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        一株產(chǎn)纖維素酶降香內(nèi)生真菌的分離鑒定及產(chǎn)酶活性檢測

        2022-04-27 10:11:36孫詩雨王金鶴
        化學與生物工程 2022年4期

        高 原,王 琢,孫詩雨,王金鶴,王 鑫

        (哈爾濱商業(yè)大學藥學院 細胞與分子生物學研究所,黑龍江 哈爾濱 150076)

        降香檀(DalbergiaodoriferaT.Chen)為豆科黃檀屬喬木,主要生長在海南、廣東等地。降香檀可供藥用,其干燥芯材稱為降香。降香具備散瘀、理氣、活血止血、定痛等功效,也可以減緩由于氣滯血瘀造成的跌打傷痛、胸脅疼痛和脘腹脹痛,還具有醫(yī)治脾胃不和、腹痛嘔吐等功效[1-2]。降香屬于國家二級保護植物,其分布受到地域和生長環(huán)境的限制,生長慢,資源日益短缺。

        從植物的內(nèi)生真菌中可獲得很多次生代謝產(chǎn)物,在植物提取、次生代謝產(chǎn)物研發(fā)方面具有較大的開發(fā)應用價值[3-5];而產(chǎn)纖維素酶內(nèi)生真菌在降香及其它中藥材活性成分的提取方面具有應用價值。鑒于此,作者從降香中分離純化獲得一株產(chǎn)纖維素酶內(nèi)生真菌,測定其產(chǎn)酶活性,并對其進行分子生物學鑒定。

        1 實驗

        1.1 材料、試劑與儀器

        新鮮降香樹枝,采于廣州市老果農(nóng)實驗基地,經(jīng)鑒定為蝶形花科、黃檀屬降香(DalbergiaodoriferaT.Chen);營養(yǎng)肉湯、馬鈴薯葡萄糖瓊脂(PDA),北京奧博星生物科技有限責任公司。

        PCR試劑盒,天根生物;DNA提取試劑盒,北京鼎國昌盛生物技術有限責任公司;其它試劑均為分析純。

        電熱鼓風干燥箱、恒溫培養(yǎng)振蕩器、高速臺式離心機、BP-9082型精密恒溫培養(yǎng)箱,上海一恒科學儀器有限公司;金屬浴,杭州博日科技有限公司;PCR儀,Eppendorf;凝膠電泳儀,北京六一生物科技有限公司;凝膠成像系統(tǒng),北京五洲東方科技發(fā)展有限公司;SX-700型高壓滅菌鍋,TOMY;BSA6202S-CW型電子分析天平,賽多利斯科學儀器有限公司;pH計,Satorius。

        1.2 方法

        1.2.1 降香內(nèi)生真菌的分離純化

        通過植物組織表面消毒法從降香樹皮中分離獲得降香內(nèi)生真菌。

        采用尖端菌絲挑取法,將降香內(nèi)生真菌接種于PDA培養(yǎng)皿上,置于28 ℃恒溫生化箱中培養(yǎng)7 d后反復純化3次。

        1.2.2 產(chǎn)纖維素酶降香內(nèi)生真菌的篩選

        待菌落長出后,通過滅菌槍頭挑取直徑約0.5 cm菌餅,接種于纖維素剛果紅培養(yǎng)皿上,做3個平行實驗,置于28 ℃恒溫生化箱中培養(yǎng)3~4 d,觀察菌落形態(tài),測量透明圈的直徑,篩選產(chǎn)纖維素酶降香內(nèi)生真菌。

        1.2.3 產(chǎn)纖維素酶降香內(nèi)生真菌的產(chǎn)酶活性檢測

        1.2.3.1 粗酶液的制備

        呂布有野心,他殺董卓,也是想單干。故而,投奔袁術、袁紹,這兩家世伐大族,皆不能容他,袁紹還想偷襲殺了他。當時群雄并起,他即與張邈、陳宮等合伙,豎立自己旗幟,想要分天下一杯羹。他去奪兗州,曹操說,這是我的地盤,你干嘛來奪,呂布說:“漢家城池,諸人有份,偏爾合得?!边@可是說了大實話。當時眾雄,豈非都在瓜分漢家天下?

        挑取高產(chǎn)纖維素酶的降香內(nèi)生真菌菌絲,轉接至200 mL PDB液體培養(yǎng)基中,調(diào)整搖床溫度為30 ℃,培養(yǎng)7~10 d,無菌紗布過濾獲得培養(yǎng)液,乙酸乙酯萃取3次,合并萃取物,旋轉蒸發(fā)至浸膏,備用。

        1.2.3.2 葡萄糖標準曲線的繪制

        葡萄糖標準溶液:稱取100 mg葡萄糖(85 ℃烘干至恒重)于容量瓶中,加入蒸餾水待完全溶解后定容至100 mL,置于4 ℃冰箱中貯存。

        3,5-二硝基水楊酸(DNS)顯色劑:稱取185 g酒石酸鉀鈉于裝有500 mL熱水的容量瓶中,待溶解完全后依次加入6.3 g DNS、262 mL 2 mol·L-1NaOH溶液、5 g苯酚、5 g亞硫酸鈉,完全溶解并恢復至室溫后,用蒸餾水定容至1 000 mL,貯存于棕色瓶中[6]。

        葡萄糖標準曲線的繪制:配制濃度(mg·mL-1)分別為0、0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6的葡萄糖標準溶液,吸取1 mL于試管中,加入1.5 mL DNS顯色劑,搖勻;沸水浴精準加熱5 min后立刻取出,降至室溫后,用蒸餾水定容至20 mL,測定540 nm處吸光度。以葡萄糖標準溶液濃度為橫坐標、吸光度為縱坐標繪制葡萄糖標準曲線[7]。

