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        PCR技術(shù)在食品微生物檢測中的應(yīng)用價值

        2022-06-20 12:00:03張譯芳王圣瑜
        中國食品 2022年9期
        關(guān)鍵詞:標準值沙門氏菌定量

        張譯芳 王圣瑜

        本文主要探究PCR技術(shù)在食品微生物檢測中的應(yīng)用價值,以期能夠為相關(guān)從業(yè)人員提供可借鑒的經(jīng)驗。首先闡述PCR技術(shù)的主要內(nèi)涵和類型,并對PCR技術(shù)的具體應(yīng)用方法進行總結(jié),然后通過多重串聯(lián)式實時熒光定量PCR檢測方法,對樣品基因組DNA進行提取,從而分析食品微生物情況。試驗證明,PCR技術(shù)在食品微生物檢驗中具有良好的應(yīng)用效果。

        一、PCR技術(shù)的基本概述

        PCR技術(shù)是指聚合反應(yīng)鏈技術(shù),利用模板在核苷酸底物和DNA聚合酶的共同作用下,擴增DNA數(shù)量,在食品安全檢測中可以測定食品過敏源、食源微生物、乳品企業(yè)的阪崎腸桿菌等,應(yīng)用前景十分廣闊。具體而言,PCR技術(shù)可以分為常規(guī)PCR技術(shù)、實時熒光定量PCR技術(shù)和數(shù)字PCR技術(shù)這三種類型。

        1.常規(guī)PCR技術(shù)。通過退火、變性、延伸,復(fù)制子鏈DNA,快速實現(xiàn)體外擴增的目的,儀器試劑成本較低。

        2.熒光定量PCR技術(shù)。作為當(dāng)前應(yīng)用最廣泛的食品微生物檢測技術(shù)之一,熒光定量PCR技術(shù)是一種在DNA擴增反應(yīng)中通過熒光化學(xué)物質(zhì)測得每次聚合酶鏈式反應(yīng)循環(huán)后產(chǎn)生總量的方法,利用內(nèi)參或外參方法對待測樣品中的DNA序列進行定量分析,通過熒光信號對PCR進程實時檢測。在PCR擴增指數(shù)過程中,模板CT值與該模板的起始復(fù)制數(shù)存在線性關(guān)系,所以可以作為定量依據(jù),并且此法較為成熟,操作簡單,試劑成本中等,配套儀器和試劑均較為齊全,特異性也較強。

        3.數(shù)字PCR技術(shù)。數(shù)字PCR技術(shù)可以直接讀取DNA分子個數(shù),是一種核酸分子絕對定量計數(shù),利用專業(yè)檢測設(shè)備(比如QX100dPCR),可以將擴增后的芯片轉(zhuǎn)移至微滴閱讀分析系統(tǒng),之后讀取熒光信號。整個過程在封閉的芯片中運行,操作較為復(fù)雜,但是污染的風(fēng)險性較低,通過評估數(shù)字PCR平臺以及平臺之間相互驗證,可以使測定結(jié)果更加精準。

        二、PCR技術(shù)在食品微生物檢測中的具體應(yīng)用

        在食品微生物檢測中,PCR技術(shù)主要是利用微生物分子檢測儀,對有害微生物的核酸進行提取,然后構(gòu)建熒光定量PCR體系,通過多重串聯(lián)式實時熒光定量PCR檢測方法,對樣品基因組DNA進行提取,從而分析食品微生物情況。具體應(yīng)用方法如下:

