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        環(huán)紋奧斯特線蟲(chóng)PCR-ELISA快速檢測(cè)方法的建立

        2023-01-08 05:44:56李永光文育勝劉雯雯趙濤魏芳祁光宇
        關(guān)鍵詞:奧斯特包被重復(fù)性

        李永光,文育勝,劉雯雯,趙濤,魏芳,祁光宇

        (1.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)應(yīng)用技術(shù)學(xué)院,甘肅 定西 730500;2.甘肅省定西市臨洮農(nóng)業(yè)學(xué)校,甘肅 定西 730500;3.中農(nóng)威特生物科技股份有限公司,甘肅 蘭州 730046)

        奧斯特線蟲(chóng)主要分布在溫帶和氣溫較涼爽的地區(qū),主要感染牛、綿羊、山羊和其他家養(yǎng)和野生反芻動(dòng)物,也可以感染人。給養(yǎng)殖業(yè)帶來(lái)巨大的經(jīng)濟(jì)損失,并且危害人類身體健康[1-2]。奧斯特線蟲(chóng)通常和東方毛圓線蟲(chóng)、捻轉(zhuǎn)血矛線蟲(chóng)、羊仰口線蟲(chóng)、甘肅食道口線蟲(chóng)等消化道線蟲(chóng)混合感染,對(duì)上述消化道線蟲(chóng)的診斷,具有重要的經(jīng)濟(jì)學(xué)意義[3]。傳統(tǒng)上對(duì)線蟲(chóng)的診斷主要依靠第3階段幼蟲(chóng)(L3)的孵化和其形態(tài)差別,費(fèi)時(shí)費(fèi)力[4-6],且特異性和敏感性較低[7-8],傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)方法對(duì)形態(tài)相似的蟲(chóng)種進(jìn)行鑒別存在較大的局限性。電鏡雖可以將不同蟲(chóng)種準(zhǔn)確區(qū)分,但需要專業(yè)人員,成本高,不適用于大樣本研究[9]。奧斯特線蟲(chóng)寄生于牛羊皺胃和十二指腸,糞便抗原免疫學(xué)檢測(cè)可以作為其診斷方法之一,Agneessens等2001年建立了一種關(guān)于胃部感染線蟲(chóng)檢測(cè)糞便蟲(chóng)體抗原的捕獲ELISA方法,敏感性較好,但是特異性較差,很難在臨床上應(yīng)用[10]。奧斯特線蟲(chóng)蟲(chóng)卵隨牛羊糞便排出體外,糞便蟲(chóng)卵檢測(cè)在一定程度上可以對(duì)奧斯特線蟲(chóng)感染做出定性診斷[11]。為克服形態(tài)學(xué)和免疫學(xué)診斷的局限性,分子生物學(xué)方法已經(jīng)用于小反芻動(dòng)物[12-15]和牛[16-18]的重要胃腸道線蟲(chóng)的鑒別診斷。

        PCR-ELISA方法具有更快的診斷速度和更高的靈敏度,為寄生蟲(chóng)的鑒別診斷、分類和流行病學(xué)調(diào)查提供了簡(jiǎn)便的方法[19-20]。目前該方法已經(jīng)廣泛應(yīng)用于動(dòng)植物檢疫、醫(yī)學(xué)、食品等多個(gè)學(xué)科[21-24]。核糖體DNA中介于5.8S,18S和28S之間的內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS),包括ITS-1和ITS-2 2段序列,由于ITS區(qū)受到的選擇壓力較小,進(jìn)化速度快且長(zhǎng)度不大,加上協(xié)同進(jìn)化使該片段在基因組不同單元間極其一致,且5.8S,18S和28S rDNA的高度保守,便于設(shè)計(jì)引物進(jìn)行動(dòng)物寄生蟲(chóng)的種間以及株間的分類鑒定,可以利用ITS的基因結(jié)構(gòu)特點(diǎn)建立特異的檢測(cè)方法[25-26]。因此,本研究以環(huán)紋奧斯特線蟲(chóng)的ITS-2為靶基因,通過(guò)條件篩選,旨在建立環(huán)紋奧斯特線蟲(chóng)PCR-ELISA的快速檢測(cè)方法,為臨床環(huán)紋奧斯特線蟲(chóng)病的批量診斷服務(wù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 試驗(yàn)樣品環(huán)紋奧斯特線蟲(chóng)、東方毛圓線蟲(chóng)、捻轉(zhuǎn)血矛線蟲(chóng)、羊仰口線蟲(chóng)、甘肅食道口線蟲(chóng)由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蘭州獸醫(yī)研究所家畜寄生蟲(chóng)病創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)提供。

