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        Cry1Ia蛋白N端信號(hào)肽對(duì)其蛋白表達(dá)量的影響

        2021-06-16 07:09:48郭俊佩韓阜志高建華史宗勇
        山西農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年6期
        關(guān)鍵詞:信號(hào)肽密碼子熱穩(wěn)定性

        郭俊佩,劉 璇,韓阜志,高建華,史宗勇

        (山西農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,山西太谷030801)

        Cry蛋白是應(yīng)用最廣泛的Bt殺蟲蛋白,對(duì)雙翅目、鞘翅目和膜翅目等害蟲具有特異、高效的毒殺作用[1],Cry蛋白的結(jié)構(gòu)和殺蟲機(jī)制已被廣泛研究[2]。Cry殺蟲蛋白主要以伴孢晶體的形式存在于蘇云金芽孢桿菌(Bacillus thuringiensis,Bt)細(xì)胞中[3],其N端含有3個(gè)與殺蟲相關(guān)的結(jié)構(gòu)域[4-7],為Cry蛋白的主要功能域,僅有這3個(gè)結(jié)構(gòu)域的Cry蛋白的分子質(zhì)量約為65 ku[8-9];另外,部分Cry蛋白C端還有一段長肽,主要幫助Cry蛋白形成晶體結(jié)構(gòu),這類蛋白的分子質(zhì)量大小約為135 ku。對(duì)于分子質(zhì)量約65 ku的Cry蛋白而言,形成伴孢晶體需要其他蛋白的幫助,如Cry2Aa蛋白需要在cry2Aa操縱子表達(dá)的Orf2蛋白(29.4 ku)幫助下才能形成伴孢晶體[10];cry11A操縱子中orf3基因編碼一個(gè)20 ku的蛋白質(zhì),可充當(dāng)分子伴侶,輔助Cry11A形成伴孢晶體[11]。

        Cry1I類蛋白結(jié)構(gòu)較為特殊,這類蛋白無C端長肽,在Bt細(xì)胞中表達(dá)后不形成伴孢晶體[12],由N端信號(hào)肽介導(dǎo)釋放到胞外[8,13]。原核細(xì)胞中,常見分泌信號(hào)肽一般分為3個(gè)部分,即N區(qū)、H區(qū)和C區(qū)[14-15]。其中,N區(qū)由帶正電荷氨基酸組成,可與脂質(zhì)雙層帶負(fù)電荷的磷酸基團(tuán)相互作用,進(jìn)而促進(jìn)蛋白質(zhì)的有效轉(zhuǎn)運(yùn);H區(qū)是中性氨基酸組成的疏水功能區(qū),決定信號(hào)肽的構(gòu)象及其對(duì)細(xì)胞膜的取向、信號(hào)肽的裂解以及影響蛋白加工和轉(zhuǎn)運(yùn)效率;C區(qū)由多個(gè)極性氨基酸組成且含有信號(hào)肽酶作用位點(diǎn),其酶切作用位點(diǎn)較保守,切割效率決定蛋白質(zhì)的分泌水平。

        Cry1類蛋白通常只對(duì)某一種昆蟲有特異殺蟲活性,而Cry1I分泌型蛋白對(duì)大多數(shù)鱗翅目和鞘翅目昆蟲均有殺蟲活性,作為廣譜殺蟲蛋白具有良好的應(yīng)用潛力[16]。如Cry1Ia蛋白能夠毒害鱗翅目和鞘翅目昆蟲[17],Cry1Ie蛋白對(duì)亞洲玉米螟[18]、小菜蛾[19]和棉鈴蟲[20]等具有較高的殺蟲活性。此外,KOSTICHKA等[12]、SCHNEPF等[21]分析認(rèn)為,Cry1Ia蛋白的N端信號(hào)肽Iasp中第1~10個(gè)氨基酸為N區(qū),第11~16個(gè)氨基酸為H區(qū),剩余29個(gè)氨基酸為C區(qū)。GAO等[22]將Iasp融合到綠色熒光蛋白eGFP的N端形成融合熒光蛋白IeGFP,其表達(dá)量顯著高于eGFP,繼而增強(qiáng)了宿主細(xì)胞的熒光強(qiáng)度,說明信號(hào)肽融合是基因表達(dá)量增強(qiáng)的原因之一,可見Iasp功能非常重要。

