張棋麟 ,江宇航,董志祥,羅智文,林連兵 ?
1.昆明理工大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,云南 昆明 650500; 2.云南省高校飼用抗生素替代技術(shù)工程研究中心,云南 昆明 650500
汞被聯(lián)合國(guó)列為威脅人類(lèi)健康和環(huán)境的十大污染物之一,并受到了廣泛的關(guān)注(Morelet al.,1998;Liet al.,2009a)。汞對(duì)水體污染十分嚴(yán)重,水環(huán)境中汞主要以3種形態(tài)存在:?jiǎn)钨|(zhì)態(tài)、無(wú)機(jī)態(tài)(如氯化汞 (HgCl2,HGC) 等)和有機(jī)態(tài)(如甲基汞等)(Monteiro et al.,2010;Marceloet al.,2013)。汞是一種難降解、易遷移、高濃度、劇毒的全球重金屬污染物。因此,世界上許多水體都存在因汞含量過(guò)高而造成的潛在環(huán)境風(fēng)險(xiǎn)。例如,在美國(guó)卡森河流域,廢棄金礦附近的水體中總汞濃度已經(jīng)達(dá)到了2 474 ng·L-1(Morway et al.,2017);印度西亞印第安納州,某些黃金礦區(qū)附近的河流水體中總汞含量最高可達(dá)37 300 ng·L-1(Inoue et al.,2016);此外,中國(guó)貴州省銅仁汞礦區(qū)的地表水總汞含量也高達(dá)到81.6—4 250 ng·L-1(夏吉成等,2016)。水體汞污染作為一種典型的有害物質(zhì),在環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域得到了廣泛的研究和調(diào)查。然而,目前較少有研究探討水體中汞對(duì)魚(yú)類(lèi)的影響。
腸道菌群在宿主的健康與疾病中扮演了重要的角色,被稱(chēng)為宿主的第二基因組(Backhedet al.,2007)。腸道菌群功能的發(fā)揮依賴(lài)于腸道菌群的組成與結(jié)構(gòu),當(dāng)受到外源物刺激時(shí),可能會(huì)導(dǎo)致腸道菌群紊亂,使宿主發(fā)生炎癥甚至死亡。例如,當(dāng)成年鯉(Cyprinus carpio)暴露于含有重金屬鎘的水溶液后,會(huì)導(dǎo)致鯉腸道菌群的多樣性降低,且腸道內(nèi)益生菌Akkermansia muciniphila的相對(duì)豐度顯著下降(Changet al.,2019);通過(guò)對(duì)暴露于重金屬鉛的成年斑馬魚(yú)進(jìn)行研究,研究者發(fā)現(xiàn)其腸道菌群的多樣性與對(duì)照組相比發(fā)生了顯著改變,并導(dǎo)致其腸道菌群失調(diào),產(chǎn)生功能紊亂(Xiaet al.,2018);鯽(Carassius auratus)腸道菌群也會(huì)隨著氨溶液暴露濃度的變化而改變(Qiet al.,2017)。此外,魚(yú)體內(nèi)的抗氧化酶防御體系對(duì)環(huán)境污染物敏感,因此魚(yú)類(lèi)組織中的抗氧化酶能作為環(huán)境污染物的生物標(biāo)記物(Ahmad et al.,2006;Oliveira et al.,2008)。有研究報(bào)道了重金屬類(lèi)污染物能在魚(yú)類(lèi)的不同組織中積累,影響體內(nèi)脂質(zhì)過(guò)氧化物含量的變化,尤其是肝組織對(duì)水體污染物的毒害反應(yīng)最為敏感,可直接影響組織中的抗氧化酶系統(tǒng),誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡和造成機(jī)體損傷等(劉林等,2015a)。以上研究表明,水體污染物對(duì)魚(yú)類(lèi)腸道菌群結(jié)構(gòu)和肝組織影響巨大,對(duì)魚(yú)類(lèi)的健康造成了威脅。然而,迄今為止,人們對(duì)汞如何影響?hù)~(yú)類(lèi)腸道菌群及肝組織抗氧化性能的認(rèn)識(shí)仍較為有限。
斑馬魚(yú)(Danio rerio)是國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)化組織(ISO)推薦使用的魚(yú)類(lèi)毒性試驗(yàn)動(dòng)物,因此被廣泛應(yīng)用于毒理學(xué)、環(huán)境保護(hù)、發(fā)育生物學(xué)等研究,已成為一種重要的生物模型(宋志慧等,2012;Maet al.,2013)。當(dāng)斑馬魚(yú)暴露于水體污染物時(shí),其能在不同層面上(如行為、生理、表型、基因表達(dá)等)對(duì)環(huán)境非生物壓力做出不同程度的響應(yīng),因此被稱(chēng)為水環(huán)境污染風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估的“活監(jiān)測(cè)儀”(Huet al.,2016)。然而,斑馬魚(yú)腸道菌群和肝臟抗氧化酶活性對(duì)重金屬污染物的響應(yīng)研究并不多見(jiàn),尤其針對(duì)汞的相關(guān)報(bào)道還未發(fā)現(xiàn)。本研究以模式生物斑馬魚(yú)為對(duì)象,通過(guò)汞暴露誘發(fā)斑馬魚(yú)成魚(yú)腸道菌群結(jié)構(gòu)和肝臟中抗氧化酶活性的變化,旨在探討水體中汞對(duì)斑馬魚(yú)腸道菌群結(jié)構(gòu)和肝臟抗氧化指標(biāo)的影響。
