趙 永 郭進軍 何 松
(1.重慶醫(yī)科大學第二臨床醫(yī)學院 重慶 400010;2.重慶市急救醫(yī)療中心 重慶 400010;3.重慶醫(yī)科大學附屬第二醫(yī)院 重慶 400010)
胃癌(GC)指源于胃黏膜上皮細胞的惡性腫瘤,是全球第二常見的癌癥相關(guān)死亡原因,嚴重威脅人類健康[1]。由于缺乏有效的臨床早期診斷腫瘤分子標志物,大多數(shù)胃癌患者確診時已是中晚期,多數(shù)伴有廣泛浸潤和遠處轉(zhuǎn)移,雖然手術(shù)切除及放、化療等多種手段廣泛應(yīng)用于GC治療,但治療效果不佳,5年生存率僅約為30%[2][3]。近幾十年來,lncRNAs的異常表達已被證明與多種人類癌癥(包括胃癌)的發(fā)生和發(fā)展有關(guān)。長非編碼RNA(Long Non Coding RNAs,lncRNAs)由于其高度的特異性、易于非侵襲性的可及性以及在不同病理生理條件下的異常表達,作為潛在的診斷或預測生物標志物而備受關(guān)注。它們也可能成為治療胃癌的靶點。因此,探索lncRNAs的特殊功能將有助于更好地理解胃癌的發(fā)病機制,并開發(fā)新的胃癌治療方法。本文就lncRNAs在胃癌中的表達和功能進行綜述,并分析其作為診斷標記物和治療靶點的潛在應(yīng)用。
隨著全基因組分析的快速發(fā)展,人們發(fā)現(xiàn)大多數(shù)基因組被轉(zhuǎn)錄的RNA中98%不能被翻譯成蛋白,這類不能被翻譯成蛋白質(zhì)的RNA統(tǒng)稱為非編碼RNA(non-codingRNA,ncRNA)[4][5]。根據(jù)ncRNA的大小,人們將它分為兩類:一類是長度小于200nt的短鏈ncRNA,如siRNA,microRNA等;一類是長度大于200nt、缺少有效的開放閱讀框或包含高密度的終止子的長鏈非編碼RNA,稱為lncRNA。根據(jù)lncRNA在基因組的位置,lncRNA可以分為5類[6]:反義lncRNA;內(nèi)含子非編碼RNA;基因間的lncRNA;正義lncRNA;雙向lncRNA。在過去,人們認為lncRNA被誤認為只具有逆轉(zhuǎn)錄功能的“噪聲”“垃圾”,但是隨著國內(nèi)外研究的不斷深入,很多研究表明lncRNA在生物進程中發(fā)揮了很大的作用[6][7][8]。lncRNA的異常表達會導致一些癌基因與抑癌基因的異常表達。因此,lncRNA與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移及預后有關(guān)。
lncRNA H19位于染色體11p15.5上,其高表達與乳腺癌、膀胱癌和宮頸癌等多種腫瘤的增殖和侵襲有關(guān)[9][10][11][12][13]。H19也被報道在胃癌中起癌基因的作用,其過表達可能與胃癌的發(fā)生有關(guān)。Li等[14]研究表明lncRNA H19在胃癌組織中的表達高于正常組織,且與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和臨床分期呈正相關(guān)。在體外,H19的上調(diào)可以促進胃癌細胞的增殖、遷移和侵襲,而H19的下調(diào)則導致細胞凋亡[15][16][17]。Zhou[18]等使用逆轉(zhuǎn)錄實時熒光定量PCR(RT-qPCR)檢測發(fā)現(xiàn)了在GC患者中血清外泌體lncRNA H19的表達水平明顯高于健康志愿者(P<0.01),并且與術(shù)前GC患者的相比,術(shù)后GC患者的血清外泌體在術(shù)后LNCRNA H19水平顯著降低。這些結(jié)果提示lncRNA H19可能是一種潛在的具有診斷和預后價值的胃癌生物標志物。
關(guān)于H19作為癌基因在胃癌中的潛在作用機制,已有多位研究人員提出了H19作為胃癌致癌基因的潛在功能機制。研究表明ISM1是H19的結(jié)合蛋白,其表達與H19的表達呈正相關(guān)[19]。CALN1是miR-675的靶基因,其表達與miR-675呈負相關(guān)。H19在胃癌中的作用是通過直接上調(diào)ISM1和海綿吸附miR-675間接抑制CALN1表達來介導惡性進展。另有研究發(fā)現(xiàn)lncRNA H19可以作為競爭性內(nèi)源RNA起作用,通過在GC細胞中螯合let-7c來調(diào)節(jié)HER2表達,而Let-7c在癌癥中被認為是腫瘤抑制因子[20]。其他研究表明,胃癌組織中H19的表達與miR-141的表達呈負相關(guān)。H19可促進胃癌的增殖和侵襲,而miR-141則抑制胃癌的增殖和侵襲。H19和miR-141之間的競爭抑制關(guān)系在胃癌的發(fā)生發(fā)展中起著重要作用[21]。
