白路平,喬向宇,海 勒,其布勒,吉日木圖,2,明 亮,2*
(1 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 乳品生物技術(shù)與工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 呼和浩特010018 2 內(nèi)蒙古駱駝研究院 內(nèi)蒙古阿拉善 750306)
駱駝乳是營(yíng)養(yǎng)價(jià)值很高的飲品,因富含維生素、礦物質(zhì)、微量元素,低過敏原以及耐貯藏等特性,而受到人們的喜愛。駱駝乳還富含乳鐵蛋白、溶菌酶、免疫球蛋白等,具有抗微生物的作用[1]。近年來,有文獻(xiàn)報(bào)道,與其它乳類相比,駱駝乳中的微生物含量最高,達(dá)到105CFU/mL[2],并且其具有改善腸道內(nèi)微生物平衡,促進(jìn)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)吸收的作用[3]。XU 等[4]研究發(fā)現(xiàn)蒙古國(guó)駱駝乳中分離出的副干酪乳桿菌亞種具有成為益生菌的潛力,推測(cè)該菌可作為肝損傷抑制劑,用于基于代謝異常和炎癥應(yīng)答的肝病干預(yù),說明駱駝乳可作為調(diào)節(jié)腸道菌群的功能性乳制品。
酒精性肝?。ˋlcoholic liver disease,ALD)是全世界較常見的可預(yù)防疾病之一,每年診斷為ALD 患者有上百萬人,并且全球死亡人數(shù)中約6%是由ALD 引起的[5]。戒酒是ALD 患者的首要治療措施,可防止ALD 患者發(fā)生進(jìn)一步的病變[6]。有研究表明,長(zhǎng)期大量飲酒會(huì)造成腸道屏障功能障礙[7],增加腸道通透性,使微生物產(chǎn)物脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS)易位到血液和肝臟中[8],引發(fā)炎癥反應(yīng),并與乙醇誘導(dǎo)的肝毒性產(chǎn)生協(xié)同作用,從而導(dǎo)致脂肪變性,造成ALD[9]。Ming 等[10]研究表明駱駝乳通過調(diào)節(jié)ALD 小鼠腸道菌群來減輕肝臟炎癥應(yīng)答,發(fā)揮其保肝作用。以上研究表明,腸道菌群與ALD 發(fā)病機(jī)制密切相關(guān),通過靶向腸道菌群的治療可能對(duì)ALD 有效。表征ALD共生微生物組的結(jié)構(gòu),鑒定飲酒后產(chǎn)生的微生物組的變化,以及探討駱駝乳對(duì)ALD 微生物多樣性及物種結(jié)構(gòu)的影響具有重大意義。
本實(shí)驗(yàn)以駱駝乳為原料,使用NIAAA 模型誘發(fā)慢性ALD 小鼠為研究對(duì)象,研究駱駝乳對(duì)慢性酒精性肝損傷小鼠腸道菌群多樣性及其結(jié)構(gòu)的影響,以期為駱駝乳益生菌的開發(fā)提供理論依據(jù)。
SPF 級(jí)雄性C57BL/6NCr 小鼠,北京維通利華實(shí)驗(yàn)動(dòng)物技術(shù)有限公司,許可證號(hào):SCXK (京)2016-0006。飼養(yǎng)于IVC 動(dòng)物實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)內(nèi),室溫20~25 ℃,相對(duì)濕度50%~60%,晝夜交替周期為12 h。
駱駝乳,采自內(nèi)蒙古自治區(qū)巴彥淖爾市牧區(qū);Lieber-DeCarli(Lieber-DeCarli,LDC)液體飼料,南通特洛菲飼料科技有限公司,生產(chǎn)許可證號(hào):蘇飼證(2014)06092。
小鼠脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS)ELISA試劑盒,上海酶聯(lián)生物科技有限公司;無水CH3CH2OH(GR),國(guó)藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司;E.Z.N.A.?Soil DNA 抽提試劑盒,美國(guó)Omega Bio-Tek 公司;MiSeq 測(cè)序試劑盒,美國(guó)Illumina 公司;FastPfu Polymerase AxyPrep DNA Gel Extraction試劑盒,美國(guó)Axygen 公司;建庫試劑盒,美國(guó)Bio Scientific 公司。