研究使用成年斑馬魚(yú),購(gòu)買(mǎi)自中國(guó)斑馬魚(yú)資源中心(CZRC,http://en.zfish.cn/)。所有斑馬魚(yú)都飼養(yǎng)于連續(xù)曝氣的300 L水族箱中,并配備溫度、光照和供氧控制裝置,光周期白天和黑夜比為14 h?10 h,水溫 (25±1) ℃,酸堿度為 (7.0±5),導(dǎo)電性為850—900 μs·cm-1。斑馬魚(yú)氯化汞暴露實(shí)驗(yàn)根據(jù)我們以前的方法進(jìn)行(Zhanget al.,2020)。首先,在無(wú)菌容器中配置0.1%(1 g·L-1)的氯化汞(HgCl2,HGC,Sigma-Aldrich,美國(guó))母液。所有動(dòng)物實(shí)驗(yàn)完全按照昆明理工大學(xué)關(guān)于實(shí)驗(yàn)動(dòng)物倫理道德和福利的相關(guān)規(guī)定進(jìn)行(KMUSTA-2019723-01)。將40尾大小相似 (3.8±0.3) cm的成年斑馬魚(yú)平均分為2個(gè)組(每組20條),分別飼養(yǎng)于兩個(gè)獨(dú)立水族箱內(nèi)(1.5 L)。HGC暴露實(shí)驗(yàn)組(DRM)的斑馬魚(yú)暴露在濃度為30 μg·L-1(采用冷原子熒光法測(cè)定水中Hg2+濃度(Wang et al.,2015),Hg2+濃度約為21.3 μg·L-1(Zhanget al.,2020)的HGC。在斑馬魚(yú)基因表達(dá)、氧化壓力、荷爾蒙和生殖系統(tǒng)等對(duì)汞暴露響應(yīng)的條件下,此濃度的氯化汞顯然能對(duì)成年斑馬魚(yú)腸道及肝組織功能造成影響(Zhanget al.,2016;Zhanget al.,2020)。以往的研究表明:30 μg·L-1氯化汞對(duì)成年斑馬魚(yú)生殖毒理學(xué)相關(guān)指標(biāo)和腸道基因表達(dá)等產(chǎn)生影響,故本研究選取30 μg·L-1的氯化汞作為成年斑馬魚(yú)汞暴露濃度(Zhanget al.,2016;Zhanget al.,2020)。此外,不含氯化汞水族箱中的斑馬魚(yú)個(gè)體作為對(duì)照組(DRC)。在飼養(yǎng)24 h后,分別隨機(jī)收集處理和對(duì)照組中的斑馬魚(yú)樣品各15尾。該實(shí)驗(yàn)分別獨(dú)立重復(fù)3次作為3個(gè)生物學(xué)重復(fù)(處理組:DRM-1、2、3;對(duì)照組:DRC-1、2、3)避免單次取樣和斑馬魚(yú)個(gè)體間引起的隨機(jī)及偶然誤差。因本研究?jī)H關(guān)注氯化汞暴露及未暴露組間斑馬魚(yú)腸道菌群結(jié)構(gòu)和肝臟抗氧化酶活間的差異,以期探討汞暴露對(duì)斑馬魚(yú)腸道菌群結(jié)構(gòu)和肝臟抗氧化指標(biāo)的影響,故本研究?jī)H設(shè)置了一個(gè)斑馬魚(yú)汞暴露組。收集后斑馬魚(yú)成體置于-80 ℃的超低溫冰箱(Sanyo,日本)。
將樣品置于超凈工作臺(tái)(蘇坤,中國(guó))進(jìn)行解剖。分別將每個(gè)個(gè)體腸道取出,并轉(zhuǎn)移至1.5 mL的離心管中,用無(wú)菌水沖洗3次以去除腸道表面微生物和其中雜質(zhì)。采用TIANamp Stool DNA Kit(天根生物技術(shù)公司,中國(guó))試劑盒,按照說(shuō)明書(shū)進(jìn)行總DNA抽提。利用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA的純度和濃度,取適量的樣品于離心管中,使用無(wú)菌水稀釋樣品至1 ng·μL-1。以稀釋后的基因組DNA為模板,使用帶Barcode的特異引物(V1—V9,正向引物:AGRGTTTGATYMTGGCTCAG;反向引物:GGYTACCTTGTTACGACTT、Phusion? High-Fidelity PCR Master Mix with GC Buffer(New England Biolabs,英國(guó))和高保真酶混合體系進(jìn)行16S全長(zhǎng)的PCR擴(kuò)增。PCR產(chǎn)物使用質(zhì)量分?jǐn)?shù)為2%的瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè);根據(jù)PCR產(chǎn)物濃度進(jìn)行等量混樣,充分混勻后使用質(zhì)量分?jǐn)?shù)為2%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物,對(duì)目的條帶使用QIAquick Gel Extraction Kit試劑盒(Qiagen,德國(guó))試劑盒進(jìn)行膠回收。
