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        基于多重插補(bǔ)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型的減壓病人危險(xiǎn)率變化估計(jì)

        2022-01-13 03:43:08王純杰任美慧肖男男
        關(guān)鍵詞:分段受試者區(qū)間

        王純杰,任美慧,肖男男,張 鉞

        (長(zhǎng)春工業(yè)大學(xué) 數(shù)學(xué)與統(tǒng)計(jì)學(xué)院,吉林 長(zhǎng)春 130012)

        0 引言

        在生物醫(yī)學(xué)、社會(huì)科學(xué)、現(xiàn)代工業(yè)等領(lǐng)域,都需要對(duì)相關(guān)的生存資料進(jìn)行研究.研究的重點(diǎn)主要在生存時(shí)間以及相關(guān)的影響因素,生存分析是解決此類問(wèn)題主要方法.目前,生存分析主要涉及兩個(gè)主要研究方向:(1)描述生存時(shí)間分布,通過(guò)觀測(cè)研究對(duì)象的生存曲線,進(jìn)一步明確某一疾病的人群生存規(guī)律;(2)危險(xiǎn)函數(shù)估計(jì)以及相關(guān)影響因素分析,如在某一疾病的隨訪過(guò)程中,分析影響患者生存的影響因素,進(jìn)一步預(yù)測(cè)患者的生存時(shí)間分布[1].

        目前,學(xué)者對(duì)于生存數(shù)據(jù)的分析與預(yù)測(cè)已經(jīng)取得了很大的進(jìn)步,因此,能夠通過(guò)繪制疾病隨訪過(guò)程中的疾病危險(xiǎn)率變化曲線,可以更加直觀地了解疾病的變化情況,并針對(duì)危險(xiǎn)率變化峰值采取相應(yīng)的治療措施.D.Faraggi和R.Simon[2]首次將神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型應(yīng)用于Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型中,進(jìn)一步分析了影響生存時(shí)間的相關(guān)因素;K.Liestol[3]提出應(yīng)用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)來(lái)構(gòu)建離散時(shí)間模型和分段指數(shù)模型兩種估計(jì)危險(xiǎn)率變化情況的非參數(shù)靈活模型;此后,M.Fornili[4-5]再次利用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分段指數(shù)模型處理右刪失數(shù)據(jù),分別對(duì)乳腺癌以及腎細(xì)胞癌患者進(jìn)行實(shí)例分析,對(duì)病人的危險(xiǎn)變化情況進(jìn)行預(yù)測(cè)估計(jì);L.Zhao[6]將深度學(xué)習(xí)方法應(yīng)用于生存數(shù)據(jù)的處理,同時(shí)估計(jì)出相應(yīng)的生存函數(shù);進(jìn)而,C.Lee[7]將神網(wǎng)絡(luò)方法應(yīng)用到生存分析的競(jìng)爭(zhēng)風(fēng)險(xiǎn)模型中,對(duì)危險(xiǎn)函數(shù)進(jìn)行了估計(jì);另外,Y.X.Sun[8]采用分段指數(shù)模型來(lái)描述疾病潛伏過(guò)程,并將其用于處理帶有空間距離和時(shí)變協(xié)變量的疾病數(shù)據(jù).

        本文將神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分段指數(shù)模型應(yīng)用于區(qū)間刪失數(shù)據(jù),由于區(qū)間刪失數(shù)據(jù)缺乏準(zhǔn)確的觀測(cè)時(shí)間點(diǎn),因此采用多重插補(bǔ)法下,對(duì)已有缺失數(shù)據(jù)進(jìn)行插補(bǔ),如花琳琳等[9]在不同缺失值處理方法下,對(duì)隨機(jī)缺失數(shù)據(jù)處理效果的比較;紀(jì)忠光等[10]針對(duì)缺失數(shù)據(jù)進(jìn)行非參數(shù)插補(bǔ);張琳琳等[11]基于數(shù)據(jù)增強(qiáng)算法,將多重插補(bǔ)方法應(yīng)用于失效時(shí)間為區(qū)間刪失型數(shù)據(jù)的加速失效時(shí)間模型的參數(shù)估計(jì)問(wèn)題中,并將有限區(qū)間刪失(但不是右刪失)數(shù)據(jù)插補(bǔ)成確切失效時(shí)間數(shù)據(jù).本文旨在應(yīng)用多重插補(bǔ)法結(jié)合神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分段指數(shù)模型對(duì)美國(guó)宇航員減壓病數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,關(guān)注后期可能出現(xiàn)的多峰值變化情況.

