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        Notch1基因在T-ALL患者中的表達(dá)及其對NF-κB通路的影響①

        2022-07-21 09:09:54馬曉波李云濤張學(xué)美李林燕史明霞
        中國免疫學(xué)雜志 2022年8期
        關(guān)鍵詞:危險(xiǎn)度引物通路

        武 坤 郭 翀 馬曉波 李云濤 張學(xué)美 李林燕 羅 珊 史明霞

        (昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)科,昆明 650032)

        急性淋巴細(xì)胞白血?。╝cute lymphoblastic leu?kemia,ALL)是一種源自淋巴系造血細(xì)胞前體的惡性血液病,其中,急性T 淋巴細(xì)胞白血?。═ cell acute lymphoblastic leukemia,T-ALL)由T 細(xì)胞祖細(xì)胞的惡性轉(zhuǎn)化所致,發(fā)病率在兒科ALL 中占10%~15%,在成人中占25%[1-2]。雖然T-ALL 的治療效果在逐漸改善,但原發(fā)性耐藥或復(fù)發(fā)性T-ALL 患者預(yù)后仍較差[3-4]。Notch1 是一種跨膜受體,可調(diào)節(jié)細(xì)胞生長、分化、血管生成和轉(zhuǎn)移[5]。Notch1 信號激活在包括T-ALL在內(nèi)的大多數(shù)血液系統(tǒng)惡性腫瘤中發(fā)揮關(guān)鍵作用[6]。有研究提示,Notch 通路激活后,可通過NF-κB 通路抑制細(xì)胞凋亡,在血液系統(tǒng)腫瘤的發(fā)生發(fā)展和耐藥過程中發(fā)揮作用[7-8]。然而,關(guān)于Notch1 與T-ALL 臨床指標(biāo)和預(yù)后的相關(guān)性,及其在T-ALL 細(xì)胞中與NF-κB 通路的相互作用目前尚不明確。本研究旨在分析Notch1 在T-ALL 患者外周血單個(gè)核細(xì)胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中的表達(dá),明確Notch1 與T-ALL 臨床特征和預(yù)后之間的關(guān)聯(lián),進(jìn)一步在細(xì)胞水平上明確沉默Notch1 對NF-κB 通路的影響。本研究有望為T-ALL提供新的預(yù)后標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)。

        1 資料與方法

        1.1 資料

        1.1.1 研究對象 選取2016 年1 月至2019 年1 月昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院血液科收治的初診為T-ALL 的患者67 例作為試驗(yàn)組,包括男性28 例,女性39 例,年齡19~72 歲;同時(shí)選取67 例健康體檢者作為對照,包括男性33 例,女性34 例,年齡20~75 歲。T-ALL 患者均經(jīng)過骨髓學(xué)、細(xì)胞免疫分型和細(xì)胞遺傳學(xué)檢查確診,排除合并其他腫瘤或急慢性感染性疾病患者。靜脈采集研究對象外周血5 ml,收集于含EDTA 的抗凝管。收集患者臨床資料,包括年齡、性別、LDH水平、白細(xì)胞水平和危險(xiǎn)度分級。T-ALL 危險(xiǎn)度分級為標(biāo)危組、中危組、高危組。標(biāo)危組必須同時(shí)滿足以下所有條件:①年齡≥1 歲且<10 歲;②WBC<50×109L-1;③潑尼松反應(yīng)良好;④非T-ALL;⑤非成熟B-ALL;⑥無t(9;22)或BCR/ABL 融合基因;⑦無t(4;11)或MLL/AF4 融合基因;⑧無t(1;19)或E2A/PBX1融合基因;⑨治療第15天骨髓呈M1(原幼淋細(xì)胞<5%)或M2(原幼淋細(xì)胞5%~25%),第33 天骨髓完全緩解。中危組必須同時(shí)滿足以下4個(gè)條件:①無t(9;22)或BCR/ABL融合基因;②潑尼松反應(yīng)良好(第8 天外周血白血病細(xì)胞<1×109L-1);③標(biāo)危誘導(dǎo)緩解治療第15 天骨髓呈M3(原幼淋細(xì)胞>25%)或中危誘導(dǎo)緩解治療第15天骨髓呈M1/M2;④如有條件進(jìn)行微小殘留?。∕RD)檢測,則第33天MRD<10-2。同時(shí)至少符合以下條件之一:⑤WBC≥50×109L-1;⑥年齡≥10 歲;⑦T-ALL;⑧t(1;19)或E2A/PBX1 融合基因陽性;⑨年齡<1 歲且無MLL 基因重排。高危組必須滿足下列條件之一:①潑尼松反應(yīng)不良(第8 天外周血白血病細(xì)胞>1×109L-1);②t(9;22)或BCR/ABL 融合基因陽性;③t(4;11)或MLL/AF4融合基因陽性。

