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        棉花根際土壤真菌分離及黃萎病菌拮抗菌的篩選

        2021-01-13 08:46:22郝海婷牛冬冬阿依妮薩阿卜力海提代先興唐澤文
        塔里木大學(xué)學(xué)報 2020年4期
        關(guān)鍵詞:登錄號黃萎病菌絲

        郝海婷 牛冬冬 阿依妮薩·阿卜力海提 代先興唐澤文 李 猛 武 剛

        (1塔里木大學(xué)植物科學(xué)學(xué)院/南疆農(nóng)業(yè)有害生物綜合治理兵團重點實驗室,新疆 阿拉爾 843300)

        (2南京農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護學(xué)院,江蘇 南京 210095)

        (3新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團第一師農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所,新疆 阿拉爾 843300)

        棉花是我國重要的一種經(jīng)濟作物。新疆棉花總產(chǎn)量已連續(xù)20多年位居全國第一位[1]。隨著種植面積的不斷擴大和連作種植,土傳病害發(fā)生嚴重,尤其是由大麗輪枝菌引起的棉花黃萎病是棉花主產(chǎn)區(qū)的重要病害,已嚴重影響棉花的產(chǎn)量和品質(zhì)[2-3]。

        一直以來,棉花黃萎病的防治比較困難,尚未找到根治的有效防治方法。當(dāng)前,在新疆地區(qū),棉花黃萎病的防治大多采取“預(yù)防為主,綜合防治”的植保策略,主要通過種植抗病、耐病品種以及結(jié)合輪作、深翻等措施控制棉花黃萎病蔓延[4-5]。近年來,土壤消毒、種子消毒以及生物防治等手段逐漸在棉花黃萎病病害防治中開始應(yīng)用[5-6]。

        生物防治既符合人們對綠色環(huán)保的需求,又可為農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展提供保障,現(xiàn)已成為防治植物病害的研究熱點。生物防治方法中,利用有益微生物防治各種植物病害是切實可行的策略之一[7]。對植物病害有拮抗效果的有益微生物包括真菌、細菌和放線菌。拮抗真菌大多存在于植物根系和葉圍,對植物有著很好的親合性,在作物上定植,生防效果穩(wěn)定,拮抗菌分泌次級代謝產(chǎn)物,通過直接或間接的方式,達到阻礙或殺死病原菌的效果[8-9]。因此,尋找環(huán)境中高效、多功能的生防微生物是目前棉花黃萎病防治的發(fā)展方向[10]。

        本研究通過對田間3株健康棉花的根際土壤真菌進行分離和純化,利用皿內(nèi)對峙方法篩選對棉花黃萎病菌有抑制效果的拮抗菌,并利用分子方法鑒定菌種,明確其種屬地位,為研制防治棉花黃萎病的高效綠色微生物制劑提供菌種資源。

        1 材料與方法

        1.1 土壤拮抗真菌的分離、純化、形態(tài)觀察

        棉花品種為新陸中37。選取棉田3個不同點分別取棉花根際土樣,每個點選擇一株健康棉花根際土壤。棉花根際土樣真菌分離采用稀釋平板法。具體步驟為:取棉花根際土樣5 g,懸浮于45 ml無菌水中,在水平搖床上以80 rpm、25℃條件下振蕩培養(yǎng)20 min,即得懸液,并以此稀釋至10-5倍。采用PDA培養(yǎng)基,用移液器分別取土壤稀釋液0.1 mL涂布于PDA培養(yǎng)基平板上,25℃培養(yǎng)4~5 d,選取生長良好的菌落繼續(xù)純化3次,觀察記錄。

        1.2 棉花根際土壤微生物DNA提取

        一種快速提取DNA的方法,具體步驟如下所示。第一步:無菌條件下,用無菌槍頭挑純化好的菌絲到1.5 mL離心管;第二步:加入50 uL 10*TE buffer溶液,振蕩分散菌絲;第三步:封口,微波爐700 W 2 min;第四步:取出立即冰浴2 min,然后離心10 min;第五步:移液器緩慢取10 uL上清液作為PCR模板。

        1.3 拮抗真菌的分子鑒定

        以提取DNA為模板進行rDNA-ITS、EF-1α、βtubulin和ACT基因測序,在NCBI網(wǎng)站進行Blast比對,選取序列同源性比較值較高的作為參考菌株,評估物種的相似度。所用引物序列見表1。

