姬妍茹,張正海,楊慶麗,滕春波,董 艷,石 杰,劉 玉,魏連會
(1 黑龍江省科學(xué)院大慶分院 黑龍江大慶 163319 2 東北林業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 哈爾濱 150040)
鮮菊芋(Jerusalem artichoke),又稱洋姜,屬菊科多年生草本植物,原產(chǎn)于北美溫帶地區(qū),現(xiàn)今在我國西北地區(qū)廣泛種植[1]。菊芋塊莖中富含菊粉,約占其干重的80%,由2~70 個果糖聚合而成,具有促進機體礦物質(zhì)吸收,降低膽固醇,調(diào)節(jié)免疫功能,對抗肥胖等生理功能[2-3]。作為一種具有益生元特性的膳食纖維,果聚糖的聚合度對菊粉的益生功能起決定性的作用,聚合度越小,活性越高[4]。一方面,低聚果糖通過刺激腸道雙歧桿菌等有益菌生長,有助于抑制腸道感染,維持腸道菌群健康[5]。另一方面,在結(jié)腸內(nèi),低聚果糖經(jīng)細菌發(fā)酵,產(chǎn)生的短鏈脂肪酸可以增加糞便含水量及膨脹能力,促進腸道蠕動,提高腸動力[6]。
鮮菊芋口感較差且不耐貯存,多用于腌制醬菜,而黑菊芋是以鮮菊芋為原料,在高溫、高濕條件下經(jīng)自然發(fā)酵制作的新型功能食品,擁有獨特的味道和口感,深受眾多品嘗者的歡迎[7-8]。研究發(fā)現(xiàn),菊芋經(jīng)熱加工后,總酚、酚酸、有機酸、脂肪酸和糖的種類和含量發(fā)生變化,其中尤以糖類的變化最為明顯[8-9],果聚糖聚合度顯著降低。研究發(fā)現(xiàn),膳食補充黑菊芋后,小鼠腸道α-葡萄糖苷酶活性得到提高[10],然而其對益生活性的影響尚需探討。
本研究以KM 小鼠為研究對象,基于16S rDNA 高通量測序技術(shù),分析黑菊芋對小鼠腸道菌群的影響并采用氣相色譜-質(zhì)譜技術(shù)檢測小鼠盲腸內(nèi)容物中短鏈脂肪酸含量,探究黑菊芋的益生活性,為進一步開發(fā)和利用黑菊芋提供新的數(shù)據(jù)支持。
鮮菊芋,“慶芋2 號”品種,由黑龍江省農(nóng)科院大慶分院提供;黑菊芋,以“慶芋2 號”為原料,采用變溫熟成技術(shù)制備,具體方法參考文獻[8]。
低聚果糖(FOS),山東保齡寶生物股份有限公司;糞便基因組提取試劑盒,德國凱杰(QIAGEN)公司;乙酸、丙酸、異丁酸、丁酸、異戊酸和正戊酸標準品,德國Dr.Ehrenstorfer 公司;其它試劑均為國產(chǎn)分析純級。
SPF 級雌性KM 小鼠,購于長春市億斯實驗動物技術(shù)有限責任公司【生產(chǎn)許可證:SCXK(吉)-2018-0007】,體質(zhì)量(20±2)g。小鼠飼養(yǎng)于東北林業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院動物實驗室,環(huán)境條件為溫度(25±2)℃、濕度(50±5)%、12 h 光照和12 h 黑夜的環(huán)境中,自由取食、進水。
黑菊芋熟成加工設(shè)備,黑龍江省科學(xué)院大慶分院自主研發(fā);P-100S 超聲清洗機,深圳市潔盟清洗設(shè)備有限公司;VFD-4500 型冷凍干燥機,北京博醫(yī)康實驗儀器有限公司;MiSeq 高通量測序系統(tǒng),美國Illumina 公司;CT15RT 型離心機,上海天美科技有限公司;ISQ 系列LT 單四極桿氣質(zhì)聯(lián)用儀,美國賽默飛世爾科技公司。
1.4.1 黑菊芋提取液的制備 黑菊芋[11]切片,稱取0.1 kg,加入0.5 L 蒸餾水浸泡16 h,勻漿后超聲30 min,過濾并凍干,蒸餾水調(diào)整至所需給藥濃度,4 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