純化后的16S基因全長(zhǎng)采用SMRT Bell Template Prep Kit(Pacific Biosciences,美國(guó))試劑盒進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建:使用DNA黏合酶將測(cè)序接頭連接在擴(kuò)增好的DNA片段兩端,用AMpure PB磁珠對(duì)DNA片段進(jìn)行純化選擇,構(gòu)建SMRT Bell文庫(kù)。純化后的片段經(jīng)buffer回溶后,使用BluePipin片段篩選特定大小的片段,并AMpure PB磁珠對(duì)DNA片段進(jìn)行純化。構(gòu)建好的文庫(kù)經(jīng)Qubit 3.0熒光計(jì)(英濰捷基,美國(guó))進(jìn)行濃度定量,并利用Agilent 2100(安捷倫,美國(guó))確認(rèn)插入片段長(zhǎng)度,隨后用PacBio Sequel(Pacific Biosciences,美國(guó))平臺(tái)對(duì)6個(gè)樣本進(jìn)行測(cè)序。
將PacBio下機(jī)數(shù)據(jù)導(dǎo)出bam格式文件。使用Lima軟件根據(jù)barcode序列區(qū)分各樣本的數(shù)據(jù),所有樣本的序列以bam格式保存。然后使用CCS(SMRT Link v5.0)對(duì)序列進(jìn)行校正,矯正參數(shù)為:CCS=3,最小準(zhǔn)確率為0.9,并去除長(zhǎng)度小于1 340 bp、最長(zhǎng)序列長(zhǎng)度大于1 640 bp的序列,以fastq和fasta保存;隨后進(jìn)行SSR過(guò)濾并使用cutadapt去除掉引物,將含有連續(xù)相同堿基數(shù)>8的序列過(guò)濾掉。經(jīng)過(guò)以上處理后得到的reads需要進(jìn)行去除嵌合體序列(http://www.drive5.com/usearch/manual/chimera_formation.html)的處理,reads序列通過(guò)(UCHIME Algorithm,http://www.drive5.com/usearch/manual/uchime_algo.html)與全長(zhǎng)注釋數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)檢測(cè)嵌合體序列,并最終去除其中的嵌合體序列,得到最終的高質(zhì)量數(shù)據(jù)(clean reads)。
利 用Uparse軟 件(Uparse v7.0.1001,http://drive5.com/uparse/)對(duì)所有樣品的全部clean reads進(jìn)行聚類(lèi),默認(rèn)以97%的一致性將序列聚類(lèi)成為OTUs(operational taxonomic units),同時(shí)會(huì)選取OTUs的代表性序列,依據(jù)其算法原則,篩選的是OTUs中出現(xiàn)頻數(shù)最高的序列作為OTUs的代表序列。對(duì)OTUs代表序列進(jìn)行物種注釋?zhuān)肕othur方 法 與SILVA(http://www.arb-silva.de/)的SSUrRNA數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行物種注釋分析(設(shè)定閾值為0.8—1.0),獲得分類(lèi)學(xué)信息并分別在各個(gè)分類(lèi)水平:kingdom(界)、phylum(門(mén))、class(綱)、order(目)、family(科)、genus(屬)、species(種)統(tǒng)計(jì)各樣本的群落組成。使用MUSCLE(Version 3.8.31,http://www.drive5.com/muscle/)軟件進(jìn)行快速多序列比對(duì),得到所有OTUs代表序列的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。最后,對(duì)各樣品的數(shù)據(jù)進(jìn)行均一化處理,以樣品中數(shù)據(jù)量最少的為標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行均一化處理,后續(xù)的Alpha多樣性分析和Beta多樣性分析都是基于均一化處理后的數(shù)據(jù)。
