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        病毒的“社交生活”

        2021-07-19 04:46:34宇辰
        大飛機(jī) 2021年4期
        關(guān)鍵詞:社交生活噬菌體宿主

        宇辰

        和人類(lèi)社會(huì)相似,病毒也不是孤獨(dú)生存的,它們之間既有合作也有競(jìng)爭(zhēng),互動(dòng)頻繁。當(dāng)人們的社交生活因?yàn)橐粓?chǎng)疫病的流行而大受影響,需要謹(jǐn)慎保持社交距離時(shí),在另一個(gè)微觀世界里,病毒們卻有著活躍的“社交生活”。

        這些新發(fā)現(xiàn)正在改寫(xiě)以往的“病毒規(guī)則手冊(cè)”,也發(fā)展出“社交病毒學(xué)”這一新興領(lǐng)域。了解病毒間繁忙的“社交互動(dòng)”,可以幫助人類(lèi)更好地戰(zhàn)勝它們。

        社交病毒學(xué)

        揭秘細(xì)胞中的“微觀社會(huì)”

        病毒是一種介于生物和非生物之間的生命體。目前,病毒學(xué)家發(fā)現(xiàn),這種獨(dú)特的生命形式有著不為人知的生存狀態(tài),它們有著豐富多樣的合作關(guān)系,也有“社交往來(lái)”——病毒并非總是獨(dú)來(lái)獨(dú)往,它們可以相互合作,也有相互競(jìng)爭(zhēng),在它們豐富的“社交活動(dòng)”中,可以是“利他主義者”,也可以是“揩油者”或“騙子”。

        科學(xué)家們的這些新發(fā)現(xiàn)正在改寫(xiě)“病毒規(guī)則手冊(cè)”,由此提出對(duì)付病毒性疾病傳播的新方法,對(duì)新冠病毒的研究也包括在內(nèi)。專(zhuān)家們認(rèn)為,理解病毒那些復(fù)雜的、有時(shí)甚至是奇怪的互動(dòng),可以幫助人們從中尋找到讓人類(lèi)社會(huì)生活恢復(fù)正常的關(guān)鍵線索。

        根據(jù)病毒感染的經(jīng)典理論,病毒之間沒(méi)有太多交互活動(dòng)的機(jī)會(huì):?jiǎn)蝹€(gè)病毒粒子或病毒體與某個(gè)目標(biāo)細(xì)胞相遇,然后突破進(jìn)入。一旦進(jìn)入,它就會(huì)像竊賊一樣打開(kāi)工具包,執(zhí)行可能致命的基因程序。

        這個(gè)病毒程序的目的只有一個(gè):建立一支病毒克隆大軍,將病毒傳播到下一個(gè)細(xì)胞,從而在宿主體內(nèi)擴(kuò)散開(kāi)來(lái)。為此,病毒“征用”了受害細(xì)胞的蛋白質(zhì)和基因組的生產(chǎn)設(shè)施,生產(chǎn)出數(shù)百萬(wàn)份含有病毒組成成分的拷貝。這些病毒基因組和蛋白質(zhì)又在一起組裝出病毒顆粒,一旦時(shí)機(jī)成熟,就會(huì)從宿主細(xì)胞中排出,殺死宿主細(xì)胞,開(kāi)始新一輪感染。

        這種觀點(diǎn)雖然沒(méi)有錯(cuò),卻將病毒活動(dòng)大大簡(jiǎn)化了。實(shí)際上,病毒攻擊很少會(huì)是單槍匹馬的行動(dòng)。“傳統(tǒng)理論認(rèn)為,病毒粒子是最小的感染單位,然而單個(gè)病毒體通常是無(wú)法成功感染的?!蔽靼嘌腊蛡愇鱽喆髮W(xué)的拉斐爾·桑胡安說(shuō)。

        研究發(fā)現(xiàn),病毒體通常都是組隊(duì)行動(dòng)的,它們甚至還會(huì)與其他類(lèi)型的病毒合作,大批量感染細(xì)胞,從而為病毒之間的交互提供大量機(jī)會(huì)。可惜的是,這種情況一直未得到充分重視。