        為深入了解Iasp完整性對(duì)Cry1Ia自身表達(dá)量的影響,本研究將Iasp的N端分別截取5、10、13、16、24、32、44、73個(gè)氨基酸,構(gòu)建一系列Iasp缺失突變體,分析N端氨基酸不同程度缺失對(duì)Cry1Ia蛋白原核表達(dá)的影響,旨在為解析Iasp功能奠定一定理論基礎(chǔ)。

        1 材料和方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        供試菌株為大腸桿菌(Escherichia coli)TG1菌株及BL21 Star(DE3)感受態(tài)細(xì)胞。

        所用試劑為DNA標(biāo)準(zhǔn)分子量1 kb Plus DNA Ladder,購自中科瑞泰(北京)生物科技有限公司;AxyGEN質(zhì)粒小提試劑盒、DNA回收試劑盒、限制性內(nèi)切酶BamH Ⅰ/SacⅠ、蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)分子量PageRuler Prestained Protein Ladder,均購自賽默飛世爾科技(中國)有限公司。

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 表達(dá)載體的構(gòu)建 在含有50μg/mL氨芐青霉素的LB固體培養(yǎng)基上劃線接種Tp304-1Ia[23]菌株的菌液,37℃條件下培養(yǎng)10 h。將單克隆接種于LB液體培養(yǎng)基(含有50μg/mL的氨芐青霉素),37℃200 r/min培養(yǎng)10 h,提取質(zhì)粒DNA。

        表1 研究所使用的引物

        表2 研究所使用的質(zhì)粒

        采用SnapGene DNA軟件設(shè)計(jì)引物(表1)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR擴(kuò)增體系為Green mix 12.5μL,上下游引物各0.5μL,DNA模板0.5μL,加ddH2O至總反應(yīng)體積25μL。PCR擴(kuò)增程序?yàn)?4℃預(yù)變性5 min;94℃變性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸150 s,35次循環(huán);最后72℃延伸5 min。將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行TA克?。╬MD19),測(cè)序正確后,用BamHⅠ和SacⅠ限制性內(nèi)切酶進(jìn)行酶切,回收后接入pET28aDel線性化載體中,并轉(zhuǎn)化TG1感受態(tài)細(xì)胞。將轉(zhuǎn)化成功的單克隆提取質(zhì)粒進(jìn)行酶切鑒定,并將鑒定正確的表達(dá)載體分別命名為p28aD-Cry1IaD5、p28aD-Cry1IaD10、p28aD-Cry1IaD13、p28aD-Cry1IaD16、p28aDCry1IaD24和p28aD-Cry1IaD32(表2)。

        1.2.2 Cry1Ia蛋白的表達(dá)分析 將成功構(gòu)建的表達(dá)載體用熱激法分別轉(zhuǎn)入大腸桿菌BL21 Star(DE3)感受態(tài)細(xì)胞,37℃培養(yǎng)10 h。分別將9個(gè)菌株的單克隆接種于含有50μg/mL卡那霉素LB液體培養(yǎng)基,37℃培養(yǎng)10 h;按1∶1000轉(zhuǎn)接至含有50μg/mL卡那霉素的LB液體培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)至OD600值為0.8;加入異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(Isopropyl-beta-D-thiogalactopyranoside,IPTG),使終濃度為1.0mmol/L,16℃125 r/min誘導(dǎo)6 h。對(duì)表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行SDS-PAGE分析。采用Image Lab 6.0.1軟件對(duì)蛋白表達(dá)結(jié)果進(jìn)行相對(duì)定量。

        1.2.3cry1Ia基因的mRNA局部結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) 用RNA structure 6.1預(yù)測(cè)cry1Ia、cry1IaD5、cry1IaD10、cry1IaD13、cry1IaD16、cry1IaD24、cry1IaD32、cry1I-D44和cry1IaD73基因的起始密碼子附近(-4~+37 nt)核苷酸的二級(jí)結(jié)構(gòu)[25],選擇每個(gè)序列具有最低折疊能量的結(jié)構(gòu)進(jìn)行比較。利用SPSS 23.0對(duì)9種蛋白表達(dá)量和9種基因的起始密碼子附近核苷酸的二級(jí)結(jié)構(gòu)熱穩(wěn)定性進(jìn)行相關(guān)性分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 載體的構(gòu)建及鑒定

