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        一株洱海來源產(chǎn)尿酸氧化酶菌株的分離、鑒定及其酶學性質(zhì)研究

        2021-12-30 02:45:56楊潤芬楊力權劉紅艷李馨偉尹以瑞
        中國飼料 2021年23期
        關鍵詞:氧化酶發(fā)酵液緩沖液

        楊潤芬, 楊力權, 劉紅艷, 李 蕾, 李馨偉, 桑 鵬, 尹以瑞

        (大理大學農(nóng)學與生物科學學院,云南大理 671003)

        尿酸為三氧基嘌呤(C5H4N4O3),是生物體嘌呤代謝的產(chǎn)物,微溶于水,易形成晶體,過高的血尿酸濃度對機體來說是有害的, 尿酸代謝不平衡會導致痛風、 腎結(jié)石和血管類等疾病 (孫澤銳等,2021) 。 尿酸氧化酶作為生物體內(nèi)嘌呤降解代謝途徑的關鍵酶, 能催化尿酸氧化為尿囊素和過氧化氫。 許多生物,如狒狒、豬等,都能利用尿酸氧化酶將其分解為易溶于水的尿囊素(熊潤松等,2012),尿囊素在體內(nèi)具有良好的溶解性, 溶解度是尿酸(0.5 mmol/L,37 ℃) 的 5 ~ 10 倍, 約為 5 mmol/L(37 ℃),不發(fā)生積累而直接排出體外(Bosly 等,2003;章茹等,1997)。

        尿酸氧化酶在自然界廣泛存在,動物、植物、真菌和細菌中均有發(fā)現(xiàn)(張金龍等,2010;劉勁等,2008)。 目前上市的尿酸氧化酶藥物有豬-狒狒尿酸氧化酶嵌合體和重組黃曲霉尿酸氧化酶兩種, 而國內(nèi)還鮮見有進入臨床的尿酸氧化酶類藥(張榮欣等,2008)。 有研究表明,微生物如鼠李糖乳酸桿菌(L.rhamnosus)經(jīng)過誘導后具有較強的尿酸降解能力(黃琳秋等,2016),植物乳桿菌(Lactobacillus plantarum)基因組中含有尿酸氧化酶基因(張曉暉,2019;白運煥等,2018)。 其中, 微生物來源的尿酸氧化酶如Aspergillus flavus (葉澤,2019) 和 Bacillus fastidiosus(Roda等,2006),活性均在 10 U/mg 以上,而來自豆類植物的尿酸氧化酶活性為2 ~ 6 U/mg ( Montalbini 等,1999),來自哺乳動物的尿酸氧化酶如豬和狒狒的活性分別為5 U/mg 和1 U/mg(陳勁春等,2015;Kelly 等,2001)。 微生物來源的尿酸氧化酶活性明顯高于其他來源,因此,微生物成為了新的尿酸氧化酶的重要來源。

        本研究以云南大理洱海底泥為試驗材料,經(jīng)過富集培養(yǎng)、篩選分離出尿酸降解菌,并對所獲得的一株尿酸降解菌進行發(fā)酵培養(yǎng), 獲得胞內(nèi)的酶進行酶學性質(zhì)研究, 旨在為今后洱海尿酸氧化酶的研究和利用奠定基礎。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料 本次試驗樣品來自大理洱海,在采樣點 (N25°36′ ~ 25°58 ′,E100°06′ ~ 100°18′)采集20 g 底泥作為試驗材料。

        1.2 培養(yǎng)基及試劑

        1.2.1 培養(yǎng)基 尿酸基礎培養(yǎng)基(g/L):MgSO40.5,NaCl 0.1,K2HPO4·3H2O 0.5,KH2PO20.5,尿酸2,pH 7.0;固體分離培養(yǎng)基添加 2% 的瓊脂。

        產(chǎn)尿酸氧化酶發(fā)酵培養(yǎng)基(g/L):蛋白胨10,蔗 糖 20,NaCl 0.5,MgSO41,KH2PO41,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.01,尿酸 1.5,pH 7.0。

        1.2.2 試驗儀器 電子分析天平、 高壓蒸汽滅菌鍋(上海博迅醫(yī)療生物儀器股份有限公司);艾柯超純水生成儀、紫外可見光分光光度計(上海菁華儀器公司);高速冷凍離心機(上海安亭科學儀器公司);SPX-250B-D 型恒溫振蕩培養(yǎng)箱 (上海一恒科學儀器有限公司);Eppendorf PCR 儀、BIORAD 電泳儀(北京六一生物科技有限公司)。

        1.3 試驗方法

        1.3.1 產(chǎn)尿酸氧化酶菌株的富集與篩選 取10 g洱海底泥樣品,加入到尿酸基礎培養(yǎng)基中,振蕩富集培養(yǎng)3 d。 梯度稀釋分別做5 個稀釋梯度,分別稀釋 10-1、10-2、10-3、10-4、10-5后涂布于含有尿酸基礎培養(yǎng)基上培養(yǎng),挑選單菌落,轉(zhuǎn)接到尿酸氧化酶發(fā)酵平板中進一步純化, 獲得一株純培養(yǎng)菌株保存于甘油管凍存,待用。

