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        T7噬菌體尾絲蛋白隨機(jī)進(jìn)化文庫(kù)的構(gòu)建

        2022-12-24 07:24:44洪偉鳴李睿婷郭子杰左偉勇
        關(guān)鍵詞:噬菌體文庫(kù)宿主

        洪偉鳴,李睿婷,郭子杰,徐 海,左偉勇,張 亮,宋 亮

        (江蘇農(nóng)牧科技職業(yè)學(xué)院 江蘇省獸用生物制藥高技術(shù)研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,江蘇 泰州 225300)

        噬菌體是一類(lèi)寄生在原核生物,如細(xì)菌、真菌、放線(xiàn)菌或螺旋體等宿主細(xì)胞內(nèi)的病毒,在發(fā)現(xiàn)之初就被用于細(xì)菌感染性疾病的治療[1]。隨著人類(lèi)進(jìn)入抗生素時(shí)代,噬菌體治療逐漸淡出公眾的視野。近年來(lái)由于抗生素的濫用,導(dǎo)致耐藥菌的不斷出現(xiàn),細(xì)菌的耐藥性已然成為全球范圍內(nèi)的公共衛(wèi)生問(wèn)題,噬菌體作為細(xì)菌的天然殺手再次受到關(guān)注[2-3]。

        噬菌體對(duì)其宿主的識(shí)別具有嚴(yán)格的特異性,不同種、甚至不同分離株常常表現(xiàn)出差異較大的噬菌體敏感性[4]。宿主譜較窄已然成為限制噬菌體抗菌發(fā)展與運(yùn)用的主要障礙之一。雞尾酒療法和廣譜噬菌體分離被認(rèn)為是克服這一障礙最為經(jīng)濟(jì)有效的途徑。將不同宿主識(shí)別譜的噬菌體配伍成混合制劑即為雞尾酒療法,格魯吉亞的Eliava噬菌體治療中心已成功運(yùn)用該方法數(shù)十年[5-6]。但該方法也存在一定的被動(dòng)性,Eliava中心需定期更新雞尾酒制劑的噬菌體構(gòu)成,以保證治療針對(duì)性與有效性。隨著分子生物學(xué)技術(shù)、基因編輯以及各種生物組學(xué)的快速發(fā)展,人們對(duì)噬菌體的認(rèn)知已經(jīng)超出形態(tài)學(xué)觀察及生理生化活性鑒定的范疇,逐步從被動(dòng)篩選自然突變株噬菌體,向主動(dòng)改造或創(chuàng)造新噬菌體轉(zhuǎn)變。其中,CRISPR-Cas[6]、Bacteriophage recombinant of electroporated DNA(BRED)[7]等技術(shù)正在被廣泛地用于噬菌體改造。Scholl等[8]通過(guò)基因改造使T7噬菌體能夠表達(dá)一種唾液酸酶,利用該酶消化大腸桿菌產(chǎn)生的K1莢膜,進(jìn)而拓展了T7噬菌體宿主譜。樂(lè)率[9]將PaP1噬菌體的尾絲蛋白替換成JG004噬菌體對(duì)應(yīng)蛋白,使得新構(gòu)建的PaP1噬菌體獲得感染JG004宿主的能力,但喪失對(duì)原有宿主的裂解性。T4噬菌體感染大腸埃希菌以及親緣關(guān)系近的志賀氏菌,Tétart等[10]將噬菌體SV76.3和Mi基因組成的片段置換T4噬菌體尾絲基因的同源結(jié)構(gòu),構(gòu)建的雜合噬菌體不僅能識(shí)別天然宿主,也能夠識(shí)別假結(jié)核耶爾森菌。