Linc00152屬于基因間的lncRNA,位于染色體2p11.2上,長約828nts長的轉(zhuǎn)錄本[22]。Pang等人采用實時定量逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)檢測71對胃癌患者癌組織及癌旁正常組織中LINC00152的表達,發(fā)現(xiàn)LINC00152在胃癌組織中的表達水平顯著高于其配對的正常組織(P=0.045)和正常胃黏膜(P=0.004),LINC00152的高表達與腫瘤的侵襲性相關(guān)(P=0.042)[23]。此外,LINC00152的高表達與腫瘤大小、浸潤深度及預后呈正相關(guān)。Zhao等[24]敲除Linc00152基因會導致細胞增殖抑制,增強細胞周期G1期阻滯,觸發(fā)晚期凋亡,減少上皮向間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)程序,并抑制細胞的遷移和侵襲。這些結(jié)果提示Linc00152可能是一種致癌的lncRNA,參與胃癌的發(fā)生和侵襲性進展。Linc00152有可能成為胃癌診斷和治療的新生物標志物。
功能分析表明[24],敲除Linc00152基因可以抑制細胞增殖和集落形成,將細胞周期阻滯于G1期,誘導晚期凋亡,抑制上皮向間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)程序,抑制細胞遷移和侵襲。另一項研究表明,通過敲除LINC00152可以顯著抑制胃癌細胞的增殖。此外,Linc00152可以直接與致癌驅(qū)動因子表皮生長因子受體(EGFR)結(jié)合,從而激活PI3K/AKT信號轉(zhuǎn)導通路,從而促進腫瘤生長,有望成為未來治療的潛在靶點[25]。Huang等人[26]發(fā)現(xiàn)LINC00152與miR-193a-3p呈負相關(guān),miR-193a-3p通過靶向MCL1顯著抑制胃癌細胞增殖,抑制腫瘤生長。因此,LINC00152通過LINC00152/miR-193a-3p/MCL1通路發(fā)揮其在胃癌發(fā)生發(fā)展中的生物學效應(yīng)。
生長停滯特異性轉(zhuǎn)錄本5(growtharrest-specific5,GAS5)GAS5是一種長約650nts的非編碼RNA,最初是在生長停滯期間篩選潛在的腫瘤抑制基因時分離出來的[27]。Gas5在胰腺癌、卵巢癌、骨肉瘤、腎細胞癌、結(jié)直腸癌等多種腫瘤中被認為是一種腫瘤抑制因子[28][29][30][31][32][33]。Liu等發(fā)現(xiàn)[34]Gas5在胃癌中低表達是一種常見事件,并且在遠處轉(zhuǎn)移的組織中以及正常胃上皮細胞系Gas5表達水平明顯低于無遠處轉(zhuǎn)移的組織及胃癌細胞系中,這表明Gas5可能在胃癌轉(zhuǎn)移中起關(guān)鍵作用。這些結(jié)果證實了Gas5在胃癌中表達下調(diào),可能參與了胃癌的轉(zhuǎn)移。也有研究顯示GAS5與腫瘤的大小(P=0.008)、分期(P<0.001)、浸潤深度(P<0.001)和局部淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(P<0.001)呈負相關(guān)[35]。
