盛輝,郭益文,張林林,李新,丁向彬,郭宏
(天津農(nóng)學(xué)院 動物科學(xué)與動物醫(yī)學(xué)學(xué)院 天津市農(nóng)業(yè)動物繁育與健康養(yǎng)殖重點實驗室,天津 300392)
肌肉生長抑制素Myoststin(MSTN),簡稱肌抑素(Growth differentiation factor-8,GDF-8),屬于轉(zhuǎn)化生長因子β(Transforming growth factor,TGF-β)超家族成員[1-2]。MSTN表達降低或部分、完全缺失會促進骨骼肌發(fā)育,其過表達會阻礙機體骨骼肌生長[3-4]。人們構(gòu)建的敲除MSTN基因小鼠[5]、大鼠[6]、狗[7]、兔[8]和豬[9]的動物機體都出現(xiàn)雙肌現(xiàn)象(Double muscle phenomenon,DMP)。同時,研究表明,MSTN在脂肪形成過程中起關(guān)鍵作用[10]。
脂肪作為生物三大營養(yǎng)素之一,是用來儲存體內(nèi)多余能量、調(diào)節(jié)熱量代謝的。哺乳動物體內(nèi)脂肪組織因脂肪細胞來源、細胞數(shù)量、細胞組成和功能等不同,可分為白色脂肪和棕色脂肪[11]。白色脂肪是儲能組織,以合成和儲存三酰甘油的形式儲存能量,在食物缺乏的情況下將儲存的能量分解供能[12]。體內(nèi)白色脂肪堆積過多可引起肥胖等相關(guān)性疾病。而棕色脂肪是耗能組織,參與非寒戰(zhàn)性產(chǎn)熱和食物誘導(dǎo)性產(chǎn)熱以抵抗低溫和肥胖,二者共同維持機體能量代謝平衡。
本研究基于MSTN-/-魯西黃牛與野生型魯西黃牛、MSTN-/-蒙古牛與野生型蒙古牛和MSTN-/-蒙古黑牛與野生型蒙古黑牛腿臀肌肌肉組織高通量蛋白質(zhì)組學(xué)與磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)結(jié)果,通過生物信息學(xué)分析和組織甘油三酯測定,探究MSTN對骨骼肌脂肪代謝的影響,為深入解析MSTN對骨骼肌脂肪代謝的調(diào)控機制研究補充新的基礎(chǔ)資料。
1.1.1 試驗材料
本研究所用的試驗動物為3 頭MSTN-/-蒙古牛、3 頭野生蒙古牛、3 頭MSTN-/-魯西黃牛、3頭野生型魯西黃牛、3 頭MSTN-/-蒙古黑牛和3 頭野生型蒙古黑牛。這18 頭牛均飼喂于內(nèi)蒙古大學(xué)轉(zhuǎn)基因試驗中心農(nóng)場,飼喂條件一致。利用活體采樣的方法采集試驗動物的腿臀肌組織,PBS 清洗,放入凍存管中,做好標記,放入液氮中保存。
1.1.2 主要試劑
PMSF(北京索萊寶生物科技有限公司)、磷酸酶抑制劑(北京索萊寶生物科技有限公司)、RIPA(北京索萊寶生物科技有限公司)、組織細胞甘油三酯酶法測定試劑盒(北京普利萊基因技術(shù)有限公司)、PBS 溶液(北京索萊寶生物科技有限公司)、BCA 試劑盒(北京康為公司)、TMT-6 plex標記試劑盒和緩沖液(Applied Biosystems)。
1.1.3 主要儀器設(shè)備
低溫冷凍干燥機(Thermo Fisher)、色譜分離系統(tǒng)(Agilent)、高效液相色譜(Applied Biosystems )、串聯(lián)質(zhì)譜分析儀(Applied Biosystems)、強陽離子交換柱(Zorbax Bio-SCX)、脫鹽柱(Michrom Bioresources)、C18AQ 反相分離柱(Michrom Bioresources)、HPLC 系統(tǒng)(Agilent)、酶標儀(Thermo Fisher)、恒溫培養(yǎng)箱(Thermo Fisher)。