真空冷凍干燥機(jī)(2014-18Ab),上海東Omega Bio-Tek 富龍科技股份有限公司;臺(tái)式高速冷凍離心機(jī)(5810R),美國(guó)Eppendorf 公司;多功能微孔板檢測(cè)儀(Synergy H1),美國(guó)BioTek 公司;Richter喂養(yǎng)管,南通特洛菲飼料科技有限公司;醫(yī)用低溫保存箱(DW-88L388J),青島海爾特種電器有限公司;電熱鼓風(fēng)干燥箱(DHG-9030A)、電熱恒溫水槽(DK-8AXX),上海一恒科學(xué)儀器有限公司;立式壓力蒸汽滅菌器(SQ510C),上海申安醫(yī)療器械廠;潔凈工作臺(tái)(SW-CJ-2FD),北京東聯(lián)哈爾儀器制造廠;超微量分光光度計(jì)(NanoDrop2000),美國(guó)Thermo Fisher Scientific 公司;電泳儀(DYY-6C),北京市六一儀器廠;PCR 儀 (ABI GeneAmpR9700),美國(guó)ABI 公司;測(cè)序儀(Illumina Miseq),美國(guó)Illumina 公司。
1.3.1 分組與取樣
1) 動(dòng)物實(shí)驗(yàn) 小鼠適應(yīng)性飼喂1 周后,將24 只小鼠隨機(jī)分為4 組,對(duì)照組(Con,n=6)、模型組(Et,n=6)、駱駝乳劑量組(EtCM,n=6)和牛乳劑量組(EtNM,n=6)。每組所飼喂飼料和實(shí)驗(yàn)處理如表1所示。分組后單籠飼養(yǎng),專用Richter 喂養(yǎng)管給食,飼喂量30 mL/只·d。開始實(shí)驗(yàn)后,除液體飼料外,不再單獨(dú)給水。實(shí)驗(yàn)共進(jìn)行8 周,前4 周僅飼喂專用飼料,不進(jìn)行灌胃操作;后4 周飼喂方式不變,灌胃給乳或生理鹽水,每日灌胃1 次,灌胃體積0.3 mL。
2) 造模 參考Bertola 等[11]的研究方法,建立NIAAA 模型(圖1)。第1 周采用過渡飼喂法[12],第2~9 周開始,造模組連續(xù)接受8 周的4%LDC 酒精液體飼料飼喂,對(duì)照組喂等熱量LDC 對(duì)照液體飼料。造模組在結(jié)束液體飼料飼喂后的第2 天,按照5 g/kg 劑量一次性灌胃體積分?jǐn)?shù)31.5%的酒精溶液,對(duì)照組灌胃等熱量的麥芽糖糊精溶液。
圖1 NIAAA 造模圖Fig.1 NIAAA modeling diagram
造模結(jié)束后,異氟烷麻醉小鼠,眼眶采血,頸椎脫臼法處死小鼠,并在無菌操作臺(tái)上收集小鼠結(jié)腸部糞便,保存于滅菌后的EP 管中,液氮速凍后保存于-80 ℃冰箱。樣本分組情況如表2所示。
表2 小鼠結(jié)腸糞便樣本信息Table 2 Mice colon stool sample information
1.3.2 血清指標(biāo)檢測(cè) 血液常溫下靜置4 h 后,低溫離心(4 ℃,3 000 r/min,25 min)分離血清,按照ELISA 試劑盒說明書的方法檢測(cè)血清中LPS的含量(EU/L)。
1.3.3 小鼠腸道菌群分析
1.3.3.1 小鼠微生物群落多樣性測(cè)序?qū)嶒?yàn)過程將小鼠糞便從-80 ℃冰箱取出后,快速放入干冰內(nèi)送至上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司測(cè)序。實(shí)驗(yàn)過程如下:
1) E.Z.N.A.?Soil DNA 抽提試劑盒隨機(jī)提取部分小鼠糞便中的DNA,以338F(5′-ACTCC TACGGGAGGCAGCAG-3′)和806R(5′-GCAC TACHVGGGTWTCTAAT-3′)為引物,進(jìn)行PCR 預(yù)實(shí)驗(yàn),擴(kuò)增16S rRNA 基因的V3-V4 區(qū)域。并用NanoDrop2000 超微量分光光度計(jì)和2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR 產(chǎn)物的質(zhì)量和濃度以及完整性。擴(kuò)增出濃度合適的產(chǎn)物后,進(jìn)行正式實(shí)驗(yàn)。
