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        水曲柳FmPHV基因克隆及在形成層愈傷組織中的表達(dá)分析

        2020-08-26 15:00:26張佳薇張旭肖英韓朝君劉華領(lǐng)張振峰梁楠松詹亞光
        廣西植物 2020年7期
        關(guān)鍵詞:生物信息學(xué)分析水曲柳

        張佳薇 張旭 肖英 韓朝君 劉華領(lǐng) 張振峰 梁楠松 詹亞光

        摘?要:該研究通過基因克隆獲得了水曲柳PHV基因,并命名為FmPHV。生物信息學(xué)分析表明,水曲柳FmPHV基因編碼區(qū)全長為2?112?bp,包含有一個(gè)完整的開放閱讀框,其編碼了一個(gè)由703個(gè)氨基酸組成的蛋白。亞細(xì)胞定位預(yù)測其主要存在于葉綠體中,為穩(wěn)定親水蛋白。保守域及同源分析表明,F(xiàn)mPHV與油橄欖、芝麻和煙草等物種的同源蛋白保守結(jié)構(gòu)域同源性高達(dá)99%。在低溫4??℃條件下,使用50?mg·L-1吲哚丁酸(IBA)溶液對水曲柳樹皮進(jìn)行處理,獲得了水曲柳形成層細(xì)胞,并進(jìn)一步誘導(dǎo)獲得形成層愈傷組織。對FmPHV基因的時(shí)空表達(dá)模式進(jìn)行分析表明,F(xiàn)mPHV基因6月表達(dá)量最高,同時(shí)FmPHV能在芽中高表達(dá),通過樹皮獲得的不同來源的愈傷組織相互比較可知,F(xiàn)mPHV在來源為形成層分生組織形成層愈傷組織中的表達(dá)量顯著高于其在其他來源的愈傷組織中的表達(dá)。此外,對水曲柳幼苗瞬時(shí)過表達(dá)FmPHV基因,對其所在通路關(guān)鍵基因的表達(dá)特征進(jìn)行分析,F(xiàn)mPHV瞬時(shí)過表達(dá)后,生長素相關(guān)基因表達(dá)下降,細(xì)胞分裂素相關(guān)基因表達(dá)上升,有利于芽的分化。以上結(jié)果表明,揭示了水曲柳FmPHV在水曲柳植株生長過程中的表達(dá)模式以及FmPHV過表達(dá)對芽再生通路各關(guān)鍵基因的調(diào)控情況,為研究水曲柳FmPHV調(diào)控生長發(fā)育的分子機(jī)制以及其在生長素和細(xì)胞分裂素響應(yīng)通路中發(fā)揮的作用奠定基礎(chǔ)。