        T7噬菌體是侵染大腸埃希菌的小型烈性噬菌體,其病毒顆粒有二十面體頭部和非常小的尾,二者之間由頭尾頸圈連接。T7噬菌體gp17基因編碼533氨基酸的尾絲蛋白(p17),每個(gè)噬菌體含有6條尾絲蛋白(圖1-A),為同源三聚體結(jié)構(gòu),主要負(fù)責(zé)識(shí)別宿主、啟動(dòng)感染。決定T7噬菌體宿主識(shí)別的區(qū)域位于最末端的球狀區(qū),結(jié)構(gòu)學(xué)解析表明,該區(qū)域有4個(gè)暴露的柔性loop環(huán)(BC-、DE-、FG-和HI-loop)(圖1-B),該區(qū)域氨基酸組成的改變導(dǎo)致宿主識(shí)別譜的變化,是主要的宿主識(shí)別區(qū)域[11]。易錯(cuò)PCR(error-prone PCR,EP-PCR)通過(guò)改變常規(guī)PCR的擴(kuò)增條件來(lái)調(diào)整反應(yīng)過(guò)程中的錯(cuò)配頻率,進(jìn)而獲得隨機(jī)突變的DNA群體,其操作簡(jiǎn)便,特別適用于構(gòu)建較小基因片段的突變文庫(kù)。本研究利用EP-PCR技術(shù)對(duì)T7噬菌體尾絲蛋白羧基末端基因序列進(jìn)行隨機(jī)突變,拯救T7噬菌體尾絲蛋白隨機(jī)進(jìn)化文庫(kù),為后續(xù)篩選相對(duì)廣譜噬菌體或者特定病原菌噬菌體奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        噬菌體與質(zhì)粒:T7 Select 415-1b噬菌體(GenBank accession number V01146噬菌體為骨架改造)拯救試劑盒購(gòu)于Merck公司,pMD19-T simple載體購(gòu)于寶生物公司。

        主要試劑:限制性?xún)?nèi)切酶、TaqDNA聚合酶、T4 DNA連接酶、Diversify PCR Random Mutagenesis Kit均為寶生物公司產(chǎn)品;膠回收試劑盒為QIAGEN公司產(chǎn)品;其余試劑均為分析純。

        主要儀器:臺(tái)式離心機(jī)購(gòu)自美國(guó)Beck-man公司;BTX電轉(zhuǎn)化儀、PCR儀購(gòu)自寶生物公司;Geldoc-It Imaging System購(gòu)自美國(guó)UVP公司。

        1.2 T7噬菌體基因組提取與酶切

        采用苯酚-氯仿抽提的方法提取T7噬菌體基因組[12],100 mL T7噬菌體培養(yǎng)液8 000 r·min-1離心15 min,去除裂解細(xì)菌的碎片,收集上清液。加入終濃度為1 μg·mL-1的RNase A、DNaseⅠ,37 ℃反應(yīng)1 h,以1∶4體積比加入PEG-NaCl溶液(20%PEG-8000,2.5 mol·L-1NaCl),搖勻溶解后,放置4 ℃過(guò)夜。次日,12 000 r·min-1離心30 min并收集沉淀。用5 mL SM緩沖溶液重懸沉淀,加入50 μL 10%SDS、50 μL 0.5 mol·L-1EDTA,于60 ℃消化30 min。加入等體積的DNA提取液(苯酚/氯仿/異戊醇體積比 25∶24∶1),抽提2次,轉(zhuǎn)移上清液,加入等體積的乙醇混勻,-20 ℃放置1 h,12 000 r·min-1離心10 min,收集沉淀并用1 mL預(yù)冷的70%乙醇洗滌沉淀2次,12 000 r·min-1離心10 min,棄上清,沉淀于室溫下自然晾干,然后溶于100 μL TE溶液,即為提取的T7噬菌體DNA。取10 μL基因組經(jīng)SfiⅠ單酶切,0.5%瓊脂糖凝膠電泳鑒定后切膠回收約33 kb片段。

        1.3 常規(guī)PCR擴(kuò)增

        以T7噬菌體基因組為模板:用引物F1/R1擴(kuò)增尾絲蛋白羧基末端(Tail fiber carboxy-terminal,TF-ct)33 308~33 663位約350 bp基因序列。反應(yīng)程序?yàn)椋?4 ℃ 30 s;55 ℃ 30 s;72 ℃ 30 s,30個(gè)循環(huán)。在F1引物5′端引入SfiⅠ酶切位點(diǎn),R1引物5′端引入SphⅠ酶切位點(diǎn)。用引物F2/R2擴(kuò)增基因組33 663~37 314位約4 000 bp基因序列。反應(yīng)程序?yàn)椋?4 ℃ 30 s;52 ℃ 45 s;72 ℃ 2 min,30個(gè)循壞,并在F2引物5′端引入SphⅠ酶切位點(diǎn)。PCR產(chǎn)物經(jīng)1.0%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,SphⅠ單酶切4 000 bp片段,切膠回收,-20 ℃保存?zhèn)溆谩R镄蛄幸?jiàn)表1。