        1 研究模型與方法

        1.1 分段指數(shù)模型

        考慮分段指數(shù)模型并將隨訪時(shí)間劃分為J個(gè)不相鄰的區(qū)間,即

        Aj=(aj-1,aj],j=1,2,…,J,

        其中a0=0,aJ=+∞.由此,可以假定風(fēng)險(xiǎn)函數(shù)在每個(gè)區(qū)間段內(nèi)均為常數(shù),即

        h(ti,xi)=λj(xi),aj-1

        在分段指數(shù)模型下,相應(yīng)的生存函數(shù)可以改寫(xiě)為

        為了簡(jiǎn)單起見(jiàn),當(dāng)滿足t≤a1時(shí),上述生存函數(shù)的第一項(xiàng)可以看作是1.

        1.2 數(shù)據(jù)插補(bǔ)法

        針對(duì)于不完全數(shù)據(jù)的分析,通常采用插補(bǔ)法進(jìn)行分析(包括單次插補(bǔ)和多重插補(bǔ)兩種方法).單次插補(bǔ)是對(duì)缺失數(shù)據(jù)依據(jù)某種規(guī)則進(jìn)行一次填充,插補(bǔ)之后可以得到一個(gè)完整的數(shù)據(jù)集[12].多重插補(bǔ)則是對(duì)缺失值進(jìn)行多次補(bǔ)充,插補(bǔ)次數(shù)一般為5~20次,因此可以得到相應(yīng)個(gè)數(shù)的完整數(shù)據(jù)集.在此基礎(chǔ)上,針對(duì)每個(gè)數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析,最終得出更為準(zhǔn)確的分析結(jié)果.采用imputeCens包[13]對(duì)區(qū)間刪失數(shù)據(jù)進(jìn)行多重插補(bǔ),具體操作步驟如下:

        (1)通過(guò)ic_par()函數(shù)擬合區(qū)間刪失數(shù)據(jù)的參數(shù)回歸模型,參數(shù)dist采用指數(shù)分布,滿足分段指數(shù)模型;

        (2)輸入Ⅱ型觀測(cè)區(qū)間和左刪失數(shù)據(jù)代入模型,進(jìn)行數(shù)據(jù)處理;

        (3)應(yīng)用imputeCens()函數(shù),對(duì)區(qū)間刪失數(shù)據(jù)進(jìn)行插補(bǔ).

        通過(guò)上述操作,可以將觀測(cè)區(qū)間以及左刪失數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成具體的觀測(cè)時(shí)間點(diǎn),與原數(shù)據(jù)構(gòu)成右刪失數(shù)據(jù),對(duì)此進(jìn)行相應(yīng)的模型分析.

        1.3 神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型及估計(jì)方法

        針對(duì)右刪失數(shù)據(jù),為了能夠準(zhǔn)確地估計(jì)腫瘤患者的預(yù)后風(fēng)險(xiǎn),采用了一種基于似然函數(shù)優(yōu)化的方法.假設(shè)有n名受試者(i=1,2,…,n),其中第i位受試者的生存時(shí)間設(shè)為ti,且xi=(xi1,xi2,…,xip)表示個(gè)體i的p維協(xié)變量,則n個(gè)獨(dú)立個(gè)體的似然函數(shù)[14]為

        對(duì)于上述似然函數(shù),引入分段指數(shù)模型,則相應(yīng)的似然函數(shù)改寫(xiě)為

        其中:Ji表示個(gè)體i所落入的最后一個(gè)區(qū)間;

        下面對(duì)危險(xiǎn)函數(shù)h(t;x)進(jìn)行建模,利用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建協(xié)變量與時(shí)間的函數(shù)關(guān)系,采用一種更靈活的模型解決了協(xié)變量之間的相依關(guān)系.采用以下前饋人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)危險(xiǎn)函數(shù)進(jìn)行建模,關(guān)系式為

        其中

        該網(wǎng)絡(luò)分為三層:輸入層是p維協(xié)變量和感興趣時(shí)間t;隱藏層包括H個(gè)神經(jīng)元;最后輸出層為J個(gè)神經(jīng)元(與分段指數(shù)模型的劃分區(qū)間數(shù)相同).另外,輸入層與隱藏層分別設(shè)定偏置單位“1”,相應(yīng)地選取Sigmoid函數(shù)作為激活函數(shù).

