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        長鏈非編碼RNA LINC00662在神經(jīng)母細胞瘤中的表達及生物學作用

        2021-12-23 01:50:14葉夢婷周佩燕
        廣州醫(yī)科大學學報 2021年5期
        關鍵詞:母細胞細胞周期生物學

        葉夢婷,周佩燕

        (1.廣州醫(yī)科大學附屬第五醫(yī)院,廣東 廣州 519000;2.廣州市白云區(qū)第三人民醫(yī)院,廣東 廣州 510000)

        神經(jīng)母細胞瘤(Neuroblastoma,NB)是兒童最常見的惡性腫瘤之一[1,2]。神經(jīng)母細胞瘤起源于原始的神經(jīng)脊細胞,惡性程度高、進展快、預后差,在早期即容易發(fā)生骨髓轉移和遠處轉移。近年來,盡管對神經(jīng)母細胞瘤的治療方式(包括手術切除、放療、化療以及分子靶向治療等)取得了很大的進展,但是患兒的5年生存率仍低于40%,嚴重威脅患兒的身體健康[3]。因此,我們亟需篩選出神經(jīng)母細胞瘤的關鍵生物學標志物,并闡明其在調(diào)控神經(jīng)母細胞瘤的惡性增殖以及高度侵襲性的生物學機制,進而在基因層面干預腫瘤的惡性進展。

        長鏈非編碼RNA(LincRNA)是一種由基因組中非編碼序列轉錄生成的,其核酸序列長度一般大于200個堿基,不具有翻譯成蛋白質的能力[4,5]。研究發(fā)現(xiàn),長鏈非編碼RNA具有廣泛的組織表達譜,與編碼蛋白質的mRNA相比較,其具有更強的組織和細胞表達特異性。越來越多的研究表明,LincRNA在調(diào)節(jié)惡性腫瘤細胞的增殖能力、侵襲轉移能力等多個方面發(fā)揮重要作用[6,7]。其中,linc00662就是一種能調(diào)控腫瘤細胞惡性進展的關鍵分子標志物,其定位于人類染色體19q11的內(nèi)含子LincRNA,長度為2085bp。近年來,linc00662已被鑒定為各種癌癥中的一種關鍵致癌基因,包括胃癌、肺癌、口腔鱗狀細胞癌等[8-10]。然而,目前尚不清楚LincRNA00662在神經(jīng)母細胞瘤中的表達及生物學效應?;诖?,本研究主要探索LincRNA00662在神經(jīng)母細胞瘤中的表達特性及其與患兒臨床病理特征之間的關系,并進一步研究其對正常背根神經(jīng)節(jié)細胞和神經(jīng)母細胞瘤細胞的增殖能力及侵襲轉移能力的影響。

        1 材料與方法

        1.1 組織樣本信息

        本研究共收集40對神經(jīng)母細胞瘤組織和配對的正常組織標本,并且對其臨床病理特征進行評價。所有參與本研究的組織樣本均購買于廣州鋮銨生物科技有限公司。

        1.2 細胞培養(yǎng)

        人類神經(jīng)母細胞瘤細胞系(SK-N-SH,IMR-32,Kelly和SH-SY5Y)和正常背根神經(jīng)節(jié)(DG)細胞均從中國上海公司ATCC獲得。將細胞系培養(yǎng)在含10%胎牛血清的McCoy’s5a培養(yǎng)基中(Gibco,Grand Island,NY ,USA)以37 ℃、5%CO2的環(huán)境培養(yǎng)。

        1.3 RNA干擾

        我們采用小RNA干擾技術(siRNA)以及脂質體3000轉染試劑(美國Thermo Fisher) 構建linc00662表達下調(diào)的神經(jīng)母細胞瘤細胞系 (siRNA-1和siRNA-2三組)。同時用相應的陰性對照(NC)序列(si-Control) 轉染細胞系。

        1.4 實時定量聚合酶鏈反應(RT-qPCR)檢測

        首先,用試劑TRIzol (Invitgen,USA)從冰凍組織和細胞系中提取總RNA,然后用PrimeScript RT Master Mix(T Akara)轉錄成cDNA。隨后,使用試劑盒SYBR PreMix Ex T AQ II Kit(T Akara)分析linc00662的表達。并以β-肌動蛋白作為內(nèi)源性對照。本研究使用的引物下所示:linc00662,5’-CAC GCT TCT GAA ACT GGT GT-3’,5’-TGT ACA GCC TGG TGA CAG AG-3’; β-actin,5’-CGC TCT CTG CTC CTC CTG TTC-3’,5’-ATC CGT TGA CTC CGA CCT TCA C -3’.