        表1 文庫(kù)構(gòu)建及鑒定引物

        1.4 易錯(cuò)PCR擴(kuò)增

        以回收的TF-ct基因片段為模板,用F1/R1引物進(jìn)行EP-PCR擴(kuò)增。反應(yīng)體系為50 μL,其中包含模板(1 ng·μL-1,1 μL)、引物(10 μmol·L-1,1 μL)和TITANIUMTaq酶(1 μL);比較3種緩沖條件(buffer condition,BC)下擴(kuò)增效率和突變率的差異:BC9(buffer,5 μL、8 mmol·L-1Mn2+,4 μL、2 mmol·L-1dGTP,5 μL)、BC6(buffer,5 μL、8 mmol·L-1Mn2+,4 μL、2 mmol·L-1dGTP,2 μL)、BC3(buffer,5 μL、8 mmol·L-1Mn2+,2 μL、2 mmol·L-1dGTP,1 μL)。EP-PCR反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性30 s;94 ℃變性 30 s,68 ℃退火延伸1 min,25個(gè)循環(huán)。1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定EP-PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,并切膠回收。

        1.5 質(zhì)粒文庫(kù)的構(gòu)建

        將突變的TF-ct基因以3∶1的物質(zhì)的量之比與pMD19-T simple連接,轉(zhuǎn)化大腸埃希菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞。轉(zhuǎn)化產(chǎn)物涂布在含有Amp+/IPTG/X-gal LB固體培養(yǎng)基的培養(yǎng)皿上,37 ℃過(guò)夜。統(tǒng)計(jì)菌落總數(shù)和藍(lán)色菌落數(shù),計(jì)算質(zhì)粒文庫(kù)的容量和重組率[13]。質(zhì)粒庫(kù)容量=菌落總數(shù)×轉(zhuǎn)化產(chǎn)物量;重組率(%)=(菌落總數(shù)-藍(lán)色菌落數(shù))/菌落總數(shù)×100。剔除藍(lán)色菌落,收集培養(yǎng)皿中所有菌落,LB液體培養(yǎng)基重懸菌落,提取質(zhì)粒經(jīng)SfiⅠ、SphⅠ雙酶切鑒定,回收350 bp目的片段。

        1.6 噬菌體文庫(kù)的構(gòu)建

        將SfiⅠ單酶切回收的33 kb基因組片段、SfiⅠ和SphⅠ雙酶切回收的隨機(jī)突變TF-ct片段以及SphⅠ單酶切回收的4 000 bp片段以1∶1∶1的物質(zhì)的量之比進(jìn)行連接(圖1-C)。取5 μL連接產(chǎn)物與25 μL包裝蛋白混合,25 ℃反應(yīng)2 h,反應(yīng)體系中加入270 μL LB液體培養(yǎng)基終止反應(yīng),即為拯救的噬菌體文庫(kù)[13]。取5 μL包裝產(chǎn)物10倍梯度稀釋并與200 μL過(guò)夜培養(yǎng)的T7噬菌體宿主細(xì)菌BL21混合,經(jīng)雙層瓊脂夾心法測(cè)定噬菌體滴度;挑取單噬斑,用引物F1/R1進(jìn)行PCR檢測(cè)目的基因插入情況。每組隨機(jī)挑選5個(gè)噬斑PCR陽(yáng)性產(chǎn)物進(jìn)行序列測(cè)定,采用DNAStar序列分析軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行比對(duì)分析。分別統(tǒng)計(jì)目的基因中突變的堿基數(shù)及對(duì)應(yīng)的氨基酸突變數(shù),按照突變率(%)=突變堿基數(shù)(個(gè))/目的基因大小(bp)×100計(jì)算突變率。將剩余的295 μL包裝產(chǎn)物轉(zhuǎn)接100 mL對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期BL21,37 ℃搖床培養(yǎng)3 h至宿主細(xì)菌完全裂解,PEG-NaCl沉淀法回收噬菌體,即為構(gòu)建的T7噬菌體尾絲蛋白隨機(jī)進(jìn)化文庫(kù)。