2) PCR 正式實(shí)驗(yàn)采用TransGen AP221-02:TransStart FastPfu DNA Polymerase,20 μL 反應(yīng)體系:4 μL 的5×FastPfu Buffer,2 μL 2.5 mmol/L dNTPs,上、下引物各0.8 μL,0.4 μL FastPfu Polymerase,0.2 μL BSA,10 μL Template DNA,最后加ddH2O 至20 μL。PCR 反應(yīng)參數(shù)如表3所示。
表3 PCR 反應(yīng)參數(shù)Table 3 PCR reaction parameters
3) 按照1.3.3.1(1)節(jié)的方法檢測(cè)PCR 產(chǎn)物的質(zhì)量和濃度及完整性,并用FastPfu Polymerase AxyPrep DNA Gel Extraction 試劑盒回收PCR 產(chǎn)物。用酶標(biāo)儀檢測(cè) PCR 產(chǎn)物定量。用NEXTFLEX Rapid DNA-Seq 試劑盒構(gòu)建MiSeq PE 文庫。最后用Illumina Miseq PE 300 平臺(tái)進(jìn)行高通量測(cè)序。
1.3.3.2 生物學(xué)信息分析 MiSeq 測(cè)序得到的是雙端序列數(shù)據(jù),并優(yōu)化數(shù)據(jù)。首先通過PE reads和overlap 的關(guān)系,將成對(duì)reads 拼接(merge)成一條序列,同時(shí)對(duì)reads 的質(zhì)量和merge 的效果進(jìn)行質(zhì)控過濾;其次,根據(jù)序列首尾兩端的barcode 和引物序列區(qū)分樣品,最后得到優(yōu)化序列?;趦?yōu)化序列進(jìn)行OTU 聚類之后與Silva 16S rRNA 數(shù)據(jù)庫(v132)進(jìn)行序列對(duì)比,并采用RDP classifier 貝葉斯算法對(duì)97%相似水平的OTU 代表序列進(jìn)行物種鑒定和注釋。根據(jù)分類學(xué)統(tǒng)計(jì)結(jié)果,實(shí)驗(yàn)一方面評(píng)估本次測(cè)序樣本量是否足夠,另一方面通過Alpha 多樣性統(tǒng)計(jì)各OTU 注釋結(jié)果在每個(gè)樣本中對(duì)應(yīng)的豐度信息;之后進(jìn)行Beta 多樣性分析,得到不同樣本間菌群結(jié)構(gòu)差異及各類水平上的物種結(jié)構(gòu)信息。
Alpha 多樣性指數(shù)數(shù)據(jù)使用Wilcoxon 秩和檢驗(yàn)進(jìn)行分析之后,用Graphpad prism 7 軟件進(jìn)行繪圖。與正常組比較,*.P<0.05,**.P<001;與模型組比較,#.P<0.05,##.P<0.01。
由圖2所示,與Con 組相比較,Et 組小鼠血清中LPS 含量顯著升高(P<0.01),說明酒精導(dǎo)致小鼠腸道粘膜損傷,使腸道菌群發(fā)生定量和定性改變(即小腸細(xì)菌過度生長(zhǎng)和營(yíng)養(yǎng)不良),腸道通透性增加,從而導(dǎo)致細(xì)菌LPS 易位至門脈血流[13]。與Et 組相比較,EtCM 和EtNM 組小鼠血清中LPS 的含量顯著降低(P<0.01),其中EtCM 組小鼠血清中LPS 含量小于Con 組小鼠。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明駱駝乳可以預(yù)防酒精引起的結(jié)腸功能障礙,能夠抑制血清中LPS 的含量的升高。
