香趙國棟中南大學(xué)湘雅醫(yī)學(xué)院附屬海口醫(yī)院海口市人民醫(yī)院肛腸科???/span>570208
        中國免疫學(xué)雜志 2022年20期
        關(guān)鍵詞:水平分析研究

        張新燕 劉英香 趙國棟(中南大學(xué)湘雅醫(yī)學(xué)院附屬海口醫(yī)院,海口市人民醫(yī)院肛腸科,???570208)

        血清淀粉樣蛋白2(serum amyloid A2,SAA2)是急性時(shí)相蛋白(serum amyloid A,SAA)的一種,其他亞 型 包 括SAA1、SAA3和SAA4。SAA1、SAA2和SAA3作為急性響應(yīng)蛋白在體內(nèi)炎癥調(diào)節(jié)等方面發(fā)揮功能[1-3]。越來越多的研究表明,在機(jī)體遭受急性損傷等情況下,SAA1、SAA2和SAA3會(huì)大量表達(dá),而SAA4則是以持續(xù)激活的形式表達(dá)[4]。目前的研究發(fā)現(xiàn),SAA1、SAA2和SAA3蛋白可作為急性炎癥和組織損傷的重要生物標(biāo)志物,在病毒、細(xì)菌感染、關(guān)節(jié)炎、克羅恩病等疾病中發(fā)揮輔助診斷作用[5-7]。近年來,SAA1在惡性腫瘤中的研究獲得了很大關(guān)注。有研究發(fā)現(xiàn)血清中SAA1可作為胃癌、胰腺癌、乳腺癌和肺癌的生物標(biāo)志物,且其表達(dá)水平與疾病的發(fā)展 進(jìn) 程 密 切 相 關(guān)[8-10]。然 而 關(guān) 于SAA2、SAA3和SAA4亞型在腫瘤中的作用尚不明確。根據(jù)已有報(bào)道,SAA2與SAA1的序列同源性較高,因此本研究聚焦SAA2在結(jié)直腸癌中的表達(dá)和臨床意義。SAA2在結(jié)直腸癌中的表達(dá)及其與結(jié)直腸癌腫瘤免疫微環(huán)境的關(guān)系尚未見報(bào)道。本研究從SAA2在結(jié)直腸癌腫瘤組織中的表達(dá)水平入手,分析SAA2表達(dá)水平對(duì)結(jié)直腸癌患者預(yù)后的影響。同時(shí)SAA2作為重要的免疫調(diào)節(jié)分子,本研究也進(jìn)一步闡述了其與結(jié)直腸癌腫瘤免疫微環(huán)境的聯(lián)系,為開發(fā)新的結(jié)直腸癌治療靶點(diǎn)提供重要參考。

        1 材料與方法

        1.1材料RIPA組織裂解液、蛋白酶抑制劑及羊抗兔過氧化物酶(HRP)標(biāo)記的二抗購自碧云天生物科技公司;SAA2抗體(13192-1-AP)及內(nèi)參抗體GAPDH購自武漢三鷹生物科技有限公司。將TCGA數(shù)據(jù)庫中275例結(jié)直腸癌腫瘤標(biāo)本和349例癌旁正常組織和基因組織表達(dá)(genotype-tissue expression,GTEx)結(jié)腸組織納入本研究;將Oncomine數(shù)據(jù)庫中65對(duì)結(jié)直腸癌腫瘤組織和癌旁正常組織納入本研究。4例結(jié)直腸癌腫瘤組織和癌旁正常組織采集于??谑腥嗣襻t(yī)院,患者均簽署知情同意書。組織標(biāo)本取材于術(shù)中,將組織儲(chǔ)存于超低溫冰箱。