        關(guān)鍵詞:水曲柳,PHV基因,生物信息學(xué)分析,瞬時(shí)侵染,形成層細(xì)胞

        中圖分類號:Q943

        文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A

        文章編號:1000-3142(2020)07-0963-14

        Abstract:?PHAVOLUTA(PHV)transcription?factor?is?one?of?the?most?important?members?of?homeodomain-leucine?zipper?Ⅲ?(HD-ZIP)?family,and?plays?an?important?role?in?the?regulation?of?formation?of?plant?stems?apical?and?germ?meristem.?In?this?research,the?PHV?gene?of?Fraxinus?mandshurica?was?acquired?by?gene?cloning?and?was?named?by?FmPHV.?Detailed?bioinformatics?analysis?showed?that?the?length?of?FmPHV?gene?was?2?112?bp,and?contained?a?complete?Open?Reading?Frame?(ORF)?which?encoded?a?protein?with?703?amino?acids.?The?FmPHV?gene?encoded?a?stable?hydrophilic?protein,the?subcellular?localization?prediction?of?FmPHV?protein?showed?the?FmPHV?was?mainly?present?in?the?chloroplast.?Conserved?domain?and?homology?analysis?of?FmPHV?protein?indicated?that,the?homology?of?FmPHV?between?the?homology?PHV?proteins?in?other?species,such?as?Olea?europaean,Sesamum?indicum?and?Nicotiana?tabacum,was?99%.?Under?4?℃?condition,with?the?treatment?of?50?mg·L-1?3-indolebutyric?acid(IBA)solution,we?obtained?the?cambium?callus?from?cambium?stem?cells?of?Fraxinus?mandshurica.?Analysis?of?the?gene?expression?pattern?of?FmPHV?showed?that?the?FmPHV?was?the?highest?expression?in?June.?Furthermore,the?expression?of?FmPHV?in?buds?was?stronger?than?which?in?any?other?tissues.?Compared?with?the?callus?from?different?sources,which?obtained?from?the?bark?of?F.?mandshurica,the?expression?level?of?FmPHV?gene?in?callus,derived?from?meristem?formation,was?significantly?higher?than?which?from?other?sources.?Moreover,overexpression?the?FmPHV?gene?in?F.?mandshurica?seedlings?will?reduce?the?expression?of?auxin-related?genes?and?increase?the?expression?of?cytokinin-related?genes.?This?phenomenon?indicated?that?the?function?of?FmPHV?gene?was?more?beneficial?to?the?process?of?plant?shoot?differentiation?and?regeneration.?In?summary,this?research?revealed?the?expression?pattern?of?FmPHV?gene?during?the?growth?and?development?in?F.?mandshurica.?And?revealed?the?expression?pattern?of?key?genes?in?plant?shoot?regeneration?pathway,which?were?regulated?by?FmPHV?gene.?Our?research?reveals?the?potential?value?of?the?molecular?characteristic?of?FmPHV?gene?in?the?response?of?auxin?and?cytokinin?pathways?during?the?process?of?the?formation?of?plant?callus?generation.

        1?材料與方法

        1.1?實(shí)驗(yàn)材料來源與處理

        水曲柳材料取自東北林業(yè)大學(xué)實(shí)驗(yàn)林場,以成熟水曲柳植株樹皮以及種子萌發(fā)所獲得的30?d幼苗為實(shí)驗(yàn)材料,根、莖、葉取自水曲柳3年生盆栽苗,5月—9月水曲柳全株(包括根,莖,葉)及雄花雌花取自野生水曲柳用于基因定量測定。對水曲柳樹皮進(jìn)行消毒后,置于4?℃中,使用50?mg·L-1IBA高滲溶液進(jìn)行20?h處理后,放入誘導(dǎo)培養(yǎng)基培養(yǎng)兩周后,獲得水曲柳形成層愈傷組織。將材料至于液氮中冷凍保存。

        1.2?實(shí)驗(yàn)方法

        1.2.1?FmPHV基因編碼區(qū)全長的克隆?使用CTAB方法提取水曲柳組培苗總RNA。經(jīng)反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA。實(shí)驗(yàn)前期對水曲柳轉(zhuǎn)錄組測序獲得水曲柳轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫。應(yīng)用BioEdit?軟件中Local?blast?功能中的blastn?和?blastx?功能,比對分析確認(rèn)PHV基因序列并設(shè)計(jì)引物,對PHV編碼區(qū)全長序列進(jìn)行克?。ㄒ锶绫?所示)。使用Omega膠回收試劑盒對特異性擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行回收純化,使用pEASY-T5載體連接特異產(chǎn)物,轉(zhuǎn)化克隆進(jìn)入Trans-T1感受態(tài)細(xì)胞中。送至生工生物工程(上海)公司測序。

