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        核酸適配體熒光分子開關(guān)的啶蟲脒測定

        2022-08-04 09:43:48楊麗敏李明明
        實(shí)驗(yàn)室研究與探索 2022年3期
        關(guān)鍵詞:雙鏈分析化學(xué)光譜

        楊麗敏, 李明明

        (中國石油大學(xué)(華東) 化學(xué)工程學(xué)院,山東 青島 266580)

        0 引 言

        近年來,食品安全、環(huán)境監(jiān)測、重大疾病早期診斷等問題日益突出。這些問題是民生,也是政治,關(guān)乎社會(huì)和諧、國家穩(wěn)定,更在十三五時(shí)期上升為國家重大戰(zhàn)略。為此,現(xiàn)代分析化學(xué)的任務(wù)已不只限于測定物質(zhì)的組成及含量,而是需要融合科學(xué)前沿,以新的思路、觀念和方式改進(jìn)目前的分析檢測水平。

        核酸適配體(簡稱,適配體)作為一種人工合成的識(shí)別分子,具有高特異性、高親和性、便于化學(xué)修飾與功能化、易于大規(guī)模低成本合成等特點(diǎn)[1-3]。無機(jī)離子、有機(jī)分子、蛋白質(zhì)乃至細(xì)胞、微生物均可能存在與其對應(yīng)的適配體。因此,基于適配體的傳感檢測方法已在食品安全、臨床醫(yī)療、環(huán)境監(jiān)測等領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用,成為分析化學(xué)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)之一[4-5]。將適配體前沿學(xué)術(shù)知識(shí)理論和實(shí)驗(yàn)融入分析化學(xué)理論教學(xué)和實(shí)驗(yàn)教學(xué)中,有助于推動(dòng)分析化學(xué)教學(xué)與國家需求相銜接[1,6]。

        本文聚焦分析化學(xué)的實(shí)驗(yàn)教學(xué)改革,設(shè)計(jì)了實(shí)驗(yàn)“核酸適配體熒光分子開關(guān)測定茶葉中的啶蟲脒”。適配體熒光分子開關(guān)是適配體熒光傳感器最常見的策略,屬于無需基底的靶分子非標(biāo)記模式(即SFALF模式)[7]。此模式下無需將適配體固定在基底上,整個(gè)傳感過程在均相溶液中完成。傳感信號(hào)主要來自適配體-靶分子結(jié)合過程對體系產(chǎn)生的擾動(dòng)。不僅操作簡單,即使動(dòng)手能力薄弱的學(xué)生依然可以輕松駕馭;而且設(shè)計(jì)靈活,可以激發(fā)學(xué)生自主探索的興趣,有助于創(chuàng)新能力的培養(yǎng)。在靶標(biāo)分析物的選擇上,關(guān)注到近年來越顯突出的茶葉中的農(nóng)藥殘留問題,特別是新煙堿類農(nóng)藥(如啶蟲脒、吡蟲啉等)超標(biāo)現(xiàn)象時(shí)有發(fā)生[8],不僅成為人體健康不可忽視的隱患,而且對茶葉行業(yè)造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失。因此,本實(shí)驗(yàn)以啶蟲脒為靶分子,設(shè)計(jì)適配體熒光分子開關(guān),建立茶葉中啶蟲脒定量分析方法,加快我國茶葉行業(yè)的轉(zhuǎn)型和升級(jí),保障消費(fèi)者的健康。

        1 實(shí)驗(yàn)部分

        1.1 試劑和儀器

        啶蟲脒特異性結(jié)合適配體(即ABA)的序列來源于文獻(xiàn)[9]。實(shí)驗(yàn)所用核酸鏈均由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,其序列如表1所示。啶蟲脒購自Sigma公司,Tris-鹽酸緩沖液(1 mol/L,pH7.6)購自阿拉丁試劑公司。實(shí)驗(yàn)用水均為Millipore超純水(電阻率18.2 MΩ·cm)。熒光光譜用Fluoromax-4型熒光光譜儀(法國Horiba Jobin Yvon)測定。