使用Qiime軟件(Version 1.9.1)(Caporasoet al.,2010)計(jì)算Observed-otus、Chao1、Shannon、Simpson、ACE,Goods-coverage指數(shù)。Alpha和Beta多樣性指數(shù)組間差異分析均進(jìn)行有參數(shù)檢驗(yàn)和非參數(shù)檢驗(yàn),當(dāng)滿(mǎn)足參數(shù)假設(shè)條件,則組間兩兩比較選用T-test檢驗(yàn);反之,則使用Wilcoxon秩和檢驗(yàn)測(cè)試組間差異的顯著水平,統(tǒng)計(jì)分析采用IBM SPSS Statistics 22軟件進(jìn)行。采用Qiime軟件計(jì)算Unifrac距離。使用R語(yǔ)言(Version 2.15.3)vegan軟件包繪制NMDS圖。
解剖收集成年斑馬魚(yú)肝臟,后在預(yù)冷勻漿培養(yǎng)基(0.01 M Tris-HCl、0.001 M EDTANa2、0.01 M蔗糖、pH7.4)中研磨,以3 000 r·min-1離心,收集上清液以測(cè)定酶活性(劉林等,2015a)。然后將上清液與酶底物孵育,使用UV-8000ST分光光度計(jì)(上海元析儀器有限公司)以指定波長(zhǎng)讀取。酶活性檢測(cè)一式三份。谷胱甘肽過(guò)氧化物酶(GSH-Px,E.C.1.11.1.9)、過(guò)氧化氫酶(CAT,E.C.1.11.1.6)、超氧化物歧化酶(SOD,E.C.1.15.1.1)、過(guò)氧化物酶(POD,E.C.1.11.1.7)活性和丙二醛(MDA)水平,并用作生化指標(biāo)。商業(yè)檢測(cè)試劑盒購(gòu)自南京建城生物工程研究所(南京,中國(guó),http://elder.njcbio.com/index_en.php),所有酶活性檢測(cè)均按照試劑盒說(shuō)明書(shū)測(cè)量。采用GSH-Px活性測(cè)定試劑盒(目錄號(hào):A005-1-2)測(cè)量GSH-Px活性。GSH-Px催化還原型谷胱甘肽還原過(guò)氧化氫,在420 nm處檢測(cè)其吸光度。使用CAT活性測(cè)定試劑盒(目錄號(hào):A007-1-1)測(cè)量CAT活性。CAT能催化過(guò)氧化氫的分解,鉬酸銨能迅速阻止過(guò)氧化氫的分解。剩下的過(guò)氧化氫可以很快與鉬酸銨結(jié)合,生成一種淡黃色的絡(luò)合物,可以在405 nm處測(cè)量。采用總超氧化物歧化酶(T-SOD)檢測(cè)試劑盒(羥胺法)(目錄號(hào):A001-1-2)在550 nm處測(cè)定SOD活性。POD活性用過(guò)氧化物酶檢測(cè)試劑盒(目錄號(hào)A084-1-1)測(cè)定,POD能催化過(guò)氧化氫反應(yīng);酶活性用420 nm吸光度變化測(cè)定。使用丙二醛測(cè)定試劑盒(TBA法)(目錄號(hào):A003-1-1)在532 nm的吸收波長(zhǎng)下測(cè)量丙二醛水平。用總蛋白測(cè)定試劑盒(雙辛酸法)(目錄號(hào):A045-4-1)在562 nm處測(cè)定粗酶提取物中的可溶性蛋白質(zhì)。
對(duì)兩組實(shí)驗(yàn)的6個(gè)斑馬魚(yú)腸道菌群測(cè)序文庫(kù)進(jìn)行測(cè)序,一共得到71 472條原始序列,質(zhì)量控制后,得到69 344高質(zhì)量序列;一共獲得堿基100 717 757 bp,平均長(zhǎng)度為1 450 bp。單獨(dú)樣品的測(cè)序結(jié)果如表1所示。有效序列和原始序列的比值為96.72%。每個(gè)樣品詳細(xì)數(shù)據(jù)測(cè)序數(shù)據(jù)和過(guò)濾后數(shù)據(jù)信息見(jiàn)表1。
表1 不同斑馬魚(yú)腸道菌群樣品16S rDNA測(cè)序基本信息Table 1 Information of 16S rDNA sequencing of different gut flora samples in zebrafish
NMDS(Stress<0.001)結(jié)果顯示,實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組顯著分開(kāi),且各自生物學(xué)重復(fù)間具有更近的距離(圖1)。本研究通過(guò)Alpha多樣性指數(shù)反映微生物群落的豐富度和多樣性。使用Chao 1、ACE指數(shù)反映群落豐富度,使用Shannon、Simpson指數(shù)反映群落多樣性。使用Coverage指數(shù)反應(yīng)群落覆蓋度(表2)。通過(guò)對(duì)是否暴露于重金屬汞的斑馬魚(yú)腸道菌群進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析發(fā)現(xiàn),HGC暴露顯著影響斑馬魚(yú)腸道菌群的多樣性(ACE,P=0.004 6;Chao 1,P=0.008 7;Shannon,P=0.017 0;Simpson,P=0.059 0)。這些結(jié)果表明,HGC暴露顯著降低了斑馬魚(yú)腸道菌群的多樣性。Coverage指數(shù)均大于0.983,表明測(cè)序飽和,所測(cè)數(shù)據(jù)充分。
