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        人類白細(xì)胞抗原-DPA1基因多態(tài)性與無(wú)胚胎妊娠的相關(guān)性

        2021-02-25 02:46:30王振東盧曉琳姚秀英劉鑫麗趙琳琳王理牛勃
        關(guān)鍵詞:等位基因分型多態(tài)性

        王振東,盧曉琳,姚秀英,劉鑫麗,趙琳琳,王理,牛勃,4

        1.山西醫(yī)科大學(xué)生化教研室,山西 太原 030001;2.首都兒科研究所分子免疫室,北京 100020;3.陸軍總醫(yī)院263臨床部婦產(chǎn)科,北京 100024;4.首都兒科研究所轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究室,北京 100020

        無(wú)胚胎妊娠也稱為枯萎卵妊娠,是指胚胎從未發(fā)育或再吸收,最終導(dǎo)致流產(chǎn)。無(wú)胚胎妊娠通常發(fā)生在懷孕婦女流產(chǎn)前12周,是妊娠早期較常見的流產(chǎn),占自然妊娠的50%[1-3]。有研究表明,無(wú)胚胎妊娠可能與感染、免疫、染色體異常、內(nèi)分泌等多種因素相關(guān)[4]。

        胎兒一半的遺傳物質(zhì)源于父本,因此可能會(huì)引起母體免疫系統(tǒng)的排斥反應(yīng),有研究證實(shí),胚胎著床是母體胎兒復(fù)雜的免疫耐受過程,免疫系統(tǒng)調(diào)節(jié)在該過程中發(fā)揮重要作用[5]。婦女在育齡期發(fā)生自然流產(chǎn)大多數(shù)存在免疫異常現(xiàn)象,其中約80%的復(fù)發(fā)性自然流產(chǎn)(recurrent spontaneous abortion,RSA)與自身免疫因素相關(guān)[6-7]。

        人類白細(xì)胞抗原(human leucocyte antigen,HLA)也稱為主要組織相容性復(fù)合體(major histocompatibility complex,MHC),負(fù)責(zé)免疫系統(tǒng)中的抗原表達(dá),分為Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ類[8]。HLAⅠ類分子是NK細(xì)胞受體的配體,具有阻斷NK細(xì)胞活性的能力,起到保護(hù)胎兒的作用。胎盤滋養(yǎng)層細(xì)胞表達(dá)3種HLAⅠ類分子(HLA-C、HLA-G、HLA-E),有研究證實(shí),HLAⅠ類基因的缺失或突變可能導(dǎo)致流產(chǎn)[8]。AGRAWAL等[9]研究發(fā)現(xiàn),HLA-G基因多態(tài)性增加了RSA的風(fēng)險(xiǎn)。HLAⅡ類分子是一種固定在細(xì)胞膜上的異質(zhì)二聚體,由1條α鏈(DPA1)和1條β鏈(DPB1)構(gòu)成,結(jié)合細(xì)胞外源性抗原肽后,可被CD4+T細(xì)胞識(shí)別,胎盤滋養(yǎng)層HLAⅡ類抗原的抑制是妊娠成功的一個(gè)重要機(jī)制。研究已經(jīng)證實(shí),HLAⅡ類分子在胎盤滋養(yǎng)層細(xì)胞中的過表達(dá)可能誘發(fā)流產(chǎn),但其具體機(jī)制尚未明確[10]。HLAⅡ類分子包括HLA-DP、DQ、DR、DN、DO和DM 共6個(gè)亞型,有研究發(fā)現(xiàn),復(fù)發(fā)RSA患者體內(nèi)存在大量HLA-DQ或HLA-DR的表達(dá)[11-12]。目前對(duì)HLA-DP與流產(chǎn)相關(guān)性的研究較少,因此本研究采用高通量DNA分析技術(shù),檢測(cè)無(wú)胚胎妊娠婦女外周血中HLA-DPA1基因的14個(gè)單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP),并分析HLA-DPA1的遺傳多態(tài)性與無(wú)胚胎妊娠的相關(guān)性。

        1 材料與方法

        1.1 樣本 選擇2016年5月~2018年9月間由中國(guó)人民解放軍總院263醫(yī)院經(jīng)產(chǎn)前B超檢查確診為無(wú)胚胎妊娠的110名患者作為研究對(duì)象,同時(shí)招募150名因非醫(yī)療原因流產(chǎn)患者作為對(duì)照。所有參與者均為漢族,無(wú)家族病史、特殊疾病及其他藥物作用和輻射效應(yīng),且均已提交知情同意書。本研究方案經(jīng)當(dāng)?shù)貍惱砦瘑T會(huì)和首都兒科研究所IRB審核通過。經(jīng)患者靜脈采集外周血,于-30℃保存。同時(shí)記錄研究對(duì)象的年齡及孕周。

