葛將 李文坤 李倩 王蕓 王亞丹 綜述 吳靜② 審校
2003年人類基因組測序完成后,發(fā)現(xiàn)僅有20 000個基因參與蛋白質(zhì)編碼,然而超過98%的基因不進行蛋白質(zhì)翻譯,稱為非編碼RNA(non-coding RNAs,ncRNAs)[1]。傳統(tǒng)意義上的ncRNAs分為兩大類。第一大類根據(jù)長度的不同分為:長度<200個核苷酸的短鏈非編碼RNA,如microRNA(miRNA)、轉(zhuǎn)運RNA(tRNA);長度超過200個核苷酸達到10萬個堿基對的長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)。第二大類組成包括:在X染色體失活中發(fā)揮重要作用的X染色體失活特異轉(zhuǎn)錄物(X-inactive-specific transcript,Xist)、同源框基因反義基因間RNA(homeobox gene antisense intergenic RNA,HOTAIR)、H19[2]。
lncRNA構(gòu)成了非編碼基因組大部分空間,根據(jù)其在基因組上相對于蛋白質(zhì)編碼基因的位置,lncRNA分類為正義lncRNA、反義lncRNA、雙向lncRNA、基因間lncRNA、內(nèi)含子lncRNA。這些非編碼轉(zhuǎn)錄本通常與相應(yīng)的mRNA編碼序列存在部分重疊,可能具有mRNA相同的功能。lncRNA包括一類不同轉(zhuǎn)錄本,其結(jié)構(gòu)類似于mRNA,但不編碼蛋白質(zhì)[3]。與mRNA相同,大多數(shù)lncRNA也是由RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄,進行可選擇性剪切,可能攜帶有單核苷酸多態(tài)性(SNPs),進行5’端加帽和聚腺苷酸化[4]。結(jié)構(gòu)上,lncRNA可以形成復(fù)雜二級結(jié)構(gòu)及復(fù)雜高級結(jié)構(gòu),增強識別蛋白質(zhì)的能力[5]。
lncRNA在轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因表達[6]。在轉(zhuǎn)錄水平,lncRNA通過順式或者反式作用以與染色質(zhì)修飾酶相互作用、誘捕轉(zhuǎn)錄因子和直接與啟動子結(jié)合等方式導(dǎo)致基因的激活或沉默[7-9]。lncRNA LNAPPCC與EZH2結(jié)合,抑制EZH2與PCDH7啟動子結(jié)合,下調(diào)PCDH7啟動子中組蛋白H3K27me3水平,激活PCDH7的表達[10]。lncRNA HAND2-AS1將轉(zhuǎn)錄因子E2F4募集到C16orf74啟動子區(qū)域,并下調(diào)C16orf74表達。有報道表明,HAND2-AS1通過募集轉(zhuǎn)錄因子E2F4抑制C16orf74表達而抑制宮頸癌發(fā)生發(fā)展[11]。在轉(zhuǎn)錄后水平,lncRNA通過介導(dǎo)翻譯和增強部分互補mRNA的穩(wěn)定性調(diào)控基因表達;lncRNA干涉RNA結(jié)合蛋白,影響剪切和翻譯過程以及調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的活性和位置;lncRNAs作為競爭性內(nèi)源性RNA(ceRNA)吸附micRNA[12]。lncRNA RPPH1通過與β-Ⅲ微管蛋白(TUBB3)相互作用,阻止其泛素化,從而誘導(dǎo)大腸癌細(xì)胞上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化[13]。lncRNA CASC19作為ceRNA通過CASC19/miR-130b-3p/ZBR2軸調(diào)控非小細(xì)胞肺癌進展[14]。lncRNA功能與其亞細(xì)胞定位有關(guān)[15],細(xì)胞核內(nèi)的lncRNA主要參與指導(dǎo)和招募組蛋白蛋白修飾酶、轉(zhuǎn)錄因子到達特定基因位點,最終引起轉(zhuǎn)錄抑制因子失活和致癌基因激活[16]。細(xì)胞質(zhì)中l(wèi)ncRNA通常作為ceRNA調(diào)控mRNA蛋白穩(wěn)定性參與細(xì)胞生物學(xué)進程[7]。多項數(shù)據(jù)表明,lncRNA在不同疾病的基因表達,尤其是惡性腫瘤中發(fā)揮重要調(diào)節(jié)作用[17]。在癌癥中異常表達的lncRNA可以作為診斷、預(yù)后的分子標(biāo)記,以及癌癥治療潛在靶點[18]。