1.2.1 蛋白質(zhì)提取
從液氮中取出凍存的樣品組織,用研缽磨成粉末狀,移入新的1.5 mL 無酶離心管中,加入配制好的蛋白裂解液(1 mL RIPA,10 μL PMSF,10 μL磷酸酶抑制劑),冰浴10 min,4 ℃ 12 000 g 離心10 min,取上清保存于-80 ℃ 24 h,隨后凍干成粉末狀保存。
1.2.2 TMT 標記蛋白樣
凍干蛋白樣用磷酸鹽緩沖液重溶后,加入2%SDS 溶液變性,用三(2-羰基乙基)磷鹽酸鹽TCEP還原,用甲基硫代磺酸甲酯(MMTS)封閉半胱氨酸殘基,用胰蛋白酶37 ℃消化過夜。使用TMT-6 plex 試劑標記消化了的肽段,并對其進行脫鹽處理,樣品真空干燥。
1.2.3 強陽離子柱分離肽段
將TMT 6-plex 標記的胰蛋白酶肽樣品混勻上樣,在214 nm 波長下以1 min 間隔收集混合成若干組分,從每個組分中取出10%用于后續(xù)LCMS/MS 分析。
1.2.4 LC-MS/MS 分析
使用PepMap C-18 反向納米柱完成肽段吸附、除鹽和分離過程,并使用Analyst 1.6 軟件(Sciex)進行數(shù)據(jù)采集。
1.2.5 生物信息學(xué)統(tǒng)計與分析
利用在線網(wǎng)站及軟件對數(shù)據(jù)結(jié)果統(tǒng)計和分析,以便了解MSTN的生物學(xué)意義。Perseus 1.5.3.2軟件用于對蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)進行分析,篩選出差異蛋白和磷酸化蛋白。DAVID 6.8(https://david.ncifcrf.gov/)用于蛋白登錄號轉(zhuǎn)換和差異蛋白GO注釋和 KEGG 途徑分析。KEGG 數(shù)據(jù)庫(https://www.kegg.jp/kegg/pathway.html)用于差異蛋白富集信號通路分析。STRING 11.0 數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org/cgi/input.pl)可用于蛋白間互作分析。UniProt 數(shù)據(jù)庫(http://www.uniprot.org/)用于檢索蛋白的功能以及蛋白質(zhì)名稱轉(zhuǎn)換。
1.2.6 肌肉組織中甘油三酯測定
利用試劑盒檢測樣品組織中甘油三酯含量。從液氮中取出保存的肌肉組織,對其精確稱重,用研缽將組織磨成粉末,按每1 mg 組織加入20 μL裂解液的比例加入裂解液,渦旋震蕩,室溫靜置10 min。取適量上清轉(zhuǎn)移至新的1.5 mL 離心管中,室溫2 000 r/min 離心5 min,上清液即可用于酶學(xué)測定,剩余組織裂解液用BCA 蛋白定量試劑盒測定組織蛋白濃度。配制好工作液及稀釋標準品,在酶標板中加入待測樣品,37 ℃反應(yīng)15 min,將結(jié)果繪制標準曲線并計算甘油三酯濃度,最后以每mg 蛋白濃度校正組織中甘油三酯含量。
通過Perseus 1.5.3.2 軟件分析以及UniProt 數(shù)據(jù)庫檢索蛋白質(zhì)功能,發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)結(jié)果中大量差異蛋白與脂肪代謝過程相關(guān),詳細信息見表1、表2 和表3。