        1.2 主要試劑及儀器 血液和細(xì)胞培養(yǎng)DNA提取試劑盒購(gòu)自德國(guó)Qiagen公司;NANODROP 1000分光光度計(jì)購(gòu)自美國(guó)Thermo公司;帶有基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)的質(zhì)量陣列高通量DNA分析儀購(gòu)自美國(guó)Angena公司。

        1.3 DNA的提取 采用血液和細(xì)胞培養(yǎng)DNA提取試劑盒從血液樣本中提取基因組DNA,通過NANODROP 1000分光光度計(jì)測(cè)定260和280 nm波長(zhǎng)下的吸光度值,檢測(cè)DNA的濃度和純度。

        1.4 SNP的選擇及基因分型 從1000 Genomes數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選出啟動(dòng)子和HLA-DPA1基因全長(zhǎng)區(qū)域的標(biāo)記SNP,分別從NCBI SNP數(shù)據(jù)庫(kù)和NCBI pubmed數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得外顯子SNP和熱點(diǎn)SNP,利用Haploview 4.2軟件分析上述SNP的連鎖相關(guān)性。

        在 AgenaCx網(wǎng)站(https://agenacx.com/)設(shè)計(jì)漢族人群中等位基因頻率>0.10且與其他SNP有強(qiáng)連鎖不平衡的SNP(n=19)引物,設(shè)定r2<0.8,引物序列見表1,引物由生工生物工程(北京)股份有限公司合成。以提取的樣本基因組為模板,PCR擴(kuò)增SNP區(qū)域,PCR產(chǎn)物通過質(zhì)量陣列高通量DNA分析儀進(jìn)行分析,同時(shí)以純水作為陰性對(duì)照,并對(duì)60%的樣本進(jìn)行再分型,對(duì)基因分型頻率≥90%的HLA-DPA1基因的SNP進(jìn)行基因型/等位基因頻率的分析。其他群體中SNP基因型/等位基因的頻率從1000 Genomes數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得,并驗(yàn)證與對(duì)照組樣本的相關(guān)性。

        表1 SNP擴(kuò)增的引物序列Tab 1.Primer sequences for SNP regions

        1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 應(yīng)用SPSS 17.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行分析,所有統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)均為雙側(cè),哈溫平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)的比較采用卡方檢驗(yàn);以O(shè)R值的 95%置信區(qū)間(confidence interval,CI)為標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行多元線性回歸,判斷與HLA-DPA1多態(tài)性相關(guān)的無(wú)胚胎妊娠風(fēng)險(xiǎn);病例組和對(duì)照組孕周的比較采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)。均以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。在5%顯著性水平下,基于110例病例和150例對(duì)照的最小樣本量,應(yīng)用Quanto軟件(http://biostats.usc.edu/Quanto.html)計(jì)算,當(dāng) OR 為 0.5時(shí),檢測(cè)能力為99.99%。

        2 結(jié)果

        2.1 受試者年齡及孕周的比較 對(duì)照組及病例組受試者的平均年齡分別為(28.35±6.13)和(28.86±7.15)歲,平均孕齡分別為(6.84± 1.22)和(6.93±1.34)周,差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t分別為0.63和0.55,P分別為0.532和0.585)。

        2.2 DNA的濃度及純度 對(duì)照組及病例組受試者血液樣本中提取的DNA濃度均在40 ng/μL以上,可用于PCR擴(kuò)增,其在260與280 nm處的光吸收比值除少量在1.7~1.8或2.0~2.1之間,其他均在1.8~2.0之間;其在260與230 nm處的光吸收比值除少量在1.85~2.0之間,其他均在2.0以上。見表2。表明無(wú)過量蛋白質(zhì)、RNA或酚類物質(zhì)污染,可用于后續(xù)試驗(yàn)。

        2.3 HLA-DPA1基因頻率與樣本基本參數(shù)分析Haploview 4.2軟件分析結(jié)果表明,HLA-DPA1基因中共有14個(gè)SNP位點(diǎn)基因分型頻率在90%以上,除rs2073522在P<0.05時(shí)偏離HWE外,共對(duì)13個(gè)SNP位點(diǎn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,見表2。組間比較頻率時(shí)發(fā)現(xiàn),除rs1431403外,所有SNP的基因型和等位基因分布在對(duì)照組和無(wú)胚胎妊娠組間非常相近(數(shù)據(jù)未顯示),rs1431403基因分型多態(tài)性檢出率為94.23%,其中對(duì)照組為143例,病例組為102例。

        表2 SNP的詳細(xì)參數(shù)Tab.2 Detail parameters of SNP

        2.4 rs1431403位點(diǎn)的基因型及等位基因多樣性分析 基因型/等位基因頻率分析結(jié)果表明,對(duì)照組與病例組rs1431403位點(diǎn)的等位基因頻率間無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),但純合子基因型(CC 和 TT)明顯高于對(duì)照組(P<0.01),病例組純合子突變組合(CC+TT)部分也顯著高于對(duì)照組(P<0.001),見表3。表明該人群中rs1431403多態(tài)性可能與無(wú)胚胎妊娠風(fēng)險(xiǎn)呈正相關(guān)。