        對67例患者進(jìn)行電話隨訪或門診隨訪,隨訪起點(diǎn)時(shí)間為確診日期,總隨訪時(shí)間為24個(gè)月。本研究已獲得昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院倫理委員會(huì)審核通過。所有研究對象均知情同意。

        1.1.2 主要試劑與儀器 淋巴細(xì)胞分離液(Ficoll?PM 400,Sigma-Aldrich,美國);TRIzol 試劑(RNAiso Plus,TaKaRa,大連);RPMI1640 完全培養(yǎng)基、Revert-Aid Reverse Transcriptase(Thermo Scientific,美國);SGExcel FastSYBR Mixture、BCA 蛋白濃度測定試劑盒(上海生工);RIPA 裂解液(Sigma);硝酸纖維素膜(Millipore);Notch1、p-IκBα、IKKβ、GAPDH 抗體、辣根過氧化物酶標(biāo)記的兔IgG 抗體(OmnimAbs)。NanoDrop ND-2000 分光光度計(jì)(Thermo Scientific,美國);StepOnePlusTM實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(ABI,美國)。

        1.2 方法

        1.2.1 Ficoll 密度梯度離心法分析PBMC 取外周血5 ml,加入5 ml 淋巴細(xì)胞分離液,再加入2 倍體積的PBS 緩沖液吹打混勻。將混合液以300 g 離心30 min。分離PBMC,PBS 緩沖液洗滌2 次,保存于-80 ℃冰箱備用。

        1.2.2 PBMC 總RNA 提取 采用TRIzol 試劑提取PBMC 總RNA。向細(xì)胞中加入1 ml TRIzol 試劑,加入200 μl 氯仿,劇烈振蕩15 s,室溫靜置2 min,于4 ℃、400 g下離心15 min。取上層水相置于新管中,加入等體積的異丙醇,顛倒混勻,室溫靜置10 min,于4 ℃、400 g 下離心15 min,去上清。以70%的乙醇洗滌2 次,4 ℃、200 g 離心5 min,去上清,自然干燥。加入30~50 μl DEPC 水溶解,采用NanoDrop ND-2000 分光光度計(jì)分析RNA 的純度及濃度。A260/A280>2.0,A230/A260>1.8表明RNA質(zhì)量達(dá)到要求。

        1.2.3 細(xì)胞培養(yǎng)和慢病毒轉(zhuǎn)染 將T-ALL 細(xì)胞株Jurkat 細(xì)胞培養(yǎng)于含1%青鏈霉素、10%胎牛血清的RPMI1640 完全培養(yǎng)基中,置于5%CO2、37 ℃溫箱中培養(yǎng)。設(shè)計(jì)靶向Notch1 的siRNA 序列(si-Notch1:5′-GCCAAATTCAACGGGCTCTTG-3′),委托上海漢恒生物構(gòu)建慢病毒質(zhì)粒載體并包裝為慢病毒顆粒,以空白慢病毒載體作為陰性對照(si-NC)。采用慢病毒感染細(xì)胞,24 h后進(jìn)行后續(xù)分析。實(shí)驗(yàn)分組:正常PBMC 組、Jurkat 細(xì)胞組、Jurkat 細(xì)胞+si-NC(陰性對照)組和Jurkat細(xì)胞+si-Notch1組。