        1.2方法

        1.2.1基因表達(dá)分析 利用公共腫瘤數(shù)據(jù)庫TCGA和Oncomine分析結(jié)直腸癌腫瘤組織和癌旁正常組織中SAA2基因表達(dá)水平。TCGA數(shù)據(jù)分析在GEPIA工具中完成[11],基因相對(duì)表達(dá)水平采用Log處理,以TPM+1表示(TPM:transcript per million)。正常組織由癌旁正常組織及GTEx正常組織共同組成。首先在Oncomine數(shù)據(jù)庫輸入SAA2基因,選擇Cancer type為colorectal cancer,分析類型設(shè)置為cancervsnormal,分析出Gaedcke colorectal數(shù)據(jù)集[12]中SAA2在腫瘤組織中的表達(dá)是癌旁正常組織的8.446倍。1.2.2Western blot收集的結(jié)直腸癌組織樣本儲(chǔ)存于超低溫冰箱,經(jīng)液氮速凍后進(jìn)行研磨,加入RIPA蛋白裂解液,冰上裂解30 min。離心取上清,測定蛋白濃度,加入蛋白上樣buffer,100℃煮10 min后置于冰上。行8%的SDS-PAGE凝膠電泳,轉(zhuǎn)至PVDF膜,采用5%脫脂奶粉室溫封閉1 h,4℃過夜孵育一抗,TBST清洗3次后,室溫孵育二抗1 h,采用ECL系統(tǒng)進(jìn)行蛋白顯影成像。采用Quantity One軟件進(jìn)行蛋白表達(dá)水平的半定量分析。

        1.2.3患者生存期分析 在Human protein Altas工具中分析TCGA結(jié)直腸癌數(shù)據(jù)[13]。首先輸入目的基因,選擇病理組織類型為colorectal,將具有臨床隨訪信息的159例結(jié)直腸癌患者納入分析,以SAA2和SAA1基因的中位數(shù)表達(dá)水平為截?cái)嘀担瑢?59例結(jié)直腸癌患者分為高表達(dá)組和低表達(dá)組,其中SAA2高表達(dá)組119例,低表達(dá)組40例,SAA1高表達(dá)組80例,低表達(dá)組有79例。采用Log-rank法進(jìn)行生存曲線的統(tǒng)計(jì)分析。

        1.2.4結(jié)直腸癌中腫瘤免疫得分相關(guān)性分析 利用TCGA結(jié)直腸癌數(shù)據(jù),采用CIBERSORT法分析SAA2基因表達(dá)水平與腫瘤組織中腫瘤純度得分(estimate score)相關(guān)性、腫瘤免疫得分(immune score)相關(guān)性及腫瘤組織中基質(zhì)得分(stromal score)相關(guān)性,相關(guān)性分析采用Spearman法[14]。

        1.2.5結(jié)直腸癌腫瘤中基因相關(guān)性分析 在TISIDB腫瘤免疫交互系統(tǒng)工具中輸入SAA2基因名,選擇immunoinhibitors進(jìn)行相關(guān)性分析,相關(guān)性分析采用Spearman法[15]。

        1.2.6基因富集分析 根據(jù)TCGA結(jié)直腸癌數(shù)據(jù)中SAA2基因表達(dá)中位數(shù)分為高表達(dá)組和低表達(dá)組,采用Gene Set Enrichment Analysis(GSEA)法進(jìn)行SAA2的基因富集分析,基因集數(shù)據(jù)庫選擇c2.cp.kegg.v7.1.gmt,number of permutations設(shè)置為1 000,phenotype labels設(shè)置為lowvshigh,富集統(tǒng)計(jì)采 用weighted模 式,metric for ranking genes選 擇Signal2Noise,最小基因集設(shè)置為15,最大基因集設(shè)置為500。

        1.2.7組織中基因水平檢測12例結(jié)直腸癌標(biāo)本的總RNA采用Trizol試劑盒提取,得到的總RNA采用反轉(zhuǎn)錄第一鏈cDNA合成試劑盒進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄,然后采用熒光定量PCR檢測SAA2、CD274和PDCD1的相對(duì)表達(dá)水平。SAA2正向引物:5'-GCTTCTTTTCGTTCCTTGGCG-3',反向引物:5'-GCCGATGTAATTGGCTTCTCTCA-3';CD274正向引物:5'-GCTGCACTAATTGTCTATTGGGA-3',反向引物:5'-AATTCGCTTGTAGTCGGCACC-3';PDCD1正 向 引 物:5'-CCAGGATGGTTCTTAGACTCCC-3',反 向 引 物:5'-TTTAGCACGAAGCTCTCCGAT-3'。