        1.1.2 試劑與耗材鏈霉親和素和辣根過(guò)氧化物酶標(biāo)記的抗地高辛抗體購(gòu)于Sigma公司;BSA、TMB顯色液購(gòu)于Solarbio公司;質(zhì)粒提取試劑盒和膠回收試劑盒購(gòu)于OMEGA公司;pMD 19-T載體和DNA提取試劑盒購(gòu)于Takara公司;引物由生工生物工程(上海)股份有限公司;其余試劑均為化學(xué)分析純。

        PCR儀購(gòu)于Bio-Rad公司;電泳儀、電泳槽及凝膠成像儀購(gòu)于北京六一生物科技有限公司。

        1.2 方法

        1.2.1 引物設(shè)計(jì)與合成根據(jù)GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)檢索到的Ostertagia circumcincta間隔區(qū)ITS-2基因序列,在NCBI對(duì)ITS-2基因序列進(jìn)行比對(duì),用Oligo 6引物分析軟件,設(shè)計(jì)1對(duì)特異性引物。引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。

        1.2.2 樣品寄生蟲(chóng)DNA提取及環(huán)紋奧斯特線蟲(chóng)ITS-2基因PCR產(chǎn)物克隆鑒定、測(cè)序取1.1.1中的環(huán)紋奧斯特線蟲(chóng)、東方毛圓線蟲(chóng)、捻轉(zhuǎn)血矛線蟲(chóng)、羊仰口線蟲(chóng)、甘肅食道口線蟲(chóng)樣品,按TaKaRa DNA提取試劑盒操作步驟提取上述寄生蟲(chóng)基因組DNA,4℃保存?zhèn)溆?。用設(shè)計(jì)合成的引物對(duì)環(huán)紋奧斯特線蟲(chóng)的基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,反應(yīng)程序:95℃預(yù)變性5 min;95℃變性30 s,57℃退火30 s,72℃延伸30 s,35個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。將回收后的DNA連接到載體pMD 19-T構(gòu)建pMD 19-T-ITS-2質(zhì)粒。將鑒定為陽(yáng)性的質(zhì)粒送生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行序列測(cè)定,對(duì)序列進(jìn)行比對(duì)和分析。

        1.2.3 引物標(biāo)記以及PCR擴(kuò)增在引物的上下游5'端分別標(biāo)記上地高辛(DIG)和生物素(BIO),由生工生物工程(上海)股份有限公司合成1對(duì)PCRELISA所需要的引物。

        反應(yīng)程序:95℃預(yù)變性5 min;95℃變性30 s,57℃退火30 s,72℃延伸30 s,35個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。

        1.3 環(huán)紋奧斯特線蟲(chóng)ITS-2基因PCR-ELISA檢測(cè)方法的建立

        1.3.1 鏈霉親和素最佳包被濃度的確定用0.05 mol/L、pH為9.6的碳酸鹽緩沖液,把鏈霉親和素(1 mg/mL)倍比稀釋為10、5、2.5、1.25、0.625、0.3125、0.156 25 μg/mL,200 μL/孔包被酶標(biāo)板,4℃濕盒過(guò)夜,按照稀釋后的濃度進(jìn)行PCR-ELISA檢測(cè),依據(jù)D450nm以及P/N值確定鏈霉親和素的最佳包被濃度。

