亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        W和V模型解決脫去特定氨基酸的相關(guān)計算總結(jié)

        2021-11-04 03:20:22
        科學咨詢 2021年34期
        關(guān)鍵詞:肽鏈氧原子羧基

        張 瑞

        (北京市海淀區(qū)網(wǎng)易有道信息技術(shù)(北京)有限公司 北京 100193)

        在高中生物必修一中的蛋白質(zhì)的相關(guān)計算是學生的攔路虎。根據(jù)筆者的授課經(jīng)歷,部分學生不理解脫水縮合的原理和規(guī)律,覺得蛋白質(zhì)的相關(guān)計算太難就跟聽天書一樣。該類學生在遇到蛋白質(zhì)的相關(guān)計算就叫苦不迭,有時會出現(xiàn)隨意選或隨意填的現(xiàn)象,更甚至不愿意做就直接空白跳過。還有一部分學生能理解脫水縮合的原理和規(guī)律,也知道蛋白質(zhì)計算的相關(guān)公式,比如蛋白質(zhì)的相對分子量=氨基酸的數(shù)目*氨基酸的平均分子質(zhì)量-脫去水的相對分子質(zhì)量,也能利用相關(guān)方法解決一部分題目,比如一條肽鏈中至少有1個游離的氨基和羧基等。但在平時的月考期中期末考試中,蛋白質(zhì)的相關(guān)計算除了常規(guī)題目,還會經(jīng)常出現(xiàn)常規(guī)蛋白質(zhì)計算的變式題目,這些變式題目為了拉開學生的層次會提升一個難度,比如遇到脫去某種特殊氨基酸后,去計算消耗的水分子數(shù)目,或者增加的氨基或羧基數(shù)目,再或者增加的氧原子或者氫原子數(shù)目。那么,再利用常規(guī)的蛋白質(zhì)計算公式解決該類型題目的道路就行不通了。那些視蛋白質(zhì)的相關(guān)計算為大敵的學生直接跳過相關(guān)題目,他們就錯失該部分分數(shù)。筆者在授課過程中也發(fā)現(xiàn)能理解脫水縮合的原理和規(guī)律的學生經(jīng)常采用畫圖和數(shù)數(shù)的方式解決此類型題目,雖然最終有時也能算對,但是需要花費一定的時間,不能快速解題,但是部分時候也會出現(xiàn)錯數(shù)或者漏數(shù)導(dǎo)致不能得出正確結(jié)果,白白浪費時間。針對以上學生經(jīng)常出現(xiàn)的兩種情況,筆者根據(jù)此類題目反映出的規(guī)律總結(jié)出”W”和“V”模型,以期此模型不但可以幫助學生樹立能掌握蛋白質(zhì)的相關(guān)計算的信心,減輕學生的記憶負擔,同時可幫助快速方便解決脫去特定氨基酸計算原子或者基團的題目[2][3][4]。

        一、“W”和“V”模型

        所謂“W”和“V”模型,即為根據(jù)脫去的氨基酸的位置來確定模型的種類,進而根據(jù)模型種類來進行相關(guān)計算。

        1.W模型:脫去的氨基酸在肽鏈的中間位置,因為此氨基酸前后連接氨基酸,則脫去一個氨基酸即形成一個W。

        (1)脫去這個氨基酸之后,即形成一個W,那么就會斷裂2個肽鍵,需要消耗2分子的H2O,增加2個氨基和2個羧基,增加的氫原子或氧原子數(shù)目即為消耗水分子中的氫原子或氧原子數(shù)目。

        (2)總結(jié):對于總體而言,脫去中間位置的一個氨基酸=形成1個W=斷裂2個肽鍵=消耗2分子水=2個氨基和2個羧基=4個H原子和2個O原子。

        2.V模型:脫去的氨基酸在肽鏈的首位或者末尾,再或者只涉及肽鍵斷裂(不涉及氨基酸的脫去),因為前面連接氨基酸,即脫去一個氨基酸即形成一個V,或斷一個肽鍵形成一個V。