        1.5 CCK-8測定

        首先,收集linc00662基因敲低的SH-SY5Y細胞株,以適當?shù)臐舛?5×103個細胞/孔)接種于96孔板中。培養(yǎng)24、48、72、96h后,在McCoy's 5a培養(yǎng)基(CCK-8,Dojindo)中,每孔加入含10%CCK-8溶液100 μL。最后,使用微型平板讀取器(Bio-Rad,Hercules,CA,USA)讀取每孔的OD值。

        1.6 流式細胞儀分析

        本研究為了對神經(jīng)母細胞瘤細胞周期進行分析,采用細胞周期檢 測試劑盒(Keygen,Nanjing,China)進行處理。并且我們采用FACSCantoII流式細胞儀(BD Biosciences)檢測處于細胞的細胞周期階段細胞百分比。

        1.7 細胞遷移和侵襲性分析

        本研究為了評估細胞遷移,我們將收集處理后的細胞用無血清培養(yǎng)基進行培養(yǎng),并將4×104細胞加入培養(yǎng)基 (0.8 μm; Corning,NY ,USA) 的上層并且在下層中加入含2 0%胎牛血清的McCoy5a培養(yǎng)液500 μL。24 h后用4%多聚甲醛固定細胞,并用試劑0.1% crystal violet染色,最后使用光學顯微鏡成像觀察。

        1.8 統(tǒng)計分析

        本研究所有數(shù)據(jù)均以均數(shù)±標準差(SD)表示,所有實驗至少重復三次。生存資料采用Kaplan-Meier方法進行分析并使用GraphPad Prism軟件(GraphPad Software,San Diego,California,USA)進行曲線擬合分析。所有其他數(shù)據(jù)均采用Student's t-test進行評估。當P<0.05時,差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結 果

        2.1 臨床表達與臨床參數(shù)相關性

        為了進一步探索LINC00662在神經(jīng)母細胞瘤中的生物學調(diào)控作用,我們首先檢測其在神經(jīng)母細胞瘤組織以及外周正常組織中的表達水平。qPCR結果顯示:LINC00662在神經(jīng)母細胞瘤中的表達水平明顯高于外周的正常組織(圖1,***P<0.001)。此外,我們根據(jù)LINC00662的表達水平中位數(shù)將40例患兒標本分為高表達組和低表達組,并進行卡方檢驗,結果顯示:LINC00662高表達往往與腫瘤分化程度低(P=0.008)、腫瘤分期晚(P=0.0267)以及淋巴結侵犯(P=0.011)等有著密切的聯(lián)系(表1)。這提示LINC00662有可能在神經(jīng)母細胞瘤發(fā)生發(fā)展中擔任促癌角色。

        表1 LINC00662表達水平和兒童神經(jīng)母細胞瘤臨床病理參數(shù)的關系

        圖1 LincRNA00662在神經(jīng)母細胞瘤組織及外周正常組織中的表達水平,***P<0.001

        2.2 神經(jīng)母細胞瘤細胞內(nèi)LINC00662的表達水平及LINC00662低表達的細胞模型構建

        為證實LINC00662是否與具有神經(jīng)母細胞瘤發(fā)生發(fā)展相關,我們首先檢測神經(jīng)母細胞瘤細胞以及正常背根神經(jīng)節(jié)細胞中LINC00662的表達水平,qPCR結果顯示:相對于正常背根神經(jīng)節(jié)細胞,LINC00662在神經(jīng)母細胞瘤細胞中的表達水平均明顯上調(diào),其中SH-SY5Y細胞在所有神經(jīng)母細胞瘤細胞中呈現(xiàn)相對高表達狀態(tài)(圖2A)?;诖耍覀兝弥|體轉染技術構建LINC00662低表達的神經(jīng)母細胞瘤細胞株,結果提示:相對于陰性對照組(si-Control),siRNA轉染組(siRNA-1和siRNA-2)可顯著抑制SH-SY5Y細胞內(nèi)LINC00662的表達水平(圖2B),這提示LINC00662低表達的SH-SY5Y細胞模型被成功構建,可用于后續(xù)的功能實驗。