        1.3.2 最佳封閉液濃度和封閉時(shí)間的確定按照1.3.1篩選出的鏈霉親和素的最佳包被濃度包被酶標(biāo)板,分別用1%、2%、3%、4%、5%、6%和8%的BSA封閉液封閉,以標(biāo)記引物所擴(kuò)增出的PCR產(chǎn)物作為一抗,用1∶2 000稀釋的HRP標(biāo)記的抗地高辛抗體作為二抗,將封閉時(shí)間設(shè)定為10、20、30、45、60、90、120 min,進(jìn)行PCR-ELISA檢測(cè),確定最佳封閉液濃度和封閉時(shí)間。

        1.3.3 一抗最佳反應(yīng)時(shí)間的確定按照1.3.1和1.3.2篩選出的最佳包被濃度和最佳封閉條件,以標(biāo)記引物所擴(kuò)增出的PCR產(chǎn)物作為一抗,將PCR產(chǎn)物加入酶標(biāo)板的反應(yīng)時(shí)間分別設(shè)定為5、l0、20、30、40、50、60 min,進(jìn)行PCR-ELISA檢測(cè),確定一抗最佳反應(yīng)時(shí)間。

        1.3.4 酶標(biāo)二抗最佳反應(yīng)條件的確定根據(jù)1.3.3篩選出的最佳反應(yīng)條件進(jìn)行PCR-ELISA,將HRP標(biāo)記的抗地高辛抗體(1 mg/mL)按照1∶500依次倍比稀釋至1∶32 000,將二抗反應(yīng)時(shí)間依次設(shè)定為5、l0、20、30、40、50、60 min,根據(jù)結(jié)果確定最佳反應(yīng)條件[27]。

        1.3.5 最佳顯色時(shí)間的確定根據(jù)上述最佳反應(yīng)條件進(jìn)行PCR-ELISA的測(cè)定,37℃條件下,將顯色時(shí)間設(shè)置為1、3、5、10、15、20 min,根據(jù)結(jié)果確定最佳反應(yīng)條件。

        1.3.6 PCR最佳循環(huán)次數(shù)的確定以O(shè)stertagia circumcincta間隔區(qū)ITS-2設(shè)計(jì)的引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,將PCR循環(huán)數(shù)分別設(shè)置為5、10、15、20、25、30和35,進(jìn)行PCR-ELISA檢測(cè),根據(jù)結(jié)果確定最佳循環(huán)次數(shù)。

        1.3.7 PCR-ELISA臨界值的測(cè)定利用建立好的PCR-ELISA檢測(cè)方法,對(duì)己知的42份環(huán)紋奧斯特線蟲(chóng)陰性樣品進(jìn)行檢測(cè),根據(jù)測(cè)得的D450nm值進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。

        1.3.8 敏感性試驗(yàn)用超純水將環(huán)紋奧斯特線蟲(chóng)陽(yáng)性DNA進(jìn)行10倍梯度稀釋,稀釋濃度分別為4.1 ng/μL、410 pg/μL、41 pg/μL、4.1 pg/μL、410 fg/μL、41 fg/μL,按所建立的PCR-ELISA方法進(jìn)行檢測(cè),與常規(guī)PCR作比較,評(píng)價(jià)其敏感性。

        1.3.9 特異性試驗(yàn)對(duì)環(huán)紋奧斯特線蟲(chóng)、東方毛圓線蟲(chóng)、捻轉(zhuǎn)血矛線蟲(chóng)、羊仰口線蟲(chóng)、甘肅食道口線蟲(chóng)基因組DNA,按所建立的PCR-ELISA方法進(jìn)行檢測(cè),評(píng)價(jià)其特異性。