        表1 實(shí)驗(yàn)中使用的核酸鏈

        1.2 BHQ1-cDNA對FAM-ABA的光淬滅效應(yīng)測量

        取8個(gè)干凈的5 mL容量瓶,分別加入500 μL濃度為0.1 μmol/L的FAM-ABA,0、50、200、300、400、500、1 000、2 000 μL濃度為0.1 μmol/L的BHQ1-cDNA,再用Tris-鹽酸緩沖液定容至5 mL。然后,置于37 °C下反應(yīng)1 h。最后,以480 nm為激發(fā)波長測量系列溶液的熒光光譜。

        1.3 啶蟲脒的標(biāo)準(zhǔn)曲線

        取9個(gè)干凈的5 mL容量瓶,分別加入500 μL濃度為0.1 μmol/L的FAM-ABA和500 μL濃度為0.1 μmol/L的BHQ1-cDNA,37 °C下反應(yīng)1 h。再向其中分別加入500 μL不同濃度(0,0.025,0.25,0.5,2.5,5 mg/mL)的啶蟲脒溶液(丙酮為溶劑),并用Tris-鹽酸緩沖液定容至5 mL,37 °C下反應(yīng)1 h。最后,以480 nm為激發(fā)波長測量系列溶液的熒光光譜。以發(fā)射波長520 nm處的熒光強(qiáng)度為縱坐標(biāo),啶蟲脒濃度的對數(shù)值為橫坐標(biāo),繪制啶蟲脒的標(biāo)準(zhǔn)曲線。

        1.4 茶葉中啶蟲脒的檢測

        在啶蟲脒測定前,首先根據(jù)文獻(xiàn)[10]進(jìn)行了樣品制備,具體操作步驟如下。取5 g茶葉放進(jìn)100 mL沸水中煮4 min,待冷卻至室溫后,過濾掉茶葉。再將濾液用0.22 μm濾膜過濾器過濾3次,收集清液。取1個(gè)干凈的5 mL容量瓶,加入500 μL濃度為50 mg/mL的啶蟲脒溶液,并用茶葉清液定容至5 mL,獲得檢測樣品。

        然后,再取1個(gè)干凈的5 mL容量瓶,加入500 μL濃度為0.1 μmol/L的FAM-ABA和500 μL濃度為0.1 μmol/L的BHQ1-cDNA,37 °C下反應(yīng)1 h。再向其中加入500 μL檢測樣品溶液,并用Tris-鹽酸緩沖液定容至5 mL,37 °C下反應(yīng)1 h后,以480 nm為激發(fā)波長測量溶液的熒光光譜。取發(fā)射波長520 nm處的熒光強(qiáng)度,代入標(biāo)準(zhǔn)曲線,計(jì)算樣品中的啶蟲脒含量。最后,用測定的啶蟲脒含量值除以理論值,計(jì)算回收率[11]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 熒光分子開關(guān)設(shè)計(jì)

        本實(shí)驗(yàn)以“雙鏈-復(fù)合物法”構(gòu)建適配體熒光分子開關(guān)[12-13],其原理如圖1所示。將熒光基團(tuán)FAM標(biāo)記在啶蟲脒適配體ABA的5′端,形成FAM-ABA。將淬滅基團(tuán)BHQ1標(biāo)記在適配體互補(bǔ)鏈cDNA的3′端,形成BHQ1-cDNA。當(dāng)FAM-ABA與BHQ1-cDNA雜交成雙鏈時(shí),F(xiàn)AM和BHQ1位于雙鏈同一端,彼此靠近。在波長為480 nm的激發(fā)光照射下,F(xiàn)AM發(fā)射的熒光以非輻射形式轉(zhuǎn)移至BHQ1,即發(fā)生熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)現(xiàn)象。在熒光光譜上可觀察到,F(xiàn)AM-ABA的熒光強(qiáng)度比它單獨(dú)存在時(shí)要低得多,即熒光發(fā)生淬滅。若樣品中存在靶分子啶蟲脒,F(xiàn)AM-ABA傾向于與其靶分子結(jié)合,而使雙鏈解離,F(xiàn)AM和BHQ1彼此遠(yuǎn)離。研究表明,F(xiàn)RET效率與熒光基團(tuán)-淬滅基團(tuán)間距離的6次方成反比[14-15]。因此,當(dāng)啶蟲脒存在時(shí),F(xiàn)RET效應(yīng)減弱甚至消失,F(xiàn)AM-ABA的熒光部分或完全恢復(fù)。由此可見,F(xiàn)AM-ABA與BHQ1-cDNA構(gòu)成的雙鏈結(jié)構(gòu),因啶蟲脒的存在與否,形成熒光信號(hào)的關(guān)和開。以此構(gòu)建的適配體熒光分子開關(guān)可用于啶蟲脒的測定。

