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        長鏈非編碼RNA和微小RNA相互作用參與調(diào)控肝細胞癌發(fā)生和發(fā)展的研究進展*

        2021-09-12 12:46:04鄭西特彭歆瑞
        關(guān)鍵詞:癌基因癌癥編碼

        鄭西特,彭歆瑞,何 曉

        (桂林醫(yī)學(xué)院,桂林 541100)

        相關(guān)統(tǒng)計報告顯示,原發(fā)性肝癌(primary liver cancer,PLC)的發(fā)病率位居世界第6,病死率居第4,全世界每年新增病例約84.1 萬,死亡病例約78.2萬,其發(fā)病率和病死率呈逐年上升趨勢[1-2]。PLC中75%~85%為肝細胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC),晚期HCC患者5年存活率不超過5%[3],這與早期發(fā)現(xiàn)診斷率不高、治療手段單一有關(guān)。近年來,隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展,大量非編碼RNA(non-coding RNA,ncRNAs)被發(fā)現(xiàn)在細胞的生命調(diào)控過程中扮演著十分重要的角色。ncRNAs包括長鏈非編碼RNA(lncRNAs)、微小RNA(microRNAs)和環(huán)狀RNA(circularRNAs),可以通過調(diào)控轉(zhuǎn)錄過程、轉(zhuǎn)錄后過程和翻譯后過程來控制特定的基因表達程序,涉及幾乎所有的生命活動過程,如增殖、衰老、靜止、分化、凋亡以及應(yīng)激和免疫反應(yīng)等[4]。隨著對HCC 研究的深入發(fā)展,大量研究結(jié)果顯示,lncRNAs、microRNAs 及兩者相互作用在HCC 的發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮著重要的作用。本文通過檢索近期有一定影響力的文章,綜合分析lncRNAs、microRNAs相互作用參與調(diào)控HCC發(fā)生發(fā)展的研究進展,為今后HCC臨床診斷和治療提供新思路。

        1 LncRNAs、microRNAs

        LncRNAs是一類長度在200個核苷酸以上的非編碼RNA,占全部ncRNA的80%~90%,數(shù)量龐大,為mRNA的3~100倍。LncRNAs是以RNA形式在多種層面上調(diào)控基因的表達,通常情況下其表達水平較低,可利用帽子結(jié)構(gòu)和多聚A 尾進行拼接,但缺乏開放讀框,所以lncRNA 本身并不具備翻譯蛋白質(zhì)的功能,而是在RNA水平上,參與基因組印記、染色質(zhì)修飾、基因表達、細胞周期、核內(nèi)運輸?shù)冗^程的調(diào)控[5]。LncRNAs 的作用機制多樣,能在調(diào)節(jié)機體各種生物學(xué)過程中扮演多種角色,如分子誘餌、分子向?qū)?、分子支架以及信號通路的調(diào)節(jié)劑等[6]。同時lncRNAs 也在多種癌癥表達異常,相關(guān)研究提示它的異常表達與miRNA、mRNA 的表達存在聯(lián)系,影響著多種癌癥的發(fā)生發(fā)展[7]。

        MiRNAs 作為一類長度約18~24 個核苷酸的微小非編碼RNA,也是一種表觀遺傳因子,由獨立的非編碼區(qū)RNAs或蛋白編碼基因的內(nèi)含子轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生,能參與調(diào)節(jié)許多重要的生物學(xué)過程以及基因的表達[8]。大量研究表明,miRNAs在多種人類癌癥的發(fā)生發(fā)展中扮演著雙重角色,既可以扮演促癌基因,又可以扮演抑癌基因,能夠參與調(diào)控腫瘤細胞的增殖、侵襲、遷移、血管生成、細胞周期進展、細胞凋亡和自噬等功能[9]。

        2 LncRNAs 和microRNAs相互作用參與調(diào)控HCC的發(fā)生發(fā)展

        LncRNAs、miRNAs 等非編碼RNAs 參與生理病理過程的作用機制不斷被研究,其中它們之間相互作用參與調(diào)控HCC 的發(fā)生發(fā)展的作用機制已逐漸成為研究熱點,最受關(guān)注的理論應(yīng)該是ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò),即競爭內(nèi)源性RNAs(competitive endogenous RNAs,ceRNAs)假說。該假說認為,lncRNAs可通過miRNA 反應(yīng)元件競爭性地與miRNA 結(jié)合,從而減少miRNAs 與mRNAs 的結(jié)合,以此來調(diào)節(jié)miRNAs 下游靶基因的表達水平,反之miRNAs 也可以通過相應(yīng)途徑調(diào)節(jié)lncRNAs 的表達水平[10]。LncRNAs 與miRNAs 相互之間的競爭內(nèi)源性,也稱為相互競爭的內(nèi)源海綿。很多研究通過研究lncRNAs 與miRNAs 的調(diào)控關(guān)系來揭示非編碼RNA的功能。