圖1 不同處理樣品NMDS圖Fig.1 NMDS plots for different samples
對(duì)斑馬魚(yú)腸道菌群測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行注釋后,得到門(mén)、屬等分類(lèi)單元信息。其中,在門(mén)分類(lèi)單元中,相對(duì)豐度最高的為梭桿菌門(mén)(Fusobacteria),其次為變形菌門(mén)(Proteobacteria)、厚壁菌門(mén)(Firmicutes)、擬桿菌門(mén)(Bacteroidetes)、放線(xiàn)菌門(mén)(Actinobacteria)、藍(lán)藻菌門(mén)(Cyanobacteria)、浮霉菌門(mén)(Planctomycetes)、疣微菌門(mén)(Verrucomicrobia)、Melainabacteria和酸桿菌門(mén)(Acidobacteria) (圖2A)。在屬分類(lèi)單元中,相對(duì)豐度最高的為鯨桿菌屬(Cetobacterium),鞘脂單胞菌屬(Sphingomonas),芽孢桿菌屬(Bacillus),鏈球菌屬(Streptococcus),鄰單胞菌屬(Plesiomonas),氣單胞菌屬(Aeromonas),Burkholderiaceae,尿素芽胞桿菌屬(Ureibacillus),醋桿菌屬(Acetobacter),腸球菌屬(Enterococcus)(圖2B)。
表2 多樣性指數(shù)統(tǒng)計(jì)Table 2 Statistics for diversity indices
為探索HGC暴露對(duì)斑馬魚(yú)腸道菌群結(jié)構(gòu)的影響,本研究定義相對(duì)豐度前十的菌群為優(yōu)勢(shì)菌群,并進(jìn)一步對(duì)其在對(duì)照組和HGC處理組間的相對(duì)豐度差異進(jìn)行比較分析。結(jié)果表明:相比于對(duì)照組,HGC暴露后,梭桿菌門(mén)(P=0.000 0)、變形菌門(mén)(P=0.000 2)、厚壁菌門(mén)(P=0.015 3)、擬桿菌門(mén)(P=0.030 4)、放線(xiàn)菌門(mén)(P=0.005 5)、藍(lán)藻菌門(mén)(P=0.001 9)、浮霉菌門(mén)(P=0.000 2)等7個(gè)門(mén)的相對(duì)豐度發(fā)生了顯著變化(表3)。其中,梭桿菌門(mén)的相對(duì)豐度上升幅度最大,與對(duì)照組中未明顯檢測(cè)相比其相對(duì)豐度上升至處理組中的75%以上;相反,變形菌門(mén)的相對(duì)豐度下降幅度最大,其在對(duì)照組樣品中相對(duì)豐度約占75%,而在處理組樣品中卻僅占約20%,約降低了近4倍;同時(shí),厚壁菌門(mén)也顯示了顯著的下降幅度,處理組中厚壁菌門(mén)細(xì)菌僅為對(duì)照組中約不足30%。此外,在屬水平,鯨桿菌屬(P=0.000 0)、鞘脂單胞菌屬(P=0.000 2)、芽孢桿菌屬(P=0.006 8)、鏈球菌屬(P=0.011 2)、氣單胞菌屬(P=0.019 6)、尿素芽胞桿菌屬(P=0.016 1)、腸球菌屬(P=0.007 6)等7個(gè)屬細(xì)菌的相對(duì)豐度在斑馬魚(yú)HGC暴露下也發(fā)生了顯著改變。其中,鯨桿菌屬、鏈球菌屬和氣單胞菌屬的細(xì)菌相對(duì)豐度上呈現(xiàn)出顯著的上升幅度,尤其是鯨桿菌屬的細(xì)菌上升幅度最大,從對(duì)照組中未明顯檢測(cè)到上升至處理組中的75%以上;相反,鞘脂單胞菌屬、芽孢桿菌、解脲芽孢桿菌屬和腸球菌屬的細(xì)菌相對(duì)豐度上呈現(xiàn)出顯著的下降幅度,尤其是鞘脂單胞菌屬的細(xì)菌,從對(duì)照組樣品中的約70%相對(duì)豐度下降至處理組樣品中的低于5%(表4)。
圖2 門(mén)(A)、屬(B)水平腸道菌群組成Fig.2 Composition of gut flora at Phyla (A) and Genera (B) level in treatment and control groups
表3 門(mén)分類(lèi)單元下相對(duì)豐度前10細(xì)菌的變化Table 3 Changes in relative abundance of top10 bacteria phylum taxa