        研究共使用了Cry1Ia蛋白的8種N端缺失表達(dá)載體,其中,p28aD-Cry1IaD5、p28aD-Cry1IaD10、p28aD-Cry1IaD13、p28aD-Cry1IaD16、p28aD-Cry1-IaD24和p28aD-Cry1IaD32等6種表達(dá)載體是本研究構(gòu)建(圖1-A)。通過對(duì)8種N端缺失表達(dá)載體進(jìn)行雙酶切鑒定,結(jié)果顯示,目的片段的大小與預(yù)期一致,表明載體構(gòu)建成功(圖1-B)。

        2.2 N端信號(hào)肽缺失對(duì)Cry1Ia蛋白表達(dá)量的影響

        將酶切鑒定正確的表達(dá)載體轉(zhuǎn)化BL21 Star(DE3)感受態(tài)細(xì)胞原核表達(dá)發(fā)現(xiàn),Cry1Ia和8種突變體蛋白均能成功表達(dá),目的蛋白大小與預(yù)期一致(圖2、表2)。用Image Lab軟件對(duì)圖2中的目的條帶進(jìn)行相對(duì)定量,將Cry1Ia作為對(duì)照(表達(dá)量記為1),結(jié)果發(fā)現(xiàn)(表3),Cry1IaD32和Cry1IaD44的表達(dá)量最高,分別約為對(duì)照Cry1Ia的1.43倍和1.12倍;Cry1IaD13和Cry1IaD16的表達(dá)量與對(duì)照Cry1Ia持平,分別為對(duì)照Cry1Ia的1.04倍和1.07倍;而Cry1IaD5、Cry1IaD10、Cry1IaD24和Cry1IaD73的表達(dá)量均低于對(duì)照Cry1Ia。說明Cry1Ia的N端信號(hào)肽缺失不同程度影響其蛋白表達(dá),但與對(duì)照間差異不顯著。

        表3 蛋白表達(dá)相對(duì)定量

        2.3 cry1Ia基因的mRNA分析

        利用RNA structure 6.1預(yù)測(cè)了cry1Ia和8種5′端堿基缺失基因的二級(jí)結(jié)構(gòu),結(jié)果如圖3所示,cry1IaD24與cry1Ia起始密碼子(-4~+37)附近的核苷酸區(qū)域預(yù)測(cè)二級(jí)結(jié)構(gòu)相似,均僅包含一個(gè)莖環(huán)結(jié)構(gòu),且雙股螺旋內(nèi)部僅含有一個(gè)GC配對(duì),該結(jié)構(gòu)導(dǎo)致二者熱穩(wěn)定性接近,ΔG分別為-0.7 kcal/mol和-0.6 kcal/mol;cry1IaD13基因的mRNA也包含一個(gè)莖環(huán)結(jié)構(gòu),但雙股螺旋中存在2個(gè)GC配對(duì),從而增加了該結(jié)構(gòu)的熱穩(wěn)定性(ΔG=-4.0 kcal/mol);其他幾個(gè)突變體基因的二級(jí)結(jié)構(gòu)均包含多個(gè)莖環(huán)結(jié)構(gòu),其中,cry1IaD5和cry1IaD73莖環(huán)結(jié)構(gòu)最多,且GC含量相對(duì)較高,熱穩(wěn)定性也最高。

        進(jìn)一步對(duì)Cry1Ia蛋白表達(dá)量和對(duì)應(yīng)基因的起始密碼子附近核苷酸的二級(jí)結(jié)構(gòu)熱穩(wěn)定性進(jìn)行了相關(guān)性分析,結(jié)果顯示,2個(gè)變量間相關(guān)系數(shù)為0.377,在95%水平下不顯著,所以,2個(gè)變量間無顯著相關(guān)關(guān)系。