        2.1 抑制HCC的發(fā)生發(fā)展

        2.1.1 LncRNA MIR31HG 與miR-575 已發(fā)現(xiàn)lncRNA MIR31HG與幾種癌癥的進程有關(guān)聯(lián),在不同情況下可充當(dāng)致癌因子或抑癌因子[11]。在HCC 相關(guān)研究中,Yan 等[12]通過體內(nèi)、外實驗檢測lncRNA MIR31HG 對HCC 細胞增殖和轉(zhuǎn)移的影響,發(fā)現(xiàn)MIR31HG 的過表達可明顯抑制HCC 增殖和轉(zhuǎn)移;雙熒光素酶報告實驗和免疫沉淀實驗顯示,MIR31HG 通過MIR31HG/miR-575/ST7L 通路的作用發(fā)揮腫瘤抑制功能,說明MIR31HG和miR-575在HCC中可能存在相互抑制形成RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合體(RNA-induced silencing complex,RISC)。對MIR31HG/miR-575的共表達情況研究和應(yīng)用,也許能為肝癌的診斷和治療帶來益處。

        2.1.2 LncRNA CASC2與miR-24和miR-221

        Cancer Susceptibility Candidate 2(CASC2)是一種在多種癌癥類型中下調(diào)的lncRNA,包括膠質(zhì)瘤、乳腺癌及肝細胞癌等,可通過多種機制發(fā)揮抑制腫瘤的作用[13]。Jin 等[14]在HCC 的研究中發(fā)現(xiàn),lncRNA CASC2 能夠競爭性結(jié)合miR-24 和miR-221,通過CASC2/miR-24/caspase 3 和CASC2/miR-221/caspase 8 兩條通路降低HCC 細胞對腫瘤壞死因子(TNF)相關(guān)細胞凋亡誘導(dǎo)配體(TRAIL)的抵抗,以提高TRAIL 療法的治療效率。TRAIL 通過死亡受體和下游死亡誘導(dǎo)信號復(fù)合物的形成,選擇性誘導(dǎo)腫瘤細胞凋亡,激活caspases 3/8,導(dǎo)致細胞凋亡。TRAIL屬于TNF超家族成員之一,能選擇性誘導(dǎo)腫瘤細胞、轉(zhuǎn)化細胞凋亡,對人體正常組織無毒,在腫瘤治療方面具備良好的應(yīng)用前景[15]。然而,簡單直接使用TRAIL 療法很容易引起肝細胞癌細胞的耐藥性,限制了其作為治療手段的應(yīng)用。Jin等[14]研究結(jié)果有望為如何提高肝癌的治療效果、降低抗藥性帶來新的方法。

        2.1.3 LncRNA 01093 與miR-96-5p LINC01093為HCC 組織中顯著下調(diào)的lncRNA 之一,其表達下調(diào)與不良預(yù)后相關(guān)[15]。有學(xué)者使用基因表達分析交互分析(GEPIA)患者lncRNA和mRNA的表達,發(fā)現(xiàn)LINC0109主要作為miR-96-5p的ceRNA發(fā)揮作用,兩者在HCC 中呈負相關(guān)關(guān)系,并通過LINC01093/miR-96-5p/ZFAND5/NF-κB 途徑發(fā)揮腫瘤抑制功能[16-17]。ZFAND5是ZFAND家族的成員,研究表明,ZFAND5通過激活泛素—蛋白酶體系統(tǒng)來增強蛋白質(zhì)降解[18]。而NF-κB信號傳導(dǎo)是ZFAND5的一個重要的下游途徑,對腫瘤的增殖進行調(diào)控。lncRNAs通過調(diào)控microRNAs對HCC的發(fā)生、發(fā)展產(chǎn)生抑制作用,見表1。

        表1 lncRNAs和microRNAs相互競爭抑制HCC發(fā)生、發(fā)展

        2.2 促進HCC的惡性進展

        2.2.1 LncRNAHOXA-AS2與miR-520c-3p HOXA簇反義RNA 2(HOXA-AS2),是一種位于人HOXA3和HOXA4基因之間的反義lncRNA,多方報道顯示其在乳腺癌、胃癌、肝癌等癌癥中均存在差異表達情況,今后很可能成為癌癥的可行的生物標志物或治療的靶點[23]。Zhang 等[24]研究顯示,lncRNA HOXA-AS2 在HCC 組織和細胞中表達上調(diào),沉默HOXA-AS2 則會抑制HCC 細胞的增殖并導(dǎo)致細胞凋亡,過表達HOXA-AS2 則使肝癌細胞生長迅速,并促進肝癌細胞的遷移和侵襲,提示HOXA-AS2可能為HCC 的促進因子。進一步研究顯示,lncRNA HOXA-AS2 在HCC 的發(fā)展過程中與miRNA-520c-3p 競爭性結(jié)合,并通過HOXA-AS2/miR-520c-3p/GPC3 通路促進肝癌生長。如何有效調(diào)控lncHOXA-AS2/miRNA-520c-3p 的共表達以達到治療HCC的目的將是值得深入研究的課題。

