俞樹杰 鄒佳軍 楊建峰 盧增新 韋明珠
直腸癌是第三常見的惡性腫瘤,約占所有腫瘤發(fā)病率的9%,每年有超過百萬人因直腸癌死亡[1]。研究表明,Ki-67 表達高低與直腸癌患者預后密切相關,Ki-67 高表達患者的生存率顯著低于低表達患者[2]。目前,Ki-67 在直腸癌中的表達需通過手術組織病理或者內鏡活檢來確定。然而Ki-67 在腫瘤中表達具有異質性,活檢樣本得到的Ki-67 指數不能準確地代表整個腫瘤的水平[3]。影像組學技術能夠獲取高通量數據,通過挖掘腫瘤本身的異質性和紋理等定量信息,建立預測模型,已被廣泛用于腫瘤表型分類和預測疾病進展[4,5]。既往研究顯示,影像組學可以預測Ki-67 在某些腫瘤中的表達,例如肝癌、神經膠質瘤、肺癌等[6~8],而目前通過影像組學預測直腸癌Ki-67 表達的研究較少。因此,本次研究旨在尋找與直腸癌Ki-67 表達相關的影像組學特征,并探討基于這些特征構建的影像組學模型能否預測直腸癌Ki-67表達。
1.1 一般資料 回顧性收集2019 年1 月至2021 年12 月期間在紹興市人民醫(yī)院進行手術治療的直腸癌患者。納入標準為:①術后病理證實為直腸癌;②病理資料中包括Ki-67 表達指數;③MRI 圖像質量佳,無嚴重偽影干擾。排除標準為:①術前經過抗癌治療;②MRI檢查前腸道準備不足,直腸癌病灶顯示不清。本次研究經醫(yī)院倫理委員會批準。最終納入109 例直腸癌患者,年齡48~93 歲,平均年齡(67.00±10.20)歲;病理組織Ki-67 陽性率5%~90%,平均58.26%;參考林妙霞等[9]分組標準,其中高Ki-67 表達組(Ki-67>50%)73 例、低Ki-67 表達組(Ki-67≤50%)[9]36 例。
1.2 方法 所有患者采用Siemens 3.0T Verio MR掃描儀,體部相控陣線圈檢查。掃描序列:①直腸軸位T1WI(TR 465 ms,TE 9 ms),直腸軸位T2WI(TR 2950 ms,TE 85 ms),層厚4 mm,層間距2 mm,視野215 mm×245 mm;②DWI:TR 3650 ms,TE 71 ms,層厚3 mm,視野215 mm×245 mm,b 值取0 及800 s/mm2;③直腸矢狀位DCE-T1WI:TR 3.35 ms,TE 1.26 ms,翻轉角10°,層厚3 mm,視野225 mm×265 mm,采用Gd-DTPA,劑量0.15 mmol/kg,經肘靜脈注入(速率1.5 ml/s)后開始掃描,共掃描36 個時相,得到1 080 幅圖像,每個周期掃描7 s,成像時間252 s。
1.3 圖像分割 采用DWI、DCE-T1WI(第21 期圖像)、T2WI 序列圖像分割直腸癌病灶。將圖像導入ITK-SNAP 軟件,由一名放射科研究生沿病灶邊緣逐層勾畫,另一名放射科腹部組高年資醫(yī)生核對結果,得到病灶感興趣容積(volume of interest,VOI),最后生成_merge.nii 格式的VOI 文件(見封二圖1)。
圖1 直腸癌VOI選取示意圖
1.4 特征提取 基于Artificial Intelligence Kit 平臺提取直腸癌VOI的影像組學特征,包括:①形狀特征(9 個);②灰度游程矩陣特征(180 個);③灰度區(qū)域大小矩陣特征(1 個);④直方圖特征(42 個);⑤灰度共生矩陣特征(154 個)。將109 例直腸癌患者按7∶3 隨機分成訓練組(73 例)和測試組(36 例)。訓練組用來進行特征篩選和建立影像組學模型,測試組的數據用來對建立的模型進行驗證。
1.5 統(tǒng)計學方法 應用R 語言軟件進行統(tǒng)計學分析。使用中位值填補數據中的缺失值,然后對數據進行標準化處理。由于本次研究Ki-67 低表達樣本較少,采用過采樣法(synthetic minority oversampling technique,SMOTE)解決訓練組中樣本不平衡問題,使兩類直腸癌患者在訓練組中比例為1∶1。通過Spearman 相關分析剔除 ||r >0.8 的相關特征,使用LASSO 回歸實現(xiàn)特征降維,最終得到4 個影像組學特征庫:①DCE-T1WI 特征庫;②T2WI 特征庫;③DWI 特征庫;④DCE-T1WI+T2WI+DWI 聯(lián)合特征庫(先聯(lián)合DCE-T1WI、T2WI、DWI 三種序列共計1 188 個特征,再篩選得到最佳特征庫)。應用logistic 回歸算法構建各個特征庫的影像組學模型。通過受試者工作特征(receiver operating characteristic curve,ROC)曲線、Delong 檢驗、凈重新分類指標(net reclassification improvement,NRI)和綜合判別改善指數(integrated discrimination improvement,IDI)評估和比較不同模型的性能。設P<0.05 為差異有統(tǒng)計學意義。