表1 MSTN-/-蒙古牛與野生蒙古牛數(shù)據(jù)中與脂肪代謝相關(guān)差異蛋白
表2 MSTN-/-魯西黃牛與野生魯西黃牛數(shù)據(jù)中與脂肪代謝相關(guān)差異蛋白
表3 MSTN-/-蒙古黑牛與野生蒙古黑牛數(shù)據(jù)中與脂肪代謝相關(guān)差異蛋白
將這些差異蛋白輸入DAVID 6.8、KEGG 數(shù)據(jù)庫,發(fā)現(xiàn)這些差異蛋白主要富集在脂肪酸代謝和PPAR 信號通路上,結(jié)果見圖1。并將三組數(shù)據(jù)中與脂肪代謝相關(guān)的蛋白輸入STRING 數(shù)據(jù)庫,分析蛋白間互作,結(jié)果見圖2。
圖1 差異蛋白富集脂肪酸代謝通路圖
圖2 差異蛋白PPI 分析結(jié)果
用試劑盒檢測組織中甘油三酯含量,并以每mg 蛋白濃度校正甘油三酯含量。結(jié)果見圖3,與各個品種野生牛相比,MSTN-/-蒙古牛肌肉組織中甘油三酯含量無明顯差異,MSTN-/-魯西黃牛肌肉組織中甘油三酯含量極顯著下降,MSTN-/-蒙古黑牛肌肉組織中甘油三酯含量顯著下降。
圖3 肌肉組織中甘油三酯含量檢測結(jié)果
脂肪組織不僅是機體的能量儲存庫,還可能作為最大的內(nèi)分泌器官,通過分泌多種因子調(diào)節(jié)代謝穩(wěn)態(tài)、食欲、免疫等多種生物過程[13]。多項研究表明,肌肉生長抑制素MSTN在脂肪形成過程中起關(guān)鍵作用[10]。敲除MSTN基因的動物肌肉組織中脂肪膜轉(zhuǎn)運蛋白水平(FAT/CD36,F(xiàn)ABP3,F(xiàn)ATP1 和FATP4)降低,這與脂質(zhì)氧化途徑(檸檬酸合酶和β-HAD 活性)降低相關(guān),同時脂肪形成受損(甘油三酯和游離脂肪酸含量降低)[14]。敲除MSTN的飼喂高脂飲食(HFD)的小鼠組織脂肪酸氧化增強,產(chǎn)熱增加,最終導(dǎo)致脂肪利用增加和脂肪組織減少,從而防止飲食誘發(fā)的肥胖[15]。小鼠敲除MSTN基因后顯著影響了肌肉組織細胞中線粒體的功能,增強了線粒體中脂肪酸的β氧化,抑制了三羧酸循環(huán)和氧化磷酸化過程[16]。并且本實驗室前期通過定量蛋白質(zhì)組學(xué)與磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)研究發(fā)現(xiàn),MSTN基因敲除能夠促進脂肪酸在線粒體中的β氧化過程,加強糖酵解過程,進而促進了糖原分解[17-18]。
本研究通過對MSTN-/-牛與野生牛腿臀肌肌肉組織蛋白質(zhì)組學(xué)與磷酸化組學(xué)分析以及對肌肉組織甘油三酯檢測發(fā)現(xiàn),敲除MSTN基因脂肪酸代謝增強,肌肉組織中甘油三酯含量降低。本研究結(jié)果與前述敲除MSTN基因小鼠脂肪酸β氧化增強、脂肪組織減少的結(jié)果相一致。
綜上所述,本研究利用敲除MSTN的蒙古牛、魯西黃牛和蒙古黑牛與野生的蒙古牛、魯西黃牛和蒙古黑牛腿臀肌肌肉組織作為試驗樣品,通過蛋白質(zhì)組學(xué)與磷酸化組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)大量差異蛋白富集在脂肪酸代謝信號通路,同時對肌肉組織進行甘油三酯含量檢測發(fā)現(xiàn),敲除MSTN基因牛骨骼肌中甘油三酯含量降低。研究結(jié)果為接下來進一步探討MSTN對牛骨骼肌代謝機制的相關(guān)研究提供一定參考。