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        土荊芥白粉病菌的分子檢測(cè)與鑒定①

        2021-06-25 00:52:04范會(huì)云陳衛(wèi)明黃意成曾慶錢
        熱帶農(nóng)業(yè)工程 2021年2期
        關(guān)鍵詞:白粉白粉病病原菌

        范會(huì)云 黃 勇 陳衛(wèi)明 黃意成 曾慶錢

        (廣東省中藥研究所 廣東廣州 510000)

        土荊芥(Chenopodium ambrosioidesL.)為藜科藜屬芳香性草本植物,原產(chǎn)于中美洲、南美和墨西哥南部,全草入藥。2003 年,土荊芥被列為中國(guó)首批外來(lái)入侵物種之一[1]。目前,僅韓國(guó)對(duì)土荊芥白粉病有相關(guān)報(bào)道,認(rèn)為引起韓國(guó)境內(nèi)土荊芥白粉病的病原菌為Erysiphe betae[2],中國(guó)尚未有相關(guān)報(bào)道。土荊芥被白粉菌侵染后,初期葉片出現(xiàn)白色粉狀斑點(diǎn),粉狀斑點(diǎn)不斷擴(kuò)大或相連成片,后期葉面布滿白色粉層,葉片變黃、變褐。

        在傳統(tǒng)的病原菌鑒定方法中,白粉菌主要以形態(tài)學(xué)為主要鑒定指標(biāo),但這種分類存在嚴(yán)重不足,如缺少無(wú)性世代的特征、許多子實(shí)體類型經(jīng)常難以獲得等[3-4]。近年來(lái),植物病原菌在r-DNA的內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)被廣泛的應(yīng)用于快速檢測(cè)和鑒定植物病原菌[5-6]。目前國(guó)內(nèi)尚未見(jiàn)土荊芥白粉病病原菌分子分類系統(tǒng)的相關(guān)研究報(bào)道,本文利用分子生物學(xué)技術(shù)對(duì)其分類特征及親緣關(guān)系進(jìn)行研究,以確定土荊芥白粉病菌的種類。

        1 材料與方法

        1.1 實(shí)驗(yàn)材料

        白粉菌樣本于2020 年5 月20 日采自廣東省博羅縣醪酥村農(nóng)場(chǎng),寄主植物為土荊芥,樣品編號(hào)為MT 799 966。提取白粉菌基因組DNA 所使用的的試劑盒購(gòu)自O(shè)MEGA bio-tek 公司(貨號(hào):D3390).

        1.2 實(shí)驗(yàn)方法

        1.2.1 白粉菌樣本的收集、基因組DNA 的提取和特異序列的擴(kuò)增

        用細(xì)毛刷輕輕地將葉片表面的菌絲與孢子混合物刷到培養(yǎng)皿中,轉(zhuǎn)入到2 mL 離心管中,按照試劑盒說(shuō)明書(shū)中的步驟提取土荊芥白粉病菌基因組DNA,并保存于-20 ℃?zhèn)溆?。PCR反應(yīng)的引物采用通用引物 ITS1 和 PM6[7-8],PCR 反應(yīng)所用的試劑是Green Taq Mix (Vazyme:P131-03)。PCR 產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),檢測(cè)合格的PCR 產(chǎn)物送至生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行序列測(cè)定與分析。

        1.2.2 ITS序列分析

        將測(cè)序所得ITS 序列在GenBank 數(shù)據(jù)庫(kù)中Blast 比對(duì)分析,從NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù)中下載25 種白粉菌ITS 保守序列(表1),利用軟件MEGA7將測(cè)序所得白粉菌序列與數(shù)據(jù)庫(kù)中ITS 序列比對(duì),并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),推演系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系。

        表1 用于同源性比較分析的白粉菌

        2 結(jié)果與分析

        2.1 基因組DNA提取與PCR擴(kuò)增結(jié)果

        利用通用引物ITS1 和PM6 進(jìn)行PCR 擴(kuò)增獲得的目的片段以及基因組DNA 進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),并送測(cè)序,測(cè)序獲得長(zhǎng)度為535 bp 的堿基序列。

        2.2 構(gòu)建土荊芥白粉病菌ITS 序列進(jìn)化樹(shù)的結(jié)果與分析

        根據(jù)比對(duì)結(jié)果,土荊芥白粉菌MT799966 的ITS 序列與KY399969.1 的ITS 序列最為接近,相似度達(dá)到99%以上。說(shuō)明樣品土荊芥白粉菌與KY399969.1 具有較近的親緣關(guān)系。此外,25 種白粉菌的ITS 序列在265~434 bp 保留著較高遺傳一致性,可能是這個(gè)片段起到了保障白粉菌性狀穩(wěn)定遺傳作用。

        對(duì)25 種不同的白粉菌ITS 序列用MEGA7 軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)并進(jìn)行分析(圖1)。結(jié)果表明,25 種白粉菌的ITS 序列形成2 個(gè)比較大的分支,本研究中的樣本MT799966 的ITS 序列與希臘的紅菾菜白粉菌(KY399969.1)和英國(guó)的甜菜白粉菌(DQ164440.1)的ITS 序列的距離最近,也就是說(shuō)本研究中的土荊芥白粉菌與它們的親緣關(guān)系較近,從分子水平上證明,發(fā)生在廣東醪酥村的土荊芥白粉病是由E.betae引起。

        圖1 25種白粉菌系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)

        3 討論

        在傳統(tǒng)的分類方法中,白粉菌的分類主要依據(jù)寄主植物的種類、危害癥狀以及病原菌的顯微特征進(jìn)行分類,不僅耗時(shí)耗力,而且還會(huì)受到研究人員的經(jīng)驗(yàn)和主觀因素的影響,得出錯(cuò)誤的結(jié)論[7]。

        以ITS序列作為一種遺傳分子標(biāo)記的PCR技術(shù)是診斷植物病害的快速、有效的方法。由于真菌ITS 序列具有種內(nèi)保守性強(qiáng)、種間存在變異的特點(diǎn),使得ITS已經(jīng)成為研究真菌系統(tǒng)發(fā)育和檢測(cè)的重要的手段[9]。馬原松等通過(guò)對(duì)河南省5 種植物(大葉黃楊、鳳仙、豇豆、菊芋和番茄)白粉菌的ITS 序列進(jìn)行分析,認(rèn)為ITS 序列可用來(lái)作為病原菌分類鑒定和系統(tǒng)發(fā)育等研究的依據(jù)。

        通過(guò)利用特異性引物ITS1/PM6 進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,獲得本地土荊芥白粉菌的ITS序列,將獲得的序列在NCBI 中進(jìn)行比對(duì),從中篩選相似度較高的白粉菌種類的ITS序列,建立系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù),發(fā)現(xiàn)引起土荊芥白粉菌的種類屬于Erysiphe屬,本研究結(jié)果將為該病原菌的檢測(cè)、分類與鑒定提供理論依據(jù),同時(shí),也可為防范土荊芥白粉菌的其他寄主植物白粉病的防控提供理論指導(dǎo)。

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