Gas5在胃癌中的表達下調(diào)已被普遍證實,但其作用機制尚不清楚。越來越多的證據(jù)表明,在腫瘤發(fā)生過程中,Gas5可能通過與miRNA結(jié)合發(fā)揮作用。Li等人[36]發(fā)現(xiàn)過表達Gas5可以通過負調(diào)控miR-222抑制胃癌細胞的增殖,miR-222被證明是一種致癌的miRNA。Liu等[37]發(fā)現(xiàn)lncRNA GAS5與Y-box結(jié)合蛋白1(YBX1)相互作用,敲除lncRNA GAS5可加速YBX1蛋白的周轉(zhuǎn),而不影響YBX1的轉(zhuǎn)錄。lncRNA GAS5的下調(diào)降低了YBX1蛋白的水平,從而降低了YBX1轉(zhuǎn)錄的p21表達,逆轉(zhuǎn)了胃癌G1期細胞周期停滯。同時也證明了lncRNA Gas5/YBX1/p21通路可能為發(fā)展以lncRNA為基礎(chǔ)的胃癌治療提供有用的靶點[38]。另有研究發(fā)現(xiàn)Gas5的作用可能是通過上調(diào)P21蛋白的表達和抑制CDK6介導,抑制胃癌細胞的增殖。
轉(zhuǎn)移相關(guān)肺腺癌轉(zhuǎn)錄本1(metastasis- associated lung adenocarcinoma transcript 1, MALAT1)是長約800nts的非編碼RNA,位于染色體11q13.1上。MALAT1是Ji等人于2003年最初在早期非小細胞肺癌發(fā)現(xiàn)的原癌基因之一,Bi等人證實了它促進癌癥的增殖、遷移和轉(zhuǎn)移[39][40][41][42]。近年來也有研究提示MALAT1可能作為癌基因在胃癌中發(fā)揮作用,高水平的MALAT1可作為胃癌遠處轉(zhuǎn)移的潛在生物標志物。Xia等人[43]報道胃癌患者遠處轉(zhuǎn)移組織和血漿中的MALAT1水平顯著高于無遠處轉(zhuǎn)移患者和健康對照組(P<0.01)。此外,COX分析表明MALAT1的高表達與胃癌患者的不良預后正相關(guān)(風險比,0.242;95%CI,0.154-0.836;P=0.036)。另一項研究通過分析MALAT1在胃癌組織和配對的非癌組織中的表達水平,也表明了MALAT1表達水平的上調(diào)與局部侵襲、淋巴結(jié)侵襲、腹膜轉(zhuǎn)移和短總生存期之間的正相關(guān)[44][45]。
體外研究證實[46],MALAT1與miR-1297呈負相關(guān),并發(fā)揮分子海綿作用,拮抗miR-1297抑制HMGB2表達的能力。這表明MALAT1/miR-1297/HMGB2軸在胃癌發(fā)生發(fā)展過程中發(fā)揮重要調(diào)控作用,為胃癌治療提供了新的靶點。另有研究表明,MALAT1通過與EZH2結(jié)合抑制抑癌基因PCDH10的表達,導致胃癌細胞遷移和侵襲[47]。MALAT1還可以作為miR-23b-3p的競爭性內(nèi)源性RNA,降低其對TG12的抑制作用,而TG12是自噬的重要調(diào)節(jié)因子[48]。這將促進化療誘導的胃癌細胞自噬和化療耐藥。這些結(jié)果表明,MALAT1可以作為胃癌的治療靶點。
位于染色體14q32.3上的母系表達基因3(MEG3)在多種腫瘤組織和細胞中表達下調(diào)[49]。現(xiàn)已證實MEG3基因是一種腫瘤抑制基因,與包括胃癌在內(nèi)的多種癌癥有關(guān)。Peng等發(fā)現(xiàn)MEG3在胃癌組織中表達下降,并且MEG3在胃癌中的表達水平與pM分期(P<0.01)和pT分期(P<0.01)呈負相關(guān),與患者性別、年齡、靜脈浸潤、腫瘤位置、borrmann分型、T分期和pN分期等臨床病理特征無顯著差異。此研究還表明,MEG3的表達與腫瘤大小呈負相關(guān),與胃癌患者的總體生存率呈正相關(guān)。越來越多的研究表明,MEG3的過表達可以抑制胃癌的增殖和轉(zhuǎn)移,并且與腫瘤的深層侵襲、晚期轉(zhuǎn)移和不良預后密切相關(guān)。
研究表明,lncRNA可能通過與miRNAs相互作用,促進信號通路,在胃癌的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用。MEG3在胃癌患者和細胞系中降低,其表達與轉(zhuǎn)移性胃癌相關(guān),MEG3可通過miR-181a上的競爭內(nèi)源性RNA(CeRNA)活性上調(diào)Bcl-2的表達,從而抑制了細胞增殖、遷移、侵襲,促進了細胞凋亡。miR-770及其宿主基因MEG3可能發(fā)揮抑癌作用,近端啟動子和增強子區(qū)域的高甲基化可能是MEG3和miR-770失活在GC發(fā)展中的關(guān)鍵機制之一。MEG3和miR-770可作為預測GCA患者預后的潛在生物標志物。故MEG3可以作為競爭的內(nèi)源性RNA,吞噬不同的miRNAs,從而調(diào)節(jié)胃癌的惡性行為。另有研究表明,MEG3過表達促進了胃癌細胞系p53的表達,提示MEG3可能通過p53依賴的轉(zhuǎn)錄途徑抑制胃癌的增殖和轉(zhuǎn)移。