        1.3統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用Graphpad Prism軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)繪圖,以±s展示數(shù)據(jù)。兩組間表達(dá)差異采用Student'st檢驗(yàn),以Spearman法進(jìn)行相關(guān)性分析;總生存期分析采用Kaplan-Meier法進(jìn)行Log-rank統(tǒng)計(jì)。P<0.05表示差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1SAA2基因在結(jié)直腸癌腫瘤組織中高表達(dá) 在GEPIA工具中分析TCGA結(jié)直腸癌數(shù)據(jù),其中結(jié)直腸癌腫瘤組織275例,癌旁組織和GTEx正常組織349例,SAA2基因在結(jié)直腸癌腫瘤組織中的表達(dá)水平顯著高于正常組織(P<0.001,圖1A)。進(jìn)一步在Oncomine腫瘤數(shù)據(jù)庫中分析,結(jié)果表明,相對(duì)于癌旁正常組織,腫瘤組織中SAA2表達(dá)水平顯著升高(8.446倍,P<0.001,圖1B)。而SAA1在結(jié)直腸癌腫瘤組織中表達(dá)雖然有所升高,但不顯著(圖1C),且生存分析曲線也表明SAA1的表達(dá)水平對(duì)結(jié)直腸癌患者預(yù)后無明顯影響(P=0.89,圖1D)。

        圖1 結(jié)直腸癌腫瘤組織中SAA2基因高表達(dá)Fig.1 SAA2 gene is highly expressed in colorectal tumor tissues

        2.2結(jié)直腸癌腫瘤組織中SAA2蛋白高表達(dá)4例結(jié)直腸癌手術(shù)切除標(biāo)本,包括對(duì)應(yīng)癌旁正常組織,Western blot結(jié)果表明SAA2蛋白在結(jié)直腸癌腫瘤組織中的表達(dá)高于癌旁正常組織,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001,圖2)。

        圖2 結(jié)直腸癌腫瘤組織中SAA2蛋白表達(dá)高于癌旁組織Fig.2 Protein expression of SAA2 was higher in colorectal tumor tissues than normal tissues

        2.3結(jié)直腸癌中SAA2高表達(dá)患者生存期下降 由圖3可知,119例SAA2高表達(dá)組結(jié)直腸癌患者生存期顯著低于SAA2低表達(dá)組患者(P<0.05)。SAA2高表達(dá)組中94例存活,25例死亡,而SAA2低表達(dá)組中39人存活,僅1人死亡,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01,表1)。

        表1 結(jié)直腸癌中SAA2表達(dá)水平與總生存期的關(guān)系Tab.1 Association between SAA2 and overall survival time in colorectal cancer

        圖3 結(jié)直腸癌腫瘤組織高表達(dá)SAA2的患者生存期差Fig.3 Higher SAA2 expression of colorectal cancer patients showed worse survival rate

        2.4結(jié)直腸癌中SAA2表達(dá)與腫瘤免疫浸潤微環(huán)境緊密相關(guān) 結(jié)直腸癌中SAA2表達(dá)水平與腫瘤組織中腫瘤純度的相關(guān)性分析顯示,兩者具有顯著的正相關(guān)關(guān)系(R=0.214,P=3.72e-06,圖4A),說明隨著腫瘤組織中腫瘤純度提高,SAA2表達(dá)升高,進(jìn)一步驗(yàn)證了SAA2在結(jié)直腸癌腫瘤組織中高表達(dá)。對(duì)腫瘤組織中浸潤的免疫細(xì)胞進(jìn)行免疫得分分析,發(fā)現(xiàn)SAA2與結(jié)直腸癌腫瘤組織中免疫得分呈正相關(guān)(R=0.346,P=2.63e-14,圖4B)。然而SAA2表達(dá)與結(jié)直腸癌中基質(zhì)得分差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(R=0.074,P=0.111,圖4C),說明結(jié)直腸癌中SAA2與腫瘤免疫浸潤微環(huán)境緊密相關(guān)。

        圖4 結(jié)直腸癌腫瘤中SAA2與免疫浸潤微環(huán)境緊密相關(guān)Fig.4 SAA2 was closely associated with immune infiltration microenvironment in colorectal cancer

        2.5結(jié)直腸癌中SAA2具有潛在的腫瘤免疫抑制功能 如圖5所示,結(jié)直腸癌腫瘤組織中SAA2的表達(dá)與CD274、CD244、CTLA4、LAG3、PDCD1、IL-10、ADORA2A、TIGIT、BTLA4和CD160等免疫抑制性分子均呈正相關(guān),提示結(jié)直腸癌中SAA2具有潛在的腫瘤免疫抑制功能。

        圖5 結(jié)直腸癌中SAA2具有潛在的腫瘤免疫抑制功能Fig.5 SAA2 has potential regulation function of tumor immune suppression in colorectal cancer

