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        耐甲氧西林金黃色葡萄球菌mecA基因的超支化等溫?cái)U(kuò)增PCR檢測(cè)方法研究

        2020-12-14 14:18:26席家莊何建春趙峻英
        關(guān)鍵詞:等溫金黃色葡萄球菌

        董 劍,席家莊,王 杉,何建春,趙峻英*

        (重慶市大足區(qū)人民醫(yī)院,重慶 402360)

        耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)是金黃色葡萄球菌的一個(gè)獨(dú)特菌株,能抵抗所有青霉素及其他β內(nèi)酰胺酶類抗菌藥物。至今MRSA感染幾乎遍及全球,成為重要的院內(nèi)感染病原菌之一[1]。MRSA的早期篩查,對(duì)臨床治療和院感防控至關(guān)重要。然而,傳統(tǒng)病原菌培養(yǎng)鑒定耗時(shí)較長(zhǎng)、靈敏度有限、操作繁瑣,難于實(shí)現(xiàn)MRSA的早期檢測(cè)[2]。因此,急需構(gòu)建具有高效、靈敏、便捷的MRSA檢測(cè)方法。本研究以mecA基因?yàn)槟繕?biāo)基因,構(gòu)建超支化等溫?cái)U(kuò)增PCR檢測(cè)方法,現(xiàn)將研究結(jié)果報(bào)道如下。

        1 材料與方法

        1.1 菌株來(lái)源

        菌株為隨機(jī)抽取的我院2015年1月~2019年1月保存的經(jīng)VITEK2 Compact全自動(dòng)細(xì)菌鑒定儀鑒定的MRSA 83株,甲氧西林敏感的金黃色葡萄球菌(MSSA)62株。

        1.2 主要試劑

        細(xì)菌核酸提取試劑盒、dNTPs 、Champagne Taq DNA polymerase由北京天根生物科技股份有限公司生產(chǎn)、PCR引物由上海捷瑞生物公司合成。

        1.3 引物設(shè)計(jì)

        根據(jù)GenBank 中發(fā)布的mecA耐藥基因序列,采用Primer 6.0設(shè)計(jì),遵循核酸設(shè)計(jì)的原則,在保守區(qū)設(shè)計(jì)超支化等溫?cái)U(kuò)增PCR技術(shù)發(fā)卡結(jié)構(gòu)H1、H2、SH1、SH2,采用Oligo 6.0進(jìn)行評(píng)價(jià)。

        1.4 核酸提取

        按試劑盒說(shuō)明書操作步驟進(jìn)行細(xì)菌核酸提取

        1.5 超支化等溫?cái)U(kuò)增PCR反應(yīng)體系及條件

        采用50 μL的反應(yīng)體系,模板1~5 μL,H1、H2、SH1、SH2 1M共5 μL,dNTPs 4 μL,Buffer緩沖液5 μL,Taq酶0.25 μL,無(wú)菌雙蒸水補(bǔ)齊。反應(yīng)條件:62℃水浴恒溫 52 min,80℃5 min10 min。

        1.6 超支化等溫?cái)U(kuò)增PCR反應(yīng)產(chǎn)物

        取擴(kuò)增產(chǎn)物10 μL與2 μL上樣緩沖液混合,加入到PAGE電泳孔,

        恒流100 mA電泳,在凝膠像分析儀下觀察并記錄結(jié)果。

        1.7 統(tǒng)計(jì)分析

        應(yīng)用SPSS 19.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié) 果

        (1)在電泳圖上含mecA基因的金黃色葡萄球菌(MRSA)被檢出,有梯狀條帶出現(xiàn),

        不含mecA基因的金黃色葡萄球菌(MSSA)不出現(xiàn)條帶,呈陰性。

        (2)145株金黃色葡萄球菌兩種方法的檢測(cè)結(jié)果

        145株金黃色葡萄球菌中,VITEK2 Compact全自動(dòng)細(xì)菌鑒定共檢出MRSA83株,檢出率57.24%,超支化等溫?cái)U(kuò)增PCR在以上83株MRSA中全部找到mecA基因,在62株MSSA中找到3株含mecA基因,MRSA檢出率59.31%。兩種檢測(cè)方法結(jié)果比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。

        3 討 論

        本研究所構(gòu)建的超支化等溫鏈擴(kuò)增PCR技術(shù)[3-5],采用臨床分離的菌株進(jìn)行檢測(cè)具有較好的特異性,含mecA基因的金黃色葡萄球菌可出現(xiàn)有梯狀條帶出現(xiàn),不含mecA基因的金黃色葡萄球菌則呈陰性。對(duì)145株金黃色葡萄球菌的檢測(cè)結(jié)果來(lái)看[6-8]:超支化等溫鏈擴(kuò)增PCR技術(shù)與VITEK2 Compact全自動(dòng)細(xì)菌鑒定和藥敏分析儀,二者對(duì)MRSA檢出率相比差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[9-11](P>0.05)。兩種方法結(jié)果不一致的3株,符合率97.93%。在本研究超支化等溫鏈擴(kuò)增PCR反應(yīng)體系過程中僅需一個(gè)普通的恒溫水浴箱,不需昂貴的PCR儀。只需1 h左右就可得到檢測(cè)結(jié)果,相較于常規(guī)的細(xì)菌培養(yǎng)和鑒定流程時(shí)間大大縮短[12-14],可在基層的實(shí)驗(yàn)室開展。

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