        注:A.LINC00662在人類神經(jīng)母細胞瘤細胞和正常背根神經(jīng)節(jié)細胞中的表達水平;B.LINC00662低表達的神經(jīng)母細胞瘤細胞株的構建,***P<0.001。

        2.3 敲低LINC00662的表達后能顯著抑制神經(jīng)母細胞瘤細胞的增殖能力

        無限增殖能力是所有惡性腫瘤的基本生物學特征,因此在本研究中我們通過CCK-8實驗來進一步探索LINC00662對細胞增殖能力的影響,實驗結果顯示:下調(diào)SH-SY5Y細胞中LINC00662的表達后,細胞的增殖水平較對照組顯著明顯減慢(圖3),這說明敲低細胞內(nèi)LINC00662的表達能顯著抑制神經(jīng)母細胞瘤細胞的增殖能力。

        2.4 敲低LINC00662的表達后對神經(jīng)母細胞瘤細胞周期分布的影響

        為進一步明確LINC00662對神經(jīng)母細胞瘤細胞惡性增殖能力調(diào)控的作用機制,在本研究中我們利用流式細胞學技術檢測細胞周期分布情況,結果顯示:與對照組相比較,敲低細胞內(nèi)LINC00662的表達后能使得S期細胞的比例明顯下降、而G2/M期的比例明顯增加,差異有統(tǒng)計學意義(圖4)。這提示敲低LINC00662的表達能誘導更多的神經(jīng)母細胞瘤細胞阻滯在G2/M期,進而抑制神經(jīng)母細胞瘤的惡性增殖能力。

        2.5 敲低LINC00662的表達后能顯著抑制神經(jīng)母細胞瘤細胞的侵襲及轉移能力

        為了進一步探究LINC00662對神經(jīng)母細胞瘤細胞侵襲轉移能力的影響,在本研究中我們還進行了Transwell實驗,結果顯示:與對照組相比較,siRNA-1和siRNA-2組的細胞侵襲與轉移數(shù)目均顯著減少(圖5),這說明敲低LINC00662表達后能顯著抑制細胞的侵襲轉移能力。

        注:***P<0.001。

        si-ControlsiRNA-1siRNA-2100080060040020001000800600400200010008006004002000204060801002000si-ControlsiRNA-1siRNA-26040200CellcycledistributionG1G2/MSDpG1DpG2DpSDpG1DpG2DpSDpG1DpG2DpS***********204060801002000204060801002000

        注:***P<0.001。

        3 討 論

        神經(jīng)母細胞瘤是嬰兒與兒童最常見的顱外實體腫瘤[3]。近年來,隨著社會經(jīng)濟水平的提高和人們生活方式的改變,兒童的神經(jīng)母細胞瘤的患病率呈逐年增加的趨勢,已經(jīng)成為威脅兒童生命安全的重要疾病[11]。在日常診療中,神經(jīng)母細胞瘤起病隱匿、早期癥狀不明顯、極易發(fā)生遠處轉移[12],盡管神經(jīng)母細胞瘤的的早期篩查、診斷及治療方面取得了較明顯的進展,但患兒的5年生存率仍處于較低的水平。其實,腫瘤的惡性演變過程是一個多因素、長期累積突變的過程,闡明其發(fā)生機制可能為兒童神經(jīng)母細胞瘤的治療帶來新的希望。隨著高通量測序技術及分子生物學的進步,尋找神經(jīng)母細胞瘤的關鍵調(diào)控靶標成為了可能,這將為臨床決策提供關鍵性的指導作用。