        圖1 適配體熒光分子開關(guān)的工作原理

        2.2 BHQ1-cDNA對FAM-ABA的熒光淬滅效應(yīng)

        為了驗(yàn)證BHQ1-cDNA對FAM-ABA的熒光淬滅效應(yīng),將FAM-ABA(10 nmol/L)先與不同濃度的BHQ1-cDNA雜交后,測量系列溶液的熒光光譜。如圖2所示,在420 nm激發(fā)波長下,F(xiàn)AM-ABA在520 nm處形成一熒光發(fā)射峰。隨著BHQ1-cDNA濃度從0逐漸增加到40 nmol/L,520 nm處熒光峰的強(qiáng)度逐漸降低。這說明FAM-ABA與BHQ1-cDNA雜交后,熒光發(fā)生淬滅,F(xiàn)RET現(xiàn)象發(fā)生。并且,觀察到當(dāng)BHQ1-cDNA濃度為10 nmol/L(即與FAM-ABA濃度相同)時(shí),已有58%的熒光發(fā)生淬滅,可以用于啶蟲脒測定。

        圖2 FAM-ABA(10 nmol/L)與不同濃度BHQ1-cDNA作用后,在480 nm激發(fā)波長下的熒光光譜

        2.3 啶蟲脒的標(biāo)準(zhǔn)曲線

        為了獲得啶蟲脒的標(biāo)準(zhǔn)曲線,首先對啶蟲脒對雜交雙鏈體系的熒光強(qiáng)度影響進(jìn)行了探究。將FAM-ABA(10 nmol/L)先與BHQ1-cDNA(10 nmol/L)雜交成雙鏈后,再與濃度分別為0,2.5,25,50,250,和500 μg/mL的啶蟲脒反應(yīng),最后,測量系列溶液的熒光光譜。如圖3所示,隨著BHQ1-cDNA濃度從0逐漸增加到500 μg/mL,520 nm處熒光峰的強(qiáng)度逐漸增高。這說明,F(xiàn)RET效應(yīng)減弱,啶蟲脒的存在可以引起FAM-ABA與BHQ1-cDNA的分離。另外,還可以注意到,即使使用500 μg/mL(相當(dāng)于2.25 mmol/L,遠(yuǎn)高于核酸的使用濃度10 nmol/L)啶蟲脒,依然不能使FAM-ABA的熒光強(qiáng)度完全恢復(fù),推測機(jī)理可能同時(shí)存在內(nèi)濾效應(yīng)[16]。

        圖3 FAM-ABA及不同濃度啶蟲脒作用下雜交雙鏈體系的熒光光譜

        然后,取520 nm處熒光強(qiáng)度為縱坐標(biāo),啶蟲脒濃度的對數(shù)值為橫坐標(biāo),繪制啶蟲脒的標(biāo)準(zhǔn)曲線。如圖4所示,當(dāng)啶蟲脒濃度在2.5~500 μg/mL時(shí),熒光強(qiáng)度與啶蟲脒濃度的對數(shù)值呈良好線性相關(guān)性。

        圖4 熒光分子開關(guān)測定啶蟲脒的標(biāo)準(zhǔn)曲線

        2.4 茶葉中啶蟲脒檢測

        按照前述實(shí)驗(yàn)操作步驟制備含有啶蟲脒的茶葉樣品溶液,與雜交雙鏈體系作用后,測定體系熒光光譜。取520 nm處的熒光強(qiáng)度,代入標(biāo)準(zhǔn)曲線,計(jì)算樣品中的啶蟲脒含量為50.46 μg/mL,與理論值接近,回收率計(jì)算得100.92%,說明該方法準(zhǔn)確可靠,可用于實(shí)際樣品檢測。

