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        不同方法檢測(cè)食源性致病菌的對(duì)比研究

        2021-11-11 11:46:16
        食品安全導(dǎo)刊 2021年23期
        關(guān)鍵詞:食源性致病菌靈敏度

        蘇 敏

        (太原市市場(chǎng)監(jiān)管綜合行政執(zhí)法隊(duì),山西太原 030031)

        隨著人們生活水平的不斷提升,人們對(duì)食品安全問(wèn)題的關(guān)注度也越來(lái)越高,食品安全問(wèn)題也是全球共同關(guān)注的公共衛(wèi)生問(wèn)題,其中食源性致病菌是最大的威脅,為此要采用高效的檢測(cè)手段來(lái)檢測(cè)食源性致病菌,才能保障食品安全。在食品安全事件當(dāng)中,最為常見(jiàn)的食源性致病菌有副溶血性弧菌、單核細(xì)胞增生李斯特菌、沙門(mén)菌、金黃色葡萄球菌等,當(dāng)前我國(guó)將細(xì)菌培養(yǎng)法運(yùn)用至食物病原菌的檢測(cè)當(dāng)中,但是由于操作步驟煩瑣、用時(shí)長(zhǎng)等,很難滿足當(dāng)前公共衛(wèi)生事件快速反應(yīng)的需求[1],為此,檢測(cè)方法必須符合特異性高、靈敏度高、快速等要求,而熒光PCR 法作為食源性致病菌的檢測(cè)方式,得到了廣泛的運(yùn)用?;诖?,為了選擇更加有效的食源性致病菌檢測(cè)方法,本文分別比較了細(xì)菌培養(yǎng)法以及熒光定量RCR 法的檢測(cè)效果。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        熒光定量PCR 儀(型號(hào):ABI7500),美國(guó)ABI 公司;檢測(cè)用試劑,均由青島海默技術(shù)有限公司提供;API 鑒定生化試條,法國(guó)梅里埃公司;熒光PCR 檢測(cè)試劑、樣本處理DNA 提取液,均由上海之江生物科技有限公司提供。

        1.2 樣本來(lái)源

        選取時(shí)間為2020 年6—12 月,選取250 份樣本,包括即食非發(fā)酵豆制品(50 份)、速凍熟制米面制品(50 份)、熟肉制品(50 份)、生禽肉(50 份)和生畜肉(50 份)。

        1.3 方法

        1.3.1 細(xì)菌培養(yǎng)

        對(duì)食品樣本中的副溶血性弧菌、金黃色葡萄球菌、單核細(xì)胞增生李斯特氏菌、沙門(mén)氏菌嚴(yán)格按照《全國(guó)臨床檢驗(yàn)操作規(guī)范(第3 版)》[2]中的操作流程,對(duì)細(xì)菌進(jìn)行分離操作、培養(yǎng)以及鑒定。

        1.3.2 熒光PCR 檢測(cè)

        (1)制備菌株基因組DNA。選擇每個(gè)標(biāo)準(zhǔn)的單個(gè)菌落,采用細(xì)菌基因組DNA 試劑盒,嚴(yán)格按照其說(shuō)明書(shū)的內(nèi)容提取每個(gè)菌種的基因組DNA 并保存(-20 ℃),將其作為陽(yáng)性對(duì)照。

        (2)樣本處理和DNA 提取。在無(wú)菌的環(huán)境下,選取食品樣本25.0 g,將其放入無(wú)菌培養(yǎng)基(225 mL)中,增菌24 h(37 ℃),提取增菌液的(50 mL)DNA,采用相應(yīng)的試劑盒進(jìn)行檢測(cè)。

        (3)PCR 擴(kuò)增。選擇食品樣本中的DNA 以及標(biāo)準(zhǔn)菌株的DNA 為模板,應(yīng)用特異性引物、探針實(shí)施PCR 擴(kuò)增。體系(25 μL)包括標(biāo)本DNA 提取物5 μL+混合酶0.5 μL(UNG酶+Taq 酶)+PCR 反應(yīng)液19.5 μL。UNG 處理時(shí)間為2 min(50 ℃反應(yīng)條件下);預(yù)變性95 ℃,時(shí)間為3 min;95 ℃,時(shí)間為5 s;55 ℃時(shí)間為60 s,共計(jì)40 個(gè)循環(huán)。