圖2 駱駝乳對(duì)慢性酒精性肝損傷引起的小鼠血清中LPS 含量的影響Fig.2 Effect of camel milk on changes in LPS content in serum of mice caused with chronic alcoholic liver injury
長(zhǎng)期大量飲酒會(huì)降低細(xì)菌多樣性。通過α 多樣性來檢查OTU 數(shù)量[14],α 多樣性是度量單個(gè)樣本中微生物群落的豐度和均勻度的指標(biāo)[15]。本實(shí)驗(yàn) 采 用ACE 指 數(shù)、Chao 指 數(shù)、Shannon 指 數(shù)、Simpson 指數(shù)、Coverage 指數(shù)和稀釋曲線來評(píng)估單個(gè)樣本的α 多樣性。
采用對(duì)有效序列進(jìn)行隨機(jī)抽樣的方法繪制稀釋曲線,以抽到的序列數(shù)與它們對(duì)應(yīng)的OTU 數(shù)目構(gòu)建稀釋曲線,并用mothur 計(jì)算不同隨機(jī)抽樣下的α 多樣性指數(shù),利用R 語言工具制作曲線圖[16]。如圖3結(jié)果所示,在OTU 水平上,小鼠腸道菌群的多樣性指數(shù)Sobs 稀釋曲線趨于平坦(圖3a),說明本次測(cè)序數(shù)據(jù)量合理,增加數(shù)據(jù)量只會(huì)產(chǎn)生少量新的OTU。并且小鼠腸道菌群的多樣性指數(shù)Shannon 稀釋曲線也趨于平坦(圖3b),說明測(cè)序數(shù)據(jù)量足夠大,可以反映樣本中絕大多數(shù)的微生物多樣性信息。
圖3 基于Sobs 指數(shù)與Shannon 指數(shù)的稀釋曲線圖Fig.3 Dilution curve based on Shannon index and Sobs index
ACE 和Chao 指數(shù)反映樣本中所含微生物群落豐度。而Shannon 和Simpson 指數(shù)反映樣本中所含微生物群落豐度和均勻度兩方面評(píng)估[15]。Coverage 指數(shù)反映樣本中所含微生物群落的覆蓋度[17]。由圖4結(jié)果可知,每個(gè)樣本的Coverage 值均為0.997 以上,表明測(cè)序深度良好,覆蓋率高,可以真實(shí)反映樣本中微生物群落狀況(圖4a)。根據(jù)ACE(圖4b)和Chao(圖4c)指數(shù)結(jié)果可知,Et 組小鼠糞便微生物豐度顯著降低,而EtCM 組小鼠糞便微生物豐度顯著升高。并且根據(jù)Shannon(圖4d)和Simpson(圖4e)指數(shù)結(jié)果顯示,Et 組小鼠糞便微生物群落均勻度顯著降低,而EtCM 組小鼠糞便微生物群落均勻度呈上上升趨勢(shì)。以上結(jié)果表明,雖然EtCM 組小鼠糞便微生物群落均勻度略低,但是有更高的豐度,表現(xiàn)出比其它組較高的多樣性。
圖4 基于OTU 總數(shù)的α 多樣性指數(shù)圖Fig.4 α-Diversity indexes based on the total number of OTUs
Venn 圖可用于統(tǒng)計(jì)多組或多個(gè)樣本中所共有和獨(dú)有的物種(如OTU)數(shù)目,可以直觀展現(xiàn)不同組樣本中物種(如OTU)結(jié)構(gòu)相似性及重疊情況[18]。由圖5可知,4 組樣本中共檢驗(yàn)出1 413 個(gè)OTU。EtCM 組樣本OTU 數(shù)量最多,達(dá)到370 個(gè),其次是Con 組,OUT 數(shù)為357 個(gè);EtNM 組和Et 組OUT 數(shù)分別為345 個(gè)和341 個(gè)。長(zhǎng)期大量飲酒,導(dǎo)致小鼠OTU 數(shù)量有所降低,這可能由于飲酒使小鼠腸道菌群失調(diào),影響腸道菌群結(jié)構(gòu)[14]。經(jīng)駱駝乳干預(yù)處理后,小鼠OTU 數(shù)量顯著增加,并且較Con組小鼠OTU 數(shù)量高出13 個(gè)。表明駱駝乳可以顯著提高小鼠糞便微生物群落的多樣性。該結(jié)果與α 多樣性結(jié)果相一致。從維恩圖(圖5)進(jìn)一步得出,4 組共有OTU 數(shù)為258 個(gè),Con、Et、EtCM 和EtNM 組獨(dú)有的OTU 數(shù)分別為99,83,112,87 個(gè),分別占各組總OTU 數(shù)的27.73%,24.34%,30.27%和25.22%。