        3 實(shí)驗(yàn)特點(diǎn)

        本實(shí)驗(yàn)是科研成果反哺基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)教學(xué)的典型案例,具有以下突出特點(diǎn)。

        (1) 強(qiáng)調(diào)科技前沿與實(shí)際問題的結(jié)合,增強(qiáng)學(xué)生服務(wù)國家社會(huì)的意識(shí)。本實(shí)驗(yàn)立足食品安全國家重大戰(zhàn)略,聚焦茶葉農(nóng)藥殘留超標(biāo)實(shí)際問題,突破傳統(tǒng)儀器分析在實(shí)際應(yīng)用中的局限,以茶葉常用農(nóng)藥啶蟲脒為靶分子,結(jié)合適配體傳感檢測前沿技術(shù),設(shè)計(jì)適配體熒光分子開關(guān),建立新型檢測方法。本實(shí)驗(yàn)始于實(shí)際問題,止于實(shí)際應(yīng)用,有助于提高學(xué)生利用所學(xué)解決實(shí)際問題的能力,增強(qiáng)服務(wù)社會(huì)、熱愛國家的情操和意識(shí)。

        (2) 匹配學(xué)生實(shí)操基礎(chǔ),助力學(xué)生把握科技前沿。本實(shí)驗(yàn)所需關(guān)鍵材料為FAM-ABA和BHQ1-cDNA兩條核酸鏈,屬于商業(yè)化定制材料,極易獲得。整個(gè)實(shí)驗(yàn)過程,除了簡單的溶液配制外,不涉及任何工藝復(fù)雜的材料制備,非常便于操作,能夠與學(xué)生薄弱的實(shí)操基礎(chǔ)相匹配。在實(shí)驗(yàn)技能上不設(shè)置門檻,重在培養(yǎng)解決問題的能力,以及把握科技前沿的能力。

        (3) 強(qiáng)化科研思維,培育創(chuàng)新源動(dòng)力。本實(shí)驗(yàn)流程包括:①熒光分子開關(guān)設(shè)計(jì);②BHQ1-cDNA對FAM-ABA的熒光淬滅效應(yīng);③啶蟲脒的標(biāo)準(zhǔn)曲線;④茶葉中啶蟲脒的檢測。其中,第①步是原理設(shè)計(jì),“提出假設(shè)”;第②、③步是原理可行性驗(yàn)證,“小心求證”;第④步是應(yīng)用拓展。這種根據(jù)問題構(gòu)建科學(xué)假說、根據(jù)假說設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)合理求證、根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果再調(diào)整甚至重構(gòu)科學(xué)假說的教學(xué)設(shè)計(jì),是科研思維的具體表現(xiàn),有助于培養(yǎng)學(xué)生創(chuàng)新意識(shí)。在假設(shè)階段,啟迪學(xué)生不迷信學(xué)術(shù)權(quán)威,不盲從既有學(xué)說,敢于大膽質(zhì)疑。在求證階段,要求學(xué)生嚴(yán)格求證,唯真唯實(shí)。在應(yīng)用階段,引導(dǎo)學(xué)生融入實(shí)際應(yīng)用情景,以解決實(shí)際問題為己任。

        4 結(jié) 語

        本實(shí)驗(yàn)將分析化學(xué)學(xué)科研究熱點(diǎn)—適配體熒光分子開關(guān)引入本科實(shí)驗(yàn)教學(xué),面向國家重大需求,科研思維貫穿教學(xué)始終。通過本實(shí)驗(yàn),學(xué)生們不僅可以接觸到學(xué)科前沿,更重要的,在解決實(shí)際問題的過程中,科研思維得以塑造,科學(xué)視野得以拓展,愛國意識(shí)得以加強(qiáng),創(chuàng)新精神得以喚醒。本實(shí)驗(yàn)將推動(dòng)分析化學(xué)突破經(jīng)典的束縛,與前沿接軌,與國家社會(huì)需求緊密銜接。

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