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        含白噪聲的隨機(jī)糖酵解化學(xué)反應(yīng)模型的動(dòng)力學(xué)行為

        2021-01-13 04:47:54李丹彤
        關(guān)鍵詞:糖酵解確定性直方圖

        李丹彤,楊 穎

        (長(zhǎng)春師范大學(xué)數(shù)學(xué)學(xué)院,吉林 長(zhǎng)春 130000)

        1 預(yù)備知識(shí)

        糖酵解是一種通過(guò)代謝過(guò)程將葡萄糖轉(zhuǎn)化為丙酮酸的生化反應(yīng),是活細(xì)胞利用葡萄糖獲得能量的方法.文獻(xiàn)[1]給出了一個(gè)基本模型,它可以通過(guò)以下兩個(gè)耦合的一階微分方程[2]來(lái)表示:

        (1)

        其中:x和y分別表示二磷酸腺苷(ADP)和磷酸果糖(F6P)的濃度;參數(shù)(α,β)非負(fù).方程(1)為無(wú)量綱化之后的形式,容易看出P(β,β/(α+β2))是系統(tǒng)(1)的唯一正平衡點(diǎn).如果適當(dāng)選擇參數(shù)α和β,系統(tǒng)(1)存在一個(gè)穩(wěn)定的極限環(huán)[3].此外,有關(guān)糖酵解數(shù)學(xué)模型的細(xì)節(jié)可見(jiàn)文獻(xiàn)[4-6].文獻(xiàn)[7-9]擴(kuò)展了對(duì)于糖酵解模型的分支分析和定性性質(zhì)的研究.文獻(xiàn)[10]構(gòu)造了一個(gè)非標(biāo)準(zhǔn)差分形式,利用離散時(shí)間模型的極限環(huán)行為證明了解的正性.文獻(xiàn)[11]討論了離散時(shí)間模型的定性行為、分岔分析和混沌控制.

        本文旨在研究隨機(jī)糖酵解模型的動(dòng)力學(xué)行為.最近通過(guò)研究一些隨機(jī)化學(xué)反應(yīng)模型得到了它們的遍歷性[12-14].顯然,生化反應(yīng)模型不可避免地會(huì)受到環(huán)境白噪聲的影響.反應(yīng)中的催化劑、溶劑、溫度等因素都會(huì)對(duì)反應(yīng)過(guò)程產(chǎn)生影響,因此在化學(xué)反應(yīng)中考慮隨機(jī)擾動(dòng)是合理的.現(xiàn)將確定性糖酵解模型(1)加入白噪聲系統(tǒng)擾動(dòng),將其轉(zhuǎn)化為伊藤隨機(jī)微分方程:

        (2)

        首先給出一些常用的記號(hào)和公式.在本文中,令

        除非另行說(shuō)明,總假設(shè)(Ω,F(xiàn),{Ft}t≥0,P)為滿足通常條件(右連續(xù)且F0包含所有的零測(cè)集)的帶有域流{Ft}t≥0的完全概率空間.下面考慮給定初始值x(t0)=x0∈R+的d維隨機(jī)微分方程:

        dx(t)=f(x(t),t)dt+g(x(t),t)dB(t),t>t0.

        (3)

        LV(x,t)=Vt(x,t)+Vx(x,t)f(x,t)+1/2trace[gT(x,t)Vxx(x,t)g(x,t)].

        dV(x(t),t)=LV(x(t),t)dt+Vx(x(t),t)g(x(t),t)dB(t).

        2 正解的存在唯一性

        首先說(shuō)明系統(tǒng)(2)的解是正的和全局的.對(duì)于任意初始值,為了得到唯一的全局解,即解在有限時(shí)間內(nèi)不會(huì)爆破,方程的系數(shù)被要求滿足局部Lipschitz條件和線性增長(zhǎng)條件[15].然而隨機(jī)系統(tǒng)(2)中的xy2項(xiàng)是非線性的,因此系統(tǒng)(2)的系數(shù)顯然不滿足線性增長(zhǎng)條件.這樣解可能會(huì)在有限時(shí)間內(nèi)爆破.這里利用Lyapunov分析方法,說(shuō)明系統(tǒng)(2)的解如文獻(xiàn)[16-18]提到的那樣是正的和全局的.

        定理2.1如果σ1,σ2滿足

        (4)

        P{τn≤T}>ε.