        1.2.2?FmPHV基因編碼區(qū)序列的生物信息學(xué)分析?用NCBI在線工具中的Open?Reading?Frame?(ORF)?Finder預(yù)測FmPHV基因的編碼區(qū)(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/)。使用SignalP5.0在線分析軟件對FmPHV蛋白進(jìn)行信號肽的預(yù)測和分析(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)。利用ExPASy中ProtParam工具對該蛋白理論等電點(diǎn)pI(isoelectric?point)值、親水性/疏水性等理化性質(zhì)進(jìn)行分析(https://web.expasy.org/protparam/、https://web.expasy.org/protscale/)。使用在線分析軟件對FmPHV蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)域進(jìn)行分析(https://embnet.vital-it.ch/software/TMPRED_form.html)。利用WOLF-PSORT在線軟件對FmPHV蛋白的亞細(xì)胞定位情況進(jìn)行預(yù)測分析(https://wolfpsort.hgc.jp/)。利用?NCBI數(shù)據(jù)庫Conserved?Domain?Search?Service(CD?Search)在線分析軟件分析FmPHV的保守結(jié)構(gòu)域。使用MEGA7.0.2軟件的Neighbor-Joining(NJ)算法對其他物種中同源性較高的PHV蛋白構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹。利用在線多序列比對軟件PRALINE對不同物種的PHV結(jié)構(gòu)域進(jìn)行多重序列比對。

        1.2.3?水曲柳外植體無菌材料的獲得?選擇并收集一年生或多年生水曲柳莖條。截剪長度為4~6?cm的莖段在流水下沖洗2~4?h,將清洗過的組織放無菌燒瓶中,75%乙醇以及5%的次氯酸鈉(日本Junsei)對外植體消毒。材料接種于MD201培養(yǎng)基(WPM+4.0?g·L-1瓊脂+20?g·L-1蔗糖+1?mg·L-1毒莠定+1?mg·L-16-BA),并于黑暗條件培養(yǎng)7?d。

        1.2.4?實(shí)時(shí)熒光定量對水曲柳不同部位及瞬時(shí)侵染植株中FmPHV和相關(guān)基因表達(dá)量分析?以水曲柳微管蛋白基因Tu作為內(nèi)參基因(Livak?et?al.,2001),引物見表2。PCR反應(yīng)體系如下:10?μL?Master?Mix,2?μL模板cDNA,10?μmol·L-1的正反向引物各1?μL,用ddH2O補(bǔ)足至20?μL。擴(kuò)增反應(yīng)利用Applied?Biosystems7500熒光定量PCR儀進(jìn)行,反應(yīng)程序:95??℃30?s、95??℃5?s、60??℃?34?s(共40個(gè)循環(huán))、95??℃15?s、60??℃1?min、95??℃15?s。每份樣品進(jìn)行3次重復(fù)。目標(biāo)基因表達(dá)水平運(yùn)用相對定量的2-ΔΔCt(Livak?et?al.,2001)進(jìn)行計(jì)算,式中:Ct是熱循環(huán)儀檢測到反應(yīng)體系中熒光信號的強(qiáng)度值。

        2?結(jié)果與分析

        2.1?FmPHV基因全長克隆與序列分析

        以水曲柳實(shí)生苗全株的cDNA為模板進(jìn)行PCR反應(yīng)擴(kuò)增,獲得一條大小為2?100?bp左右的片段,擴(kuò)增結(jié)果見圖1。經(jīng)測序,通過NCBI數(shù)據(jù)庫blastn比對,確定獲得水曲柳PHV基因序列,并命名為FmPHV。FmPHV基因的開放閱讀框全長為2?112?bp,編碼了703個(gè)氨基酸(圖2)。經(jīng)過比對,與油橄欖(Olea?europaea)OeATHB14基因核苷酸序列(XM_023011038.1)的一致性為99%;與芝麻(Sesamum?indicum)SiATHB14基因核苷酸序列(XM_011098376.2)?的一致性為99%;與煙草(Nicotiana?tabacum)?NtPHV基因核苷酸序列?(JQ686932.1)的一致性為94%。所以我們確定水曲柳中該基因?yàn)镠D-ZIP?Ⅲ轉(zhuǎn)錄因子家族成員PHV,并命名為FmPHV。