        圖1 定向進(jìn)化文庫(kù)構(gòu)建原理及流程

        1.7 單克隆噬菌體吸附力比較

        從已測(cè)序的15個(gè)單克隆噬菌體中隨機(jī)挑選EP3、EP6、EP10、EP12和EP13這5個(gè)在loop區(qū)域有點(diǎn)突變的克隆進(jìn)行純培養(yǎng),用于比較宿主吸附能力的差異。將宿主細(xì)菌BL21培養(yǎng)至對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,并在預(yù)熱的LB培養(yǎng)基稀釋至1×107CFU·mL-1。以5 mL每管分裝BL21細(xì)菌,往其中分別接種單克隆噬菌體至濃度為1×105PFU·mL-1,并于37 ℃繼續(xù)孵育5 min。取200 μL孵育混合物立即離心分離游離噬菌體和吸附在BL21表面的噬菌體;另取200 μL孵育混合物不做離心處理。分別測(cè)定離心后上清中游離噬菌體的滴度(Nf)和未離心處理混合物中的噬菌體滴度(Nt)。計(jì)算噬菌體吸附率α=-0.2[ln(Nf/Nt)][14]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 基因片段的制備

        從T7噬菌體培養(yǎng)液中成功提取到高純度T7噬菌體基因,電泳顯示基因組條帶單一、大小符合預(yù)期;經(jīng)SfiⅠ單酶切可將線(xiàn)性T7噬菌體基因組分成約33 kb左側(cè)片段以及約4 000 bp右側(cè)片段(圖2-A)。以提取的基因組為模板,F(xiàn)1/R1引物擴(kuò)增出350 bp的T7噬菌體尾絲蛋白羧基末端基因片段(圖2-B),F(xiàn)2/R2引物擴(kuò)增出尾絲蛋白基因下游約4 000 bp基因片段(圖2-C)。

        A:T7噬菌體基因組提取及酶切;M,DL15000 DNA marker;1,T7噬菌體基因組;2,SfiⅠ單酶切T7噬菌體基因組。B:PCR擴(kuò)增T7噬菌體尾絲蛋白羧基末端基因片段;M,DL2000 DNA marker;1,TF-ct基因片段。C:PCR擴(kuò)增T7噬菌體尾絲蛋白下游末端基因片段;M,DL5000 DNA marker;1,尾絲蛋白下游末端基因片段。

        2.2 TF-ct基因片段的隨機(jī)突變及質(zhì)粒文庫(kù)構(gòu)建

        為了有效擴(kuò)增TF-ct基因片段同時(shí)保證獲得足夠的突變率,根據(jù)突變?cè)噭┖惺褂谜f(shuō)明,選擇3個(gè)緩沖條件進(jìn)行EP-PCR擴(kuò)增。隨著擴(kuò)增體系中Mn2+、dGTP含量的逐漸下降,從圖3-A可以看出,目的條帶的亮度逐漸升高,說(shuō)明下調(diào)擴(kuò)增體系中Mn2+及dGTP的含量有助于提高擴(kuò)增效率。分別回收3個(gè)緩沖條件下擴(kuò)增的TF-ct基因片段,與pMD19-T simple載體連接,轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細(xì)胞,構(gòu)建質(zhì)粒文庫(kù)。提取文庫(kù)質(zhì)粒,經(jīng)SfiⅠ和SphⅠ雙酶切,獲得與預(yù)計(jì)大小相符的目的條帶(圖3-B),說(shuō)明質(zhì)粒文庫(kù)構(gòu)建成功。重復(fù)構(gòu)建質(zhì)粒文庫(kù)3次,其庫(kù)容分別為1.25×107、2.33×107、3.46×107CFU·mL-1,通過(guò)統(tǒng)計(jì)藍(lán)白斑比率發(fā)現(xiàn)3個(gè)質(zhì)粒文庫(kù)的重組率均高達(dá)90%以上。

        A:EP-PCR擴(kuò)增TF-ct 基因片段;M,DL5000 DNA marker;1~3,BC9、BC6和BC3緩沖條件下擴(kuò)增TF-ct基因片段。B:雙酶切鑒定質(zhì)粒文庫(kù);M,DL5000 DNA marker;1~3,BC9、BC6和BC3質(zhì)粒文庫(kù)雙酶切鑒定。