        3 結(jié)論與討論

        前期研究表明,Cry1Ia蛋白的N端信號(hào)肽Iasp跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)eGFP蛋白的性能較弱,但是具有作為融合標(biāo)簽的潛力,可改善多種蛋白,比如eGFP、MMP13和GDF8在大腸桿菌BL21 Star(DE3)中的表達(dá)[22]。本試驗(yàn)為了研究Iasp不同區(qū)域?qū)ry1Ia蛋白表達(dá)的影響,分析了8種Iasp的缺失突變體,結(jié)果顯示,Cry1Ia蛋白和8種缺失突變體在大腸桿菌中均獲得了較好的表達(dá),且表達(dá)產(chǎn)物的大小與預(yù)期一致,該結(jié)果與前人研究結(jié)果一致[22,26]。

        本研究用Image Lab軟件對(duì)目的條帶進(jìn)行相對(duì)定量,結(jié)果發(fā)現(xiàn),Cry1IaD32和Cry1IaD44的表達(dá)量高于Cry1Ia,Cry1IaD13和Cry1IaD16的表達(dá)量同Cry1Ia基本持平,其余4種蛋白的表達(dá)量低于Cry1Ia。但整體而言,Cry1Ia和8種突變體蛋白表達(dá)水平差異不大。該結(jié)果表明,Cry1Ia蛋白N端氨基酸序列不同程度缺失對(duì)Cry1Ia蛋白表達(dá)無顯著影響。有研究發(fā)現(xiàn),在原核細(xì)胞中蛋白表達(dá)量受多種因素影響,其中,SD序列與起始密碼子AUG之間的序列及其長度會(huì)影響肽鏈的翻譯效率[27],二者之間的堿基組成和排列順序通過影響雙股螺旋的結(jié)構(gòu)參數(shù)而改變起始密碼子AUG在核糖體中相對(duì)角度,進(jìn)而影響翻譯效率[28]。值得注意的是,起始密碼子附近的核酸序列二級(jí)結(jié)構(gòu)的熱穩(wěn)定也是關(guān)鍵因素之一[22,29-30]。前人研究發(fā)現(xiàn),熱穩(wěn)定性較低的基因蛋白表達(dá)水平較高,比如,KUDLA等[29]研究發(fā)現(xiàn),在不同GFP編碼序列的5′端添加一段二級(jí)結(jié)構(gòu)熱穩(wěn)定性低的前導(dǎo)序列,獲得的融合基因高水平表達(dá);GAO等[22]研究發(fā)現(xiàn),iegfp起始密碼子附近核苷酸二級(jí)結(jié)構(gòu)的熱力學(xué)穩(wěn)定性低于egfp,而IeGFP蛋白表達(dá)量卻高于eGFP。本研究結(jié)果表明,熱穩(wěn)定性從弱到 強(qiáng) 依 次 為Cry1Ia、Cry1IaD24、Cry1IaD32、Cry1IaD10、Cry1IaD44、Cry1IaD13、Cry1IaD16、Cry1IaD73、Cry1IaD5;蛋白表達(dá)量從高到低依次為Cry1IaD32、Cry1IaD44、Cry1IaD16、Cry1IaD13、Cry1Ia、Cry1IaD24、Cry1IaD73、Cry1IaD5、Cry1IaD10;關(guān)聯(lián)性分析發(fā)現(xiàn),二者無顯著相關(guān)性。這與前人研究結(jié)果不一致[22,29],可能是由于Cry1Ia信號(hào)肽對(duì)自身蛋白與其他融合蛋白的影響有所差異,也有可能是由于重復(fù)次數(shù)有限且缺少轉(zhuǎn)錄水平和翻譯水平的精確定量。因此,本研究中表達(dá)量與mRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)熱穩(wěn)定性的關(guān)系還需進(jìn)一步研究。

        本研究構(gòu)建了一系列Cry1Ia蛋白N端信號(hào)肽缺失突變體,首次研究了不同程度信號(hào)肽缺失對(duì)其自身蛋白表達(dá)的影響,結(jié)果發(fā)現(xiàn),Iasp不同程度缺失影響其蛋白表達(dá),但表達(dá)水平差異不大。以上研究結(jié)果為進(jìn)一步探究Iasp的功能奠定了一定理論基礎(chǔ)。

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