        (1)那么脫去這個氨基酸后或者斷裂該肽鍵,即形成一個V,那么就會斷裂1個肽鍵,需要消耗1分子的H2O,增加1個氨基或1個羧基,增加的氫原子或氧原子數(shù)目即為消耗水分子中的氫原子或氧原子數(shù)目。

        (2)總結(jié):對于總體而言而言,脫去首位或末尾位置一個氨基酸=1個V=斷裂1個肽鍵=消耗1分子水=1個氨基或個羧基(視脫去是氨基酸的氮端還是碳端來定)=2個H原子和1個O原子

        3.W和V模型同時出現(xiàn):相鄰位置的兩個氨基酸同時脫去。

        那么脫去這兩個氨基酸,相當于形成1個W和1個V,則可根據(jù)W模型和V模型進行相關(guān)計算。

        二、直接問原子數(shù)目、肽鍵、氨基或羧基數(shù)目變化等題目

        典型例題:

        1.某蛋白酶能專一性水解賴氨酸(C6H14N2O2)兩側(cè)的肽鍵,某四十九肽經(jīng)該蛋白酶作用后的情況如圖所示,圖中的短肽E加上短肽F的元素組成與四十九肽的元素組成相比,原子數(shù)相等的是( )。

        A.C B.H C.O D.N

        解析:首先觀察脫去氨基酸(23號)的位置:位于中間位置,即為一個W,則根據(jù)公式,脫去中間位置一個氨基酸=1個W=斷裂2個肽鍵=消耗2分子水,則整體增加4個氫原子,2個氧原子,現(xiàn)在脫去23號氨基酸后,比較新形成的短肽之和與四十九肽的元素,根據(jù)賴氨酸的分子式:C6H14N2O2,可知:C少6個,H少10個,N少2個,O保持不變,C選項正確。

        2.如圖表示是四十一肽中含有4個丙氨酸,現(xiàn)去掉其中的丙氨酸,得到4條長短不一的肽鏈,這些肽鏈中肽鍵總數(shù)為( )。

        A.33 B.34 C.32 D.31

        解析:首先觀察脫去氨基酸(6、17、27、41號)的位置:其中3個氨基酸(6、17、27號)位于中間位置,即為3個W則根據(jù)公式,對于整體而言,脫去中間位置一個氨基酸=1個W=斷裂2個肽鍵=消耗2分子水=2個氨基和2個羧基,1個氨基酸(41號)位于末尾,即為1個V,脫去首位或末尾位置一個氨基酸=1個V=斷裂1個肽鍵=消耗1分子水=1個氨基或個羧基,則斷裂的肽鍵數(shù)目=3*2+1=7個,其中四十一肽含有40個肽鍵,則這4條長短不一的肽鏈中的肽鍵數(shù)目=40-7=33個,則A正確。

        3.某五十肽中有2個丙氨酸,現(xiàn)脫掉其中的丙氨酸(相應(yīng)位置如圖)得到幾種不同有機產(chǎn)物,其中脫下的氨基酸均以游離態(tài)正常存在。以下關(guān)于這一過程產(chǎn)生的所有有機物中的原子、基團或肽鍵數(shù)量的陳述是錯誤的( )。

        A.肽鍵數(shù)目減少4個

        B.氧原子數(shù)目增加2個

        C.氨基和羧基分別增加4個

        D.氫原子數(shù)目增加8個

        解析:首先觀察脫去氨基酸(21、49號)的位置:2個氨基酸位于中間位置,即為2個W,則根據(jù)公式,對于整體而言,脫去中間位置一個氨基酸=1個W=斷裂2個肽鍵=消耗2分子水=2個氨基和2個羧基,則斷裂4個肽鍵,消耗4分子水,增加4個氨基和4個羧基,增加8個氫原子和4個氧原子,則ACD正確,B錯誤。