成年斑馬魚(yú)HGC暴露后,肝臟抗氧化酶GSH-Px、CAT和SOD活性發(fā)生顯著上升或下降(P<0.05),而POD活性略有上升,但差異不顯著(P>0.05)(表5)。另外,相比對(duì)照組,HGC暴露組肝臟MDA水平發(fā)生顯著上升(P<0.05)。具體來(lái)看,HGC暴露后,斑馬魚(yú)肝組織的GSH-Px活性(41.79±7.11) U·mg-1與對(duì)照組的GSH-Px活性(23.61±4.98) U·mg-1相比顯著增高1.77倍;HGC暴露后,斑馬魚(yú)肝組織的SOD活性 (74.12±9.32)U·mg-1與對(duì)照組的SOD活性 (31.22±6.47) U·mg-1相比顯著升高到了2.37倍;與此同時(shí),MDA水平在斑馬魚(yú)HGC暴露前后變化最為劇烈,由(4.71±0.51) nmol·mg-1升 高 到 (31.26± 5.58)nmol·mg-1,升幅高達(dá)6.64倍。但通過(guò)HGC暴露處理成年斑馬魚(yú)后,卻誘發(fā)了肝臟中CAT活性發(fā)生顯著下降由對(duì)照組((132.63±13.87) U·mg-1下降至(53.71±8.16) U·mg-1,2.47倍)。
表4 屬分類(lèi)單元下相對(duì)豐度前10的變化Table 4 Changes in relative abundance of the top10 in genera taxa
表5 汞暴露對(duì)斑馬魚(yú)肝臟抗氧化酶(谷胱甘肽過(guò)氧化物酶、過(guò)氧化氫酶、超氧化物歧化酶、過(guò)氧化物酶)活性和丙二醛水平的影響Table 5 Effect of mercury exposure on the activity of antioxidant enzymes (GSH-Px, CAT, SOD, POD) and MDA levels in zebrafish liver
本研究通過(guò)第三代測(cè)序技術(shù)對(duì)對(duì)照和HGC暴露的斑馬魚(yú)腸道菌群進(jìn)行16S rDNA全長(zhǎng)序列進(jìn)行高通量測(cè)序,獲得了一批高質(zhì)量的數(shù)據(jù),保證了下游腸道菌群結(jié)構(gòu)分析的可靠性。NMDS分析表明實(shí)驗(yàn)處理恰當(dāng),不同處理的生物學(xué)重復(fù)樣品各自聚在一起,且處理和對(duì)照組明顯分開(kāi),顯示了斑馬魚(yú)腸道菌群在HGC暴露后產(chǎn)生了明顯不同的結(jié)構(gòu)特征。研究結(jié)果進(jìn)一步顯示對(duì)照組斑馬魚(yú)腸道菌群多樣性顯著高于HGC暴露組斑馬魚(yú),可見(jiàn)腸道菌群多樣性下降也是菌群結(jié)構(gòu)變化的重要特征之一。此外,利用重金屬銅處理異育銀鯽(Carassius auratus)后,腸道微生物發(fā)生多樣性出現(xiàn)顯著下降(涂宗財(cái)?shù)龋?017),而且斑馬魚(yú)短期暴露于霜霉威鹽酸鹽時(shí),腸道菌群的多樣性也會(huì)發(fā)生顯著下降(Zhanget al.,2018)。這些證據(jù)進(jìn)一步支持了HGC暴露可以降低斑馬魚(yú)腸道菌群的多樣性,腸道菌群多樣性的下降可能是外源環(huán)境的強(qiáng)烈刺激對(duì)機(jī)體正常生命活動(dòng)造成的一種損傷機(jī)制。當(dāng)然,這還需要通過(guò)降低或提高斑馬魚(yú)腸道菌群多樣性后,比較不同腸道菌群多樣性斑馬魚(yú)間的行為、生理和生化等指標(biāo)來(lái)進(jìn)一步確認(rèn)。另外,斑馬魚(yú)腸道菌群多樣性的降低或可作為一個(gè)對(duì)水環(huán)境污染風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估的潛在指標(biāo)。
在門(mén)分類(lèi)水平,梭桿菌門(mén),變形菌門(mén),厚壁菌門(mén)為的斑馬魚(yú)腸道細(xì)菌相對(duì)豐度占據(jù)前三,尤其梭桿菌和變形菌占絕大多數(shù),該研究結(jié)果與以往大部分針對(duì)成年斑馬魚(yú)腸道菌群的研究結(jié)果相似(Bates et al.,2006;Wonget al.,2015;Zhanget al.,2019),顯示了本研究測(cè)序及分析結(jié)果的可靠。同時(shí),斑馬魚(yú)暴露于HGC,結(jié)果發(fā)現(xiàn)其腸道優(yōu)勢(shì)菌群中的梭桿菌門(mén)相對(duì)豐度發(fā)生了顯著上升,而變形菌門(mén)和厚壁菌門(mén)相對(duì)豐度發(fā)生了顯著下降,這也進(jìn)一步表明斑馬魚(yú)暴露于HGC后,其腸道菌群在門(mén)水平的相對(duì)豐度會(huì)受到顯著影響。以往研究表明,暴露于高濃度的殺菌劑抑霉唑21 d后,斑馬魚(yú)腸道內(nèi)的變形菌門(mén)相對(duì)豐度顯著下降,而厚壁菌門(mén)的豐度顯著上升(Jinet al.,2017),厚壁菌門(mén)的變化趨勢(shì)同幼年斑馬魚(yú)暴露于微塑料7 d后的一致(Wanet al.,2019)。然而,作為常見(jiàn)的重金屬污染物,砷會(huì)改變小鼠腸道微生物的組成,造成厚壁菌門(mén)的豐度顯著降低(Luet al.,2014)。可見(jiàn),不同水體污染物造成的腸道細(xì)菌在門(mén)水平類(lèi)型和變化趨勢(shì)上存在較大差異。