腫瘤是一個多基因多因素疾病,除腫瘤細(xì)胞之外,腫瘤微環(huán)境(tumor microenvironment,TME)其他組成部分也介入到腫瘤發(fā)展過程中。TME與腫瘤細(xì)胞之間相互關(guān)系對腫瘤發(fā)生發(fā)展起重要作用。除了腫瘤細(xì)胞,TME由許多不同的非癌細(xì)胞類型組成,包括內(nèi)皮細(xì)胞、脂肪細(xì)胞、成纖維細(xì)胞、肌成纖維細(xì)胞、周細(xì)胞、平滑肌細(xì)胞以及不同的免疫細(xì)胞[19]。來源于骨髓的單核細(xì)胞隨著血液循環(huán)遷移到組織和器官,之后分化為巨噬細(xì)胞[20]。巨噬細(xì)胞是不同的群體,不斷改變其功能表型應(yīng)對不同壓力條件[21]。在TME當(dāng)中,巨噬細(xì)胞受到不同刺激極化成兩種不同亞型巨噬細(xì)胞:傳統(tǒng)激活型M1巨噬細(xì)胞亞型和交替激活型M2巨噬細(xì)胞亞型[22]。在非惡性腫瘤中,大多數(shù)巨噬細(xì)胞是M1亞型,主要發(fā)揮促炎作用,以抗原呈遞和促進腫瘤消亡為特征。惡性腫瘤中的巨噬細(xì)胞,通常被稱為腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞(tumor-associated macrophages,TAMs),主要是M2亞型,產(chǎn)生細(xì)胞因子和下調(diào)抗炎免疫反應(yīng)促進腫瘤進展[21]。巨噬細(xì)胞從M1亞型轉(zhuǎn)變成M2亞型是可逆過程,取決于微環(huán)境中的信號[23]。
實體TME中,外周血單核細(xì)胞通過血管浸潤到腫瘤組織中極化為TAMs,腫瘤發(fā)展不同時期有不同亞型[24]。腫瘤發(fā)展早期階段,TAMs發(fā)揮促炎表型作用,啟動抗腫瘤I型炎癥反應(yīng),通過釋放TNF-α、ROS或者吞噬作用抑制腫瘤細(xì)胞生長[25-26]。腫瘤進展期,TME刺激巨噬細(xì)胞分泌IL-10、TGF-β限制細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞和自然殺傷細(xì)胞的活性。大多數(shù)腫瘤中,巨噬細(xì)胞大量浸潤與臨床預(yù)后不良相關(guān)[27]。TAMs占據(jù)腫瘤實體50%以上,大多數(shù)為M2亞型。高密度的TAMs與多種腫瘤預(yù)后不良有極大相關(guān)性[28]。TAMs是TME主要的免疫抑制細(xì)胞,被認(rèn)為是腫瘤干性和藥物抵抗主要促進因素[29]。有研究表明,lncRNA在癌癥免疫方面發(fā)揮重要作用,包括免疫激活、免疫細(xì)胞遷移和抗癌細(xì)胞毒性[30]。腫瘤發(fā)展過程中,TAMs在TME中發(fā)揮不同作用,lncRNA與TAMs在腫瘤發(fā)展過程中存在調(diào)控關(guān)系。
lncRNA是免疫細(xì)胞激活和分化的重要調(diào)控者[31]。肝癌細(xì)胞中高表達的lnc LINC00662 與miRNA-16、miRNA-107、miRNA-15a結(jié)合調(diào)控WNT3A表達水平發(fā)揮ceRNA的機制,高表達的WNT3A激活腫瘤細(xì)胞內(nèi)Wnt/β-catenin信號通路促進肝癌細(xì)胞增殖、遷移和侵襲,同時高表達的WNT3A激活TME中TAMs內(nèi)Wnt/β-catenin信號通路,使其表現(xiàn)為M2型功能巨噬細(xì)胞[32]。