        PCR反應(yīng)體系為25 uL:DNA模板1 uL,2×Es Taq Master Mix12.5 uL,引物-F0.3 uL,引物-R0.3 uL,ddH2O 10.9 uL。PCR擴增產(chǎn)物用1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測,然后送生工生物工程(上海)股份有限公司測序。

        1.4 抑菌實驗

        通過平板對峙法測定分離真菌對大麗輪枝菌的拮抗效果,具體步驟:在新鮮固體PDA培養(yǎng)皿正中間用記號筆分別在距離點2.5 cm左右兩側(cè)同一水平線上做標記;用8 mm無菌打孔器在大麗輪枝菌培養(yǎng)皿邊緣打孔,菌餅菌絲面朝下放入PDA左側(cè)標記處,封口,放入28℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)5~7 d(大麗輪枝菌生長緩慢);生長5~7 d的大麗輪枝菌培養(yǎng)基另一端加入純化后的分離真菌,同樣用8 mm無菌打孔器打孔,菌餅菌絲面朝下放入,28℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng),直至產(chǎn)生抑菌圈;對照是在新鮮固體PDA培養(yǎng)皿左側(cè)標記點打上8 mm大麗輪枝菌菌餅,右側(cè)標記點打8 mm PDA空白菌餅,放入28℃培養(yǎng)箱培養(yǎng);每個實驗三個生物學(xué)重復(fù)。

        表1 所用引物序列及其來源

        計算抑菌率:抑菌率=(對照組真菌菌落生長直徑-處理組真菌菌落生長直徑)/對照組真菌菌落生長直徑×100%。抑菌率數(shù)值越高說明抑菌作用越強,拮抗效果越好。

        1.5 數(shù)據(jù)處理

        使用Excel對數(shù)據(jù)進行處理;使用Bioedit進行序列整理,進一步在NCBI上比對。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 棉花根際土壤真菌的分離情況

        采用稀釋平板法進行菌株的分離與純化,從3份土壤樣本中分離獲得若干菌株,針對這些分離真菌的菌落形態(tài)特征進行初步判斷,將這些菌株分為3大類。第一類菌株包括C11,菌株C11接種至PDA培養(yǎng)基中,培養(yǎng)5 d后,菌落正面呈白色,背面呈淡黃色,邊緣菌絲形狀不規(guī)則(圖1:A和B);第二類菌株包括C41、A21和C421,菌落呈波浪狀或高山狀,氣生菌絲呈白色,且輻射狀蔓延,有的菌株有白色菌絲隆起,7 d后菌絲幾乎鋪滿整個培養(yǎng)皿,基內(nèi)菌絲多層重疊(圖 1:C和 D);第三類菌株包括 B11、B51、C31和C91,菌落正面呈白色,5 d左右后背面呈淡粉色,菌絲發(fā)達,絨毛狀(圖1:E和F)。

        圖1 代表菌株菌落形態(tài)圖

        2.2 棉花黃萎病拮抗菌的篩選

        采用皿內(nèi)對峙法對分離真菌進行抑菌試驗(見表2、圖2)。結(jié)果顯示,與對照相比,分離出的每株真菌都對棉花黃萎病菌有一定的抑制作用,抑菌率為29.51%~42.86%,說明這些菌可能產(chǎn)生了具有抑制棉花黃萎病菌活性的代謝產(chǎn)物。

        表2 棉花根際土壤分離真菌對棉花黃萎病菌的抑制效果

        圖2 棉花根際土壤分離真菌對棉花黃萎病菌菌絲生長的抑制作用

        2.3 棉花根際土壤真菌的分子生物學(xué)鑒定結(jié)果

        采用通用引物ITS1和ITS4,擴增8株菌株,得到的片段長度為570~680 bp之間(見表3);分別采用EF-1α、β-tubulin和ACT基因擴增根際土壤真菌,擴增片段范圍分別為 216~229 bp、329~439 bp和 268~274 bp。