        回收SfiⅠ和SphⅠ雙酶切條帶,用于T7噬菌體尾絲蛋白定向進(jìn)化文庫(kù)的構(gòu)建。

        2.3 隨機(jī)進(jìn)化文庫(kù)的構(gòu)建及鑒定

        按照?qǐng)D1-C中的構(gòu)建流程,將33 kb的T7噬菌體基因左側(cè)片段、3個(gè)質(zhì)粒文庫(kù)中回收的TF-ct片段以及尾絲蛋白下游至基因右側(cè)的片段,以等物質(zhì)的量之比進(jìn)行連接,通過(guò)包裝蛋白包裝拯救T7噬菌體尾絲蛋白隨機(jī)進(jìn)化文庫(kù)。測(cè)定BC9、BC6和BC3噬菌體文庫(kù)的滴度分別為1.37×107、5.52×107和8.26×107CFU·mL-1,并隨機(jī)挑選5個(gè)噬斑進(jìn)行PCR鑒定,從圖4-A可以看出,TF-ct基因均成功插入到設(shè)計(jì)位點(diǎn)。對(duì)15個(gè)PCR產(chǎn)物進(jìn)行序列測(cè)定,通過(guò)與原始序列相比對(duì)發(fā)現(xiàn)(圖4-B),隨機(jī)挑選的15個(gè)克隆均有隨機(jī)突變位點(diǎn),突變率高達(dá)100%。

        A:單克隆噬菌體PCR鑒定;M,DL2000 DNA marker; 1~5,BC9噬菌體文庫(kù);6~10,BC6噬菌體文庫(kù);11~15,BC3噬菌體文庫(kù)T7噬菌體基因組。B:氨基酸序列分析;15個(gè)測(cè)序樣品的氨基酸序列各需相同,且在對(duì)應(yīng)的4個(gè)loop區(qū)域均有氨基酸點(diǎn)突變。

        2.4 不同緩沖條件下突變率的分析

        本研究選擇BC9、BC6和BC3三個(gè)緩沖條件,并依次降低體系中Mn2+和dGTP濃度,從表2可以看出:隨著Mn2+和dGTP濃度的降低,其平均堿基突變數(shù)及對(duì)應(yīng)氨基酸突變數(shù)均同步下降。

        表2 不同BC條件下EP-PCR的突變率統(tǒng)計(jì)

        2.5 尾絲蛋白突變對(duì)吸附能力的影響

        分析已測(cè)序噬菌體單克隆TF-ct氨基酸序列,挑選EP-4(I 517K)、EP-6(K 498 T)、EP-10(S 477 I)、EP-12(K 498 R)和EP-13(G 476 A)5個(gè)在loop區(qū)域有點(diǎn)突變的單克隆進(jìn)行純培養(yǎng)。通過(guò)測(cè)定突變株T7噬菌體吸附大腸埃希菌宿主能力,評(píng)價(jià)尾絲蛋白羧基末端loop區(qū)域氨基酸突變對(duì)T7噬菌體生物學(xué)功能的影響。以T7-wt作為對(duì)照,比較吸附能力,從圖5可以看出,EP-6、EP-12對(duì)應(yīng)于DE loop的突變降低了噬菌體與宿主的吸附能力,而EP-10、EP-13對(duì)應(yīng)于BC loop的突變,僅EP-13提高了噬菌體與宿主的吸附能力。

        以T7-wt標(biāo)準(zhǔn)株為參照,比較5株尾絲蛋白點(diǎn)突變T7噬菌體吸附宿主大腸埃希菌的效率差異,相同字母標(biāo)記表示差異不顯著,不同字母標(biāo)記表示差異顯著(P<0.05)。

        3 結(jié)論與討論

        自然進(jìn)化往往是隨機(jī)的過(guò)程,而實(shí)現(xiàn)進(jìn)化的兩個(gè)前提是突變與篩選。定向進(jìn)化則是人為設(shè)定標(biāo)準(zhǔn)的選擇,很早就被運(yùn)用于動(dòng)植物的育種篩選。針對(duì)特定蛋白分子的體外定向進(jìn)化,又被稱(chēng)為實(shí)驗(yàn)分子進(jìn)化,無(wú)需事先了解蛋白的空間結(jié)構(gòu)和作用機(jī)制,幾乎適用于任何蛋白質(zhì)的分子改造和篩選,這為研究蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能提供了一種更為方便、快捷的途徑。定向進(jìn)化的成功實(shí)現(xiàn),需要滿(mǎn)足3個(gè)方面的條件:合理的進(jìn)化策略、合適的表達(dá)系統(tǒng)以及高通量篩選方法[15]。