        為優(yōu)化神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型參數(shù),選取極大似然函數(shù)的負(fù)對(duì)數(shù)作為網(wǎng)絡(luò)損失函數(shù),通過(guò)最小化損失函數(shù)進(jìn)一步得出最優(yōu)化的網(wǎng)絡(luò)參數(shù)為

        采用梯度下降法來(lái)最小化損失函數(shù),并選定合適的學(xué)習(xí)率,通過(guò)計(jì)算,M.Akaike等[15]提出的評(píng)價(jià)指標(biāo)AIC值,來(lái)選擇最優(yōu)模型結(jié)構(gòu);M.Stone[16]已經(jīng)證明AIC指標(biāo)與交叉驗(yàn)證的結(jié)果是等價(jià)的(具有計(jì)算優(yōu)勢(shì)),即

        AIC=D+2β,

        其中D為似然函數(shù)的負(fù)對(duì)數(shù)值,β為待估參數(shù)的個(gè)數(shù).

        2 實(shí)例分析

        本文主要研究高空飛行時(shí)減壓病的危險(xiǎn)率變化,數(shù)據(jù)NASAs Hypobaric Decompression Sickness(HDSD)來(lái)源于thregI包,該數(shù)據(jù)集記錄了美國(guó)空軍在低壓脫氮情況下肺動(dòng)脈內(nèi)氣栓(VGE IV)發(fā)病時(shí)間、年齡、性別、TR值(減壓前組織氮分壓與減壓終壓值的比值)、下肢運(yùn)動(dòng)等,以此來(lái)分析減壓病(DCS)在觀測(cè)時(shí)間內(nèi)的發(fā)病危險(xiǎn)率.數(shù)據(jù)集內(nèi)包含238個(gè)樣本,探測(cè)發(fā)生DCS患者自減壓至終壓的失效時(shí)間內(nèi)DCS危險(xiǎn)變化情況.

        2.1 數(shù)據(jù)預(yù)處理

        在HDSD中,每位受試者VGE發(fā)生時(shí)間在某一固定的檢測(cè)時(shí)間段內(nèi),并未記錄準(zhǔn)確的觀測(cè)時(shí)間,針對(duì)區(qū)間Ⅱ型刪失數(shù)據(jù),本文采取多重插補(bǔ)法,應(yīng)用imputeCens包同時(shí)依據(jù)分段指數(shù)分布規(guī)律預(yù)測(cè)出可能的生存時(shí)間分布,進(jìn)而將觀測(cè)區(qū)間以及左刪失數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成具體的觀測(cè)時(shí)間點(diǎn),與原數(shù)據(jù)構(gòu)成右刪失數(shù)據(jù),將插補(bǔ)的準(zhǔn)確觀測(cè)時(shí)間以及相應(yīng)協(xié)變量應(yīng)用到神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分段指數(shù)模型中,進(jìn)一步分析減壓病的危險(xiǎn)變化趨勢(shì).

        2.2 分析結(jié)果

        減壓病是人體暴露在一定程度的低氣壓下而出現(xiàn)的一種特殊病癥,由于處于低氣壓下,使得體內(nèi)的氮?dú)庠跍p壓時(shí)出現(xiàn)過(guò)飽和現(xiàn)象,進(jìn)而生成氣泡而導(dǎo)致的病癥.根據(jù)受試者DCS發(fā)病的時(shí)間依從性信息(相關(guān)協(xié)變量)以及終檢時(shí)間(暴露期間)是否發(fā)病等信息,研究受試者在低壓暴露時(shí)間內(nèi)的危險(xiǎn)率變化情況.

        根據(jù)所研究的數(shù)據(jù)集,為了選擇更加合適的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),以M.Stone所提出的AIC準(zhǔn)則作為評(píng)價(jià)指標(biāo),分別考慮了6,8,12個(gè)隱層單元數(shù)和學(xué)習(xí)率0.1,0.01以及0.001,根據(jù)AIC準(zhǔn)則的值,選擇具有較好性能的模型,相應(yīng)的結(jié)果如表1所示,因此選用6個(gè)隱層單元和學(xué)習(xí)率0.1來(lái)構(gòu)建神經(jīng)網(wǎng)絡(luò).

        表1 AIC值分布Tab.1 AIC value distribution

        在分析中,將隨訪時(shí)間0~6 h劃分為12個(gè)區(qū)間段,主要考慮了以下協(xié)變量:年齡、性別、TR值(即氮?dú)膺^(guò)飽和系數(shù))、是否運(yùn)動(dòng)以及VGE IV級(jí)對(duì)減壓病DCS危險(xiǎn)率變化的影響,具有不同特征的受試者在低壓情況下,一段隨訪時(shí)間內(nèi),各類人群的危險(xiǎn)變化情況.