        2.2?FmPHV蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析

        2.2.1?FmPHV蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)分析?利用ProtParam工具在線分析,F(xiàn)mPHV編碼703個(gè)氨基酸,相對分子質(zhì)量為76.89?kD,等電點(diǎn)(pI)為6.27,不穩(wěn)定系數(shù)為55.08,確定為不穩(wěn)定蛋白(不穩(wěn)定系數(shù)大于40時(shí),預(yù)測蛋白質(zhì)不穩(wěn)定,反之則穩(wěn)定)。FmPHV蛋白的親水/疏水性分析結(jié)果表明,F(xiàn)mPHV蛋白平均親水系數(shù)(GRAVY)為-0.182,為親水蛋白。此外,F(xiàn)mPHV蛋白親疏水性圖譜顯示,F(xiàn)mPHV蛋白共有47個(gè)疏水區(qū)和59個(gè)親水區(qū)(圖3:A)(>0.5區(qū)域?yàn)槭杷畢^(qū),<-0.5區(qū)域?yàn)橛H水區(qū),介于+0.5~-0.5之間主要為兩性區(qū)域)??缒そY(jié)構(gòu)域預(yù)測結(jié)果表明,F(xiàn)mPHV存在兩個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)區(qū)域,分別在453~471?bp氨基酸序列片段上存在從里到外的跨膜結(jié)構(gòu)區(qū)域,以及445~467?bp氨基酸序列片段上存在的從外到里的跨膜結(jié)構(gòu)區(qū)域,分?jǐn)?shù)分別為889和515(分?jǐn)?shù)>500為顯著跨膜結(jié)構(gòu)),由內(nèi)到外與由外到內(nèi)的跨膜結(jié)構(gòu)域基本重合,并且都有強(qiáng)烈的跨膜螺旋結(jié)構(gòu),由此可推斷,F(xiàn)mPHV蛋白既可以具有由外到內(nèi)的跨膜能力,也具有由內(nèi)到外的跨膜能力(圖3:B)。信號肽預(yù)測結(jié)果表明,F(xiàn)mPHV蛋白可能不存在信號肽,我們認(rèn)為該蛋白為非分泌蛋白。利用WOLFPSORT預(yù)測FmPHV亞細(xì)胞定位,結(jié)果表明,F(xiàn)mPHV主要分布在葉綠體中,占57.14%,其次分布在細(xì)胞核中,占28.57%,少部分分布于囊泡中,占4.28%。

        2.2.2?FmPHV蛋白的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測?利用SOPMA在線工具分析FmPHV蛋白的二級結(jié)構(gòu)組成,結(jié)果顯示蛋白二級結(jié)構(gòu)主要由43.67%(307?aa)的無規(guī)卷曲(random?coil)、36.84%(259?aa)的α螺旋結(jié)構(gòu)(alpha?helix)、14.51%(102?aa)的擴(kuò)展長鏈(extended?chain)、4.98%(35?aa)的β轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu)(beta?turn)構(gòu)成(圖4)。

        2.2.3?FmPHV蛋白氨基酸序列比對及保守結(jié)構(gòu)域的預(yù)測?分別以FmPHV蛋白的氨基酸序列為基礎(chǔ),在NCBI數(shù)據(jù)庫中檢索與水曲柳FmPHV蛋白同源性較高的其他物種的氨基酸序列進(jìn)行比對。包括油橄欖(Olea?europaea)、可可(Theobroma?cacao)、木薯(Manihot?esculenta)、胡桃(Juglans?regia)、煙草(Nicotiana?tabacum)、芝麻(Sesamum?indicum)、紫花風(fēng)鈴(Handroanthus?impetiginosus)、紫瓶子草(Sarracenia?purpurea)、細(xì)葉石竹(Nicotiana?sylvestris)、牽牛(Ipomoea?nil)、綠豆(Vigna?radiata?var.?radiata)、大豆(Glycine?max)、水蜜桃(Prunus?persica)、甜櫻桃(Prunus?avium)、馬鈴薯(Solanum?tuberosum)、長蒴黃麻(Corchorus?olitorius)、亮葉樺(Betula?luminifera)、土瓶草(Cephalotus?follicularis)、柑橘(Citrus?sinensis)、中粒咖啡(Coffea?canephora)。采用MEGA7.0.2中的NJ方法構(gòu)建蛋白的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹,結(jié)果顯示進(jìn)化樹聚為兩組,其中水曲柳FmPHV與同屬木犀科的油橄欖OeATHB14親緣關(guān)系最為緊密(圖5)。