        1.選定檢測儀器。在進行微生物檢測之前,要選擇合適的檢測儀器,本文主要以CSY-ATP檢測儀為例。CSY-ATP檢測儀能夠?qū)λ形⑸铩⑹称分形⑸?、餐飲器具等進行快速檢測,利用生物化學(xué)方法來檢驗ATP菌落總數(shù),其檢測精度為1*10-16molestp,檢測范圍為1-9999PLUS,重復(fù)性≤5%。由于含有高靈敏度光度計,此檢測方法較為便捷,不需要復(fù)雜的前期處理。利用微生物分子檢測儀,可以測試果汁、豆?jié){、雞肉、牛奶、面包、水產(chǎn)品等樣本中的微生物含量;利用多孔板可以完成多次試驗,檢測出食品中含有的沙門氏菌、金黃色葡萄球菌、蠟樣芽孢桿菌、大腸埃希菌、單核細胞增生李斯特氏菌等多種食源性疾病的主流微生物。技術(shù)人員也可以構(gòu)建多重串聯(lián)式實時熒光定量PCR檢測方法,但是應(yīng)用到的主要儀器設(shè)備除了CSY-ATP檢測儀,還包括多重PCR試劑盒、立式壓力蒸汽滅菌器、冰箱、凝膠成像儀、核酸電泳儀、梯度PCR儀、超微量分光光度計、光學(xué)顯微鏡等,檢驗過程需要在全封閉情況下進行,防止出現(xiàn)假陰性和假陽性情況,從而提高檢測質(zhì)量和準確性。

        2.試驗與檢測方法。(1)配置試劑。①BHI肉湯:取雞肉或者豬肉作為樣本,稱取38.5g,放置在1000mL蒸餾水中,加熱攪拌使其溶解,在121℃高壓環(huán)境下滅菌,滅菌時間為15-18min。②0.5*TBE:用滅菌純水稀釋50mL的10*TBE,放置在25℃環(huán)境中保存。③10*TBE:將108g的Ttis、55g的硼酸、0.5M的Na2EDTA(40mL)混入800mL蒸餾水中,對pH值進行調(diào)整,確保pH值能夠穩(wěn)定在7.8-8.0范圍內(nèi),然后放置在高壓滅菌室中保存。④2%瓊脂糖凝膠:稱取定量瓊脂糖,每份0.9g,加入0.5*TBE,用量為30mL,放置于藍蓋瓶中,用微波爐加熱1min,待瓊脂糖全部溶解后,取出倒入模具冷卻。⑤BHI瓊脂:稱取瓊脂糖40g,將其溶解之后放入蒸餾水中分裝,蒸餾水含量為1000mL,之后放入121℃高溫環(huán)境下進行滅菌,滅菌時間設(shè)定為15-18min。

        (2)構(gòu)建PCR檢測體系。對需要檢測的靶基因進行擴增,將目標菌種制成模板,混合液含有每個菌種20ng,其多重PCR反應(yīng)體系和PCR反應(yīng)程序如表1所示。

        在多重PCR反應(yīng)體系和PCR反應(yīng)程序構(gòu)建完成之后,按照測定結(jié)果繪制標準曲線,得到擴增效率。根據(jù)稀釋倍數(shù)的不同,確定菌落計數(shù)結(jié)果。每隔12h進行三重PCR檢測,如果變異系數(shù)均維持在1.3%-3.9%,說明所采用的測試方法重復(fù)性良好,具有良好的精準性。

        (3)試驗操作。以PCR技術(shù)在檢測牛奶中沙門氏菌含量的研究作為試驗案例,選擇合適的PCR模板制備方法,之后進行靈敏度試驗,得出檢測試樣中沙門氏菌的敏感性。具體操作方法如下:

        ①樣品選擇和純菌培養(yǎng)。選擇市場中的普通牛奶產(chǎn)品(盒裝,每盒250mL),經(jīng)過高壓蒸汽滅菌處理后放置在冰箱中保存,冷藏溫度保持在4℃-5℃,全部試驗菌株接種5mL液體,液體培養(yǎng)需要震蕩,培養(yǎng)基為LB,培養(yǎng)溫度為37℃-38℃,震蕩速率為220r/min。采用乙醇沉淀法制備PCR模板,提取1mL細菌培養(yǎng)液離心2min,轉(zhuǎn)速為12000r/min,置于小離心管中;采用滅菌蒸餾水洗滌,利用懸浮液緩沖,懸浮液為300μL,之后在8000r/min的環(huán)境下離心20min,隔水煮沸15min;加入40μL醋酸鈉,pH值為5.4;加入無水乙醇80μL,在12000r/min的環(huán)境下離心20min,利用50μL的TE緩沖劑復(fù)溶;利用70%乙醇進行洗滌,放入4℃冰箱中冷卻之后取出,即為模板。

