賴文昶 黃森豪 祁成民 吳仁燁
摘 ? ?要:水稻是我國主要糧食作物之一,水稻育種是一項(xiàng)重要的科研工作。隨著科技的發(fā)展,相關(guān)人員研發(fā)出越來越多的新型生物技術(shù),例如基因工程、細(xì)胞工程、分子標(biāo)記技術(shù)、基因編輯技術(shù)等,并在水稻育種研究中得到廣泛的應(yīng)用,解決了育種工作中出現(xiàn)的許多問題。文章論述了生物技術(shù)在水稻育種中的作用,總結(jié)了生物技術(shù)在水稻育種中存在的問題,以供參考。
關(guān)鍵詞:水稻育種;生物技術(shù);基因工程;細(xì)胞工程;分子標(biāo)記技術(shù);基因編輯技術(shù)
文章編號:1005-2690(2022)09-0034-03 ? ? ? 中國圖書分類號:S511 ? ? ? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:B
水稻是稻屬谷類作物,是世界上最主要的三大糧食作物之一,種植面積占世界糧食總面積的1/5。我國是世界上最大的水稻生產(chǎn)國和消費(fèi)國,水稻產(chǎn)量約占全國糧食總產(chǎn)量的1/2。同時(shí),水稻在釀酒、醫(yī)藥、工業(yè)等領(lǐng)域應(yīng)用廣泛,水稻事業(yè)的發(fā)展與國家糧食安全關(guān)系重大。
生物技術(shù)以基因工程和細(xì)胞工程為核心,包含發(fā)酵工程、酶工程等生物技術(shù)的新興學(xué)科。目前,我國水稻育種面臨病蟲害頻發(fā)、人多地少、選育效率低等問題,生物技術(shù)可以有效解決這些問題,被廣泛應(yīng)用于水稻育種中。
1 基因工程
基因工程也被稱作基因拼接技術(shù)和DNA重組技術(shù),是在分子生物學(xué)和微生物學(xué)的基礎(chǔ)上,以分子遺傳學(xué)為理論來源的現(xiàn)代生物技術(shù)。水稻基因工程育種是把需要的目的基因克隆轉(zhuǎn)移到水稻上,進(jìn)而實(shí)現(xiàn)對水稻遺傳特性的改良。同時(shí),通過建立完善高效的遺傳轉(zhuǎn)化體系,對優(yōu)良的目的基因進(jìn)行整合和表達(dá),使之穩(wěn)定地遺傳給下一代[1]。在基因轉(zhuǎn)化過程中常被使用的外植物體包括愈傷組織、原生質(zhì)體和根尖、莖尖等組織器官,水稻的幼穗、幼胚和花藥等愈傷細(xì)胞往往作為基因轉(zhuǎn)化的受體。
目前,水稻轉(zhuǎn)基因包括抗病性基因、抗蟲性基因、抗除草劑基因、抗逆性基因以及品質(zhì)改良基因等。促進(jìn)水稻基因工程育種的發(fā)展對于培育高產(chǎn)、抗病、抗蟲、抗逆的新型水稻品種,對推動農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的可持續(xù)發(fā)展具有重要意義。
1.1 基因槍法
基因槍法是利用高壓放電、壓縮氣體等方法產(chǎn)生的巨大動力,使黏有目標(biāo)DNA的高速金(鎢)微粒轟擊進(jìn)入靶細(xì)胞,再通過未知機(jī)制,將外源DNA導(dǎo)入植物染色體上實(shí)現(xiàn)基因轉(zhuǎn)移的技術(shù)。
基因槍法的可控度較高,可根據(jù)需要將金屬顆粒射入特定的細(xì)胞,并且不受宿主的限制。但基因槍轟擊位點(diǎn)的隨機(jī)性和整合位點(diǎn)的不固定性,大大增加了基因突變、丟失和基因沉默的可能性,影響了外源基因在生物體內(nèi)的穩(wěn)定表達(dá)。
1.2 花粉管通道法