        2.6結(jié)直腸癌組織中SAA2與CD274和PDCD1呈正相關(guān) 分析12例結(jié)直腸癌組織中SAA2與CD274和PDCD1表達(dá)的相關(guān)性,進(jìn)一步驗(yàn)證SAA2與腫瘤免疫抑制分子的相關(guān)性,結(jié)果顯示,12例結(jié)直腸癌組織中SAA2與CD274和PDCD1的表達(dá)相關(guān)性較強(qiáng),相關(guān)系數(shù)分別為0.93和0.90(P<0.001,圖6),進(jìn)一步驗(yàn)證了結(jié)直腸癌中SAA2與免疫抑制分子的正相關(guān)關(guān)系。

        圖6 結(jié)直腸癌腫瘤中SAA2與CD274和PDCD1表達(dá)的相關(guān)性Fig.6 Correlation between SAA2 and CD274 and PDCD1 expression in colorectal cancer

        2.7結(jié)直腸癌中高表達(dá)的SAA2可能參與抗腫瘤免疫調(diào)節(jié)信號(hào)通路負(fù)反饋調(diào)節(jié) 進(jìn)一步基因富集分析顯示,結(jié)直腸癌高表達(dá)的SAA2與趨化因子信號(hào)通路和細(xì)胞因子受體相互作用網(wǎng)絡(luò)均呈明顯的負(fù)相關(guān)(圖7A、B),結(jié)直腸癌中SAA2表達(dá)與自然殺傷細(xì)胞介導(dǎo)的細(xì)胞毒作用及抗原呈遞信號(hào)網(wǎng)絡(luò)也呈負(fù)相關(guān)(圖7C、D)。而這些信號(hào)通路在抗腫瘤免疫功能的調(diào)控中均發(fā)揮重要作用,因此結(jié)直腸癌中高表達(dá)的SAA2可能參與抗腫瘤免疫調(diào)節(jié)信號(hào)通路負(fù)反饋調(diào)節(jié)。

        圖7 結(jié)直腸癌中SAA2可能參與抗腫瘤免疫調(diào)節(jié)信號(hào)通路負(fù)反饋調(diào)節(jié)Fig.7 SAA2 may involve in negative regulation of antitumor immune-regulation signaling pathways

        3 討論

        SAA2是最重要的急性時(shí)相蛋白之一,在病毒和細(xì)菌感染、自體免疫性疾病,如關(guān)節(jié)炎、紅斑狼瘡等疾病中均發(fā)揮重要調(diào)節(jié)功能[2,9]。目前的研究進(jìn)展顯示,SAA2作為SAA重要的成員之一,也能夠發(fā)揮生物標(biāo)志物作用,在疾病的診斷和輔助治療方面發(fā)揮重要作用[1,6,8]。近年來,關(guān)于SAA2在腫瘤中的研究也獲得了越來越多的關(guān)注,SAA2在結(jié)直腸癌中的表達(dá)和功能仍不十分明確。同時(shí),考慮到SAA2在免疫炎癥方面的重要調(diào)節(jié)作用,而炎癥免疫功能紊亂是結(jié)直腸癌炎-癌轉(zhuǎn)化等過程中的一大特點(diǎn),本研究進(jìn)一步分析了結(jié)直腸癌中SAA2表達(dá)與腫瘤免疫調(diào)節(jié)微環(huán)境間的潛在聯(lián)系。