        1.4 陽(yáng)性判定結(jié)果

        實(shí)驗(yàn)有效,Ct ≤30,且存在明顯指數(shù)增長(zhǎng)期判定為陽(yáng)性;Ct 值>35 或者無(wú)Ct 值,則為陰性。當(dāng)Ct 值在30~35,應(yīng)即刻重復(fù)檢驗(yàn)。當(dāng)Ct 值在30~35,且存在較為明顯的指數(shù)長(zhǎng)期增長(zhǎng),判定為陽(yáng)性[3],反之為陰性。

        1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        采用SPSS22.0 展開(kāi)詳細(xì)分析,數(shù)量數(shù)據(jù)采用(%)體現(xiàn),χ2互比檢驗(yàn),如P值<0.05,則表示為具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果與討論

        2.1 檢測(cè)結(jié)果

        本次選取的實(shí)驗(yàn)室細(xì)菌培養(yǎng)物靈敏度是4.9×102CFU/mL,而選用的DNA 檢測(cè)靈敏度為0.1 pg,從樣本中采用細(xì)菌培養(yǎng)共檢出副溶血性弧菌、金黃色葡萄球菌、單核細(xì)胞增生李斯特菌、沙門(mén)氏菌等常見(jiàn)致病菌,分別為9 株、13 株、10 株、15 株,共計(jì)47 株,細(xì)菌培養(yǎng)總檢出率為18.80%。

        2.2 熒光定量PCR 檢測(cè)和細(xì)菌培養(yǎng)陽(yáng)性檢出率比較

        細(xì)菌培養(yǎng)法陽(yáng)性率(18.80%)與熒光定量陽(yáng)性率(20.0%)互比差異微小χ2=0.890,無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),詳細(xì)數(shù)據(jù)見(jiàn)表1。

        表1 熒光定量PCR 檢測(cè)和細(xì)菌培養(yǎng)法陽(yáng)性檢出率表

        2.3 討論

        食品安全已然是全世界的公共衛(wèi)生問(wèn)題,而因?yàn)槭称钒踩珕?wèn)題導(dǎo)致的食源性疾病已得到全社會(huì)的關(guān)注,據(jù)相關(guān)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)[4],每年因微生物所引發(fā)的食源性疾病占所有疾病的80%,在此嚴(yán)峻的背景之下,我國(guó)衛(wèi)生部早在2 000 年已經(jīng)建立了食源性疾病、污染物監(jiān)測(cè)網(wǎng),然而對(duì)食品樣品的食源性致病菌檢測(cè)主要還是沿用血清學(xué)、生化學(xué)、細(xì)菌培養(yǎng)等,檢測(cè)的周期較長(zhǎng),且具有較低的靈敏度,為此已然不適應(yīng)當(dāng)前突發(fā)事件的食品安全保障工作。伴隨著分子生物學(xué)檢測(cè)技術(shù)水平的不斷提升,PCR 得到了眾多研究者的認(rèn)可,其中熒光PCR 檢測(cè)所具有的特異性強(qiáng)、靈敏度高、快速有效的優(yōu)勢(shì)已經(jīng)被廣泛的應(yīng)用于各種病毒、致病菌的檢測(cè)當(dāng)中,為此熒光定量PCR 檢測(cè)已經(jīng)成為當(dāng)下微生物學(xué)檢測(cè)最有利的工具。

        細(xì)菌培養(yǎng)技術(shù)作為傳統(tǒng)檢驗(yàn)食源性致病菌的技術(shù),其檢測(cè)原理是通過(guò)對(duì)食品樣本內(nèi)的微生物進(jìn)行培養(yǎng),再劃線分離,實(shí)施選擇性培養(yǎng),觀察菌落的特征,最后鑒別致病菌的種類(lèi)[5]。由于生物技術(shù)的不斷發(fā)展,顯色培養(yǎng)基因其具有較強(qiáng)的特異性、極高的靈敏度,已經(jīng)被應(yīng)用于食源性致病菌的檢測(cè)當(dāng)中,有效地提升了檢測(cè)效率。借助微生物鑒定系統(tǒng)能夠有效減少檢測(cè)步驟、縮短檢測(cè)時(shí)間,也能保障檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性,而傳統(tǒng)細(xì)菌培養(yǎng)技術(shù)在實(shí)際應(yīng)用中操作流程煩瑣,檢測(cè)用時(shí)長(zhǎng),不能滿足當(dāng)前的檢測(cè)需求。