圖5 各組微生物群落OTU 水平的Venn 圖Fig.5 Venn diagram of OTU level of microbial communities in each group
β 多樣性是度量樣本間微生物群落結(jié)構(gòu)相似度的指標(biāo)。PCoA 分析法用來考察和區(qū)分樣本間的菌群結(jié)構(gòu)差異,是β 多樣性分析方法之一。通過β多樣性分析可以確定不同組間微生物群落是否存在差異[19]。由圖6所示,每組樣本點(diǎn)分散區(qū)域比較密集,表明組內(nèi)差異較小,微生物群落結(jié)構(gòu)相似。根據(jù)P<0.001,表明組間差異很大,Con、Et、EtCM和EtNM 組能很好地區(qū)分開來(圖6a),說明酒精和駱駝乳以及牛乳對(duì)小鼠的微生物群落有顯著影響。而EtCM 組和EtNM 組的組間差異很小,兩組小鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)上無顯著差異 (P>0.05)(圖6b)。
圖6 小鼠腸道菌群與PCoA 分析圖Fig.6 Analysis of mouse intestinal community and PCoA
根據(jù)α 多樣性和β 多樣性分析,可以確定本次實(shí)驗(yàn)測(cè)序數(shù)據(jù)量足夠大,可以反映樣本中絕大多數(shù)微生物多樣性信息;其中EtCM 組小鼠糞便微生物群落α 多樣性最高,而Et 組小鼠糞便微生物群落α 多樣性最低。
通過PCoA 分析,發(fā)現(xiàn)Con 與Et 組小鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)上有顯著差異,表明酒精使小鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)發(fā)生了明顯變化。經(jīng)駱駝乳和牛乳干預(yù)處理后,發(fā)現(xiàn)Et 與EtCM 組和EtNM 組小鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)上有顯著差異,說明駱駝乳和牛乳能在一定程度上改變小鼠腸道菌群環(huán)境,調(diào)節(jié)小鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)。此外,研究發(fā)現(xiàn)EtCM 組和EtNM 組小鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)上無顯著差異。Morrin 等[20]研究發(fā)現(xiàn)牛乳可以直接調(diào)節(jié)腸道細(xì)胞表面,并可能改變細(xì)胞的糖基化狀態(tài),進(jìn)而促進(jìn)不同細(xì)菌群落,如雙歧桿菌(Bifidobacterium)的黏附。Morrin 等[21]研究發(fā)現(xiàn)牛乳中的免疫球蛋白G 刺激腸道上皮細(xì)胞表面來增加雙歧桿菌對(duì)腸上皮細(xì)胞的粘附。Zhao等[22]研究發(fā)現(xiàn)新鮮的駱駝乳具有較高的細(xì)菌多樣性,并且是分離新型乳酸菌的寶貴天然資源。Ming等[10]研究表明駱駝乳通過調(diào)節(jié)ALD 小鼠腸道菌群,來減輕肝臟炎癥應(yīng)答,發(fā)揮它的保肝作用。因此駱駝乳與牛乳一樣,通過改變腸道菌群的生存環(huán)境,調(diào)節(jié)腸道菌群的豐度,來調(diào)整菌群結(jié)構(gòu),促進(jìn)有益菌在腸道內(nèi)黏附,減少有害菌的增殖,并且防止乙醇對(duì)小鼠結(jié)腸內(nèi)微生態(tài)平衡的破壞。
2.5.1 基于門水平上的物種結(jié)構(gòu)分析 物種結(jié)構(gòu)分析采用統(tǒng)計(jì)學(xué)的分析方法,可得到各樣本在各水平(域、界、門、綱、目、科、屬、種、OTU 等)上含有哪些優(yōu)勢(shì)物種,以及各優(yōu)勢(shì)物種的相對(duì)豐度[23]。本實(shí)驗(yàn)重點(diǎn)分析了門水平和屬水平。