        社交病毒學(xué)是一個(gè)新學(xué)科領(lǐng)域,該領(lǐng)域的微生物學(xué)家們認(rèn)為,他們可以用描述動(dòng)物、植物和細(xì)菌之間相互作用的理論來(lái)理解病毒的“社交互動(dòng)”。他們?cè)噲D用社會(huì)進(jìn)化理論來(lái)解釋這些相互作用,并將諸如合作與競(jìng)爭(zhēng)等復(fù)雜動(dòng)物的行為納入其理論的基礎(chǔ)。

        其中,特別棘手的一個(gè)問(wèn)題是利他主義,例如合作繁殖系統(tǒng),一些個(gè)體為幫助撫養(yǎng)其他個(gè)體的后代,卻放棄自身的繁殖機(jī)會(huì)。為什么要作出如此昂貴的犧牲?答案原來(lái)也是出于私利。個(gè)體作出的犧牲只為近親付出,這有助于將實(shí)際上屬于自己的基因引入下一代,這就是所謂的親緣選擇理論。

        復(fù)雜交互

        組隊(duì)感染和重復(fù)感染排除

        顯而易見(jiàn),在任何情況下,“單個(gè)病毒感染”都不需要太多“社交”技能,受感染的細(xì)胞最終會(huì)充滿(mǎn)病毒——由于它們都是原始入侵病毒的克隆體,因而出現(xiàn)復(fù)雜關(guān)系的機(jī)會(huì)微乎其微。然而,最近的一些發(fā)現(xiàn)改變了所有這些觀點(diǎn)。

        大約20年前,社會(huì)進(jìn)化理論擴(kuò)展到了細(xì)菌學(xué)領(lǐng)域,病毒學(xué)家們也更多意識(shí)到了這一點(diǎn)。之后的研究表明,病毒活動(dòng)顯然也不排除在這些規(guī)則之外。

        病毒學(xué)家發(fā)現(xiàn),病毒之間存在一些奇怪的行為,比如重復(fù)感染排除,即一旦某個(gè)細(xì)胞被感染,其他病毒通常會(huì)被阻止進(jìn)入。

        “這提出了一個(gè)重要問(wèn)題,‘重復(fù)感染排除是‘社交活動(dòng)的特性之一,因?yàn)椴《颈仨氝M(jìn)化出一種與周?chē)渌《究购獾姆绞?。”美?guó)加州大學(xué)戴維斯分校進(jìn)化病毒學(xué)家塞繆爾·迪亞茲·穆諾茲說(shuō)。

        病毒與其同類(lèi)的競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系并不僅僅局限于排斥,它們之間還有更復(fù)雜的互動(dòng)。例如,被某個(gè)病毒感染的宿主細(xì)胞,最終也會(huì)成為各種不同病毒基因組的聚集地。病毒有著非常高的變異率,一個(gè)宿主細(xì)胞內(nèi)可“窩藏”同一種病毒的數(shù)千種不同的變異體,這就為病毒進(jìn)化展開(kāi)的競(jìng)爭(zhēng)與合作創(chuàng)造了大量機(jī)會(huì)。

        另一個(gè)重要發(fā)現(xiàn)是,病毒通常會(huì)通過(guò)集體行動(dòng)來(lái)尋找新的宿主。它們會(huì)組隊(duì)成變化多樣的“感染團(tuán)隊(duì)”,形式可以是由相同病毒組成的簡(jiǎn)單團(tuán)隊(duì),也可以是由兩個(gè)或更多沒(méi)有親緣關(guān)系的大量病毒組成一團(tuán)團(tuán)泡泡樣的復(fù)雜病毒感染團(tuán)隊(duì)。病毒既可在感染團(tuán)隊(duì)內(nèi)互動(dòng),也可共同感染同一個(gè)細(xì)胞,為病毒的復(fù)雜互動(dòng)提供大量機(jī)會(huì)。這種共感染現(xiàn)象其實(shí)是非常普遍的。