        (5)

        dV(x,y)=LVdt+σ1(x-1)dB1(t)+σ2(y-1)dB2(t)+k1(x+y)(σ1xdB1(t)+σ2ydB2(t))+k2σ2y2dB2(t).

        (6)

        這里L(fēng)是系統(tǒng)(2)的生成算子,且有

        (7)

        (8)

        (9)

        由函數(shù)V(x,y)的定義及(7)—(9)式,可得

        (10)

        3 遍歷性

        先給出文獻(xiàn)[20]中的一個(gè)重要引理,讀者也可以參考文獻(xiàn)[21].

        引理3.2設(shè)X(t)是El中正則時(shí)間的齊次Markov過(guò)程.如果X(t)相對(duì)于某個(gè)有界域U是遞歸的,那么它相對(duì)于El中的任何非空域都是遞歸的.

        定理3.1如果σ1,σ2滿足

        (11)

        證明為了證明這個(gè)定理,需要證明在條件(11)滿足的情況下,引理3.1中的條件(B1)和(B2)成立.首先,將系統(tǒng)(2)寫成以下形式:

        由于條件(11)成立,所以可以取C1,C2,C3為正常數(shù),滿足:

        (12)

        LV≤-(C2+C3-C1β)x-[αC2-β(1+C1)]y-C3β/y-αC3y/x+C3x2+K.

        (13)

        K-βC3/ε<-1,

        (14)

        K-αC3/ε<-1,

        (15)

        K-(C2+C3-C1β)/ε2<-1,

        (16)

        K-[αC2-β(1+C1)]/ε<-1.

        (17)

        基于對(duì)上述情形的討論,引理3.1中的條件(B2)也滿足.這樣就完成了定理3.1的證明.

        4 數(shù)值模擬

        假設(shè)時(shí)間的單位為min,反應(yīng)物的濃度單位為mol/L.在模型(2)中選取兩組不同的參數(shù)值,得到了模型(1)和模型(2)的散點(diǎn)分布比較圖,并進(jìn)一步模擬了隨機(jī)系統(tǒng)的解及其直方圖.選取Δt=0.002,使用MATLAB軟件進(jìn)行模擬.

        (a)確定性系統(tǒng)(1) (b)隨機(jī)模型(2)

        例4.2系統(tǒng)(2)的參數(shù)選取如下:α=0.099,β=0.8,σ1=0.1,σ2=0.1.選取與例4.1相同的初始值,可以計(jì)算出P(x*,y*)=P(0.8,0.988).圖2給出了常微分模型(1)和相應(yīng)的隨機(jī)模型(2)的散點(diǎn)分布對(duì)比圖.圖2表明,系統(tǒng)的穩(wěn)態(tài)周圍有一個(gè)極限環(huán).

        (a)確定性系統(tǒng)(1) (b)隨機(jī)模型(2)

        例4.3系統(tǒng)(2)中參數(shù)的選取與例4.1相同,則系統(tǒng)(2)滿足定理3.1中的條件(11).由此可得一個(gè)平穩(wěn)分布,見(jiàn)圖3右側(cè)的直方圖.圖3的左圖顯示系統(tǒng)(2)的解在一個(gè)小鄰域內(nèi)波動(dòng).

        圖3 例4.3中隨機(jī)系統(tǒng) (2)的解及其直方圖

        例4.4系統(tǒng)(2)中的參數(shù)的選取與例4.2相同,隨機(jī)系統(tǒng)的模擬結(jié)果如圖4所示.

        圖4 例4.2中隨機(jī)系統(tǒng)(2)的解及其直方圖

        從模擬的結(jié)果可以看出,確定性系統(tǒng)的穩(wěn)態(tài)有時(shí)是穩(wěn)定的,有時(shí)存在極限環(huán).在糖酵解模型中加入隨機(jī)擾動(dòng),會(huì)得到一個(gè)隨機(jī)化學(xué)的糖酵解模型.如果白噪聲的強(qiáng)度滿足定理3.1的條件,則無(wú)論確定性系統(tǒng)平衡點(diǎn)的形式如何,相應(yīng)的隨機(jī)模型都具有遍歷性.而且似乎白噪聲的加入導(dǎo)致了糖酵解系統(tǒng)的弱穩(wěn)定性.

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