        1.3.2 菌株生長和胞內(nèi)、 胞外尿酸氧化酶活性檢測 挑取上述產(chǎn)尿酸氧化酶菌株單菌落接種于200 mL 的尿酸發(fā)酵培養(yǎng)基中,25 ℃、180 r/min振蕩培養(yǎng), 每隔12 h 取發(fā)酵液檢測菌體濃度(OD600nm)和發(fā)酵液中尿酸的殘余量(OD290nm)。 每次檢測取1 mL 發(fā)酵液用于測菌體濃度, 取50 mL發(fā)酵液8000 g,室溫離心20 min 取上清發(fā)酵液為胞外酶,并測發(fā)酵液尿酸含量,收集菌體加50 mL PBS 緩沖液(pH 8.0)懸浮后超聲波破碎 20 min,裂解液在4 ℃、12000 g,離心 20 min,取裂解上清液為胞內(nèi)酶。 以濃度為0.06 mmol/L 的尿酸為底物,加入50 μL 粗酶液,反應 15 min 后使用紫外光分光光度計測定OD290nm吸光值。酶活力計算公式如下:

        1.3.3 產(chǎn)酶菌株16S rRNA 基因測序及鑒定 收集尿酸降解菌純培養(yǎng)菌體,根據(jù)北京天根生化科技有限公司提供的試劑盒以及說明書進行DNA 的提取。 使用通用引物 27F:5’ -AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’和 1492R:5 ’ -GGTTACCTTGTTACGACTT-3’擴增細菌 16S rDNA。PCR 擴增條件為:預變性 94 ℃,4 min;變性 94 ℃,30 s;退火55 ℃,35 s;延伸 72 ℃,90 s;32 個循環(huán)后,最后延伸 72 ℃,5 min。 PCR 產(chǎn)物在1.0%瓊脂糖凝膠電泳鑒定, 使用膠回收試劑盒進行PCR 產(chǎn)物回收。 將PCR 回收產(chǎn)物送至昆明擎科生物科技有限責任公司進行測序, 測序結(jié)果上傳至 GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank), 并在 BLAST 數(shù)據(jù)庫(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)中進行比對, 根據(jù)細菌 16S rRNA 基因序列相似性, 利用MEGA 7.1 軟件進行系統(tǒng)進化分析。

        1.3.4 最適反應溫度的測定 以0.06 mmol/L 的尿酸為底物,加 50 μL 粗酶液,分別在 20、25、30、35、40、45、50、55 ℃下測該酶的活性,每組試驗設置 3個平行試驗組,一個對照組(加入100 ℃高溫酶活酶),反應15 min 后分別測定在OD290nm的吸光度值。

        1.3.5 最適反應pH 用不同的pH 緩沖液(pH 3~8 磷酸氫二鈉-檸檬酸緩沖液,pH 8 ~ 9 甘氨酸-NaOH 緩沖液) 溶解尿酸至濃度為0.06 mmol/L,在最適溫度下反應15 min 后,測OD290nm的吸光度值。

        1.3.6 溫度和pH 對粗酶液穩(wěn)定性的影響 將1 mL粗酶液分別置于不同的溫度(30、35、40 ℃)下保溫, 在保溫 20、40、60、80、100、120 min 時測定酶活。以保溫0 min 溫度下所測得的酶活為對照組,其余溫度下所測得的酶活與其相比, 并計算相對酶活,用相對酶活繪制出酶的熱穩(wěn)定性曲線。每組試驗設置3 個平行。

        取適量0.5 mL 粗酶液分別加入1.5 mL 不同pH 緩沖液(pH 3 ~ 10)孵育 12 h 或 24 h 后作為反應的酶液加入反應體系中, 以生理鹽水(0.9%NaCl)稀釋的粗酶液作為對照組。在最適溫度下反應15 min,測吸光度值。

        2 結(jié)果

        2.1 菌株生長與發(fā)酵液中尿酸的降解 在發(fā)酵培養(yǎng)基中培養(yǎng),DLEH-68 的生長情況(OD600nm)和對尿酸的降解情況(OD290nm)如圖1 所示。 結(jié)果表明,隨著菌體量增加,尿酸逐漸被降解;培養(yǎng)前36 h 菌株DLEH-68 處于對數(shù)生長期, 尿酸含量迅速下降;至48 h 時,菌株進入穩(wěn)定期,尿酸含量趨于穩(wěn)定。 這說明菌株DLEH-68 能產(chǎn)生尿酸降解相關酶,利用尿酸提供生長所需碳源和氮源。

        圖1 菌體生長與尿酸降解

        2.2 胞內(nèi)、 胞外尿酸氧化酶活性測定 如圖2 所示,胞內(nèi)的活性無論在各個培養(yǎng)時間段(12~48 h)都高于胞外,胞內(nèi)的活性在培養(yǎng)12 h 時最高,由此確定該菌株所產(chǎn)尿酸氧化酶以胞內(nèi)酶為主,12 h時活性達到最高。