        ②檢測結(jié)果分析。以上述試驗流程得到的樣品DNA為模板,將具有一定濃度的菌液接種到試驗樣本中,提取樣本中的基因組DNA,對擴增CT值進行繪圖,檢測MT-PCR。依據(jù)MT-PCR標準曲線,測定樣本中MT-PCR的檢測下限,其中阪崎腸桿菌的檢測下限為103LOD(CFU/g)、大腸埃希菌的檢測下限為103LOD(CFU/g)、蠟樣芽孢桿菌的檢測下限為103LOD(CFU/g)、金黃色葡萄球菌的檢測下限為103LOD(CFU/g)、單核細胞增生李斯特氏菌的檢測下限為102LOD(CFU/g)、福氏志賀氏菌的檢測下限為103LOD(CFU/g)。觀察R2值,若R2值符合標準值規(guī)定,說明樣品微生物檢測合格;若超過標準值,則說明樣品微生物檢測不合格,樣品中存在微生物超標問題,不符合食品安全條例,這種食品如果被消費者食用,會給消費者的身體健康造成一定影響。

        三、PCR技術(shù)在食品微生物檢測中的應(yīng)用價值

        沙門氏菌是引起食源感染性腹瀉的致病微生物之一,其菌型繁多,嚴重威脅消費者的安全和健康。傳統(tǒng)的檢測方法更依賴于微生物檢測法或免疫熒光試驗法,但卻費時費力,并且可能存在假陽性、假陰性問題,不適于常規(guī)檢查,如果利用PCR擴增技術(shù)則可以提高檢測的準確性。

        隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展,PCR技術(shù)已經(jīng)成為分子檢測領(lǐng)域的佼佼者,不僅在病源體檢測方面具有一定的優(yōu)勢,在病源微生物檢測方面的靈敏性也更高,對各種類型都可以進行檢測,大大縮短了報告周期,與傳統(tǒng)檢測方法相比,操作更為簡單。

        由于不同微生物所需要的營養(yǎng)物質(zhì)、溫濕度、pH值均有不同,在微生物檢測中需要耗費大量的人力和物力去觀察革蘭氏染色情況、菌落特征和細胞特征,自動化程度不高,無法滿足現(xiàn)代食品微生物檢測的需要。而利用PCR技術(shù)可以由一個人完成檢測過程,一天就可以得出結(jié)果,還可以同時檢測多種病原微生物,而傳統(tǒng)微生物檢測方法至少需要七天。

        除了在牛奶中檢測沙門氏菌,技術(shù)人員也可以按照相應(yīng)的標準和操作流程,對其他微生物菌落進行檢驗,將其他菌體接種至液體培養(yǎng)基內(nèi),然后測定PCR技術(shù)在食品微生物檢測方面的有效性,測定樣品的偏差值。比如,將市面上某家超市中采集的牛奶、醬油、面包、雞肉、飲料作為樣本,測定其菌體含量,具體數(shù)據(jù)如表2所示。

        通過表2的數(shù)據(jù)可以發(fā)現(xiàn),采用PCR技術(shù)測定食品微生物含量,能夠得到各種菌落的實際情況。例如,在牛奶檢測過程中,其沙門氏菌的標準值為23.11%,金黃色葡萄球菌的標準值為20.80%,但在檢測過程中,只有樣品1和樣品2的沙門氏菌含量在標準值之內(nèi),而樣品3的沙門氏菌含量高于標準值,同時只有樣品1的金黃色葡萄球菌在標準值范圍之內(nèi),樣品2和樣品3的金黃色葡萄球菌均超于標準值。因此,若只將沙門氏菌和金黃色葡萄球菌兩項微生物作為檢驗標準,僅有樣品1符合食品安全規(guī)定。以此類推,可以判定食物微生物是否超標,也可以證明PCR技術(shù)能夠更加方便、快捷、迅速地得出檢驗結(jié)論,提高檢測質(zhì)量和準確性。348D1141-19FB-420F-9ED2-A08157F8BE63

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