花粉管通道法也被稱為授粉后外源基因?qū)胫参锛夹g(shù)。在植物完成授粉后,柱頭部位的花粉會形成一個(gè)花粉管通道,然后采用人工方法將外源DNA轉(zhuǎn)移至胚囊。由于受精卵和生殖細(xì)胞仍處于未形成細(xì)胞壁的“原生質(zhì)體”狀態(tài),外源DNA片段容易進(jìn)入、整合到原有的基因組中,達(dá)到遺傳轉(zhuǎn)化的目的。
當(dāng)前流行的方法包括花粉管直接攜帶法、花粉勻漿涂抹柱頭法、自花授粉后導(dǎo)入法、受體花粉及供體DNA混合授粉法等。
1.3 農(nóng)桿菌介導(dǎo)法
農(nóng)桿菌是在土壤中普遍存在的一種革蘭氏陰性菌,能夠在自然條件下有選擇地感染大多數(shù)雙子葉植物的受傷部位,產(chǎn)生根癌農(nóng)桿菌和發(fā)根農(nóng)桿菌。具體過程是將根癌農(nóng)桿菌Ti質(zhì)粒和發(fā)根農(nóng)桿菌Ri質(zhì)粒中的一段T-DNA插入到植物基因組中,進(jìn)而對水稻的性狀進(jìn)行改良[2]。
1.3.1 農(nóng)桿菌介導(dǎo)水稻的優(yōu)點(diǎn)
與基因槍法、花粉管通道法相比,農(nóng)桿菌介導(dǎo)法是最經(jīng)濟(jì)、操作最為簡單的方法。農(nóng)桿菌介導(dǎo)法利用天然的載體轉(zhuǎn)化系統(tǒng),具有高效率、高成功率的特點(diǎn)。外源DNA有明顯的轉(zhuǎn)化機(jī)理,能夠在轉(zhuǎn)化過程中保持穩(wěn)定。外源基因在植物器官內(nèi)進(jìn)行特異性表達(dá),可進(jìn)行人為控制。
通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)入的外源DNA結(jié)構(gòu)完整,反應(yīng)機(jī)理清楚,整合位點(diǎn)穩(wěn)定。經(jīng)過Ti質(zhì)粒轉(zhuǎn)化系統(tǒng)轉(zhuǎn)化的外源大多以單拷貝為主,且符合孟德爾遺傳定律。因此通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)法獲得的植物大多被應(yīng)用于育種的中間選育材料。T-DNA含有能夠被植物體識別的功能啟動子和轉(zhuǎn)錄信號,能夠使外源DNA和T-DNA一同在植物體內(nèi)表達(dá)[3]。
1.3.2 農(nóng)桿菌介導(dǎo)水稻的缺點(diǎn)
存在再生細(xì)胞感受態(tài)與轉(zhuǎn)化細(xì)胞感受態(tài)不一致的情況。農(nóng)桿菌可能會使檢測結(jié)果出現(xiàn)假陽性。農(nóng)桿菌介導(dǎo)目前僅在雙子葉植物中被廣泛應(yīng)用,對于單子葉植物的轉(zhuǎn)化仍比較困難。
2 細(xì)胞工程
2.1 細(xì)胞工程育種簡述
細(xì)胞工程的主要理論支撐和思想來源是Haberlandt在20世紀(jì)初提出的植物細(xì)胞全能性,是指植物體的每個(gè)體細(xì)胞都攜帶一整套完整的植物基因組,在理論上具備發(fā)育成一個(gè)完整植株的能力。
在細(xì)胞水平上對植物細(xì)胞進(jìn)行融合,再通過細(xì)胞核質(zhì)移植、染色體移植等操作,培育植物新品種、改善植物性狀或引入新性狀。當(dāng)前流行的細(xì)胞工程技術(shù)主要有無性系篩選、原生質(zhì)體培養(yǎng)、體細(xì)胞雜交、花藥培養(yǎng)和多倍體育種等。
植物學(xué)家曾運(yùn)用細(xì)胞工程技術(shù)雜交兩種植物的體細(xì)胞創(chuàng)造出一個(gè)新細(xì)胞,對其進(jìn)行單細(xì)胞培養(yǎng),讓先分裂分化為組織,進(jìn)而發(fā)芽生根,最后發(fā)育成新植物,新植物同時(shí)具有親代的各自特征,而且在外觀上很像親代植物的組合體。