        病毒合作

        “囚徒困境”與群體感應(yīng)

        社會(huì)病毒學(xué)的早期研究對(duì)象是噬菌體。噬菌體看起來(lái)像一個(gè)個(gè)微小的行星登陸艇,它們降落在細(xì)菌表面,將死亡細(xì)菌變成噬菌體生產(chǎn)工廠。

        噬菌體曾被視為完美的“獨(dú)行俠”殺手。但在1999年,桑胡安的同事們?cè)谟^察一種名為phi6的噬菌體時(shí),有了一個(gè)意外發(fā)現(xiàn):如果細(xì)菌同時(shí)感染了兩種稍有不同的噬菌體基因突變體,隨著時(shí)間的推移,這兩種噬菌體的感染成功幾率會(huì)越來(lái)越低。盡管確切原因尚不清楚,但研究人員認(rèn)為,這可以用一種稱(chēng)為“博弈論”的數(shù)學(xué)方法來(lái)解釋其相互作用,特別是一種被稱(chēng)為“囚徒困境”的經(jīng)典思維實(shí)驗(yàn)。

        病毒玩的游戲似乎也是這樣:一開(kāi)始它們會(huì)保持沉默,然后一方發(fā)現(xiàn)了搞小動(dòng)作的好處,另一方也會(huì)效仿——換句話說(shuō),它們也在進(jìn)行“社交互動(dòng)”或“反社交互動(dòng)”。

        另一項(xiàng)重要發(fā)現(xiàn)是,感染細(xì)菌菌落的噬菌體會(huì)從所在細(xì)胞中發(fā)出分子信息,用以傳達(dá)感染的整體水平。病毒數(shù)量多,分子信號(hào)也會(huì)增強(qiáng),噬菌體從而決定是立即出擊還是暫時(shí)潛伏。

        噬菌體的這種行為相當(dāng)于群體感應(yīng),這是在細(xì)菌中常見(jiàn)的一種合作策略。之后,科學(xué)家的研究重點(diǎn)從噬菌體轉(zhuǎn)向了感染哺乳動(dòng)物的病毒。

        2005年,美國(guó)加利福尼亞大學(xué)的馬可·維努茲對(duì)脊髓灰質(zhì)炎病毒進(jìn)行了基因工程修改,使其成為一種變異率極高的RNA病毒。這是最早發(fā)現(xiàn)病毒合作行為的一項(xiàng)研究。

        他精確復(fù)制了病毒的基因組,結(jié)果發(fā)現(xiàn)“改進(jìn)型”的病毒感染細(xì)胞更成功。這期間究竟發(fā)生了什么,科學(xué)家并不清楚,但維努茲認(rèn)為,變異脊髓灰質(zhì)炎病毒是通過(guò)合作取得成功的——當(dāng)大群病毒變異體的集體行動(dòng)更有利于它們的基因傳播時(shí),合作就發(fā)生了,這是一種進(jìn)化選擇。

        合作現(xiàn)象在許多種類(lèi)的病毒中都有發(fā)現(xiàn),包括流感病毒、麻疹病毒和乙肝病毒等。2016年,美國(guó)華盛頓大學(xué)一個(gè)團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),兩種基因變異的H3N2流感病毒共感染同一細(xì)胞時(shí)更易成功。例如,一種變異病毒更擅長(zhǎng)于攻入細(xì)胞內(nèi),另一種變異病毒則更容易在宿主體內(nèi)生存下去,這兩種病毒變異體單獨(dú)行動(dòng)成功率都不高,但如果合作,它們的感染能力就會(huì)成倍提高。

        更多研究揭示了病毒合作的其他方式。變異可能會(huì)產(chǎn)生稍有不同的病毒蛋白,其中一些變異病毒在某些條件下會(huì)更成功。不過(guò),不可能所有變異好處都出現(xiàn)在同一病毒身上,但這沒(méi)關(guān)系,病毒蛋白基因會(huì)在細(xì)胞內(nèi)整合,成為“公共資源”,這是來(lái)自社會(huì)進(jìn)化理論的另一個(gè)概念。通過(guò)利用這種整合后的資源,一種完全適應(yīng)了新環(huán)境的病毒很可能會(huì)聚集起來(lái),在宿主細(xì)胞中占據(jù)主導(dǎo)地位。