1.4.2 小鼠腸道菌群試驗 隨機將50 只健康KM雌性小鼠分為5 組,即空白對照組(無菌生理鹽水,CK)、陽性對照組 (0.83 g/kg bw 低聚果糖,F(xiàn)OS)、黑菊芋低劑量組(0.05 g 黑菊芋,BL)、黑菊芋中劑量組(0.1 g 黑菊芋,BM)、黑菊芋高劑量組(0.2 g 黑菊芋,BH),灌胃劑量為0.2 mL/10 g bw,試驗期為15 d,分別于第1 天和第15 天稱量小鼠體質(zhì)量。第14 天,停止飼喂10 h,再給予相應(yīng)日糧,解剖小鼠后切取盲腸于無菌離心管中,置于液氮中保存,用于糞便菌群分析和短鏈脂肪酸(SCFA)含量的檢測[12]。
1.4.3 16 S rDNA 文庫構(gòu)建與高通量測序 根據(jù)糞便基因組提取試劑盒說明書提取小鼠糞便中微生物總DNA。采用末端連接測序接頭的細菌通用引物對V3~V4 區(qū)進行PCR 擴增和純化,構(gòu)建測序文庫。測序試驗由北京百邁客生物科技有限公司完成,并根據(jù)97%的序列相似度使用QIIME 工具包進行分類操作單元(Operational taxonomic units,OTUs)分類。
1.4.4 小鼠糞便短鏈脂肪酸含量的測定 取0.3 g 樣品加入2.0 mL 磷酸水溶液(V磷酸∶V水=1∶3),渦旋振蕩2 min,加入1.0 mL 乙醚萃取10 min,以4 000 r/min 在0 ℃條件下離心20 min。重復(fù)萃取1 次,合并上清液,濃縮至1.0 mL 以內(nèi),用0.22 μm 微孔膜過濾后進樣分析。氣相質(zhì)譜分析采用TG WAXMS(30 m×0.25 mm×0.25 μm)毛細管柱;色譜柱溫度設(shè)定程度:初始柱溫100 ℃,持續(xù)5 min,再以5 ℃/min 升至150 ℃,隨后以30 ℃/min的速率升至240 ℃,持續(xù)30 min;載氣:99.99%高純氦氣;載氣流量:1.0 mL/min;進樣口溫度:240℃;進樣方式:分流進樣;分流比:75∶1;進樣量:10 μL;電子轟擊離子源(EI)能量:70 eV;單離子掃描模式:定量離子60,73;離子源溫度:200 ℃;傳輸線溫度:250 ℃。
圖1 短鏈脂肪酸混合標準品氣相色譜-質(zhì)譜總離子流圖Fig.1 GC-MS total ion current chromatogram of mixed standard of short-chain fatty acid
1.4.5 統(tǒng)計學(xué)分析 試驗結(jié)果采用Graphpad Prism 7.0 軟件處理并繪制,One-way ANOVA 進行單因素方差分析,并進行Turkey 事后檢驗,P<0.05 時認為具有顯著性差異,P<0.01 時認為具有極顯著性差異。
表1 6 種短鏈脂肪酸標品的標準曲線Table 1 The standard curves of six short-chain fatty acid
如圖2所示,各組小鼠體質(zhì)量在15 d 后均有所增加,F(xiàn)OS 組體質(zhì)量增加最多 (5.630 g),CK 組最低(4.063 g),BL 組和BM 組與CK 組差異不顯著,但極顯著低于FOS 組(P<0.01);BH 組極顯著高于CK 組(P<0.01),但與FOS 組差異不顯著(P>0.05),表明黑菊芋對小鼠的正常生長無不良影響。
通過Illumina Miseq 測序統(tǒng)計數(shù)據(jù)處理各階段樣品序列數(shù)目,評估數(shù)據(jù)質(zhì)量。如圖2所示,經(jīng)質(zhì)控過濾后,優(yōu)化序列平均長度為420.33 bp,可覆蓋細菌16S rDNA V3~V4 區(qū)序列全長。
圖2 灌胃前、后各組小鼠體質(zhì)量差Fig.2 Changes in body weight of mice before and after intragastric administration