        1.2.4 qRT-PCR 采用RevertAid Reverse Tran?scriptase 將RNA 逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。按照2×SGExcel FastSYBR Mixture 說明書,配制qPCR 反應(yīng)體系(25 μl 2×SGExcel FastSYBR Mixture+1 μl 正向引物+1 μl 反向引物+1 μl cDNA,加入超純水補(bǔ)齊至50 μl),上機(jī)檢測,反應(yīng)程序?yàn)椋侯A(yù)變性95 ℃,20 s;變性95 ℃,3 s;退火/延伸60 ℃,30 s;35 個(gè)循環(huán)。引物均由上海生工合成。Notch1 正向引物:5'-GAT?GTTGGCAAGGTAGTCGAT-3',反向引物:5'-GCTCCCTGTGTTCTCATTGAT-3';IκBα 正向引物:5'-GCCTGGACTCCATGAAAGACGA-3',反向引物:5'-CAATTTCTGGCTGGTTGGTGAT-3';IKKβ 正向引物:5'-GAAGACTTGAATGGAACGGT-3',反向引物:5'-CACTGAGTGGCAGGCTTATC-3'。以GAPDH 為內(nèi)參,GAPDH 正向引物:5'-ACGGGAAGCTTGTCAT?CAATGG-3';反向引物:5'-ATGGTGGTGAAGACGC?CAGTGG-3'。根據(jù)2-ΔΔCt計(jì)算目的基因的相對表達(dá)量。以Notch1 mRNA 在T-ALL 患者PBMC 中相對表達(dá)量中位數(shù)為界,將T-ALL 組分為Notch1 高表達(dá)組和Notch1低表達(dá)組。

        1.2.5 Western blot 離心收集各組細(xì)胞,采用1×RIPA裂解液裂解細(xì)胞,BCA蛋白濃度測定試劑盒對蛋白定量。取50 μg 蛋白樣品與凝膠緩沖液混合,煮沸10 min 后,行SDS-PAGE 電泳。將蛋白轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜,非特異性抗體采用含5%脫脂牛奶的1×Tris 緩沖液封閉,室溫下孵育2 h。在4 ℃下,膜與Notch1、p-IκBα、IKKβ或Notch1 GAPDH 抗體在含5%脫脂牛奶的1×TBS 緩沖液中孵育過夜。采用1×TBS 洗滌3 次后,膜與辣根過氧化物酶標(biāo)記的兔IgG 抗體在室溫下孵育2 h。在Fluor Chem Systems(ProteinSimple)下觀察結(jié)果,采用系統(tǒng)自帶的軟件(Alpha View Software)分析目標(biāo)蛋白的相對表達(dá)量。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 采用SPSS17.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。計(jì)量資料采用±s表示。采用t檢驗(yàn)或ANOVA檢驗(yàn)分析組間基因表達(dá)差異。采用Spearman 相關(guān)性分析確定Notch1 的表達(dá)水平與T-ALL 患者LDH 水平、白細(xì)胞水平和危險(xiǎn)度分級等臨床指標(biāo)間的關(guān)聯(lián);Kaplan-Meier 法分析Notch1 表達(dá)水平與患者生存時(shí)間的關(guān)系;P<0.05表示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 Notch1 在T-ALL 患者PBMC 中的表達(dá) qRTPCR 分析T-ALL 組和健康組(各67 例)PBMC 中Notch1 mRNA 表達(dá)水平,結(jié)果如圖1 所示,與健康組相比,T-ALL組Notch1表達(dá)明顯上調(diào),差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。

        圖1 健康組和T-ALL組PBMC中Notch1 mRNA表達(dá)分析Fig.1 Analysis of Notch1 mRNA expression in PBMC of healthy group and T-ALL group