        1.2.3.3 酶活力的測定

        酶活力定義:底物為羧甲基纖維素鈉,pH值為6,反應條件為50 ℃水浴恒溫加熱30 min,定義每30 min催化羧甲基纖維素鈉生成1 μg葡萄糖所需的纖維素酶量為一個酶活力單位,用IU·mL-1表示[12]。

        羧甲基纖維素酶活力(X,IU·mL-1)按下式計算:

        式中:m為依據(jù)標準曲線方程計算的葡萄糖含量,mg;n為酶液稀釋倍數(shù);V為酶液體積,mL;t為培養(yǎng)時間,min;5.56為1 mg葡萄糖的μmol數(shù),1000/180=5.56。

        1.2.4 產(chǎn)纖維素酶降香內(nèi)生真菌的分子生物學鑒定

        采用CTAB法提取降香內(nèi)生真菌DNA,對降香內(nèi)生真菌JXP2-2目的基因 ITS rDNA片段擴增并測序。上游引物為ITS1(5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′),下游引物為ITS4(5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′)。采用瓊脂糖凝膠電泳檢測JXP2-2目的片段的PCR擴增產(chǎn)物;委托生工生物工程(上海)股份有限公司測定PCR擴增產(chǎn)物序列;利用Mega 5.0軟件構建系統(tǒng)發(fā)育樹,并對降香內(nèi)生真菌JXP2-2進行分類鑒定,參數(shù)設置:鄰接樹方法(neighbor-joining),最大概似法(maximum composite likelihood)模型,自展值為1 000。

        2 結果與討論

        2.1 分離純化

        從保存完好的降香內(nèi)生真菌培養(yǎng)皿中挑取5株具有不同形態(tài)、大小、顏色的菌落進行純化。利用纖維素剛果紅培養(yǎng)皿完成初篩,獲得一株產(chǎn)纖維素酶效果較好的降香內(nèi)生真菌JXP2-2,其菌落形態(tài)如圖1所示。

        圖1 菌株JXP2-2的菌落形態(tài)

        菌株JXP2-2經(jīng)發(fā)酵培養(yǎng)產(chǎn)生的透明圈直徑為2.20 cm,透明圈直徑與其菌落直徑的比值(D/d)為2.75。

        2.2 產(chǎn)酶活性

        按1.2.3.2方法繪制葡萄糖標準曲線,得到線性回歸方程:y=0.1314x+0.0051,R2=0.9993。取粗酶液,稀釋100倍,按1.2.3.3方法測定纖維素酶活力,結果如圖2所示。

        從圖2可以看出,隨著培養(yǎng)時間的延長,菌株JXP2-2粗酶液的酶活力逐漸升高,4.5 d時達到最高,為84.50 IU·mL-1;繼續(xù)延長培養(yǎng)時間,酶活力反而下降,第4.5 d~第5.5 d,酶活力下降顯著,從84.50 IU·mL-1降至73.32 IU·mL-1,第5.5 d~第6.5 d,酶活力降幅趨緩,從73.32 IU·mL-1降至71.06 IU·mL-1,第6.5 d~第7.5 d,酶活力基本穩(wěn)定。隨著培養(yǎng)時間的延長,對照組的酶活力也逐漸升高,4.5 d時達到最高,為80.65 IU·mL-1;繼續(xù)延長培養(yǎng)時間,酶活力基本呈直線下降。

        圖2 菌株JXP2-2粗酶液酶活力變化曲線

        2.3 分子生物學鑒定

        2.3.1 JXP2-2 ITS序列PCR擴增

        采用CTAB法提取產(chǎn)纖維素酶降香內(nèi)生真菌JXP2-2的基因組DNA,使用ITS1、ITS4引物對內(nèi)生真菌JXP2-2 ITS序列進行PCR擴增,以基因組DNA為模板擴增獲得ITS產(chǎn)物,擴增產(chǎn)物送生工生物工程(上海)股份有限公司測序,共536個堿基。

        2.3.2 系統(tǒng)發(fā)育樹構建

        在GenBank數(shù)據(jù)庫中,對PCR擴增得到的菌株JXP2-2的ITS-DNA基因序列進行BLAST比對[13],發(fā)現(xiàn)該序列與尖孢炭疽菌(Colletotrichumacutatum)KX347475的相似度高達99%,并利用Mega 5.0軟件進行分析,建立系統(tǒng)發(fā)育樹,如圖3所示。

        圖3 基于ITS基因構建的菌株JXP2-2系統(tǒng)發(fā)育樹

        從圖3可以看出,菌株JXP2-2與尖孢炭疽菌聚為一枝,表現(xiàn)出較近的親緣關系。菌株JXP2-2與尖孢炭疽菌遺傳距離最近,堿基相似度為99%,但是從系統(tǒng)發(fā)育的角度來講親緣關系程度達到95%,初步鑒定菌株JXP2-2為尖孢炭疽菌。

        3 結論

        采用植物組織表面消毒法分離獲得降香內(nèi)生真菌,使用纖維素剛果紅培養(yǎng)皿篩選獲得一株產(chǎn)纖維素酶的降香內(nèi)生真菌。初步鑒定該菌株屬尖孢炭疽菌,具有較高的產(chǎn)纖維素酶活性。該研究在節(jié)約降香資源、保護植物生長環(huán)境、輔助提取中藥活性成分等方面具有重要意義,為構建高產(chǎn)纖維素酶工程菌提供了參考。

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