        表3 對(duì)照組和病例組rs1431403位點(diǎn)基因型的比較Tab.3 Comparison of rs1431403 genotypes in two groups

        2.5 rs1431403位點(diǎn)基因型和等位基因頻率在不同人群中的多態(tài)性分析 對(duì)照組rs1431403位點(diǎn)基因型/等位基因頻率與北京其他正常漢族人群間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),除日本和非洲人群的等位基因頻率與對(duì)照組差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義外(P>0.05),包括西雙版納中國(guó)傣族人口在內(nèi)的其他亞洲國(guó)家或其他洲的外國(guó)人群的rs1431403位點(diǎn)基因型/等位基因頻率差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見表4。表明對(duì)照組rs1431403位點(diǎn)基因型/等位基因頻率可代表漢族人群,且rs1431403位點(diǎn)在不同民族或種族人群中具有不同的基因型/等位基因頻率分布。

        表4 不同民族或種族正常人群rs1431403位點(diǎn)基因型和等位基因頻率的多態(tài)性Tab.4 Polymorphisms of frequencies of rs1431403 genotype/allele in healthy populations of various nationalities or races

        3 討論

        本實(shí)驗(yàn)基因分型結(jié)果表明,病例組CC與TT分型為40.2%和30.4%,分別比對(duì)照組高出19.2%和10.8%,CT分型為29.4%,比對(duì)照組低30.0%,病例組純合子突變組合(CC+TT)部分為70.6%,比對(duì)照組高30.0%;分型差異結(jié)果表明,HLA-DPA1基因中SNP位點(diǎn)rs1431403與無(wú)胚胎妊娠有顯著相關(guān)性,純合子基因型(CC和TT)明顯增加了無(wú)胚胎妊娠的風(fēng)險(xiǎn)。本實(shí)驗(yàn)還將對(duì)照組中rs1431403位點(diǎn)基因型/等位基因頻率與北京其他正常漢族人群(1000 Genomes數(shù)據(jù)庫(kù))進(jìn)行了比較,兩組間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),該結(jié)果進(jìn)一步證實(shí)了對(duì)照組rs14-31403位點(diǎn)基因型/等位基因頻率可代表漢族人群,其分布與包括西雙版納中國(guó)傣族人口在內(nèi)的其他亞洲國(guó)家或其他洲的外國(guó)人群相比,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),表明rs1431403位點(diǎn)與無(wú)胚胎妊娠的關(guān)系在不同民族中可能存在差異。

        有研究發(fā)現(xiàn),rs1431403位點(diǎn)的基因變異同時(shí)存在于HLA-DPA1和HLA-DPB1的內(nèi)含子區(qū)域,可能與類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎、1型糖尿病等自身免疫性疾病和HIV等免疫缺陷相關(guān)[13-14]。HLAⅡ類分子與外源性抗原結(jié)合為復(fù)合物,與CD4+T淋巴細(xì)胞(Th)表面受體(T cell receptor,TCR)結(jié)合,CD4+Th 的活化引起Th細(xì)胞增殖,表達(dá)相應(yīng)的淋巴因子,進(jìn)而啟動(dòng)體液免疫[15],表明HLAⅡ類分子增加可刺激CD4細(xì)胞上升。FERRERIA等[14]發(fā)現(xiàn),rs1431403的C等位基因在Ⅰ型糖尿病和HIV中均可引起CD4/CD8的下調(diào)。YANG等[13]發(fā)現(xiàn),rs1431403位點(diǎn)的變異顯著增加類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎的發(fā)生,HLAⅡ類分子表達(dá)上調(diào)是類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎的檢測(cè)指標(biāo)之一;也有研究表明,類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎風(fēng)險(xiǎn)與HLA的基因多態(tài)性密切相關(guān)[16]。綜上所述,rs1431403位點(diǎn)的基因型與HLADPA1的表達(dá)可能存在關(guān)聯(lián),rs1431403位點(diǎn)基因型可能是影響無(wú)胚胎妊娠發(fā)生的途徑,但具體病理機(jī)制有待進(jìn)一步研究。轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測(cè)(Alibaba 2.1,gene-regulation.com/pub/programs/alibaba2/index.html)發(fā)現(xiàn),rs1431403下游4 bp處為干擾素共識(shí)序列結(jié)合蛋白(ICSBP)結(jié)合位點(diǎn),ICSBP能夠促進(jìn)HLA-DP表達(dá)[17],但I(xiàn)CSBP與該位點(diǎn)的結(jié)合是否受rs1431403位點(diǎn)突變調(diào)節(jié)尚需證實(shí)。

        綜上所述,HLA-DPA1中rs1431403位點(diǎn)的純合分型(CC或TT)是中國(guó)人群胚胎停育的潛在危險(xiǎn)因素,該結(jié)果可能為自然流產(chǎn)的產(chǎn)前診斷提供線索,對(duì)優(yōu)生優(yōu)育具有積極意義。

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