        2.2 Notch1 表達(dá)水平與T-ALL 臨床指標(biāo)和NF-κB通路間的相關(guān)性 Notch1表達(dá)水平與T-ALL臨床指標(biāo)相關(guān)性分析結(jié)果如表1 所示,Notch1 表達(dá)水平與LDH 水平、白細(xì)胞水平和危險(xiǎn)度分級之間呈正相關(guān)(r=0.102,P=0.025;r=0.247,P=0.019;r=0.429,P=0.006),而與年齡和性別無顯著相關(guān)性。Notch1 與NF-κB 通路抑制性蛋白IκBα mRNA 水平呈負(fù)相關(guān)(r=-0.754,P=0.039),與NF-κB 通路激活性蛋白IKKβ mRNA水平呈正相關(guān)(r=0.738,P=0.002)。提示Notch1 可能在T-ALL 疾病的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用,而NF-κB通路是其作用靶點(diǎn)。

        表1 Notch1表達(dá)水平與T-ALL患者臨床指標(biāo)和NF-κB通路間的相關(guān)性Tab.1 Correlation between Notch1 expression and clinical characteristics and NF-κB pathway in T-ALL patients

        2.3 Notch1 表達(dá)水平與T-ALL 患者生存時(shí)間的關(guān)聯(lián) 對67例患者進(jìn)行電話隨訪或門診隨訪,未出現(xiàn)失訪病例。通過Kaplan-Meier 法分析Notch1 表達(dá)水平與T-ALL 患者生存時(shí)間的關(guān)系。結(jié)果表明,Notch1 高表達(dá)組[(12.7±3.4)個(gè)月]的中位總生存時(shí)間低于Notch1 低表達(dá)組[(18.5±2.2)個(gè)月],差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=1.677,P=0.038),見圖2。表明Notch1表達(dá)水平與T-ALL患者生存時(shí)間有關(guān)。

        圖2 Notch1表達(dá)水平與T-ALL患者生存時(shí)間的關(guān)聯(lián)Fig.2 Associations between Notch1 expression level and survival time in patients with T-ALL

        2.4 沉默Notch1 基因?qū)κBα 和IKKβ mRNA 表達(dá)的影響 qRT-PCR 分析各組mRNA 的相對表達(dá)量。結(jié)果表明,Jurkat 細(xì)胞Notch1 mRNA 的表達(dá)水平高于正常PBMC(P<0.05),下調(diào)Notch1基因表達(dá)后,與Jurkat 細(xì)胞+si-NC 組相比,IκBα mRNA 水平顯著上調(diào)(P<0.05),而IKKβ mRNA 顯著下調(diào)(P<0.05)。見圖3。以上結(jié)果表明沉默Notch1 基因可在mRNA水平上抑制NF-κB通路。

        圖3 沉默Notch1基因后Notch1、IκBα、IKKβ mRNA表達(dá)的變化Fig.3 Changes of Notch1,IκBα,IKKβ mRNA expressions after silencing Notch1 gene

        2.5 沉默Notch1 基因?qū)κBα 和IKKβ 蛋白表達(dá)的影響 Western blot 結(jié)果表明,Jurkat 細(xì)胞Notch1 蛋白表達(dá)水平高于正常PBMC,下調(diào)Notch1 基因的表達(dá)后,與Jurkat 細(xì)胞+si-NC 組相比,p-IκBα 水平上調(diào),而p-IKKβ 下調(diào)(圖4)。以上結(jié)果表明,沉默Notch1基因可在蛋白質(zhì)水平上抑制NF-κB通路。

        圖4 沉默Notch1基因?qū)κBα和IKKβ蛋白表達(dá)的影響Fig.4 Effect of silencing Notch1 gene on expressions of IκBα and IKKβ protein

        3 討論

        T-ALL 是一種T 淋巴細(xì)胞相關(guān)的惡性腫瘤。近年來,隨著化療治療手段的進(jìn)步,T-ALL患者完全緩解率有了一定的改善[9-10]。然而,其總體生存率仍然較低。復(fù)發(fā)是當(dāng)前治療T-ALL 面臨的主要挑戰(zhàn)[11-12]。因此,深入了解T-ALL 的發(fā)病機(jī)制,尋找有效的治療靶點(diǎn),對于改善T-ALL患者預(yù)后至關(guān)重要。