        在分子生物學(xué)飛速發(fā)展的今天,定向進(jìn)化的先驅(qū)們建立了許多經(jīng)典的進(jìn)化策略和技術(shù),例如Leung團(tuán)隊(duì)建立的EP-PCR技術(shù)[16]、Willem教授建立的DNA Shuffling[17]技術(shù)以及Miguel Alcalde開(kāi)發(fā)的MORPHING[18]技術(shù)等,為定向進(jìn)化研究提供了技術(shù)保證。其中,EP-PCR技術(shù)是在常規(guī)PCR基礎(chǔ)上演化而來(lái)的,是在擴(kuò)增過(guò)程中引入錯(cuò)誤配對(duì),使得擴(kuò)增產(chǎn)物出現(xiàn)數(shù)量眾多的點(diǎn)突變,是一種體外誘導(dǎo)DNA序列突變的高效方法。擴(kuò)增過(guò)程中DNA聚合酶保真性、4種dNTP比例、Mg2+離子濃度、Mn2+離子濃度、模板濃度等都是影響錯(cuò)配率的關(guān)鍵因素,優(yōu)化EP-PCR條件可以確保獲得隨機(jī)度更高的擴(kuò)增產(chǎn)物。本研究中通過(guò)采用3種不同濃度的Mn2+、dGTP進(jìn)行EP-PCR擴(kuò)增,獲得3個(gè)不同突變率的目的片段,從而使尾絲蛋白羧基末端的突變子覆蓋最適合的范圍,提高了后期文庫(kù)篩選的得率。

        從自然界中篩選相對(duì)廣譜的噬菌體是一項(xiàng)長(zhǎng)期且艱巨的工作,而噬菌體宿主識(shí)別譜較窄的特性更是給這項(xiàng)工作增加了難度[19]。T7噬菌體通過(guò)尾絲蛋白與宿主細(xì)菌表面LPS相作用,每條尾絲獨(dú)立結(jié)合LPS能力很弱且可逆,這樣使得T7噬菌體能沿著細(xì)菌表面滑動(dòng);只有當(dāng)多條尾絲和LPS相互作用后才能使噬菌體在細(xì)菌表面穩(wěn)定定植,此時(shí)基盤(pán)正對(duì)細(xì)菌外膜,這種初步吸附使信號(hào)從噬菌體底部傳遞到頭部,從而啟動(dòng)感染的不可逆步驟。決定T7噬菌體宿主識(shí)別的區(qū)域位于尾絲蛋白最末端的第4個(gè)球狀區(qū),結(jié)構(gòu)學(xué)解析表明,該區(qū)域有4個(gè)暴露的柔性loop環(huán),是主要的宿主識(shí)別區(qū)域。Heineman等[20]發(fā)現(xiàn)T7噬菌體p17蛋白在FGloop的Asp520突變成Glu和HI-loop的Val544突變成Ala,使其喪失與宿主E.coliB和E.coliK2的結(jié)合能力,說(shuō)明該區(qū)域的氨基酸組成對(duì)宿主的選擇識(shí)別至關(guān)重要,氨基酸的突變導(dǎo)致其宿主識(shí)別的改變。本研究中挑選5個(gè)loop區(qū)域發(fā)生點(diǎn)突變的克隆進(jìn)行宿主吸附能力的差異比較,發(fā)現(xiàn)在DE loop的K498T和K498R突變能夠降低T7噬菌體與宿主的吸附能力,而位于BC loop的G476A突變能夠提高T7噬菌體與宿主的吸附能力,該發(fā)現(xiàn)再次驗(yàn)證了T7噬菌體尾絲蛋白loop區(qū)域與宿主識(shí)別的相關(guān)性。

        受到實(shí)驗(yàn)室生物材料積累的限制,尚未針對(duì)臨床細(xì)菌樣品尤其是畜禽致病性大腸埃希菌開(kāi)展相對(duì)廣譜的T7噬菌體篩選。但本研究構(gòu)建的T7噬菌體尾絲蛋白隨機(jī)進(jìn)化文庫(kù)為后續(xù)篩選工作奠定了良好的基礎(chǔ)。

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