        圖2 不同培養(yǎng)時間胞內(nèi)和胞外尿酸氧化酶活性

        2.3 菌株DLEH-68 分子生物學鑒定 通過16S rRNA 序列通用引物PCR 和測序, 獲得1437 bp 16S rRNA 基因核苷酸序列, 序列在線上傳至GenBank, 登錄號:NO.MW090727, 與菌株 Klebsiella oxytoca N8 (登錄號:KM349413.1)親緣關系最近,同源性為 99.65%(圖 3),基于 16S rRNA 序列同源性構建系統(tǒng)進化樹, 菌株DLEH-68 與Klebsiella 屬聚在一枝,故通過分子生物學鑒定該菌株為克雷伯氏菌屬菌株, 命名為Klebsiella sp.DLEH-68。

        圖3 基于16S rRNA 序列同源性構建菌株DLEH-68 的系統(tǒng)進化樹

        2.4 最適溫度和pH 如圖4a 所示, 菌株DLEH-68 來源尿酸氧化酶的最適溫度為35 ℃。 在20 ℃時基本無活性,隨著溫度升高活性漸漸的增長,在35 ℃時達到最高, 隨后逐漸降低直至55 ℃徹底失去活性。 如圖4b 所示,其最適反應pH 為7.0,在pH 3.6 開始有活性,越接近中性pH 活性越高,在pH 7.0 時達到最高,pH>7.0,活性逐漸降低,在pH 6.6 ~ 7.6 保持60%以上。

        圖4 溫度(a)和 pH(b)對菌株 DLEH-68來源尿酸氧化酶活性的影響

        2.5 溫度對酶穩(wěn)定性的影響 在30、35、40 ℃三個溫度下熱處理, 結(jié)果如圖5 所示,35 ℃下處理20 min 后達到最高, 隨著熱處理時間的延長,活性逐漸降低,在處理80 min 時降低至60%并處于穩(wěn)定至100 min, 在處理120 min 后急劇下降至13%。 在溫度為30 ℃和40 ℃下熱處理酶喪失活性的速度較快, 在處理60 min 后均下降至75%,隨著處理時間的延長,40 ℃下下降的最快,30 ℃下降速率較慢,當處理120 min 后降至30%。

        圖5 溫度對菌株DLEH-68來源尿酸氧化酶穩(wěn)定性的影響

        2.6 pH 對酶穩(wěn)定性的影響 菌株DLEH-68 來源尿酸氧化酶分別在pH 3 ~ 10 中處理12 h 和24 h,結(jié)果如圖 6 所示。 在處理 12 h 后,該酶從pH 3 開始有活性,pH 越接近中性活性越高,并在中性pH 7 時達到最大, 有最初的43%升高到92%, 之后隨 pH 從 7 升高到 10, 酶活性逐漸降低,在 pH 10 時降至 40%。 在處理 24 h 后,pH 3、pH 3.6 均沒有活性,從pH 4 開始有35%的活性,也是隨著pH 越接近于中性,酶活性越高,但都低于處理12 h 的活性。 在pH 7 ~ 10, 活性逐漸降低,當pH 到10 時活性降到14%。

        圖6 pH 對菌株DLEH-68來源尿酸氧化酶穩(wěn)定性的影響

        3 討論

        尿酸氧化酶作為治療高尿酸癥的最有發(fā)展優(yōu)勢和最具有潛力的一類藥, 越來越受到人們的重視和關注, 而微生物具有易于培養(yǎng)和代謝類型多樣的特點。由此產(chǎn)生很多對人類有益的代謝產(chǎn)物,是尿酸氧化酶的一個重要來源,為現(xiàn)代醫(yī)藥的發(fā)展做出了重大貢獻。 對現(xiàn)有微生物資源進行高通量篩選, 有可能找到性能上更適合醫(yī)藥應用的酶(咸靜女等,2018;張玉然等,2016)。 近年來不斷有研究在挖掘和探究產(chǎn)尿酸氧化酶的細菌、真菌,目前已知的產(chǎn)尿酸氧化酶微生物有產(chǎn)朊假絲酵母屬,芽孢桿菌屬,曲霉屬,微桿菌屬,節(jié)桿菌屬等( 薛璟等,2011;程新等,2009)。有報道表明Klebsiella pneumoniae 來源的尿酸氧化酶是一種新型的黃素腺嘌呤二核甘酸(FDA)依賴的尿酸氧化酶 (Hpxo)(Hicks 等,2013;Katherine等,2009)。 這預示著菌株 Klebsiella sp. DLEH-68 來源的尿酸氧化酶可能也是一種FAD 依賴的尿酸氧化酶,在檢測其活性過程中,所需FAD可能來自細胞裂解液。

        本研究從洱海底泥篩選出的這株尿酸降解菌, 通過發(fā)酵發(fā)現(xiàn)其為產(chǎn)尿酸氧化酶菌株-克雷伯氏菌(Klebsiella sp. DLEH-68),對其活性進行試驗測定, 最終確定獲得的降解尿酸胞內(nèi)酶的最適pH 為7, 最適溫度為35 ℃, 處于人體體溫范圍, 對未來開發(fā)用于痛風病人的臨床診斷與注射治療有很大的潛力和研究價值。

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