在屬分類(lèi)水平,7個(gè)優(yōu)勢(shì)細(xì)菌屬的相對(duì)豐度對(duì)斑馬魚(yú)HGC暴露發(fā)生了顯著的響應(yīng),其中鯨桿菌屬、鏈球菌屬和氣單胞菌屬的細(xì)菌相對(duì)豐度上發(fā)生了顯著上升,鞘脂單胞菌屬、芽孢桿菌、解脲芽孢桿菌屬和腸球菌屬的細(xì)菌相對(duì)豐度發(fā)生顯著下降,這與涂宗財(cái)?shù)龋?017)利用重金屬銅對(duì)異育銀鯽腸道處理后鯨桿菌屬和氣單胞菌屬細(xì)菌相對(duì)豐度發(fā)生顯著上升,芽孢桿菌屬細(xì)菌相對(duì)豐度發(fā)生顯著下降,具有一定相似性。盡管一些相對(duì)豐度顯著改變的細(xì)菌的生物學(xué)功能尚不清楚,但其中部分細(xì)菌類(lèi)群與代謝、疾病和炎癥密切相關(guān)。例如,鯨桿菌屬是魚(yú)類(lèi)腸道和糞便中的優(yōu)勢(shì)菌群(Sylvain et al.,2017),是魚(yú)類(lèi)微生物屏障功能的重要組成部分。當(dāng)前環(huán)境污染物對(duì)魚(yú)類(lèi)腸道鯨桿菌屬類(lèi)群影響的研究還極為鮮見(jiàn),本研究首次報(bào)道了重要水體重金屬污染物對(duì)魚(yú)類(lèi)腸道鯨桿菌屬細(xì)菌的影響。不過(guò),在魚(yú)類(lèi)病原菌對(duì)魚(yú)類(lèi)腸道菌群影響的研究中已發(fā)現(xiàn)嗜水氣單胞菌(Aeromonas hydrophilis)感染顯著提高了成年草魚(yú)(Ctenopharyngodon idellus)腸道內(nèi)鯨桿菌屬菌群的相對(duì)豐度(李東亮,2016)。本研究結(jié)果顯示:當(dāng)斑馬魚(yú)暴露于HGC時(shí),腸道內(nèi)鯨桿菌的相對(duì)豐度會(huì)顯著增加。這些證據(jù)暗示了鯨桿菌屬相對(duì)豐度的增加可能是魚(yú)類(lèi)遭受外源物刺激誘發(fā)的一個(gè)腸道細(xì)菌標(biāo)志。此外,鞘脂單胞菌屬是魚(yú)類(lèi)重要的益生菌(余桂娟等,2019)。本研究發(fā)現(xiàn)鞘脂單胞菌相對(duì)豐度在斑馬魚(yú)HGC暴露下,豐度顯著降低。芽孢桿菌能對(duì)斑馬魚(yú)腸道有較好的黏附,具有免疫調(diào)節(jié)和免疫保護(hù)作用,能有效刺激斑馬魚(yú)腸道黏膜的抗炎反應(yīng)和屏障再生,提高斑馬魚(yú)對(duì)嗜水氣單胞菌感染的免疫抵抗能力(Wanget al.,2015)。尿素芽胞桿菌和腸球菌在斑馬魚(yú)腸道中的角色還鮮有報(bào)道,但這兩類(lèi)細(xì)菌已廣泛作為動(dòng)物腸道益生菌。鏈球菌和氣單胞菌是自然界重要的魚(yú)類(lèi)病原菌,其病害是水產(chǎn)業(yè)的主要威脅之一,斑馬魚(yú)已被用于作為鏈球菌和氣單胞菌疾病研究的模型(Neelyet al.,2002;Ayaz Ahmedet al.,2018)。這些證據(jù)表明,水體HGC暴露誘導(dǎo)成年斑馬魚(yú)腸道菌群失調(diào),主要益生菌和病原菌的相對(duì)豐度都產(chǎn)生了顯著改變。
活性氧種類(lèi)(reactive oxygen species,ROS)和過(guò)氧化氫(hydrogen peroxide,H2O2)水平由抗氧化防御機(jī)制的協(xié)同作用控制,抗氧化酶的活性是氧化應(yīng)激、細(xì)胞膜和DNA損傷程度以及過(guò)量ROS和H2O2消除的潛在指標(biāo)(劉林等,2015b;Zhenget al.,2019)。大量的研究顯示水體污染物能引誘機(jī)體產(chǎn)生過(guò)量的ROS和H2O2,從而損傷器官和組織(Livingstone,2003;Valavanidiset al.,2006)。GSH-PX在CAT含量較低的組織中具有與CAT相似的作用,可以去除H2O2,防止H2O2對(duì)組織的氧化損傷(Eliaet al.,2006)。已有大量研究報(bào)道了GSH-PX在魚(yú)類(lèi)遭受水體污染物脅迫中的抗氧化防御作用。例如,研究發(fā)現(xiàn)水體中Cu2+暴露能顯著提高銀鯧(Pampus gentareus)幼魚(yú)組織中的GSH-PX活性,造成抗氧化防御系統(tǒng)的破壞(周健愷等,2014)。本研究中,斑馬魚(yú)HGC暴露前,肝臟中GSH-Px水平較低時(shí)具有良好的抗氧化防御作用,然而,HGC暴露后,GSH-PX活性急劇上升,表明汞暴露可促進(jìn)斑馬魚(yú)肝臟中抗氧化酶系統(tǒng)的損傷。