探究駱駝乳和牛乳對(duì)慢性ALD 小鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)的影響。由圖7可知,在門水平上,4 組細(xì)菌種類的相對(duì)豐度,檢測(cè)到厚壁菌門(Firmicutes)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、疣微菌門(Verrucomicrobia)、變形菌門(Proteobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、脫鐵桿菌門(Deferribacteres)等為小鼠結(jié)腸腸道中相對(duì)豐度較高的菌門,其中厚壁菌門和擬桿菌門的豐度最高,兩者的相對(duì)豐度之和超過了80%。與Con 組相比,Et 組厚壁菌門豐度提高了4.97%,而擬桿菌門的豐度降低了4.30%。與Et 組相比,EtCM 組厚壁菌門豐度降低了30.96%,擬桿菌門豐度提高了27.9%。EtNM 組厚壁菌門豐度降低了20.71%,擬桿菌門豐度提高了18.70%。其中,EtCM 組有效提高了小鼠腸道菌群的豐度。
圖7 小鼠腸道菌群門水平物種結(jié)構(gòu)分析柱狀圖Fig.7 Histogram of phylum level species composition analysis of intestinal flora in mice
2.5.2 基于屬水平上的物種結(jié)構(gòu)分析 由圖8可知,在屬水平上,瘤胃菌科(Ruminococcaceae)下的未知屬Ruminococcaceae_UCG-013、副擬桿菌屬(Parabacteroides)、擬桿菌屬(Bacteroides)、阿克曼菌屬 (Akkermansia)、Muribaculaceae 科下的未知屬norank_f_Muribaculaceae 屬、柔嫩梭菌屬(Faecalibaculum)、Romboutsia 屬、毛螺旋菌科(Lachnospiraceae)下的未知屬norank_f_Lachnospiraceae等在小鼠結(jié)腸腸道中相對(duì)豐度較高的菌屬。其中瘤胃菌科下的未知屬Ruminococcaceae_UCG-013、副擬桿菌屬、擬桿菌屬、阿克曼菌屬的豐度最高。此外,由圖9可知,瘤胃菌科下的未知屬Ruminococcaceae_UCG-013 是Et 組豐度最高的優(yōu)勢(shì)菌屬,相對(duì)豐度占41%。副擬桿菌屬、擬桿菌屬和阿克曼菌屬均為EtCM 組和EtNM 組的優(yōu)勢(shì)菌屬。3 個(gè)菌屬的豐度各占10%以上,其中EtCM 組的3個(gè)菌屬豐度之和最高約為45%。而EtNM 組的3個(gè)菌屬豐度之和最高約為36%,這與門水平結(jié)果相一致。Blacher 等[23]研究發(fā)現(xiàn),瘤胃菌會(huì)加重肌萎縮性側(cè)索硬化癥。Ponziani 等[24]還研究發(fā)現(xiàn)肝癌患者腸道菌群中瘤胃菌屬豐度增加,雙歧桿菌豐度減少。本實(shí)驗(yàn)中Et 組小鼠結(jié)腸菌群的瘤胃菌科下的未知屬Ruminococcaceae_UCG-013 豐度顯著提高,表明瘤胃菌科下的未知屬Ruminococcaceae_UCG-013 可能是加重慢性ALD 的一類菌屬。Wang 等[25]研究發(fā)現(xiàn)白藜蘆醇處理的小鼠微生物菌群結(jié)構(gòu)發(fā)生了顯著變化,擬桿菌、毛螺菌科下的未知屬Lachnospiraceae_NK4A136_group、Lachnoclostridium、布勞特氏菌(Blautia)、副擬桿菌屬和Ruminiclostridium_9 豐度顯著提高,并且這些菌群能調(diào)節(jié)脂肪代謝,還通過減少炎癥來改善腸屏障功能。Henning 等[26]也得到了同等結(jié)果。最新研究發(fā)現(xiàn),羅斯伯里氏菌屬(Roseburia)、阿克曼菌屬、丙酸桿菌屬(Propionibacterium)等可以參與到未來益生菌的開發(fā)中,稱為潛在益生菌[27]??偟膩碚f,駱駝乳和牛乳均擁有改善腸道屏障功能的優(yōu)勢(shì)菌群。而駱駝乳的優(yōu)勢(shì)菌群豐度比牛乳較高。駱駝乳的作用機(jī)制很可能是通過提高副擬桿菌屬、擬桿菌屬、阿克曼菌屬的豐度,來降低瘤胃菌科下的未知屬Ruminococcaceae_UCG-013 的豐度,達(dá)到調(diào)節(jié)小鼠結(jié)腸腸道菌群的目的。
