史曉霞
摘要:PCR技術(shù)主要工作是分析食品樣品中微生物的指令基因,從而辨別食品樣品當(dāng)中微生物的種類及數(shù)量,以達(dá)到食品檢驗(yàn)工作的目的。本文主要分析實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)的技術(shù)原理及其在食品檢測(cè)中的具體應(yīng)用,僅供參考。
關(guān)鍵詞:實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù);食品檢測(cè);應(yīng)用
一、實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)
1.傳統(tǒng)PCR技術(shù)
微生物檢測(cè)中的PCR技術(shù)就是聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),又稱為無(wú)細(xì)胞分子克隆技術(shù)。在微生物檢測(cè)中應(yīng)用PCR技術(shù)檢測(cè)食品安全,首先要搜集微生物中的細(xì)菌細(xì)胞,將細(xì)胞中的DNA進(jìn)行分解,然后根據(jù)微生物中所持有的特點(diǎn)設(shè)計(jì)所需的引物,最后運(yùn)用電泳法技術(shù)檢測(cè)細(xì)菌中DNA的排列順序。在微生物檢測(cè)中運(yùn)用PCR技術(shù)檢測(cè)細(xì)菌具有靈敏度高及特異性強(qiáng)等優(yōu)勢(shì),可以快速檢測(cè)出食品中含有的細(xì)菌種類及狀態(tài)。
2.實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)原理
實(shí)時(shí)熒光定量技術(shù)基礎(chǔ)在于:實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)與傳統(tǒng)PCR技術(shù)相比,基本原理相同,主要區(qū)別是其定量體系。將熒光染料或熒光基團(tuán)加入到PCR反應(yīng)體系中,使之具有特定波長(zhǎng)。利用熒光信號(hào),可對(duì)整個(gè)聚合酶反應(yīng)過(guò)程進(jìn)行實(shí)時(shí)自動(dòng)檢測(cè)和監(jiān)測(cè)。測(cè)量到的信號(hào)將被用來(lái)作為聚合酶鏈反應(yīng)周期熒光閾值的坐標(biāo)。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR的定量方法中主要包括:(1)絕對(duì)的定量措施,通過(guò)構(gòu)建合理的基因序列標(biāo)準(zhǔn),并對(duì)其進(jìn)行一系列的定量檢測(cè)工作,將標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行合理的稀釋工作之后,可以獲得多個(gè)不同稀釋之后的Ct數(shù)值。(2)相對(duì)定量:其主要是檢測(cè)人員不需要做一些額外的標(biāo)準(zhǔn)曲線,其具有簡(jiǎn)便、省時(shí)等優(yōu)勢(shì)。
檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物時(shí),若應(yīng)用常規(guī)PCR技術(shù)只能檢測(cè)終點(diǎn),實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)是將熒光基團(tuán)融入到PCR反應(yīng)系統(tǒng)中,對(duì)熒光信號(hào)強(qiáng)度進(jìn)行觀測(cè)從而觀察實(shí)驗(yàn)全過(guò)程,其中指數(shù)增長(zhǎng)階段數(shù)據(jù)分析最為適用,并且樣品DNA含量與Ct值(循環(huán)數(shù))二者間的關(guān)系為線性,因此,樣品的定量分析可在完成標(biāo)準(zhǔn)曲線制定后開(kāi)展。實(shí)時(shí)熒光定量PCR可分為SYBRGreenreal-timePCR和Taq[1]Manreal-timePCR。SYBRGreenreal-timePCR熒光染料可以實(shí)現(xiàn)以特異性方式插入DNA雙鏈中,并將熒光信號(hào)輸出,SYBR熒光染料未插入DNA雙鏈中則分子不會(huì)出現(xiàn)熒光,對(duì)于熒光信號(hào)觀察過(guò)程中通過(guò)熒光信號(hào)的強(qiáng)弱程度來(lái)確定PCR產(chǎn)物含量。DNA擴(kuò)增后,該技術(shù)可以通過(guò)溶解曲線對(duì)單堿基突變進(jìn)行檢驗(yàn)。TaqManreal-timePCR熒光強(qiáng)度改變是通過(guò)熒光標(biāo)記探針的熒光基團(tuán)解離來(lái)實(shí)現(xiàn)的。在探針完整的情況下,猝滅基團(tuán)可以將報(bào)告基團(tuán)的熒光信號(hào)吸收;而擴(kuò)增過(guò)程中,探針被酶切,2個(gè)基團(tuán)分離,故產(chǎn)生熒光信號(hào)并被接收,最終通過(guò)熒光信號(hào)的強(qiáng)弱來(lái)觀測(cè)產(chǎn)物的形成。這樣的方式主要特點(diǎn)是模板與探針融合和水解使特異性更強(qiáng),而且不需要進(jìn)行電泳,簡(jiǎn)化了流程,可實(shí)現(xiàn)單個(gè)反應(yīng)將多種肉類同時(shí)進(jìn)行鑒定的目的。