更有生物學(xué)家幻想將動物細(xì)胞與植物細(xì)胞相融合,讓動物具有植物的葉綠體,使其具有光合作用,能夠自己合成營養(yǎng)物質(zhì)。除此之外,還有許多基于細(xì)胞工程得以實(shí)現(xiàn)的成果,目前細(xì)胞工程的許多技術(shù)已十分成熟,且廣泛應(yīng)用于各個(gè)領(lǐng)域。
2.2 細(xì)胞工程育種的特點(diǎn)
細(xì)胞工程育種可以改良舊植物品種或產(chǎn)生新植物品種,篩選出良好性狀的植物品種,改善植物的生長速度、繁殖速度,實(shí)現(xiàn)種子脫毒。運(yùn)用細(xì)胞工程技術(shù)改良的植物可以穩(wěn)定遺傳性狀,加快育種進(jìn)程,提高育種效率,縮短育種年限。體細(xì)胞融合技術(shù)和雜交技術(shù)等新技術(shù)的出現(xiàn),可以幫助相關(guān)人員克服植物間遠(yuǎn)緣雜交不親和的問題。
2.3 細(xì)胞工程技術(shù)在水稻育種中的應(yīng)用
早在20世紀(jì)70年代,我國便開始將細(xì)胞工程技術(shù)運(yùn)用于水稻育種。先是中國科學(xué)院嘗試將水稻花粉離體培養(yǎng),不久中科院遺傳所率先使用單倍體育種法先后培育出兩個(gè)新品種水稻,在之后的50多年里,我國育種專家不斷將各種細(xì)胞工程技術(shù)運(yùn)用到水稻育種中,如今許多技術(shù)已相當(dāng)成熟并實(shí)現(xiàn)了廣泛應(yīng)用[4]。例如,水稻的花藥培養(yǎng)技術(shù)不僅應(yīng)用于常規(guī)育種與雜交育種,而且在水稻“恢復(fù)系”和“不恢復(fù)系”材料的選育方面也發(fā)揮了重要作用。
3 分子標(biāo)記技術(shù)
3.1 分子標(biāo)記技術(shù)的簡介及原理
DNA分子標(biāo)記技術(shù)是一種依靠基因組DNA中核苷酸排列順序的差異示位、追蹤、顯示不同個(gè)體之間所潛藏的遺傳變異差異的生物技術(shù)[5]。分子標(biāo)記最早出現(xiàn)要追溯到20世紀(jì)80~90年代SSR技術(shù)(Simple Sequence Repeat:簡單重復(fù)序列)和RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism:限制性片段長度多態(tài)性)的橫空出世。
前者是依靠當(dāng)時(shí)已經(jīng)成熟的PCR技術(shù)(Polymerase Chain Reaction)和微衛(wèi)星DNA特性的標(biāo)記技術(shù),原理是在真核生物基因組上會出現(xiàn)短串聯(lián)重復(fù)序列這一序列,又稱微衛(wèi)星DNA,不同個(gè)體之間的重復(fù)序列長度不同,根據(jù)這一差異可以在微衛(wèi)星序列的兩端設(shè)計(jì)引物,再通過PCR技術(shù)對微衛(wèi)星序列進(jìn)行大量擴(kuò)增。因?yàn)椴煌瑐€(gè)體間的序列長度不同,所以使用PCR技術(shù)擴(kuò)增出的序列長度也有所不同,因此電泳出的條帶大小也不同。
RFLP技術(shù)比SSR技術(shù)更早,早在1974年Grodzicke等人就創(chuàng)立了RFLP技術(shù),其建立在DNA雜交技術(shù)原理的基礎(chǔ)上,同時(shí)也是最早廣泛應(yīng)用的分子標(biāo)記技術(shù)。分子標(biāo)記技術(shù)首先使用特定的限制性內(nèi)切酶對整個(gè)基因組進(jìn)行切割,得到長度不同的DNA片段,再通過southern雜交和放射性影像顯示得到相應(yīng)的圖譜,不同圖譜能反映出不同個(gè)體間酶切位點(diǎn)的多態(tài)性。RFLP技術(shù)因?yàn)槠涔诧@性與特定位點(diǎn)的多樣性,在遺傳圖譜的構(gòu)建、遺傳育種、臨床醫(yī)療診斷等許多領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用。