        1.3.10 重復(fù)性試驗(yàn)用同一批次包被的酶標(biāo)板對(duì)環(huán)紋奧斯特線蟲(chóng)病的4份陽(yáng)性樣品和1份陰性樣品進(jìn)行重復(fù)性試驗(yàn),每份樣品重復(fù)檢測(cè)5次,評(píng)價(jià)其批內(nèi)重復(fù)性。用不同批次包被的酶標(biāo)板對(duì)環(huán)紋奧斯特線蟲(chóng)病的4份陽(yáng)性樣品和1份陰性樣品進(jìn)行重復(fù)性試驗(yàn),每份樣品重復(fù)檢測(cè)5次,評(píng)價(jià)其批間重復(fù)性,測(cè)定其D450nm值,計(jì)算變異系數(shù)。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 PCR產(chǎn)物克隆鑒定與測(cè)序

        對(duì)環(huán)紋奧斯特線蟲(chóng)基因組DNA PCR產(chǎn)物和重組克隆質(zhì)粒pMD19-T-ITS-2 PCR產(chǎn)物,用1.5%瓊脂糖凝膠電泳,90 V電壓電泳40 min,均可以檢測(cè)到大小約196 bp的條帶,與預(yù)期大小相符(圖1)。

        圖1 重組質(zhì)粒pMD19-T-ITS-2的PCR鑒定結(jié)果(196 bp)Figure 1 PCR results of pMD19-T-ITS-2 plasmid

        測(cè)序結(jié)果顯示,重組質(zhì)粒pMD19-T-ITS-2基因中的目的基因片段大小為196 bp,與試驗(yàn)預(yù)期結(jié)果相符,其序列與GenBank中己經(jīng)發(fā)表的Osterta?gia circumcincta間隔區(qū)ITS-2基因序列同源性為99%,用BLAST軟件對(duì)序列進(jìn)行分析比對(duì)結(jié)果如圖2所示。

        圖2 重組克隆質(zhì)粒pMD19-T-ITS-2測(cè)序結(jié)果Figure 2 Sequencing results of pMD19-T-ITS-2 plasmid

        2.2 環(huán)紋奧斯特線蟲(chóng)ITS-2基因PCR-ELISA檢測(cè)方法的建立

        2.2.1 鏈霉親和素最佳濃度的確定由表1可知,當(dāng)鏈霉親和素濃度為1.25 μg/mL時(shí),P/N=17.29的值最大,確定鏈霉親和素的最佳包被濃度為1.25 μg/mL。

        表1 鏈霉親和素包被濃度的確定Table 1 Screening of the suitable concentration of streptavidin

        2.2.2 最佳封閉液濃度和封閉時(shí)間的確定由表2可知,當(dāng)封閉液濃度為3%,封閉時(shí)間為30 min時(shí),P/N=14.57值最大,確定BSA封閉液最佳封閉濃度為3%,最佳封閉時(shí)間為30 min。

        表2 封閉液各工作濃度及時(shí)間的確定Table 2 Screening of sealing solution concentration and sealing time

        2.2.3 一抗最佳反應(yīng)時(shí)間的確定由表3可知,當(dāng)PCR產(chǎn)物反應(yīng)20 min時(shí),P/N=20.40值最大,確定一抗反應(yīng)最佳時(shí)間為20 min。

        表3 一抗最佳反應(yīng)時(shí)間的確定Table 3 Screening of the optimum reaction time of pri‐mary antibody

        2.2.4 酶標(biāo)二抗條件的確定由表4可知,當(dāng)HRP標(biāo)記的抗地高辛抗體濃度為1∶2 000,反應(yīng)時(shí)間為20 min時(shí),P/N=14.09值最大,確定二抗最佳稀釋濃度為1∶2 000,最佳反應(yīng)時(shí)間20 min。

        表4 二抗最佳反應(yīng)濃度和反應(yīng)時(shí)間的確定Table 4 Screening of the optimum reaction concentration and time of antibodyⅡ

        2.2.5 最佳顯色時(shí)間的確定根據(jù)上述最佳反應(yīng)條件進(jìn)行PCR-ELISA,由表5可知,當(dāng)顯色時(shí)間為5 min時(shí),P/N=15.50值最大,符合檢測(cè)要求。