        利他行為

        病毒“社交”的最高境界

        研究人員甚至還觀察到病毒“社交互動(dòng)”的最高境界:利他行為。

        丙肝病毒會(huì)產(chǎn)生大量變異,其中一些會(huì)強(qiáng)勢(shì)吸引免疫系統(tǒng)的注意力,讓其他一些病毒可以乘機(jī)低調(diào)神秘地潛入。這些作為誘餌的病毒單獨(dú)是起不了什么作用的,但它們可以犧牲小我,獲取更大的團(tuán)體利益。

        去年,桑胡安的團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)了病毒利他主義的另一種表現(xiàn)形式。

        水皰性口炎病毒(VSV)是一種RNA病毒,其宿主通常是馬、?;蜇i,偶爾也會(huì)感染人類(lèi)。桑胡安團(tuán)隊(duì)通過(guò)觀察發(fā)現(xiàn),VSV可以通過(guò)產(chǎn)生一種抑制抗病毒干擾素的分子來(lái)壓制宿主的免疫系統(tǒng)。

        抗病毒干擾素是細(xì)胞為警告附近分子有病毒攻擊所釋放的一種物質(zhì)。對(duì)于病毒來(lái)說(shuō),介入這種化學(xué)戰(zhàn)需要付出昂貴的投資代價(jià),對(duì)其繁殖并感染宿主也會(huì)產(chǎn)生不利影響,但好處是,可以讓附近細(xì)胞對(duì)病毒易感,為將來(lái)成功感染宿主鋪平道路。

        研究團(tuán)隊(duì)隨后引入了一種不會(huì)抑制抗病毒干擾素的變異VSV,將其與那些會(huì)產(chǎn)生抵制抗病毒干擾素分子的VSV混在一起。如他們所想,這些變異病毒利用了那些沒(méi)有變異的VSV,并在主導(dǎo)權(quán)競(jìng)爭(zhēng)中占據(jù)了上風(fēng)。然而,欺騙行為最終會(huì)被發(fā)現(xiàn),就長(zhǎng)遠(yuǎn)利益而言,那些最初作出犧牲的病毒要比那些“占便宜者”更為成功。

        好占便宜

        病毒常上演“公地悲劇”

        或許很多人會(huì)覺(jué)得,會(huì)“聯(lián)合起來(lái)”的病毒太過(guò)可怕,可實(shí)際上,病毒頻繁的“社交活動(dòng)”也會(huì)同時(shí)形成“社交阻力”——將病毒們綁在一起的公共利益的存在,為欺騙和占便宜行為提供了機(jī)會(huì)。通常情況下,病毒會(huì)成為經(jīng)典的“公地悲劇”的犧牲品。這一經(jīng)濟(jì)學(xué)經(jīng)典理論指出,每個(gè)個(gè)體都會(huì)盡可能地想要去占據(jù)公共資源的好處,但最后每個(gè)個(gè)體都會(huì)成為爭(zhēng)斗中的失敗者。

        例如,在被兩種無(wú)關(guān)聯(lián)病毒共感染的某個(gè)細(xì)胞內(nèi),兩種不同病毒都為獲得復(fù)制基因組的酶展開(kāi)競(jìng)爭(zhēng),自然選擇的壓力傾向于眷顧自己不能產(chǎn)生酶卻利用其他個(gè)體產(chǎn)生的酶的“占便宜者”。不過(guò),最終結(jié)果往往是,由于沒(méi)有足夠分配的酶,導(dǎo)致感染過(guò)程中止。

        對(duì)于病毒來(lái)說(shuō),“占便宜”病毒的基因組是一個(gè)大問(wèn)題,特別是RNA病毒?!霸诓《臼澜缋?,欺騙行為非常普遍?!庇?guó)牛津大學(xué)社交病毒學(xué)家亞瑟·利克說(shuō)。