采用QIIME[12](Version 1.8.0)軟件,統(tǒng)計各樣本OUT 數(shù)量,分析腸道微生物組成。篩選除去原始OTU 聚類結(jié)果中極低豐度的OTU(豐度小于0.005%),共獲得335 個OUT,包括1 界、10 門、14綱、19 目、32 科、79 屬、80 種。
圖3 高質(zhì)量序列長度分布圖Fig.3 High quality distribution of sequence length
利用Mothur (Version v.1.30.)軟件對樣本α多樣性進行評估,并繪制稀釋性曲線(Rarefaction curve),香農(nóng)指數(shù)曲線(Shannon Index)和等級豐度曲線(Rank Abundance Curve)。如圖4所示,各組稀釋性曲線均趨于平緩,說明更多的測序數(shù)據(jù)量只可能產(chǎn)生少量的新物種;OUT 等級豐度曲線有足夠的寬度和平坦度,說明物種的組成豐富,均勻程度高;香農(nóng)指數(shù)曲線隨著測序深度的增加已經(jīng)基本達到飽和,可見當前測序深度足夠大,OUT可以反映樣本中絕大多數(shù)的微生物物種信息。
圖4 α 多樣性指數(shù)曲線Fig.4 Alpha diversity index curves
利用距離熱圖,對樣本間物種群落多樣性差異程度進行量化分析。如圖5所示,CK 組樣本與其它組樣本距離較遠,說明經(jīng)黑菊芋和FOS 干預(yù)后,確實改變了小鼠腸道微生物的群落結(jié)構(gòu)。
圖5 樣品間距離熱圖Fig.5 Heatmap of the distance between samples
圖6直觀呈現(xiàn)出各樣本中微生物在門和屬水平的相對豐度。門水平上,各組小鼠腸道菌群構(gòu)成主要包括厚壁菌門(Firmicutes)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、脫鐵桿菌門(Deferribacteres)、變形菌門(Proteobacteria)和髕骨細菌門(Patescibacteria)菌等,其中厚壁菌門和擬桿菌門占比超過80%,為優(yōu)勢菌群。與CK 組相比,BL 和BH 組菌群表現(xiàn)為厚壁菌門豐度下降,擬桿菌門豐度上升。有研究表明,肥胖與體內(nèi)厚壁菌門豐度升高和擬桿菌門豐度下降密切相關(guān)[13],擬桿菌門擁有更廣泛的多糖降解酶和碳水化合物代謝通路,因此適量食用黑菊芋可能會有助于控制小鼠體脂含量。
圖6 物種分布柱形圖Fig.6 Column diagram of species distribution
黑菊芋干預(yù)組的脫鐵桿菌門菌群豐度高于CK 組,Li 等[14]發(fā)現(xiàn)與正常小鼠相比,腸癌模型組小鼠的脫鐵桿菌豐度由1.9%降至0.9%,黨參治療后恢復(fù)到1.2%,這種趨勢提示黑菊芋可能通過提高脫鐵桿菌的豐度降低腸癌的發(fā)生。黑菊芋干預(yù)組和FOS 組的髕骨細菌門菌群數(shù)量均顯著低于CK 組,而且呈現(xiàn)隨灌胃劑量增加,菌群數(shù)量減少的趨勢。髕骨細菌門的細菌在缺氧環(huán)境中被發(fā)現(xiàn),目前在實驗室中尚未實現(xiàn)離體培養(yǎng),研究人員認為髕骨細菌門的細菌屬于新的超級類群,該類群包含小基因組菌總門,Parcubacteria 和纖細菌門[15],對髕骨細菌門細菌的基因組進行系統(tǒng)發(fā)育分析,發(fā)現(xiàn)其基因組通常小于1 Mb,代謝能力嚴重下降,無潛在的附著和黏附蛋白,缺乏生物合成能力和DNA 修復(fù)能力說明髕骨細菌門的細菌是其它生物體的外共生生物或寄生生物[16],迄今為止鮮有在小鼠體內(nèi)發(fā)現(xiàn)髕骨細菌門的細菌以及關(guān)于髕骨細菌門的細菌對小鼠腸道功能影響的相關(guān)報道。黑菊芋干預(yù)組的放線菌門菌群豐度呈現(xiàn)隨灌胃劑量增加而增加的趨勢,然而均低于CK 組,而FOS 組則高于CK 組。變形菌門中包含大腸桿菌、沙門氏菌、銅綠假單胞桿菌、胃幽門螺旋桿菌等多類致病菌,與CK 組相比,BM 和BH 組的變形菌門含量略有升高,具體原因有待進一步研究。