        Notch1 是一種廣為人知的調(diào)節(jié)因子,在許多惡性腫瘤中發(fā)揮致癌基因作用[13]。Notch1 主要分布在造血干細(xì)胞、淋巴細(xì)胞等細(xì)胞表面,參與了造血細(xì)胞的自我更新。Notch1 的突變或過度激活可能會(huì)導(dǎo)致T 淋巴細(xì)胞異常[14]。在小鼠模型中,Notch1信號通路的組成性激活可誘導(dǎo)T-ALL 的發(fā)生,而抑制Notch1 信號通路可抑制T-ALL 細(xì)胞增殖并促進(jìn)細(xì)胞凋亡[15]。此外,Notch1 與化療耐藥有關(guān),這是T-ALL 預(yù)后不良的主要原因[16]。Notch 信號通路由Notch 受體、配體、DNA 結(jié)合蛋白和靶分子構(gòu)成,當(dāng)Notch 通路被激活后,胞內(nèi)片段可進(jìn)入細(xì)胞核促進(jìn)靶基因轉(zhuǎn)錄,Notch1 的靶基因主要包括Hes1、c-myc和NF-κB等[17]。

        在T-ALL 中,IKK/I-κB/NF-κB 通路是Notch1 主要的下游通路。NF-κB 是一種序列特異性DNA 結(jié)合蛋白,可誘導(dǎo)與炎癥反應(yīng)相關(guān)的細(xì)胞因子表達(dá)。有研究發(fā)現(xiàn),阻斷NF-κB 通路可降低Notch1 突變的白細(xì)胞數(shù)量,提示NF-κB 可能是Notch1 的靶點(diǎn)[18]。通過抑制Nocth1 受體的活化調(diào)控下游靶基因,在T-ALL臨床治療中已經(jīng)展現(xiàn)出良好的前景[19]。

        本研究共納入67 例T-ALL 患者,收集其年齡、性別、LDH 水平、白細(xì)胞水平和危險(xiǎn)度分級等臨床資料。分離其PBMC并提取RNA,分析Notch1 mRNA的表達(dá)水平。結(jié)果表明,與健康人相比,T-ALL 組PBMC中Notch1 mRNA表達(dá)顯著升高(P<0.05)。提示Notch1 在T-ALL 的發(fā)生發(fā)展中可能發(fā)揮重要作用。此外,課題組分析了Notch1 表達(dá)與T-ALL 臨床指標(biāo)的相關(guān)性,結(jié)果發(fā)現(xiàn),Notch1 與LDH 水平、白細(xì)胞水平和危險(xiǎn)度分級呈正相關(guān)(r=0.102,P=0.025;r=0.247,P=0.019;r=0.429,P=0.006),而與年齡和性別無顯著相關(guān)性,提示Notch1 mRNA 表達(dá)水平可能是T-ALL診斷及預(yù)后評估的重要因素之一。本研究納入的樣本量有限,有關(guān)結(jié)論還需更多驗(yàn)證。課題組進(jìn)一步在細(xì)胞水平上分析了Notch1 對NF-κB通路的影響,通過RNA 干擾技術(shù)成功下調(diào)Notch1在mRNA 和蛋白水平上的表達(dá),結(jié)果表明沉默Notch1可明顯上調(diào)IκBα mRNA 和p-IκBα 蛋白水平,明顯下調(diào)IKKβ mRNA 和p-IKKβ 蛋白水平,提示NF-κB通路是Notch1 的重要靶點(diǎn)之一,但具體機(jī)制有待進(jìn)一步研究。

        總之,本研究發(fā)現(xiàn)Notch1 基因在T-ALL 患者血漿PBMC 中高表達(dá),與患者LDH 水平、白細(xì)胞水平和危險(xiǎn)度分級等臨床指標(biāo)和生存率相關(guān),Notch1 mRNA 有望成為T-ALL 早期診斷和預(yù)后評估的重要指標(biāo)。此外,Notch1 可能通過NF-κB 通路發(fā)揮調(diào)控作用。但本研究中的病例數(shù)有限,下一步工作還需要擴(kuò)大樣本量對文中結(jié)論做進(jìn)一步驗(yàn)證,同時(shí)對Notch1參與T-ALL發(fā)展的分子機(jī)制做深入探討。

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