2.1 最優(yōu)影像特征篩選結果 經提取和降維得到4 個最優(yōu)影像組學特征庫,其中DCE-T1WI 特征庫有7 個特征,T2WI 特征庫有5 個特征,DWI 特征庫有6 個特征,DCE-T1WI+T2WI+DWI 聯(lián)合特征庫有10 個特征,具體特征見表1。
表1 經篩選獲得的影像組學特征庫
2.2 影像組學模型預測直腸癌Ki-67 表達的效能見表2
由表2 可見,應用logistic 回歸算法對上述篩選好的影像組學特征庫構建4 個預測模型,分別為DCE-T1WI 模型、T2WI 模型、DWI 模型及聯(lián)合模型?;贒CE-T1WI+T2WI+DWI 聯(lián)合特征庫的影像組學模型預測性能最佳(訓練組和測試組分別為0.89與0.86)。單序列模型中,DCE-T1WI 模型的的AUC值最高(訓練組和測試組分別為0.81 與0.77),優(yōu)于T2WI 模型AUC 值(0.73、0.73)和DWI 模型AUC值(0.68、0.67)。
表2 影像組學模型預測直腸癌Ki-67表達的效能
2.3 不同特征庫模型預測直腸癌Ki-67 表達的NRI和IDI見表3
由表3 可見,將聯(lián)合模型與DCE-T1WI 模型、T2WI 模型及DWI 模型對比,聯(lián)合模型的NRI 和IDI均大于0,表明聯(lián)合模型對直腸癌Ki-67的預測有正改善作用。相比于T2WI模型,DCE-T1WI模型在訓練組中體現(xiàn)出預測效能的正改善(NRI>0,IDI>0),而在測試組中DCE-T1WI 模型預測效能無明顯改善(NRI=0,IDI<0)。
表3 不同特征庫模型預測直腸癌Ki-67表達的NRI和IDI
2.4 不同特征庫模型Delong檢驗結果見表4
由表4 可見,在測試組中,不同模型的AUC 差值兩兩比較,差異均無統(tǒng)計學意義(P 均>0.05)。在訓練組中,聯(lián)合模型的AUC 差值在訓練組中高于DWI 模型(P<0.05)和T2WI 模型(P<0.05),但DCE-T1WI 模型與聯(lián)合模型的AUC 差值比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。
表4 不同特征庫模型Delong檢驗結果
Ki-67表達與腫瘤進展密切相關,高Ki-67表達往往提示腫瘤組織有更高的細胞密度,更強的侵襲性,因此術前預測Ki-67 表達水平對于惡性腫瘤的治療具有重要意義[10]。影像組學能夠從醫(yī)學圖像中提取信息,通過對這些信息進行分析,為評價腫瘤蛋白表達情況提供了可能[11,12]。既往大多數研究還集中在基于MRI 影像組學特征來預測各種腫瘤的Ki-67 表達,包括肝癌[6]、神經膠質瘤[7]和乳腺癌[13],這表明基于MRI 影像組學特征有可能預測直腸癌Ki-67的表達狀態(tài)。
本次研究基于DCE-T1WI、T2WI及DWI序列圖像,利用直腸癌VOI提取特征,經篩選獲得4 個影像組學特征庫,并構建相應的模型用于直腸癌患者進行Ki-67 表達預測。結果顯示不同模型均有一定的預測效能。在單序列模型中,基于DCE-T1WI 構建的模型AUC 值最高,這可能與直腸癌病灶新生血管豐富有關。相較于T2WI、DWI 序列,DCE-T1WI 序列有助于評估微血管分布和血液灌注,同時能更清楚地反映病變的形態(tài)學和血流動力學特征[14]。因此,與T2WI 和DWI 影像組學模型相比,DEC-T1WI影像組學模型在預測直腸癌的Ki-67 表達方面增加了更多的凈收益。
為進一步探討影像組學與直腸癌Ki-67 表達之間的關系,本次研究聯(lián)合三種序列建立聯(lián)合模型預測直腸癌Ki-67 表達,發(fā)現(xiàn)聯(lián)合模型的效能最佳,測試組AUC 為0.86。與單序列模型相比,聯(lián)合模型預測直腸癌Ki-67 表達的NRI 和IDI 均大于0,這也證實了聯(lián)合模型具有更好的性能。Zhou等[15]結合T1WI、T1WI 增強和T2WI 序列的影像組學特征預測髓母細胞瘤的Ki-67 表達水平,結果與本次研究類似,即多序列組合模型預測性能優(yōu)于單序列模型。由此可見,將多序列影像組學特征融合到一個聯(lián)合模型中,能顯著提高模型的準確性和擬合度。本次研究的局限性:本次研究為單中心回顧性研究,研究樣本量較小,尤其是Ki-67低表達組的樣本量,可能會導致選擇偏差。此外,ROI 的勾畫沒有標準化流程和規(guī)則,需要進一步研究制定統(tǒng)一的多中心標準。
綜上所述,基于DCE-T1WI、T2WI、DWI 三種序列的圖像特征,構建4 個模型較好地預測了直腸癌Ki-67 的表達,對直腸癌生長和預后的分析判斷具有一定價值。