        將測序結(jié)果進一步和NCBI上的基因序列進行比對(表3),結(jié)果表明:分離獲得的B11菌,其ITS序列與粉紅粘帚霉Clonostachys rosea菌株的ITS序列同源性為99.83%(登錄號KX058045.1)、EF-1α序列與C.rosea菌株同源性為97.99%(登錄號MK752496.1)、β-tubulin序列與C.rosea菌株同源性為98.07%(登錄號KJ413352.1)、Actin序列與C.rosea菌株同源性為98.85%(登錄號MH102067.1)。分離獲得的B51菌,其ITS序列與粉紅粘帚霉C.rosea菌株的ITS序列同源性為99.82%(登錄號MT845995.1)、EF-1α序列與C.rosea菌株同源性為98.01%(登錄號MK752496.1)、β-tubulin序列與C.rosea菌株同源性為98.37%(登錄號AF358166.1)。分離獲得的C31菌,其ITS序列與粉紅粘帚霉C.rosea菌株的ITS序列同源性為99.83%(登錄號 KX058045.1)、EF-1α序列與C.rosea菌株同源性為97.99%(登錄號MK752496.1)、β-tubulin序列與C.rosea菌株同源性為96.90%(登錄號KJ413352.1)、Actin序列與C.rosea菌株同源性為99.23%(登錄號MH102067.1)。分離獲得的C91菌,其ITS序列與粉紅粘帚霉C.rosea菌株的ITS序列同源性為 99.83%(登錄號KX058045.1)、EF-1α序列與C.rosea菌株同源性為99.49%(登錄號MT462122.1)、β-tubulin序列與C.rosea菌株同源性為97.83%(登錄號KJ413352.1)。

        分離獲得的C11菌,其ITS序列與球毛殼菌Chaetomium globosum菌株的ITS序列同源性為100.00%(登錄號MN809366.1);C41、A21和C421菌株,其ITS序列與高山被孢霉Mortierella alpina菌株的ITS序列同源性分別為99.41%(登錄號MF093212.1)、99.71%(登錄號KX343169.1)和99.56%(登錄號MT453270.1)。

        根據(jù)分子研究結(jié)果,結(jié)合形態(tài)學(xué)的初步鑒定,該8株菌中B11、B51、C31和C91為C.rosea,歸屬于真菌界,半知菌門,叢梗孢科,粘帚霉屬;C41、A21和C421為M.alpina,歸屬于真菌界,接合菌門,被孢霉科,被孢霉屬;C11菌株為C.globosum,歸屬于真菌界,子囊菌門,毛殼科,毛殼屬。

        表3 棉花根際土壤真菌的rDNA-ITS、EF-1α、β-tubulin和ACT序列相似性分析

        3 討論與結(jié)論

        粉紅粘帚霉是重要的生防真菌,具有生長速度快、產(chǎn)孢量大、拮抗能力強等多種優(yōu)點,除了對病原菌有重寄生、抗生、溶菌、競爭作用外,還能誘導(dǎo)植物產(chǎn)生系統(tǒng)抗性[11],有良好的開發(fā)和應(yīng)用價值。高航等[12]研究發(fā)現(xiàn)粉紅粘帚霉有較強的寄生能力,對林果枝干病害病原菌抑制率達60%以上;趙士振等[13]研究發(fā)現(xiàn)粉紅粘帚霉對果蔬灰霉病有很好的防效,能有效的寄生灰霉菌核及抑制孢子的產(chǎn)生;楊蕊等[14]研究發(fā)現(xiàn)粉紅粘帚霉菌絲可以重寄生苗期玉米莖基腐病病原菌菌絲,導(dǎo)致病菌菌絲細胞原生質(zhì)顆?;?、潰解,從而達到防治效果。但目前有關(guān)粉紅粘帚霉防治棉花黃萎病的報道較少,有待進一步圍繞粉紅粘帚霉防治棉花黃萎病開展系統(tǒng)研究。

        本研究還分離出一株在農(nóng)業(yè)和工業(yè)都有應(yīng)用的球毛殼菌。該菌對病原微生物和蚜蟲的生物防治有顯著作用[15-17],可產(chǎn)生大量有生物活性的次級代謝物[18],如球毛殼菌素,具有廣譜拮抗性和抗逆性,對多種作物病害具有良好的防治效果。現(xiàn)有研究結(jié)果表明,球毛殼菌作為拮抗菌對三七根腐病[19]、油菜根腫病[20]、玉米大斑病[21]以及南方根結(jié)線蟲[22]都有很好的防治效果。新疆棉花的產(chǎn)量和品質(zhì)主要受棉花黃萎病和棉蚜的影響,后續(xù)有必要將球毛殼菌作為潛在的棉花黃萎病和棉蚜防治菌,采用以菌治菌、以菌治蟲的防治策略,開發(fā)利用球毛殼菌防治棉花病蟲害。

        綜上所述,本研究通過對棉花根際土壤真菌的研究,獲得的2株潛在拮抗菌(粉紅粘帚霉和球毛殼菌),可為進一步有效防治棉花黃萎病提供菌種資源[23],對后續(xù)棉花黃萎病在生物防治方面的研究具有重要意義。

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