        據(jù)美國(guó)潛水與高氣壓醫(yī)學(xué)會(huì)組織研究的相關(guān)資料顯示,發(fā)生減壓病的時(shí)間一般在剛進(jìn)入低氣壓環(huán)境時(shí),尤其是進(jìn)入低壓環(huán)境1 h以內(nèi),危險(xiǎn)率呈現(xiàn)遞增趨勢(shì),隨著時(shí)間的增長(zhǎng)危險(xiǎn)率會(huì)出現(xiàn)下降趨勢(shì),而后又會(huì)出現(xiàn)上升趨勢(shì),直至出現(xiàn)平穩(wěn)狀態(tài).圖1是通過(guò)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分段指數(shù)模型擬合的238位受試者的生存曲線,可以發(fā)現(xiàn)本文所提出的模型擬合的曲線與K-M估計(jì)得出的生存曲線基本重合,由此可以說(shuō)明該模型具有較好的評(píng)估性能.

        圖1 生存曲線擬合圖Fig.1 Fitting diagram of survival curve

        為進(jìn)一步分析危險(xiǎn)率變化情況,分別將受試者按照不同協(xié)變量劃分為不同的組別,如:年齡(劃分為三個(gè)區(qū)間段:20~30歲、30~40歲以及40~50歲)、性別、TR值(將比值劃分為1.6以下、1.6~1.7以及1.7以上)、是否運(yùn)動(dòng)等連續(xù)變量和分類變量對(duì)危險(xiǎn)率的影響.由圖2結(jié)果發(fā)現(xiàn),處于不同年齡段的受試者在低壓情況下危險(xiǎn)率變化情況基本一致,說(shuō)明年齡對(duì)低壓環(huán)境下減壓病的危險(xiǎn)率并不造成影響;另外,相較于男性而言,女性在低壓環(huán)境中危險(xiǎn)率系數(shù)更低,更具有耐受性.

        圖2 不同年齡段以及不同性別人群的危險(xiǎn)率變化曲線Fig.2 Risk curves of different age groups and different genders

        另一方面,還分析了TR值以及在低壓環(huán)境中是否運(yùn)動(dòng)對(duì)危險(xiǎn)率變化的影響,TR值是組織內(nèi)氮分壓與減壓終壓值的比值,有關(guān)資料表明,TR比值一般在1.53~1.63范圍內(nèi)波動(dòng),如果TR值過(guò)高,相應(yīng)的發(fā)病危險(xiǎn)率也會(huì)提高.由圖3結(jié)果顯示,當(dāng)TR值處于1.6水平以下,受試者的危險(xiǎn)率較低,但中間仍會(huì)出現(xiàn)危險(xiǎn)率的波動(dòng)變化;而當(dāng)危險(xiǎn)率處于1.6~1.7水平之間,受試者在最開(kāi)始時(shí)刻就會(huì)面臨著較大的危險(xiǎn)率,直至5 h以后趨于平緩;如果TR值超過(guò)1.7以上,危險(xiǎn)率會(huì)出現(xiàn)小高峰,相較于前者,具有更高的危險(xiǎn)率.

        圖3 不同TR值含量下的危險(xiǎn)率變化曲線Fig.3 Variation curve of risk rate under different TR values

        在低壓環(huán)境中,運(yùn)動(dòng)會(huì)增加減壓病發(fā)生的概率,因此在低壓情況下,活動(dòng)的人會(huì)比不活動(dòng)的人具有更高的危險(xiǎn)率,因?yàn)檫\(yùn)動(dòng)是與氮含量相關(guān)的,運(yùn)動(dòng)越多會(huì)導(dǎo)致組織內(nèi)的氮含量也越多,導(dǎo)致氮?dú)膺^(guò)飽和系數(shù)并不斷增加,進(jìn)而具有更高的危險(xiǎn)率,圖4結(jié)果也說(shuō)明了這一結(jié)論.

        圖4 低壓情況下是、否為運(yùn)動(dòng)群體的危險(xiǎn)率變化曲線Fig.4 Curves of risk changes in the active and inactive groups under low pressure

        3 結(jié)語(yǔ)

        本文通過(guò)多重插補(bǔ)法將區(qū)間Ⅱ型刪失數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為右刪失數(shù)據(jù),并依托于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分段指數(shù)模型對(duì)減壓病的危險(xiǎn)率變化進(jìn)行估計(jì),與傳統(tǒng)的比例風(fēng)險(xiǎn)非線性模型相比,神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型更具靈活性,解決了協(xié)變量之間的交互作用,進(jìn)而可以直接得到隨訪時(shí)間內(nèi)的個(gè)體危險(xiǎn)率的變化情況.

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