圖8 小鼠腸道菌群屬水平物種結(jié)構(gòu)分析柱狀圖Fig.8 Histogram of the analysis of the genus level species composition of the mouse intestinal flora
圖9 樣本與物種關(guān)系圖Fig.9 Relationship between samples and species
腸道菌群結(jié)構(gòu)主要受酒精的影響。已有文獻(xiàn)報(bào)道,長(zhǎng)期大量飲酒會(huì)增加血液酒精濃度[28]。并且降低Caco-2 腸上皮細(xì)胞中的緊密連接蛋白o(hù)ccludin 和zona-occludens-1(ZO-1)的表達(dá),使腸道通透性增加,讓腸道菌群發(fā)生定量和定性改變,從而導(dǎo)致細(xì)菌LPS 易位到血流中并產(chǎn)生炎癥,促成ALD[29]。本實(shí)驗(yàn)研究發(fā)現(xiàn),在慢性ALD 模型小鼠血清中細(xì)菌LPS 含量顯著升高,這與Mutlu 等[30]的臨床結(jié)果相一致。此外,研究還發(fā)現(xiàn)經(jīng)駱駝乳和牛乳干預(yù)處理后小鼠血清中LPS 含量顯著降低,其中駱駝乳效果最佳,表明駱駝乳可以預(yù)防酒精引起的結(jié)腸功能障礙,抑制血清中LPS 含量的升高。Chu 等[31]研究發(fā)現(xiàn)用益生元UG1601 治療便秘后,腸道菌群結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,包括厚壁菌門的減少和丁酸鹽細(xì)菌的增加,并推測(cè)這可能是減輕內(nèi)毒素血癥的主要原因。已有文獻(xiàn)報(bào)道,丙酸和丁酸鹽均被認(rèn)為是有益菌的代謝產(chǎn)物[27];而擬桿菌門是產(chǎn)生丁酸鹽的主要菌群[32]。以上研究進(jìn)一步證明,Et 組的優(yōu)勢(shì)菌群厚壁菌門通過產(chǎn)生大量的LPS,促成ALD。而經(jīng)駱駝乳和牛乳干預(yù)處理后,擬桿菌門成為優(yōu)勢(shì)菌群,降低了厚壁菌門的豐度,從而改善了腸道微生態(tài)平衡。
在本實(shí)驗(yàn)中,通過高通量測(cè)序,觀察到駱駝乳和牛乳對(duì)ALD 小鼠腸道菌群有調(diào)節(jié)作用。其改善ALD 的主要機(jī)制是通過改變腸道菌群環(huán)境,來調(diào)節(jié)腸道菌群。其主要變化包括促進(jìn)腸道優(yōu)勢(shì)益生菌的繁殖,來抑制腸道有害菌的生長(zhǎng)。從有益菌的角度出發(fā),在門水平上,駱駝乳和牛乳能提高擬桿菌門的豐度。在屬水平上,提高副擬桿菌屬、擬桿菌屬、阿克曼菌屬的豐度。從有害菌的角度出發(fā),在門水平上,降低了厚壁菌門的豐度。在屬水平上,降低了瘤胃菌科下的未知屬Ruminococcaceae_UCG-013 的豐度,其中駱駝乳的有益菌豐度較牛乳高出9%,并且Et 組小鼠腸道菌群與EtCM 和EtNM 組的小鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)上有顯著差異。除此之外,研究還發(fā)現(xiàn)EtCM 和EtNM 與Con 組小鼠腸道菌群有高度的相似性。由此可知,飲用駱駝乳來預(yù)防慢性ALD 有利于長(zhǎng)期維持腸道健康。特別是對(duì)患有乳糖不耐受癥的ALD 患者,飲用駱駝乳調(diào)節(jié)腸道菌群是最佳選擇。本實(shí)驗(yàn)結(jié)果可為駱駝乳緩解慢性ALD 提供理論基礎(chǔ),并對(duì)駱駝乳益生菌產(chǎn)品的開發(fā)具有重要意義。