        三、結(jié)合蛋白質(zhì)的其他相關(guān)計算綜合考查

        例1:下圖表示含兩條肽鏈的某蛋白質(zhì),若將第70、165號氨基酸兩側(cè)的肽鍵斷開,則下列有關(guān)敘述,錯誤的是( )。

        A.斷開前有199個肽鍵

        B.斷開后氫原子數(shù)比原來多8個

        C.斷開后羧基數(shù)比原來多2個

        D.斷開后相對分子質(zhì)量增加72

        解析:首先利用常規(guī)計算公式:形成肽鍵數(shù)目=氨基酸數(shù)目-肽鏈數(shù),在70和165的氨基酸側(cè)鏈有1個肽鍵形成,那么肽鍵數(shù)目=200-2+1=199,A正確;再觀察脫去特定氨基酸(70和165)的位置,兩個氨基酸均位于中間位置,即為2個W,利用公式,脫去中間位置一個氨基酸=1個W=斷裂2個肽鍵=消耗2分子水=2個氨基和2個羧基,那么脫去70和165號氨基酸,則會需要4分子水,增加的相對分子量為4*18=72,斷開后氫原子的數(shù)量比之前多8個,氧原子比之前多4個,會形成多形成4個氨基和4個羧基,則BD對,C錯。

        例2:已知肽鏈由88個氨基酸縮合而成,包括6個游離氨基和5個甲硫氨酸(肽鏈中的位置是3、25、56、78、88),甲硫氨酸分子式為C5H11O2NS,以下敘述正確的是( )。

        A.如果多肽中的甲硫氨酸被除去,0原子的數(shù)量就會減少1個

        B.如果除去多肽中的甲硫氨酸,肽鍵的數(shù)量將減少10個

        C.由多肽合成的氨基酸的N原子總數(shù)為94個

        D.如果除去多肽中的甲硫氨酸,氨基和羧基分別增加5個

        解析:首先觀察脫去氨基酸(3、25、56、78、88號)的位置:其中4個氨基酸(3、25、56、78、88號)位于中間位置,1個氨基酸位于末尾位置(88號),即為4個W和1個V,則根據(jù)公式,對于整體而言,脫去中間位置一個氨基酸=1個W=斷裂2個肽鍵=消耗2分子水=2個氨基和2個羧基,脫去首位或末尾位置一個氨基酸=1個V=斷裂1個肽鍵=消耗1分子水=1個氨基或個羧基,則可知,斷裂的肽鍵數(shù)目=消耗的水分子數(shù)目=4*2+1=9,減少5個甲硫氨酸,少5*2個O,則總體少1個O,少5個氨基或羧基,則增加的氨基或羧基數(shù)目=4*2+1-5=4,也就是氨基有可能是4,羧基也有可能是4,則A正確,B錯誤,D錯誤;該肽鏈由88個氨基酸脫水縮合而成,游離的氨基有6個,則可以推斷R上的氨基為5個,則含有氨基的數(shù)目為88+5=93,則C錯誤。

        例3:下圖為某二十肽,其中含天門各氨酸4個,分別位于第5、6、15、20位;酶X專門作用于天門冬氨酸羧基端的肽鍵,肽酶Y專門作用于天門冬氨酸氨基端的肽鍵,下列相關(guān)敘述正確的是( )。

        A.該二十肽中含有20個肽鍵

        B.該二十肽至少含有4個游離的羧基

        C.經(jīng)肽酶Y完全作用后產(chǎn)生的多肽中氧原子數(shù)目比二十肽多4個

        D.由肽酶X的完全作用產(chǎn)生的多肽中氮原子的數(shù)量比二十肽少1個

        解析:該題涉及不同酶的作用位點不同,所以需要拆開單獨來看。酶X作用于天冬氨酸羧基端的肽鍵,則此酶會作用后形成的產(chǎn)物有:1-5,6,7-14,15-20,整體會斷3個肽鍵,產(chǎn)生3條多肽鏈,其中6號氨基酸會脫離出來,處于游離狀態(tài),相對于整體而言,經(jīng)肽酶X完全作用后產(chǎn)生的多肽中氮原子數(shù)目比二十肽少1個,則D正確;肽酶Y專門作用于天門冬氨酸氨基端的肽鍵,則此酶作用后形成的產(chǎn)物有:1-4,5,6-14,15-19,20,整體會形成1個W和2個V,則斷裂4個肽鍵,消耗4個水分子,總體增加4個氧原子,但是隨著5號和20號天冬氨酸的脫去,失去8個氧原子,則經(jīng)肽酶Y完全作用后產(chǎn)生的多肽中氧原子數(shù)目比二十肽少4個,C錯誤;選項A和B,可根據(jù)常規(guī)蛋白質(zhì)的相關(guān)計算公式,肽鍵數(shù)目=氨基酸數(shù)目-肽鏈數(shù)=20-1=19,游離的氨基或羧基=肽鏈數(shù)目+R上氨基/羧基=1+4=5,則AB錯誤。