在屬水平上,以乳酸菌屬(Lactobacillus),擬桿菌科的未純培養(yǎng)菌f Muribaculaceae 屬、毛螺菌科的NK4A136 group 屬、黏液性細菌屬(Mucispirillum)等為腸道優(yōu)勢菌群。除BM 組外,各組的乳酸菌數(shù)量均少于CK 組,正常情況下,F(xiàn)OS 有促進乳酸菌增殖的作用,而本研究中結(jié)果剛好相反,具體原因尚不明確。Muribaculaceae 以往也被稱作S24-7,具有促進腸道代謝的功能,在相關(guān)研究中被發(fā)現(xiàn)以有益菌狀態(tài)存在[16-17]或與腸道黏膜免疫系統(tǒng)相關(guān)[18]。除BH 組外,黑菊芋干預(yù)組小鼠腸道中毛螺菌豐度明顯高于CK 組(P<0.05)。毛螺菌科的NK4A136 group 屬于厚壁菌門,是腸道有益菌,該門的普拉氏梭桿菌(F.prausnitzii)和人源羅氏菌(Roseburia hominis)等多數(shù)細菌可以通過產(chǎn)生抗炎性丁酸鹽,為腸黏膜提供營養(yǎng),維持腸黏膜免疫功能[19]。有研究表明黏液性細菌屬可拮抗沙門氏菌毒性,從而保護小鼠免受結(jié)腸炎感染[20]。本研究中除CK 組外,各組的黏液性細菌豐度均有大幅度下降,具體原因尚待探究。
短鏈脂肪酸(SCFA)被稱為“腸道菌群的功能性核心類群”,是連接膳食纖維和腸道菌群與腸道健康的關(guān)鍵代謝物,在腸道內(nèi)穩(wěn)態(tài)的建立和維持中起著關(guān)鍵作用。短鏈脂肪酸由腸道細菌發(fā)酵低聚果糖等膳食纖維產(chǎn)生,主要包括乙酸、丙酸、丁酸和戊酸等,SCFA 的含量變化間接反映出腸道微生物的活性情況[21]。
由表2可見,小鼠經(jīng)黑菊芋干預(yù)后,黑菊芋干預(yù)組的乙酸含量降低(與CK 組相比),這點與腸道菌群中乳酸菌含量降低相吻合;BM 和BH 組的丙酸含量顯著高于CK 組 (P<0.05 或P<0.01),然而與FOS 組差異不顯著,推測黑菊芋通過調(diào)節(jié)小鼠腸道菌群中擬桿菌含量,增加了丙酸鹽產(chǎn)生的潛力;黑菊芋干預(yù)組的正戊酸含量顯著高于CK組和FOS 組(P<0.05 或P<0.01);黑菊芋干預(yù)組的正丁酸含量顯著高于CK 組(P<0.01),其中BH 組的正丁酸含量還顯著高于FOS 組 (P<0.01);Van den Abbeele 等[22]發(fā)現(xiàn)菊粉能促進益生菌增殖,降解黏蛋白并產(chǎn)生丁酸和丙酸等有益的代謝產(chǎn)物,防止促炎因子侵入,進而提高腸道屏障功能,改善宿主腸道健康。
表2 小鼠盲腸內(nèi)容物短鏈脂肪酸含量Table 2 Contents of short chain fatty acids in mice cecum
KM 小鼠灌胃黑菊芋后,腸道菌群結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,其中0.05~0.1 g 黑菊芋在不影響乳酸菌豐度的前提下,可以顯著增加擬桿菌目未純培養(yǎng)細菌f Muribaculaceae 菌和毛螺菌科NK4A136 group菌的豐度,顯著降低黏液性細菌豐度;灌胃黑菊芋可以顯著增加小鼠腸道中丙酸,正丁酸和正戊酸的含量,對改善小鼠的腸道健康,增強抗炎能力有所幫助。本研究為揭示黑菊芋的保健功能提供了理論依據(jù)和基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。