3.2 分子標(biāo)記技術(shù)的特點(diǎn)
分子標(biāo)記技術(shù)相對于其他標(biāo)記技術(shù)來說優(yōu)點(diǎn)突出,分子標(biāo)記技術(shù)受環(huán)境影響較小、穩(wěn)定性較高、準(zhǔn)確性高、多態(tài)性強(qiáng)。分子標(biāo)記技術(shù)以基因突變?yōu)榛A(chǔ),分子標(biāo)記的數(shù)量眾多且分布較廣,從理論的角度出發(fā),標(biāo)記的數(shù)量幾乎是無限的,生物發(fā)育的各個(gè)時(shí)期,不同器官、不同組織的DNA都可以用作于分子標(biāo)記分析。
大多數(shù)DNA分子標(biāo)記具有共顯性,利用這一特點(diǎn)能夠鑒定和識別雜合子與純合子的基因型。分子標(biāo)記的表現(xiàn)為中性,對表達(dá)目標(biāo)性狀的影響幾乎為零,并且與不良性狀不存在任何連鎖關(guān)系,最重要的是操作簡單、檢驗(yàn)迅速。
3.3 分子標(biāo)記技術(shù)在水稻遺傳育種中的應(yīng)用
通過分子標(biāo)記技術(shù)進(jìn)行基因定位、基因型鑒定、目的基因篩選、基因克隆等操作都是育種過程中所需要的,分子標(biāo)記技術(shù)不僅提高了準(zhǔn)確性及選擇效率,還縮短了育種周期與育種年限,具有很強(qiáng)的目的性,在水稻的遺傳育種中應(yīng)用非常廣泛。
分子標(biāo)記技術(shù)在水稻的抗病蟲育種中同樣發(fā)揮了重要作用,在抗病基因的選擇上得益于分子標(biāo)記技術(shù)輔助,準(zhǔn)確率和精確率得以大大提高。尤其在抗稻瘟病的研究中發(fā)揮了非常重要的作用。
我國科學(xué)家鄭祥正等發(fā)明了一種名叫InDel的標(biāo)記,該標(biāo)記能夠準(zhǔn)確實(shí)現(xiàn)抗病基因和非抗病基因的基因分型,大大簡化了水稻抗稻瘟病種質(zhì)的篩選工作[6]。陳紅旗等通過分子標(biāo)記技術(shù)在保持系金23B中導(dǎo)入基因Pi-1,Pi-3(抗稻瘟病基因),使其達(dá)到了96.7%的抗病率[7]。
分子標(biāo)記技術(shù)還可以幫助構(gòu)建水稻的分子遺傳圖譜,以分子標(biāo)記技術(shù)為工具,通過目的基因分子標(biāo)記之間的緊密連鎖實(shí)現(xiàn)目的基因的定位,構(gòu)建出水稻的高密度的遺傳連鎖圖譜。1988年McCouh率先構(gòu)建了第一張水稻遺傳圖譜,Causse等和Harushima等緊隨其后分別完成了不同標(biāo)記數(shù)量的高密度遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建工作,在之后的30多年間標(biāo)記位點(diǎn)數(shù)目不斷增加,已經(jīng)達(dá)到326個(gè)RFLP標(biāo)記,公布的水稻SSR標(biāo)記達(dá)到14 000多個(gè),基本實(shí)現(xiàn)了基因組的全部覆蓋。
4 基因編輯技術(shù)
4.1 基因編輯技術(shù)的簡介及特點(diǎn)
