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        中國2017—2018年耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌藥物敏感性及耐藥基因分析

        2021-05-17 12:39:16青,李耘,鄭
        中國感染控制雜志 2021年5期
        關(guān)鍵詞:耐藥

        王 青,李 耘,鄭 波

        (北京大學(xué)第一醫(yī)院臨床藥理研究所,北京 100034 )

        肺炎克雷伯菌是常見的機會致病菌之一,主要感染免疫力低下且患有嚴重基礎(chǔ)疾病的患者,導(dǎo)致肺炎、敗血癥、化膿性肝膿腫等嚴重感染[1]。長期以來碳青霉烯類藥物是治療產(chǎn)超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(extended-spectrum beta-lactamases ,ESBLs)肺炎克雷伯菌相關(guān)感染的有效抗生素。然而,碳青霉烯類藥物的頻繁使用,導(dǎo)致肺炎克雷伯菌對此類藥物的耐藥率升高[2]。在我國,耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistantKlebsiellapneumoniae, CRKP)檢出率從2005年的3.00%增加到2017年的20.90%[3],給臨床治療帶來挑戰(zhàn)。本研究挑選出我國2017—2018年細菌耐藥監(jiān)測研究(CARST)中CRKP菌株,并對其進行藥物敏感性分析和耐藥基因檢測,旨在為針對CRKP感染的抗菌藥物選擇提供數(shù)據(jù)支持。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 菌株來源 北京大學(xué)臨床藥理研究所2017—2018年CARST中收集的CRKP,篩選條件:亞胺培南、美羅培南、厄他培南任一不敏感的非重復(fù)性臨床分離株。

        1.2 方法

        1.2.1 藥敏試驗 除多粘菌素E外,其他藥物采用標準瓊脂二倍稀釋法。瓊脂二倍稀釋法試驗細菌懸液采用多點接種儀接種,每一點接種量為1×104CFU;多粘菌素E采用微量肉湯二倍稀釋法,細菌最終濃度為5×105CFU/mL。多黏菌素 E、磷霉素氨丁三醇使用歐盟藥敏試驗標準委員會(EUCAST) 推薦折點,替加環(huán)素使用美國食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)推薦折點,其他藥敏結(jié)果根據(jù)美國臨床實驗室標準化協(xié)會(CLSI,2019)標準,判定敏感性和耐藥性,其中頭孢哌酮/舒巴坦參照頭孢哌酮的標準判讀。大腸埃希菌ATCC 25922和大腸埃希菌ATCC 35218被用作藥敏試驗的質(zhì)量控制標準菌株。

        1.2.2 耐藥基因檢測 將細菌接種于中國蘭瓊脂平板上,37℃溫箱孵育16~20 h。次日挑取單個菌落三區(qū)劃線于中國蘭平板分純,37℃溫箱孵育16~20 h,分離得到單個純種菌落。第三日采用煮沸法提取DNA模板。使用聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction, PCR)檢測編碼碳青霉烯酶(blaKPC、blaNDM、blaIMP、blaVIM、blaOXA)和其他廣譜、超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(blaTEM、blaSHV、blaCTX-M)基因,引物序列設(shè)計以及擴增條件參照文獻[4-8],具體見表1,每批PCR試驗均帶有陰性和陽性對照。反應(yīng)停止后,取3 μL于1%瓊脂糖凝膠電泳(含1/10 000 GelRed染料)。陽性產(chǎn)物送北京諾賽基因公司測序,將測序結(jié)果提交到BLAST(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/)進行比對序列以確定耐藥基因亞型。

        1.3 統(tǒng)計學(xué)方法 應(yīng)用SPSS 20.0軟件進行分析,藥敏結(jié)果采用χ2檢驗進行比較,P<0.01為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        表1 CRKP耐藥基因引物序列及退火溫度

        表2 CRKP在臨床標本及科室中分布構(gòu)成比

        表3 CRKP對抗菌藥物的耐藥率和敏感率(%)

        2.2 基因檢測結(jié)果 129株CRKP,共112株檢測出碳青霉烯酶基因,涉及5種基因型,blaKPC-2、blaNDM-1、blaNDM-5、blaOXA51、blaIMP-4基因檢出率分別為77.52%、6.20%、2.33%、2.33%、0.78%,其中3株同時含blaKPC-2和blaNDM基因。blaTEM檢出率為51.94%,均為blaTEM-1;blaSHV檢出率為64.34%,主要為blaSHV-11(18.60%)和blaSHV-12(27.91%),此外還有7株(5.43%)含blaSHV-1,3株(2.33%)含blaSHV-28;blaCTX-M檢出率為53.49%,分別為blaCTX-M-9(43.41%)和blaCTX-M-15(10.08%),其中4株(3.10%)同時含blaCTX-M-9和blaCTX-M-15基因。80.36%的菌株攜帶ESBLs基因,32.14%的菌株同時攜帶2種或以上ESBLs基因。見表4。

        2.3blaKPC-2、blaNDM基因陽性菌株與不產(chǎn)碳青霉烯酶菌株的藥物敏感性 不產(chǎn)碳青霉烯酶菌株對β-內(nèi)酰胺類藥物中碳青霉烯類、β-內(nèi)酰胺類復(fù)合劑及部分第三代頭孢菌素敏感率高于產(chǎn)酶菌(P<0.01)。在產(chǎn)碳青霉烯酶的CRKP中,相對blaKPC-2基因陽性菌,亞胺培南、美羅培南和氨曲南對blaNDM基因陽性菌株具有更好抗菌作用,MIC50和/或MIC90值低于blaKPC-2基因陽性菌。對于非β-內(nèi)酰胺類藥物,blaKPC-2基因陽性菌對磷霉素氨丁三醇均表現(xiàn)出較低敏感率(P<0.01);不產(chǎn)碳青霉烯酶菌株對多粘菌素E敏感率低于產(chǎn)酶菌(P<0.01)。見表5。

        表4 129株CRKP耐藥基因檢出情況

        表5 blaKPC-2和blaNDM基因陽性菌株與不產(chǎn)碳青霉烯酶菌株的藥敏結(jié)果

        續(xù)表5 (Table 5, Continued)

        3 討論

        ESBLs是由質(zhì)粒介導(dǎo)的超廣譜β-內(nèi)酰胺酶,能夠使細菌對青霉素類、第一至第四代頭孢菌素類和氨曲南耐藥;ESBLs最流行的是SHV和CTX-M兩種類型[16]。本研究碳青霉烯酶基因陽性菌株中,80.36%(90/112)同時攜帶ESBLs基因,主要是blaSHV-12和blaCTX-M-9基因,32.14%(36/112)同時攜帶2種或以上ESBLs基因,與CRKP耐藥基因以KPC-2型為主,同時攜帶ESBLs基因的報道[17-18]相似。

        綜上論述,我國臨床CRKP分離株耐藥問題嚴重且攜帶多種耐藥基因,CRKP攜帶的主要碳青霉烯酶基因是blaKPC-2,最常見的ESBLs基因是blaSHV-12和blaCTX-M-9基因,需要加強CRKP中碳青霉烯酶的監(jiān)測。本文特色是試驗菌株來自全國不同地區(qū),并且同時檢測了碳青霉烯酶基因與ESBLs基因,藥敏試驗涵蓋較全的臨床治療藥物,但不足之處是耐藥菌株未進行同源性檢測,可在后續(xù)CRKP遺傳背景中深入地研究。

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