        近年來,研究發(fā)現(xiàn)長鏈非編碼RNA在染色體構象、轉錄和轉錄后調(diào)控等多個過程起著關鍵的調(diào)控作用,并參與惡性腫瘤的增殖、周期和侵襲轉移等生物過程[13]。隨著對長鏈非編碼RNA分子研究的不斷深入,我們發(fā)現(xiàn)許多LincRNA的表達具有高度的組織特異性,有望成為惡性腫瘤的潛在生物學標志為,具有巨大的應用前景[14,15]。其中,linc00662是一個新近發(fā)現(xiàn)的調(diào)控分子,主要定位于人類染色體19q11的內(nèi)含子上。Wang等人發(fā)現(xiàn)LINC00662在脊髓瘤的惡性進展中起著重要的調(diào)控作用,其主要通過調(diào)控miR-16-5p/RNF44B信號軸促進脊髓瘤細胞增殖、集落形成以及侵襲轉移的發(fā)生[16]。此外,Yao等人發(fā)現(xiàn)抑制細胞內(nèi)LINCRNA00662的表達后,能通過調(diào)控miR-145/c-myc軸抑制結直腸癌細胞的增殖能力、誘導更多的結直腸癌細胞發(fā)生凋亡[17]。然而,迄今為止,LINC00662在神經(jīng)母細胞瘤中的表達方式和生物學功能尚不清楚,有待進一步的探索。

        基于此,為明確LINC00662在神經(jīng)母細胞瘤中的生物學調(diào)控作用,在本研究中我們首先通過RT-qPCR技術檢測并分析了40例配對的兒童神經(jīng)母細胞瘤組織及外周正常組織標本中LINC00662的表達水平,結果發(fā)現(xiàn)神經(jīng)母細胞瘤組織中LINC00662的表達水平明顯高于癌旁正常組織。此外,統(tǒng)計學結果也一致表明,LINC00662的高表達狀態(tài)往往預示著患兒腫瘤分化程度低、腫瘤分期晚以及淋巴結侵犯。由此可進一步推測,對于神經(jīng)母細胞瘤患兒,LINC00662的表達水平越高意味著患兒的預后差、死亡率高,這提示LINC00662有可能在神經(jīng)母細胞瘤中起促癌作用。

        為進一步明確LINC00662的生物學作用,我們通過脂質體轉染技術成功構建了LINC00662過表達的神經(jīng)母細胞瘤細胞模型。研究結果提示,抑制細胞內(nèi)LINC00662的表達后能顯著抑制神經(jīng)母細胞瘤細胞的增殖能力,但其機制尚不明確。既往研究發(fā)現(xiàn),LincRNA的表達調(diào)控能通過誘導細胞增殖周期阻滯進而影響細胞增殖水平[18-19]。Li等研究人員發(fā)現(xiàn)lncRNA CASC11能通過調(diào)控miR-340-5p/CDK1信號軸,進而誘導細胞周期阻滯,抑制胃癌細胞增殖[20]。因此,在本研究中,我們通過流式細胞學技術檢測細胞周期的分布情況。有趣的是,研究發(fā)現(xiàn)下調(diào)細胞內(nèi)LINC00662能誘導更多的神經(jīng)母細胞瘤細胞阻滯在G2/M期,進而發(fā)揮細胞增殖抑制效應。同時,侵襲轉移特性強是神經(jīng)母細胞瘤細胞的重要生物學特征。因此,在本研究中,我們利用Transwell實驗探索LINC00662對神經(jīng)母細胞瘤細胞侵襲轉移能力的影響,結果發(fā)現(xiàn)敲低細胞內(nèi)LINC00662的表達能顯著抑制細胞侵襲轉移能力。

        綜上所述,LINC00662在神經(jīng)母細胞瘤中呈高表達狀態(tài),下調(diào)其的表達能通過誘導細胞周期阻滯、抑制細胞增殖能力以及侵襲轉移能力,進而發(fā)揮抑癌作用。LINC00662有望成為神經(jīng)母細胞瘤治療的潛在預測指標及治療靶點,通過干擾其表達能最大程度的改善神經(jīng)母細胞瘤患兒的臨床預后。

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