CAT作為清除ROS的第一道防線(xiàn)(Udayangani et al.,2017),且CAT是過(guò)氧化物酶體的標(biāo)志酶,能催化H2O2的分解,從而使細(xì)胞免于遭受ROS和H2O2的毒害,是生物防御體系的關(guān)鍵酶之一(劉林等,2015a)。以前的研究發(fā)現(xiàn),鉛對(duì)鯽魚(yú)組織中的CAT活性有一定的抑制作用(成嘉等,2006);也有研究報(bào)道了一種印度的淡水魚(yú)Wallago attu在污染水體中,魚(yú)體內(nèi)的CAT活性較清潔水體中的低(Pandeyet al.,2003)。CAT活性下降可能是重金屬通過(guò)置換出金屬酶活性中的必要金屬或結(jié)合到酶蛋白分子中的巰基、羧基等功能基團(tuán)而導(dǎo)致的,當(dāng)機(jī)體中抗氧化酶活性受到抑制后,清除自由基能力下降(劉林等,2015a)。在本研究中,與對(duì)照組相比,斑馬魚(yú)HGC暴露顯著降低了肝組織CAT活性,表明水體汞對(duì)斑馬魚(yú)肝組織可能造成了氧化損傷。另外,CAT也可能是一種潛在的水環(huán)境汞污染風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估酶學(xué)標(biāo)志物,顯示了其用于評(píng)估汞暴露對(duì)魚(yú)類(lèi)肝組織損傷程度的潛力。
SOD在魚(yú)類(lèi)抗氧化酶系統(tǒng)中起重要作用,是氧化應(yīng)激的關(guān)鍵指示物,早已作為一種酶學(xué)標(biāo)志物用于水環(huán)境污染風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估(Carla et al.,2002)。SOD維持著機(jī)體的氧化(自由基產(chǎn)生)與抗氧化(自由基清除)平衡,它能通過(guò)清除超氧陰離子保護(hù)機(jī)體免受損傷(劉林等,2015a)。在哺乳動(dòng)物中的研究發(fā)現(xiàn),當(dāng)機(jī)體受到氧化壓力,生物體內(nèi)會(huì)出現(xiàn)比正常情況下多數(shù)倍的SOD來(lái)清除過(guò)量的氧自由基,避免機(jī)體受到氧化損傷(Kellyet al.,1998)。以往研究也報(bào)道了納米氧化鋅暴露不同的時(shí)間,斑馬魚(yú)肝組織中的SOD活性上升3—5倍不等,表明了納米氧化鋅暴露對(duì)斑馬魚(yú)肝的氧化損傷(劉林等,2015a)。本研究中,HGC暴露導(dǎo)致了斑馬魚(yú)肝組織中SOD活性升高,進(jìn)一步表明汞對(duì)斑馬魚(yú)的肝組織造成了氧化損傷,而斑馬魚(yú)肝組織通過(guò)產(chǎn)生更多的SOD阻止或減緩損傷進(jìn)程。
MDA是脂質(zhì)過(guò)氧化作用的產(chǎn)物,是細(xì)胞膜系統(tǒng)損傷的重要指標(biāo)之一,其水平可用于評(píng)估組織受損傷程度(Al-Bairutyet al.,2013;劉林等,2015a)。先前的研究表明,汞暴露濃度為15 μ·mL-1時(shí),可導(dǎo)致斑馬魚(yú)卵巢內(nèi)的MDA水平顯著上升(Zhanget al.,2016);劉占才等(2016)也發(fā)現(xiàn)濃度為0.5 μg·mL-1的汞暴露5 d后,草魚(yú)腎臟中的MDA水平會(huì)出現(xiàn)顯著上升;劉林等(2015a)甚至發(fā)現(xiàn)納米氧化鋅在水體中濃度超過(guò)0.01 μg·mL-1時(shí),就能誘導(dǎo)斑馬魚(yú)肝組織中的MDA水平明顯升高,并提出這種現(xiàn)象可能是組織細(xì)胞受污染物的脅迫產(chǎn)生過(guò)多的自由基,損傷細(xì)胞膜膜脂中的不飽和脂肪酸,破壞了細(xì)胞膜正常的結(jié)構(gòu)和膜內(nèi)外物質(zhì)交換,從而產(chǎn)生大量的MDA。本研究也顯示了,汞暴露斑馬魚(yú)時(shí),其肝組織中的MDA水平上升數(shù)倍,表明汞暴露給斑馬魚(yú)肝中的抗氧化酶系統(tǒng)帶來(lái)了巨大氧化壓力,破壞了肝組織的正常功能和解毒能力。此外,本研究中,僅在24 h汞暴露后,斑馬魚(yú)肝中丙二醛水平就有較大幅度升高,說(shuō)明汞暴露可在較短時(shí)間內(nèi)造成斑馬魚(yú)的肝損傷。
(1)本研究首次采用第三代測(cè)序技術(shù)及生物信息學(xué)分析,研究了重金屬汞暴露前后魚(yú)類(lèi)腸道菌群結(jié)構(gòu),并比較了它們之間的差異。研究結(jié)果證實(shí)了汞暴露引起斑馬魚(yú)腸道菌群多樣性顯著下降,以降低斑馬魚(yú)的抗逆能力,這可能是水體污染物損傷魚(yú)類(lèi)的一種潛在機(jī)制。
(2)水體汞暴露能使斑馬魚(yú)腸道菌群中的梭桿菌門(mén)、益生菌鯨桿菌屬、魚(yú)類(lèi)病原菌氣單胞菌屬和鏈球菌屬相對(duì)豐度顯著上升;變形菌門(mén)、厚壁菌門(mén)、擬桿菌門(mén)、放線(xiàn)菌門(mén)、藍(lán)藻菌門(mén)、浮霉菌門(mén)等6個(gè)門(mén),鞘脂單胞菌屬、芽孢桿菌屬、尿素芽胞桿菌屬、腸球菌屬等4個(gè)屬腸道益生菌的相對(duì)豐度顯著下降。
(3)水體汞暴露能使斑馬魚(yú)肝組織中抗氧化酶活性受到影響,引起肝組織中氧化酶及抗氧化酶系統(tǒng)發(fā)生紊亂,導(dǎo)致肝組織受損,且這種損傷在短時(shí)間(24 h)內(nèi)即可產(chǎn)生。