        RNA病毒在復(fù)制它們的基因組時(shí),通常非常粗枝大葉,從而產(chǎn)生了大量無(wú)用垃圾,其中有些是只完成了一半的半成品,或少了某些關(guān)鍵成分,或只是一些碎片片斷,它們被統(tǒng)稱(chēng)為缺陷干擾基因組(DIGs)。

        DIGs大量消耗酶這類(lèi)公共資源,卻不會(huì)作出任何貢獻(xiàn)。DIGs比完整基因組短,復(fù)制速度卻快得多,是完整基因組的80倍,這意味著它們消耗的資源要大大超過(guò)擁有完整基因組的病毒。于是,這導(dǎo)致病毒本身被寄生,感染自動(dòng)中止。

        這是病毒的一個(gè)普遍問(wèn)題,病毒學(xué)家想要利用這一點(diǎn)來(lái)開(kāi)發(fā)抗病毒的新方法?!叭绻覀兡軌蚶没蚬こ谭蛛x缺陷干擾基因組,也許可以成為應(yīng)對(duì)病毒感染的一種有效途徑。”迪亞茲·穆諾茲說(shuō)。

        病毒共感染

        打開(kāi)“潘多拉魔盒”

        那么,新冠病毒的“社交行為”有什么特別之處呢?目前,這種病毒“社交生活”的秘密還遠(yuǎn)未被揭開(kāi)。就人們目前所了解的,新冠病毒正在發(fā)生著重要的“社交互動(dòng)”,并有可能對(duì)未來(lái)病毒的流行趨勢(shì)、社會(huì)病毒學(xué)研究產(chǎn)生重要影響。

        作為一種RNA病毒,新冠病毒有很高的變異率。但幸運(yùn)的是,它會(huì)對(duì)基因組的新拷貝進(jìn)行驗(yàn)證,因此不會(huì)產(chǎn)生大量新類(lèi)型的變異病毒。不過(guò),它仍然會(huì)產(chǎn)生大量DIGs,這是因?yàn)橛脕?lái)復(fù)制其基因組的酶非?;祀s,它們頻繁地穿梭在各個(gè)不同的RNA模板之間,產(chǎn)生多種多樣不完整的基因組片斷。

        這些是否就是通過(guò)欺騙手段獲取公共資源的缺陷干擾基因組呢?目前尚不清楚。如果這一點(diǎn)可以確定,那么將為利用人工DIGs開(kāi)發(fā)新藥提供新的可能。

        另外還有一些跡象表明,新冠病毒會(huì)組成合作團(tuán)隊(duì),與許多病毒一起組隊(duì)感染人類(lèi)。這種共感染有確鑿的證據(jù)線索。

        人類(lèi)可以感染冠狀病毒和其他病毒,包括鼻病毒、流感病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒,以及其他四種冠狀病毒。迪亞茲·穆諾茲說(shuō),新冠病毒共感染對(duì)人體的影響目前還不清楚,但這或許也是為何不同個(gè)體對(duì)病毒反應(yīng)如此不同的原因。

        共感染確實(shí)打開(kāi)了“潘多拉魔盒”——為病毒基因組拷貝提供材料的酶,可將共感染某個(gè)細(xì)胞的不同冠狀病毒的基因組整合在一起。這聽(tīng)起來(lái)有些可怕,但事實(shí)上,一種雜交病毒的毒力可能比原先病毒要弱,但它們最終卻可能會(huì)在競(jìng)爭(zhēng)中勝出。

        “人們通常傾向于認(rèn)為,一種新的變異病毒的產(chǎn)生,將會(huì)是一場(chǎng)災(zāi)難?!钡蟻喥潯つ轮Z茲說(shuō),但實(shí)際上,它可能會(huì)導(dǎo)致疾病癥狀變得更為輕微,這在進(jìn)化上對(duì)病毒可能是有利的,因?yàn)檫@可以更利于它們的傳播。

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