        表5 最佳顯色時(shí)間的確定Table 5 Screening of the optimal reactive time of the substrate

        2.2.6 PCR最佳循環(huán)次數(shù)的確定由表6可知,當(dāng)循環(huán)數(shù)為30個(gè)循環(huán)時(shí),P/N值=19.50最大。確定PCR擴(kuò)增的最佳循環(huán)次數(shù)為30個(gè)循環(huán)。

        表6 PCR擴(kuò)增最佳循環(huán)次數(shù)的確定Table 6 Screening of the optimal cycle times for PCR amplification

        2.2.7 PCR-ELISA臨界值的測(cè)定對(duì)42份樣品數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析,根據(jù)SPSS軟件計(jì)算得到平均值X=0.17,標(biāo)準(zhǔn)方差SD=0.05,校正值=X+3SD=0.32,當(dāng)樣品PCR-ELISA檢測(cè)D450nm≥0.32時(shí),判定為環(huán)紋奧斯特線蟲(chóng)陽(yáng)性,當(dāng)D450nm<0.32時(shí),判定為陰性樣本。

        2.2.8 敏感性檢測(cè)由圖3和表8可知,PCRELISA可檢測(cè)出環(huán)紋奧斯特線蟲(chóng)DNA的最低濃度為410 fg/μL,而常規(guī)PCR可以檢測(cè)最低模板濃度為4.1 pg/μL,證明PCR-ELISA的敏感性比常規(guī)PCR高10倍。

        表8 PCR-EL1SA敏感性試驗(yàn)Table 8 The sensitivity test of PCR-ELISA

        圖3 PCR敏感性檢測(cè)Figure 3 The Sensitivity of PCR

        表7 PCR-ELISA臨界值確定Table 7 Determination of PCR-ELISA threshold values

        2.2.9 特異性檢測(cè)用所建立的PCR-ELISA檢測(cè)方法對(duì)奧斯特線蟲(chóng)、東方毛圓線蟲(chóng)、捻轉(zhuǎn)血矛線蟲(chóng)、羊仰口線蟲(chóng)、甘肅食道口線蟲(chóng)DNA進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果如表9所示。奧斯特線蟲(chóng)D450nm為0.36,大于校正值0.32,檢測(cè)結(jié)果為陽(yáng)性,其他病原體D450nm均小于0.32,結(jié)果為陰性。證明本研究建立的PCR-ELISA檢測(cè)方法特異性好,無(wú)交叉反應(yīng)。

        表9 PCR-ELISA特異性試驗(yàn)Table 9 The Specificity test of PCR-ELISA

        2.2.10 重復(fù)性試驗(yàn)用同一批次包被的酶標(biāo)板進(jìn)行批內(nèi)重復(fù)性試驗(yàn),由表10可知,5份樣本的變異系數(shù)分別為4.00%,2.70%,3.00%,5.10%,7.90%,變異系數(shù)均低于8%,說(shuō)明建立的PCR-EL1SA檢測(cè)方法的批內(nèi)重復(fù)性良好。

        表10 PCR-EL1SA批內(nèi)重復(fù)性試驗(yàn)Table 10 The within-run repetive experiments of the PCR-EL1SA

        用同一批次包被的酶標(biāo)板進(jìn)行批間重復(fù)性試驗(yàn),由表11可知,5份樣本的變異系數(shù)分別為3.80%,5.80%,7.10%,4.50%,7.80%,變異系數(shù)均低于10%(表11),說(shuō)明建立的PCR-EL1SA檢測(cè)方法的批內(nèi)重復(fù)性良好。

        表11 PCR-EL1SA批間重復(fù)性試驗(yàn)Table 11 The between-run repetive experiments of the PCR-EL1SA