        四、結(jié)束語

        部分學生不太理解脫水縮合的原理和規(guī)律,對W和V模型只是簡單的記憶,也能解決上面出現(xiàn)的兩種類型題目。但是如果想熟練運用W和V模型,最好建立在理解脫水縮合的原理和規(guī)律的基礎(chǔ)上。這樣更容易理解W和V模型,知道原理的來源和原因,知其所以然,并且自然而然地內(nèi)化到自己的知識體系和儲備中,運用到平時做題中,從而提高做題速率和節(jié)省做題時間。誠然,利用W和V模型解決不了蛋白質(zhì)相關(guān)計算的全部題目,這也是筆者需要進一步根據(jù)題目反映的規(guī)律再次總結(jié)蛋白質(zhì)其他相關(guān)計算的模型。題目在考試中都會千變?nèi)f化,但是萬變不離其宗,都有其知識點和題源,在平時學習中,深刻理解出題意圖,就可以快速運用方法和技巧解決題目,并且做到舉一反三,避免題海戰(zhàn)術(shù)。

        猜你喜歡
        肽鏈氧原子羧基
        臭氧層為何在大氣層上空
        你聽
        椰城(2021年12期)2021-12-10 06:08:52
        例談基因表達過程中多種肽鏈的合成
        中學生物學(2019年2期)2019-04-16 00:54:00
        NiTi(110)表面氧原子吸附的第一性原理研究?
        物理學報(2017年21期)2017-11-10 08:25:38
        氧原子輻射作用下PVDF/POSS納米復(fù)合材料的腐蝕損傷模擬
        腐蝕與防護(2016年7期)2016-09-14 09:30:56
        烷基鏈長及肽鏈電荷分布對脂肽雙親分子自組裝及水凝膠化的影響
        膠原蛋白Ⅳ在腫瘤領(lǐng)域的研究進展
        四羧基酞菁鋅鍵合MCM=41的合成及其對Li/SOCl2電池催化活性的影響
        “蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)和功能”難點掃描
        考試周刊(2014年46期)2014-08-15 20:58:06
        廢塑料熱解聚乙烯蠟的羧基化改性和表征
        亚洲av专区国产一区| 白浆出来无码视频在线| 欧美手机在线视频| 男生自撸视频在线观看| 国产后入内射在线观看| 国产一区二区三区日韩在线观看| 国产精品久久久爽爽爽麻豆色哟哟 | 日日麻批免费高清视频| 人成午夜免费视频无码| 亚洲精品国偷拍自产在线观看蜜臀 | 人妖国产视频一区二区| 日韩av无码精品一二三区| 风流少妇又紧又爽又丰满| 日本精品人妻在线观看| 亚洲av成熟国产一区二区| 国产美女精品一区二区三区| 精品2021露脸国产偷人在视频| 久久亚洲精品国产精品婷婷| 中文字幕一区二区网址| 国产一区二区三区日韩精品| 亚洲熟妇少妇任你躁在线观看无码| 亚洲一区中文字幕在线电影网 | 男女啪啪免费视频网址 | 亚洲va在线va天堂va手机| 国内精品熟女一区二区| 亚洲视频高清一区二区| 香港aa三级久久三级| 国产内射合集颜射| 加勒比东京热综合久久| 美女视频在线观看亚洲色图| 国产色在线 | 日韩| 中文在线√天堂| 国产三级国产精品国产专区| 青青草狠吊色在线视频| 国产精品久久久久影院嫩草| 久久国产乱子精品免费女| 免费在线国产不卡视频| 中文字幕久久熟女蜜桃| 精品国产高清一区二区广区| 久久亚洲综合亚洲综合| 国产精品久久久久高潮|