        PCR 檢測(cè)技術(shù)充分運(yùn)用了每類(lèi)生物所具有的核酸片段特異性,通過(guò)含有放射性同位素探針的補(bǔ)體核酸片段進(jìn)行檢測(cè)。PCR 檢測(cè)技術(shù)在檢測(cè)沙門(mén)氏菌中效果突出,檢測(cè)中操作步驟簡(jiǎn)單易行、檢測(cè)時(shí)間短,其結(jié)果準(zhǔn)確性高,不僅廣泛地應(yīng)用于食源性致病菌的檢測(cè)當(dāng)中,也被其他領(lǐng)域所運(yùn)用,為此逐漸延伸出電化學(xué)發(fā)光PCR 檢測(cè)技術(shù)、逆轉(zhuǎn)錄PCR 檢測(cè)技術(shù)、熒光定量PCR 檢測(cè)技術(shù)等,并且已經(jīng)成為了檢測(cè)食源性致病菌的標(biāo)準(zhǔn)。其中熒光定量PCR 檢測(cè)技術(shù)就是本次研究的方法之一。

        本次的研究發(fā)現(xiàn):①食源性致病菌的檢測(cè)是控制和預(yù)防食源性疾病最重要的一環(huán),雖然我國(guó)已經(jīng)制定了食物中毒病原檢測(cè)方法——細(xì)菌培養(yǎng),但是眾多缺點(diǎn)很難滿足公共衛(wèi)生事件快速反應(yīng)需求;②本次食源性致病菌樣本較多,為此細(xì)菌培養(yǎng)檢測(cè)從檢驗(yàn)、培養(yǎng)基制備、樣品增菌前處理、分離培養(yǎng)、生化試驗(yàn)到鑒定整個(gè)過(guò)程需要5~6 d 的時(shí)間,且檢測(cè)的結(jié)果非常容易受到多種因素的影響,例如檢驗(yàn)技術(shù)、生化鑒定技術(shù)、培養(yǎng)基質(zhì)量等,且手工分離培養(yǎng)鑒定過(guò)程中,檢出率在一定程度上存在誤差,因此細(xì)菌培養(yǎng)在食源性致病菌檢測(cè)當(dāng)中具有一定的局限性[6];③經(jīng)過(guò)眾多研究者的證明,實(shí)時(shí)熒光定量PCR 技術(shù)的重現(xiàn)性佳、準(zhǔn)確性高,已經(jīng)被廣泛地應(yīng)用至病原體、基因表達(dá)各個(gè)領(lǐng)域,其操作簡(jiǎn)單、快速、特異性、靈敏度的優(yōu)勢(shì)有效地提升了檢測(cè)工作效率,能夠?qū)崿F(xiàn)和滿足病原微生物快速高通量的檢測(cè)需求,但實(shí)際應(yīng)用中依然存在弊端。由于PCR 檢測(cè)為核酸,樣品中的細(xì)胞無(wú)論是死亡亦是存活,都能夠擴(kuò)增出核酸片段,為此可能會(huì)出現(xiàn)假陽(yáng)性的結(jié)果。由于整個(gè)檢驗(yàn)僅需9 h 左右,有效地提升了檢測(cè)效率,更為細(xì)菌分離培養(yǎng)提供了初步信息,同時(shí)提供了實(shí)驗(yàn)室在分離培養(yǎng)操作中的考慮方向,并縮短了分離培養(yǎng)煩瑣的過(guò)程。更為重要的是由于致病菌核酸試劑盒的條件一致,亦能將同一份樣本在同一臺(tái)儀器上進(jìn)行多種檢測(cè),故優(yōu)勢(shì)更為突出。

        總之,在檢測(cè)食源性致病菌當(dāng)中的技術(shù)眾多,每種技術(shù)均具有優(yōu)點(diǎn)和缺點(diǎn),在實(shí)際應(yīng)用中應(yīng)充分發(fā)揮其優(yōu)勢(shì),必要時(shí)聯(lián)合多種檢測(cè)手段,以此來(lái)提升食源性致病菌檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性,進(jìn)而保障食品安全[7]。

        3 結(jié)論

        通過(guò)本次研究結(jié)果顯示來(lái)看,細(xì)菌培養(yǎng)法陽(yáng)性率(18.80%)與熒光定量陽(yáng)性率(20.0%)互比差異微小χ2=0.890,無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義P>0.05,充分證明兩種檢測(cè)方法在食源性致病菌檢測(cè)當(dāng)中均具有一定應(yīng)用價(jià)值,但是熒光PCR 的優(yōu)勢(shì)時(shí)限、結(jié)果、效率遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于細(xì)菌培養(yǎng),更加適合應(yīng)用與食源性致病菌的檢測(cè)當(dāng)中。綜上所述,熒光PCR法應(yīng)用在食源性致病菌檢測(cè)當(dāng)中,可提升檢出率、縮短檢測(cè)用時(shí)、提高檢測(cè)效率,故值得借鑒和推廣。

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