        3 討論

        PCR-ELISA檢測(cè)是將PCR擴(kuò)增目的基因與ELISA準(zhǔn)確定量相結(jié)合的一種檢測(cè)方法,該方法將PCR檢測(cè)的快速性與ELISA檢測(cè)的敏感性有機(jī)結(jié)合,使生物信號(hào)逐級(jí)放大,具有敏感、特異、可大量檢測(cè)樣品等優(yōu)點(diǎn)[28-30],為醫(yī)療、獸醫(yī)和農(nóng)業(yè)等行業(yè)重要的檢測(cè)方法[31]。該方法可直接通過(guò)讀取D450nm值判斷結(jié)果,減少了人為因素對(duì)結(jié)果的影響,同時(shí)無(wú)需接觸溴化乙錠(EB)致癌物質(zhì),減少了對(duì)試驗(yàn)人員和環(huán)境的潛在危險(xiǎn)。

        本試驗(yàn)對(duì)奧斯特線蟲(chóng)ITS?2基因的保守序列設(shè)計(jì)引物,在上下游引物的5’端分別標(biāo)記生物素和地高辛,利用生物素和鏈霉親和素特異性結(jié)合的原理,帶有標(biāo)記的PCR產(chǎn)物與鏈霉親和素結(jié)合,酶標(biāo)二抗與地高辛結(jié)合。鏈霉素和生物素的結(jié)合能力是普通抗原抗體結(jié)合能力的106倍,“鏈霉親和素-生物素”系統(tǒng)是PCR-ELISA檢測(cè)的最好搭檔[32-35]。通過(guò)對(duì)鏈霉親和素的包被濃度、包被條件、封閉液濃度及封閉時(shí)間、PCR產(chǎn)物反應(yīng)時(shí)間、二抗工作濃度以及反應(yīng)時(shí)間等條件進(jìn)行優(yōu)化,最終篩選出最佳奧斯特線蟲(chóng)PCR-ELISA反應(yīng)條件。

        本試驗(yàn)對(duì)PCR擴(kuò)增的平臺(tái)期摸索確立了最佳循環(huán)次數(shù),分別以5、10、15、20、25、30和35循環(huán)數(shù)進(jìn)行擴(kuò)增并檢測(cè),結(jié)果顯示30個(gè)循環(huán)數(shù)時(shí),擴(kuò)增效率己經(jīng)達(dá)到最高,確定最佳循環(huán)數(shù)為30個(gè)循環(huán),此時(shí)最為省時(shí)高效。同時(shí),在試驗(yàn)過(guò)程中對(duì)各個(gè)反應(yīng)條件進(jìn)行優(yōu)化,最終確定最佳包被條件為1.25 μg/mL的鏈霉親和素4℃包被過(guò)夜,3%的BSA封閉液37℃條件下封閉20 min,PCR產(chǎn)物37℃作用20 min,HRP標(biāo)記的抗地高辛抗體2 000倍稀釋的酶標(biāo)二抗(1 mg/mL)37℃反應(yīng)20 min,顯色5 min。經(jīng)過(guò)條件優(yōu)化,本試驗(yàn)建立的PCR-ELISA檢測(cè)方法比原來(lái)節(jié)省了0.5~1 h左右。

        本試驗(yàn)建立的奧斯特線蟲(chóng)PCR-ELISA可檢測(cè)出樣本的最低濃度為410 fg/μL,而常規(guī)PCR可以檢測(cè)最低模板濃度為4.1 pg/μL,證明PCR-ELISA的敏感性比常規(guī)PCR高10倍,并與東方毛圓線蟲(chóng)、捻轉(zhuǎn)血矛線蟲(chóng)、羊仰口線蟲(chóng)、甘肅食道口線蟲(chóng)無(wú)交叉反應(yīng),說(shuō)明其特異性好。對(duì)相同模板進(jìn)行批間和批內(nèi)重復(fù)性進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果顯示變異系數(shù)均低于10%,說(shuō)明建立的PCR-ELISA方法批內(nèi)批間重復(fù)性良好,證明本試驗(yàn)建立的PCR-ELISA檢測(cè)方法穩(wěn)定性高。本試驗(yàn)所建立的PCR-ELISA檢測(cè)方法具有高效、快速、靈敏、特異、安全等優(yōu)勢(shì),可以快速、準(zhǔn)確的檢測(cè)奧斯特線蟲(chóng),為調(diào)查和預(yù)警提供技術(shù)支持。

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