        2.2.2 LncRNA DLX6-AS1與miR-513c和miR-424-5p 近期有研究提示,lncRNA DLX6-AS1很可能扮演促癌基因的作用,通過調(diào)控多條信號通路參與HCC 的發(fā)生發(fā)展。在Liu 等[25]研究發(fā)現(xiàn),LncRNA DLX6-AS1、Cul4A在HCC組織和細胞中呈高表達,而miR-513c 呈低表達。在HCC 細胞中沉默LncRNA DLX6-AS1 的表達后,miR-513c 呈高表達;LncRNADLX6-AS1 沉默后能夠降低HCC 細胞增殖、侵襲和遷移能力,并能促進HCC細胞凋亡。LncRNA DLX6-AS1/miR-513c/Cul4A連軸作用方式很可能參與調(diào)控HCC的惡性進展。

        與miR-513c相似,在惡性腫瘤中DLX6-AS1與miR-424-5p 亦呈負相關(guān)關(guān)系,很可能通過DLX6-AS1/miR-424-5p/WEE1 通路參與調(diào)控肝癌的惡性進展。有研究表明,上調(diào)DLX6AS1 通過靶向miR-424-5p 可增加WEE1 的表達,而WEE1 作為一種調(diào)節(jié)G2-M過渡的核激酶,可促進肝癌細胞增殖、侵襲和遷移[26]。此外,研究證明沉默DLX6-AS1 會降低CD133、CD13、OCT-4、SOX2 和Nanog 癌癥干細胞標志物的表達水平,這些標志物均與癌癥的腫瘤發(fā)生呈正相關(guān)關(guān)系[27]。

        2.2.3 LncRNA HULC 與miR-2052、miR-372、miR-29 LncRNA HULC 在癌癥發(fā)生過程中發(fā)揮著積極作用,HULC在HCC組織中的過表達可能與HCC患者的不良預(yù)后有關(guān);HULC可能通過HULC/miR-2052/MET 軸調(diào)節(jié)HCC 中miR-2052 的下游靶標受體絡(luò)氨酸激酶MET,以促進HCC細胞增殖、遷移和侵襲以及移植腫瘤的生長[28]。

        另有研究顯示,OSER1-AS1基因與肝癌細胞的增殖、侵襲和遷移及誘導(dǎo)細胞凋亡有關(guān),雙熒光素酶報告基因?qū)嶒炛苯幼C明了OSER1-AS1作為miR-372-3p 的分子海綿促進Rab23 的表達[29]。劉遠光等[30]研究發(fā)現(xiàn),HULC 在肝癌組織和肝癌細胞中呈高表達,RT-qPCR結(jié)果表明,在肝癌MHCc-97L細胞中,高表達HULC 使CXCR4 基因上調(diào),而過表達miR-372使CXCR4基因下調(diào);而在肝癌HepG2細胞中呈現(xiàn)相反的結(jié)果,提示HULC 和miR-372 的表達呈負相關(guān)關(guān)系。

        miR-29 很可能在HCC 的發(fā)生和發(fā)展中通過抑制腫瘤的生長和轉(zhuǎn)移而發(fā)揮抑癌基因的作用[31]。朱李茹等[32]在研究中也觀察到,與癌旁組織或正常干細胞比較,HULC 在HCC 組織和細胞中均呈高表達,而miR-29均呈低表達,兩者在HCC樣本中呈負相關(guān)關(guān)系。肝癌Huh7細胞過表達HULC后,用RTqPCR法檢測miR-29及其靶基因SETDB1 mRNA的表達,與空白對照組比較,轉(zhuǎn)染pcDNA/HULC 組Huh7 細胞中miR-29 的表達量明顯降低,SETDB1 mRNA 表達升高。Hep3B 細胞沉默HULC 的表達后,miR-29 的表達明顯升高,SETDB1 表達降低。上述研究提示,在HCC 細胞中HULC 可抑制miR-29的表達,兩者的表達呈負相關(guān)關(guān)系。

        由此可知,HULC 與上述3 種microRNAs 的表達在HCC 中均呈負相關(guān)關(guān)系。miR-2052 通過激酶作用于靶細胞促進HCC 進展。而miR-372、miR-29則通過靶基因發(fā)揮促癌作用。lncNAs通過作用microRNAs對HCC的發(fā)生、發(fā)展產(chǎn)生促進作用,見表2。

        表2 lncRNAs和microRNAs相互競爭促進HCC的惡性進展

        3 結(jié)語

        HCC 嚴重危害人類健康,ncRNAs 在其發(fā)生發(fā)展中通過調(diào)控基因表達而發(fā)揮重要的作用。近年來,許多研究發(fā)現(xiàn),無論是miRNAs、lncRNAs 的獨立作用還是相互作用,在信號傳導(dǎo)、細胞代謝、增殖、分化、凋亡等重要過程中扮演重要的角色,既可能起到促癌基因的作用又可能起到抑癌基因的作用。但現(xiàn)在對ncRNA在HCC發(fā)生發(fā)展的分子調(diào)控機制的研究成果十分有限,仍需要進一步的研究和探索。

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