lncRNA UCA1位于19q11,長約1.4kb。研究人員首次在膀胱癌中發(fā)現(xiàn)了尿路上皮癌相關(guān)基因1(UCA1)。UCA1隨后被證明是一個致癌的長非編碼RNA。近年來,UCA1一直被證實在胃癌的發(fā)病機制中發(fā)揮重要作用。在之前的一項研究結(jié)果顯示UCA1在胃癌組織中的表達水平明顯高于癌旁正常組織,并且與健康對照組相比,GC患者的血漿UCA1表達明顯上調(diào)(p<0.0001),手術(shù)后血漿中的表達水平(AUC=0.883)較術(shù)前顯著降低(p<0.01),下調(diào)UCA1會抑制GC細胞增殖,遷移和凋亡。研究人員進一步的臨床病理分析顯示,UCA1的表達水平與腫瘤大小、浸潤深度、TNM分期和總體生存不良呈正相關(guān)。
功能研究表明,UCA1的表達可以促進胃癌細胞的增殖、集落形成和侵襲,而沉默UCA1則抑制腫瘤的生長。Cao等人通過改變?nèi)宋赴┘毎蠻CA1和miR-495的表達來評價細胞的體外活性以及體內(nèi)的腹膜轉(zhuǎn)移和成瘤能力。UCA1作為miR-495的一個ceRNA,可以通過上調(diào)PRL-3來加速胃癌的發(fā)展,促進胃癌細胞的增殖、遷移和侵襲,同時抑制細胞凋亡,促進了胃癌細胞的腹膜轉(zhuǎn)移和成瘤。同時,上調(diào)miR-495的表達可以逆轉(zhuǎn)UCA1的促進作用。這為胃癌的靶向干預治療提供了一個有潛力的基礎(chǔ)。另一項研究表明,抑制UCA1可降低子宮內(nèi)膜異位癥相關(guān)蛋白水平,轉(zhuǎn)化生長因子β-1(TGF-β-1)可部分逆轉(zhuǎn)這種作用。推測在轉(zhuǎn)化生長因子β-1誘導下,Uca-1可能促進胃癌的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移。Gu等人發(fā)現(xiàn)UCA1可能通過負調(diào)控miR-590-3p的表達和激活其下游靶標CREB1的表達來發(fā)揮作用。UCA1/miR590-3p/CREB1可能成為治療胃癌的潛在靶點。
除了上述已被充分證實的lncRNAs外,許多其他lncRNAs在胃癌中起著重要的病理作用。比如LincRNA00978、HULC、ANRIL、FendrR等lncRNAs,LincRNA00978在胃癌組織和血漿中升高,通過激活轉(zhuǎn)化生長因子β/smad2/MMP9通路誘導內(nèi)膜轉(zhuǎn)化。在肝癌中HULC高表達的lncRNAs也通過加速胃癌細胞的EMT而促進腫瘤細胞的遷移。ANRIL是位于INK4基因區(qū)的反義lncRNA。已有研究表明ANRIL在胃癌中過表達,并與腫瘤大小、TNM分期和生存率下降呈正相關(guān)。ANRIL通過mTOR和CDK6/E2F1途徑調(diào)控miR-99a/miR-449a,從而調(diào)控胃癌的發(fā)生發(fā)展。FendrR是在腫瘤發(fā)生中起重要作用的lncRNA之一。研究人員已經(jīng)證明了Fendrr的下調(diào)及其與浸潤深度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和患者預后不良的相關(guān)性。這表明,lncRNA在胃癌發(fā)生、發(fā)展等過程中具有重要作用。
因此,篩選和識別潛在的用于預后、監(jiān)測和評估患者治療反應(yīng)的早期生物標志物,有助于改善胃癌患者的預后及生存質(zhì)量。lncRNA作為重要的基因表達調(diào)控因子,通過細胞增殖、細胞周期、細胞凋亡、細胞分化、細胞遷移、侵襲等多種過程,在腫瘤細胞的生物學功能中發(fā)揮著明顯不同的功能作用。全基因組測序技術(shù)已經(jīng)成為一項重要的技術(shù),并報道了大量新發(fā)現(xiàn)的lncRNA,這表明lncRNA在胃癌預后和診斷中的應(yīng)用前景廣闊。然而,我們目前對lncRNA與胃癌的關(guān)系的了解仍然有限。因此,需要更多的研究來更好地了解lncRNA及其在胃癌中的作用機制。