靳美 宋培蕓 曹利
【摘 要】 目的:探討組蛋白去乙?;?(HDAC9)基因單核苷酸多態(tài)性(SNP)與東北地區(qū)漢族人群腦梗死的相關性。方法:實驗采用病例-對照方法,隨機選取符合研究目的的漢族腦梗死患者201名及漢族健康者139名。采用聚合酶鏈式反應-連接酶檢測反應(PCR-LDR),對所有受試者HDAC9 基因rs2107595位點進行基因分型,統(tǒng)計分析比較病例組和對照組不同基因型(TT/CT/CC)及等位基因(C/T)的差異,并以OR(95%CI)值表示等位基因(C/T)的相對風險。結果:HDAC9基因rs2107595C/T位點,病例組TT基因型及T等位基因頻率明顯高于對照組,差異具有統(tǒng)計學意義(χ2=7.511,P=0.022),T等位基因攜帶者患腦梗死的風險增加(OR=1.490,95% CI:1.081~2.051)。結論:HDAC9 基因 rs2107595 位點 SNP 與腦梗死易感性相關,其中 T 等位基因可能為腦梗死的遺傳易感基因。
【關鍵詞】 HDAC9、基因多態(tài)性、腦梗死
【中圖分類號】 R743.3 ? 【文獻標志碼】B ? 【文章編號】1005-0019(2020)17-199-02 ?腦梗死是一種異質性綜合疾病,環(huán)境因素和遺傳因素的交互作用在發(fā)病中具有重要的作用[1]?;?HDAC9 是在全基因組測序研究中發(fā)現的與腦梗死發(fā)生密切相關的基因,我們通過對腦梗死患者基因 HDAC9 rs2107595位點多態(tài)性的研究,揭示表觀遺傳學中遺傳變異因素在腦梗死發(fā)病過程中所起到的作用。
1 對象與方法
1.1 對象 實驗組為黑龍江省醫(yī)院 2017 年 1 月至 2019 年 6 月神經內科 201名腦梗死住院患者,所有研究對象均滿足人體試驗倫理學標準,且已簽署知情同意書。實驗組納入的標準:(1)患者均符合第四屆中國腦血管疾病學術會議關于腦卒中的診斷標準;(2)擁有東北地區(qū)戶籍并且在東北地區(qū)內居住年數大于 5 年:(3)民族為漢族。排除標準:1、患者既往史中有心臟、腎臟、肝臟、骨骼和癌癥等主要疾病的,以及艾滋病,梅毒等嚴重傳染病史;2、排除患者之間存在血緣關系。
對照組為黑龍江省醫(yī)院體檢中心2017年1月至2019年6月健康體檢者139名,排除既往曾有腦卒中、腦外傷、腦血管病,排除曾有心臟、腎臟、肝臟、骨骼和癌癥等主要疾病的,以及艾滋病,梅毒等嚴重傳染病史,排除存在神經功能明顯的缺陷者,對照組均滿足人體試驗倫理學標準。
1.2 方法 清晨空腹肘前靜脈抽取5ml血樣,置于EDTA抗凝管后保存在-80℃冰箱中。應用Axygen公司的AxyPrep-96全血基因組DNA試劑盒提取基因組DNA,置于-80℃冰箱保存?zhèn)溆谩J褂肁BI 公司PRISM3730 電泳測序儀對LDR反應產物進行測序,通過Genemapper 軟件進行數據分析,根據不同峰型及堿基大小進行基因分型。
1.3 統(tǒng)計學分析 使用SPSS 22.0軟件進行統(tǒng)計分析,不同基因型(TT/CT/CC)及等位基因(C/T)等變量屬計數資料,采用頻數及百分比表示,使用χ2檢驗比較病例組和對照組間上述資料的差異,并以 OR(95%CI)值表示等位基因(C/T)的相對風險。
2 結果
病例組及對照組 HDAC9 基因rs2107595位點基因型分布均符合Hardy-Weinberg 遺傳平衡定律(病例組 P=0.273,對照組 P=0.919;認為P>0.05符合Hardy-Weinberg 平衡),故本研究中病例組及對照組均有較好的群體代表性。結果顯示病例組 HDAC9 基因rs2107595 T/C位點TT、CT、CC基因型頻率與對照組比較,差異具有統(tǒng)計學意義(P <0.05)。病例組T等位基因頻率明顯高于對照組,T等位基因攜帶者患腦梗死的風險增加(表 1)。
3 討論
隨著分子生物學研究的深入,遺傳學、表觀遺傳學以及環(huán)境因素受到廣泛關注。最近的全基因組關聯研究(GWAS)表明HDAC9基因與腦卒中有關,但可靠性仍存在爭議,尤其是來自不同種族和地理位置的數據。GWAS報道HDAC9基因3端 SPN rs2107595多態(tài)性與大動脈腦卒中風險相關[2]。HDAC9缺失可能導致炎癥基因的下調,脂質相關基因的上調,以及小鼠動脈粥樣硬化病變大小的顯著減少[3]。大多數學者表明 rs2107595 僅增加大血管動脈粥樣硬化性卒中風險。然而Akinyemi[4]研究非洲人群 rs2107595 多態(tài)性也會增加小血管腦卒中風險。Su[5]研究 rs2107595 與南方漢族人群腦卒中關系,在加性、顯性、隱性和等位基因模型無顯著相關性,表明 rs2107595多態(tài)性與腦梗死無關聯。
本研究發(fā)現 HDAC9 基因 rs2107595T/C位點與腦梗死的發(fā)病可能存在相關性,其中T等位基因可能為腦梗死的遺傳易感基因,進一步提示HDAC9基因rs2107595 T/C位點與腦梗死易感性的關聯。
同時本研究存在一定局限性,該研究為基于醫(yī)院的病例對照研究,不能排除有選擇偏倚的可能性。并且,研究結果不應被推斷適用于其他人群,因為該研究群體均為居住于中國東北地區(qū)的漢族人群。
綜上所述,本研究提供的數據表明,HDAC9 基因rs2107595 T/C 位點可能與腦梗死的疾病易感性相關。但有關該基因位點與疾病易感性之間的具體病理生理功能及發(fā)病機制仍有待進一步的研究。
參考文獻
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