        本研究首先明確SAA2在結(jié)直腸癌中的表達(dá)水平,發(fā)現(xiàn)在結(jié)直腸癌腫瘤組織中,SAA2無論在基因水平還是蛋白水平均呈高表達(dá)。既往研究發(fā)現(xiàn),作為急性時(shí)相蛋白的SAA2在急性炎癥反應(yīng)和組織損傷的情況下表達(dá)上調(diào),進(jìn)而介導(dǎo)免疫炎癥信號(hào)網(wǎng)絡(luò)調(diào)節(jié),那么在結(jié)直腸癌中呈高表達(dá)狀態(tài)的SAA2又具有怎樣的生物學(xué)功能呢?為解決這一問題,本研究通過分析結(jié)直腸癌患者的生存期,闡述SAA2表達(dá)對(duì)結(jié)直腸癌患者生存期的影響。結(jié)果表明,高表達(dá)SAA2的結(jié)直腸癌患者生存期短,提示在結(jié)直腸癌中高表達(dá)的SAA2具有成為結(jié)直腸癌預(yù)后標(biāo)志物的可能。既往研究也證實(shí)結(jié)腸癌患者血清中SAA2作為診斷標(biāo)志物具有較好的診斷特異性和敏感度,即使在早期診斷方面也表現(xiàn)出較好的診斷效率[16-17]。本研究進(jìn)一步豐富了SAA2在結(jié)直腸癌患者預(yù)后方面的意義,為結(jié)直腸癌的診斷和治療提供臨床參考意見。本研究還發(fā)現(xiàn)SAA1雖然在結(jié)直腸癌中的表達(dá)有所升高,但不如SAA2明顯,且SAA1表達(dá)水平對(duì)患者的生存期無明顯影響,進(jìn)一步突出了SAA2在結(jié)直腸癌中的研究價(jià)值。有研究利用免疫組化檢測結(jié)直腸癌組織中SAA1高表達(dá),并闡述其與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移、TNM分期和生存期顯著相關(guān)[18]。由于SAA1蛋白具有分泌功能,因此其不僅以蛋白組織表達(dá)形式存在,還存在分泌形式。本研究以基因水平為切入點(diǎn)分析,在一定程度上概括了其分泌型和組織表達(dá)型兩種模式,進(jìn)一步豐富了既往研究結(jié)果。

        既往研究明確了腫瘤基質(zhì)作為腫瘤復(fù)雜的微環(huán)境因素,介導(dǎo)腫瘤的發(fā)生發(fā)展[19],同時(shí),基于SAA2在免疫調(diào)節(jié)方面的重要作用及腫瘤免疫微環(huán)境對(duì)結(jié)直腸癌腫瘤進(jìn)展的重要影響,本研究進(jìn)一步分析了結(jié)直腸癌中SAA2表達(dá)水平與腫瘤免疫浸潤間的聯(lián)系,SAA2與腫瘤組織中腫瘤純度及浸潤的免疫細(xì)胞均呈顯著正相關(guān),而與腫瘤組織中基質(zhì)無明顯相關(guān)性。大量研究表明腫瘤組織的免疫浸潤與腫瘤免疫耐受緊密相關(guān),而SAA2與結(jié)直腸癌腫瘤組織中免疫浸潤得分顯著相關(guān),表明SAA2可能參與結(jié)直腸癌免疫抑制微環(huán)境的調(diào)控。而關(guān)于SAA2在機(jī)體免疫調(diào)控方面的報(bào)道顯示,SAA2在機(jī)體炎癥應(yīng)激條件下可介導(dǎo)TNF-α等促炎基因表達(dá),然而其具體分子機(jī)制還有待進(jìn)一步深入探究[20]。

        炎癥是腫瘤微環(huán)境最重要的一方面[19],因此本研究通過分析結(jié)直腸癌腫瘤組織中SAA2與系列免疫抑制性分子的相關(guān)性,發(fā)現(xiàn)SAA2與CD274、CD244、CTLA4、LAG3、PDCD1、IL10、ADORA2A、TIGIT、BTLA4和CD160等經(jīng)典免疫抑制性因子均呈正相關(guān)。本研究還進(jìn)一步在12例結(jié)直腸癌組織標(biāo)本中驗(yàn)證了SAA2與CD274和PDCD1的正相關(guān)關(guān)系,揭示SAA2可能具有潛在的腫瘤免疫抑制功能,而GSEA基因聚類分析也進(jìn)一步說明結(jié)直腸癌中SAA2與趨化因子信號(hào)通路、細(xì)胞因子受體相互作用網(wǎng)絡(luò)、自然殺傷細(xì)胞介導(dǎo)的細(xì)胞毒作用及抗原呈遞信號(hào)通路均呈負(fù)相關(guān),而這些信號(hào)通路在腫瘤免疫功能維持、免疫耐受產(chǎn)生等過程中均發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)功能,以上結(jié)果提示結(jié)直腸癌中高表達(dá)的SAA2可能參與抗腫瘤免疫調(diào)節(jié)信號(hào)通路負(fù)反饋調(diào)節(jié),進(jìn)而促進(jìn)結(jié)直腸癌腫瘤進(jìn)展,提示結(jié)直腸癌患者的不良預(yù)后。

        綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)SAA2在結(jié)直腸癌中高表達(dá),且其高表達(dá)與腫瘤免疫浸潤,特別是免疫抑制性分子緊密相關(guān),進(jìn)而在參與結(jié)直腸癌的發(fā)展過程中影響結(jié)直腸癌患者的預(yù)后水平。

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