二、實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)在食品檢測(cè)中的應(yīng)用
1、動(dòng)物源性檢測(cè)
以TaqManreal-timePCR為基礎(chǔ),根據(jù)牦牛細(xì)胞色素B基因設(shè)計(jì)特異性引物和探針,并與其他動(dòng)物物種的DNA進(jìn)行擴(kuò)增,結(jié)果表明,擴(kuò)增曲線僅牦牛能夠形成,并且與其他物種DNA之間不存在交叉反應(yīng),靈敏度可達(dá)到0.001%,對(duì)牛肉的摻假檢測(cè)具有重要意義。李亮等[45]則利用牛線粒體和16SrDNA內(nèi)參基因進(jìn)行相應(yīng)的試驗(yàn),并通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算出樣品中牛的DNA水平和總DNA水平,以此計(jì)算出回收率(平均回收率為98.62%)。由于線粒體DNA在不同組織中拷貝數(shù)不同,而細(xì)胞核DNA具有高度保守性和一致性,且在同一物種的不同細(xì)胞中拷貝數(shù)基本一致。所以目標(biāo)基因的設(shè)立除了線粒體,還可以是核基因。此外,利用單拷貝核基因設(shè)計(jì)引物和探針并運(yùn)用熒光定量PCR的方法進(jìn)行了羊肉的摻假檢測(cè),由于在之前的研究中發(fā)現(xiàn),若僅應(yīng)用標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行定量會(huì)存在一定的誤差,因此,該試驗(yàn)中引入了1個(gè)常數(shù)(修正因子)將摻假肉中的DNA濃度轉(zhuǎn)化為目標(biāo)肉類所占的比例,以此提高肉類摻假檢測(cè)的準(zhǔn)確性。
2、食源性致病菌檢測(cè)
沙門(mén)氏菌是食物中最重要的食源性病原菌之一。數(shù)據(jù)顯示,沙門(mén)氏菌在我國(guó)及世界各地的食物中毒病原菌中占很大比例,對(duì)人類和動(dòng)物造成極大傷害,導(dǎo)致食物中毒、傷害、腸胃炎等諸多疾病。通過(guò)對(duì)inva基因設(shè)計(jì)引物,用熒光染料法建立沙門(mén)氏菌RTQ-PCR檢測(cè)方法,結(jié)果顯示沙門(mén)氏菌檢測(cè)下線達(dá)到101cfu/ml,靈敏度高,可以快速、準(zhǔn)確地檢測(cè)肉制品中的沙門(mén)氏菌,操作簡(jiǎn)單,耗時(shí)短。采用實(shí)時(shí)熒光定量pcr方法對(duì)生豬肉、生雞肉、生菜沙拉和羊乳制品中沙門(mén)氏菌的檢測(cè)進(jìn)行了比較。結(jié)果表明,該方法快速、有效、檢測(cè)范圍廣,符合國(guó)際標(biāo)準(zhǔn),具有實(shí)用價(jià)值。
3、轉(zhuǎn)基因食品檢測(cè)
隨著大量轉(zhuǎn)基因食品進(jìn)入市場(chǎng),轉(zhuǎn)基因食品的標(biāo)簽和安全性問(wèn)題越來(lái)越受到人們的關(guān)注。傳統(tǒng)的檢測(cè)方法存在著靈敏度低、操作繁瑣、誤報(bào)率高等缺點(diǎn)。建立準(zhǔn)確、快速、靈敏的鑒別方法已成為當(dāng)今研究的熱點(diǎn)。實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)作為一種新技術(shù),在分子水平上檢測(cè)轉(zhuǎn)基因成分具有較高的準(zhǔn)確性,因此廣泛應(yīng)用于轉(zhuǎn)基因成分的定性、品種鑒定和含量檢測(cè)。利用轉(zhuǎn)基因小麥外源片段和染色體邊界序列設(shè)計(jì)引物,建立了實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)轉(zhuǎn)基因小麥b73-6-1、b72-8-11b和b102-1-2品系,同時(shí)以轉(zhuǎn)基因玉米、大豆、水稻和非轉(zhuǎn)基因小麥為對(duì)照,結(jié)果表面該方法特異性好,靈敏度可達(dá)0.01%(m/m),為檢測(cè)具有同樣外源基因的不同轉(zhuǎn)基因小麥品系提供了一種更高效的方法,具有很大的應(yīng)用價(jià)值。
結(jié)語(yǔ)
本文主要從傳統(tǒng)PCR技術(shù)入手,重點(diǎn)分析了實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)的應(yīng)用原理,及其在食品檢測(cè)中的具體應(yīng)用,包括在動(dòng)物源性檢測(cè)、轉(zhuǎn)基因食品檢測(cè)以及食源性致病菌檢測(cè)中的應(yīng)用,研究表明,實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)在食品檢測(cè)中的應(yīng)用優(yōu)勢(shì)較為明顯,且滿足當(dāng)代食品安全發(fā)展需要。
參考文獻(xiàn)
[1]高鑫,朱武洋,盧學(xué)新.實(shí)時(shí)熒光定量PCR在病毒檢測(cè)中的應(yīng)用[J].中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào),2018,34(07):660-667.