lncRNA RP11-361F15.2在骨肉瘤組織中表達顯著增加,其表達與CPEB4的表達呈正相關(guān),與miRNA-30c-5p表達呈負(fù)相關(guān)。過表達RP11-361F15.2在體外增加了骨肉瘤細(xì)胞遷移/侵襲和TAMs M2樣極化,并促進了體內(nèi)移植瘤生長。RP11-361F15.2通過miRNA-30c-5p促進CPEB4介導(dǎo)腫瘤發(fā)生和TAM M2樣極化,RP11-361F15.2/miRNA-30c-5p/CPEB4環(huán)可作為治療內(nèi)肉瘤潛在策略[33]。在結(jié)直腸癌癌細(xì)胞中,高表達的lncRNA RPPH1被TME中巨噬細(xì)胞攝取,促使巨噬細(xì)胞分化為M2型TAMs,腫瘤細(xì)胞中的RPPH1既可對自身作用發(fā)揮促進腫瘤侵襲和遷移作用,又可通過促使M2型極化,間接促進腫瘤侵襲和遷移[34]。目前,M1型巨噬細(xì)胞抑制腫瘤進展,M2型巨噬細(xì)胞促進腫瘤進展被廣泛接受,如CASC2c[35]、GNAS-AS1[36]通過一定機制調(diào)控TME中巨噬細(xì)胞浸潤、極化,lncRNAs通過調(diào)控M1或者M2極化對腫瘤進展產(chǎn)生不同作用。異常表達的lncRNAs可作為腫瘤早期診斷分子或潛在治療靶點和未來研究的治療方向。
有報道顯示,TAMs中l(wèi)ncRNA通過調(diào)控巨噬細(xì)胞極化亞型,對腫瘤細(xì)胞產(chǎn)生不同作用。在乳腺癌中,敲降TME中TAMs內(nèi)linc-p21逆轉(zhuǎn)TAMs功能亞型,同時增加抗乳腺癌能力,促進腫瘤細(xì)胞凋亡,抑制腫瘤細(xì)胞遷移和侵襲。linc-p21可以直接作用于p53,去除MDM2對p53的降解作用,促進乳腺癌微環(huán)境TAMs亞型維持作用。敲降TAMs中l(wèi)inc-p21,p53與linc-21之間的作用關(guān)系減弱,增強p53與MDM2之間的作用關(guān)系,激活NF-κB和STAT3信號通路,逆轉(zhuǎn)TAMs的亞型,產(chǎn)生大量的TNF-α殺傷腫瘤細(xì)胞發(fā)揮抗腫瘤作用[37]。lncRNA ANCR在TAMs中高表達,使TAMs不表現(xiàn)為M1功能亞型,ANCR在誘導(dǎo)M1型巨噬細(xì)胞中呈現(xiàn)低表達,過表達M1中ANCR后,通過下調(diào)FoxO1蛋白,抑制M1功能亞型巨噬細(xì)胞極化,胃癌發(fā)生侵襲和遷移的能力增強[38]。在肝細(xì)胞癌中,lncRNA cox-2在M1型巨噬細(xì)胞中高表達,敲降lncRNA 后,M1 型巨噬細(xì)胞分子標(biāo)記IL-12、iNOS、TNF-α表達下降,而M2型分子標(biāo)記IL-10、Arg1、Fizz-1表達增加,逆轉(zhuǎn)巨噬細(xì)胞M1表型為M2亞型。敲降lncRNA cox-2的M1型巨噬細(xì)胞與肝癌細(xì)胞共培養(yǎng),抑制肝癌細(xì)胞增殖、侵襲、遷移和上皮間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)。lncRNA cox-2通過促進M1型巨噬細(xì)胞極化抑制肝癌細(xì)胞的免疫侵襲和遷移,同時抑制M2型巨噬細(xì)胞極化[39]。相關(guān)的疾病中l(wèi)ncRNAs與TAM極化相互作用的相關(guān)機制見表1。
表1 不同腫瘤中l(wèi)ncRNA與TAMs極化
目前,臨床上已采取針對TAMs作為靶點的臨床治療方式,腫瘤常規(guī)治療方式主要包括手術(shù)、放療、化療,存在一定不良反應(yīng),動員和加強免疫系統(tǒng),以識別和消除癌細(xì)胞。這些治療方法之一就是以單核細(xì)胞和巨噬細(xì)胞作為免疫治療靶點。主要是從以下幾個方面進行干預(yù):阻止巨噬細(xì)胞聚集到腫瘤組織中;消除在腫瘤組織中已經(jīng)存在的TAMs;將TAMs重編程為抑癌的M1型巨噬細(xì)胞;中和TAMs產(chǎn)生的促腫瘤產(chǎn)物;利用TAMs傳遞殺腫瘤藥物進入到微環(huán)境中[23]。
TAMs內(nèi)lncRNA調(diào)控TME中巨噬細(xì)胞極化,進而影響腫瘤進展。lncRNA還影響腫瘤血管生成,lncRNA MALAT1抑制了VEGF-A的產(chǎn)生,損害了HUVECs血管生成[40]。TAMs通過局部降解細(xì)胞外基質(zhì),釋放內(nèi)皮細(xì)胞生長刺激因子FGF-2、VEGF、GM-CSF等刺激內(nèi)皮細(xì)胞增殖和遷移,影響血管成熟,進而促進腫瘤血管生成[41]。在M2中高表達,M1中低表達的LncRNA-MM2P,增強M2巨噬細(xì)胞促血管生成功能,進而促進腫瘤進展[42]。
了解lncRNA結(jié)構(gòu)和功能,可進行以lncRNA為基礎(chǔ)的腫瘤治療。根據(jù)lncRNA 與TAMs 之間的關(guān)系及對腫瘤產(chǎn)生的作用,未來臨床上可為腫瘤新的診斷分子及治療靶點提供線索。