基因編輯也被稱作基因組編輯(genome editing)或基因組工程(genome engineering),是一種能夠準(zhǔn)確修飾生物體特定目標(biāo)基因的新興技術(shù)。基因編輯技術(shù)是利用去除或添加基因、替代基因、定點(diǎn)突變等方式修飾原有的基因,改變物種原有的基因型,進(jìn)而實(shí)現(xiàn)物種性狀的改變。目前,比較流行的基因編輯技術(shù)包括一代ZFNs基因編輯技術(shù)、二代TALENs基因編輯技術(shù)和三代CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)[8]。
4.2 基因編輯技術(shù)在水稻育種中的應(yīng)用
目前,大量試驗(yàn)數(shù)據(jù)表明,基因編輯技術(shù)與水稻育種速率和效率密切相關(guān)。利用CRISPR/Cas9技術(shù)培育的水稻具有較高的出苗率。覃玉芬等通過CRISPR/Cas9技術(shù)系統(tǒng)編輯水稻品種GXU41中TMS5的兩個(gè)靶點(diǎn)位,獲得純合突變的T0代陽性植株,并在T1代獲得到無外源標(biāo)記的植株。表明該技術(shù)能夠提高得到TGMS系效率。
隨著生活水平的提高,人們對水稻的口感和香糯程度也有了更高的要求,基因編輯技術(shù)恰恰使這一目標(biāo)成為現(xiàn)實(shí)?,F(xiàn)階段,可使用基因編輯技術(shù)改良人們所需的水稻性狀,從而將水稻中直鏈淀粉的含量達(dá)到最適水平[9]。
5 生物技術(shù)在水稻育種中存在的問題與展望
雖然當(dāng)前生物技術(shù)在水稻育種中得以廣泛應(yīng)用,取得了較大進(jìn)展,但仍存在一些現(xiàn)實(shí)性問題亟待解決。我國缺乏高效完整的基因發(fā)掘技術(shù),對于實(shí)用分子的標(biāo)記仍處于空白,一些重要的目標(biāo)性狀基因急需標(biāo)記。水稻花藥培養(yǎng)技術(shù)仍處于發(fā)展階段,水稻的出愈率、綠芽分化率較低,后期可能會影響后代的基因型表達(dá)。應(yīng)用生物技術(shù)培育的水稻雖然實(shí)現(xiàn)了目標(biāo)性狀的轉(zhuǎn)移,但要想應(yīng)用于生產(chǎn)必須通過常規(guī)育種進(jìn)行加工。農(nóng)桿菌介導(dǎo)技術(shù)無法同時(shí)標(biāo)記多個(gè)目標(biāo)性狀,農(nóng)藝產(chǎn)品無法滿足市場對品種的需求[10]。
因此,要加快水稻基因工程與細(xì)胞工程的結(jié)合,充分利用我國豐富的水稻種質(zhì)資源,建立優(yōu)良的水稻核心種質(zhì)資源基因庫,利用分子標(biāo)記技術(shù)對不同的種質(zhì)進(jìn)行遺傳多樣性評價(jià),構(gòu)建以農(nóng)家稻、野生稻、恢復(fù)系、不育系為核心的種質(zhì),為我國水稻發(fā)展提供源源不斷的種質(zhì)資源。將生物技術(shù)和常規(guī)育種相結(jié)合,使用回交方法將導(dǎo)入基因轉(zhuǎn)入生產(chǎn)品種中,或通過常規(guī)品種和轉(zhuǎn)基因品種的雜交,利用系譜法選出新品種。
只要抓住生物技術(shù)發(fā)展的契機(jī),充分做足理論、技術(shù)的準(zhǔn)備,就能利用生物技術(shù)實(shí)現(xiàn)水稻優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)、廣適應(yīng)性改良的目標(biāo),更好地緩解糧食供給側(cè)結(jié)構(gòu)矛盾,促進(jìn)我國水稻產(chǎn)業(yè)增效提質(zhì)。
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