        利用在線多序列比對軟件PRALINE對FmPHV蛋白序列與NCBI數(shù)據(jù)庫中一些其他物種的PHV蛋白序列進(jìn)行同源性比較,結(jié)果表明,F(xiàn)mPHV與其他PHV(ATHB14)蛋白序列的保守區(qū)主要集中在3個(gè)結(jié)構(gòu)域,分別為HD、b-ZIP和START結(jié)構(gòu)域(圖6)。包括油橄欖(Olea?europaea)(XP_022866806.1)、野生煙草(Nicotiana?attenuata)(XP_009612342.1)、可可(Theobroma?cacao)(EOY25496.1)、芝麻(Sesamum?indicum)(XP_020554026.1)、?中??Х?(Coffea?canephora)灰色陰影區(qū)域?yàn)镠D結(jié)構(gòu)域;下橫線區(qū)域?yàn)閎-ZIP結(jié)構(gòu)域;直角框內(nèi)為START結(jié)構(gòu)域;“*”代表終止密碼子。

        Gray?shadow?region?is?the?HD?domain;?the?lower?horizontal?line?is?the?b-ZIP?domain;right?angle?box?is?the?START?domain;“*”?represents?the?stop?codon.(CDP17314.1)、葡萄(Vitis?vinifera)(RVW23993.1)的PHV(ATHB14)氨基酸序列蛋白高度一致。

        2.3?水曲柳形成層愈傷組織的獲得及培養(yǎng)

        2.3.1水曲柳形成層愈傷組織的獲得?獲得水曲柳無菌莖段外植體后,為達(dá)到分離韌皮部和形成層的目的,使用50?mg·L-1的高濃度IBA(indole-3-butytric?acid)溶液,在4??℃條件下對已與木質(zhì)部分離的其他部分處理20?h后,將材料放入0.5?mg·L-1IBA低滲溶液中處理15?min。之后將莖段置于MD201培養(yǎng)基(WPM+4.0?g·L-1瓊脂+20?g·L-1蔗糖+1?mg·L-1毒莠定+1?mg·L-16-BA)中暗培養(yǎng)7?d后,取出,將木質(zhì)部完全去除后將靠近韌皮部一側(cè)置于MD201培養(yǎng)基上,暗培養(yǎng)7?d后即獲得水曲柳形成層愈傷組織,如圖7所示。從左至右分別為一年生樹皮形成層愈傷組織(部分整齊排列的致密白色松散細(xì)胞團(tuán))、一年生樹皮韌皮部愈傷組織(隨機(jī)分布的偏綠色松散細(xì)胞團(tuán))、多年生樹皮形成層愈傷組織(整齊排列的致密白色松散細(xì)胞團(tuán))、二年生樹皮韌皮部愈傷組織(不啟動(dòng))。

        2.3.2水曲柳形成層愈傷組織的培養(yǎng)?實(shí)驗(yàn)為形成層愈傷組織繼代培養(yǎng)選擇了WPM、B5、MSB5三種培養(yǎng)基進(jìn)行繼代培養(yǎng)基優(yōu)化,同時(shí)對形成層愈傷組織和普通皮層愈傷組織的生長量進(jìn)行了比較(圖8)。

        實(shí)驗(yàn)選取WPM、1/2?WPM、B5、MSB5四種培養(yǎng)基對水曲柳形成層愈傷組織進(jìn)行繼代培養(yǎng),其中B5培養(yǎng)基中材料出現(xiàn)不同程度的褐化,兩次繼代后材料死亡,在1/2?WPM培養(yǎng)基中材料長勢緩慢,在褐化情況出現(xiàn)之前死亡。MSB5培養(yǎng)基中材料長勢迅速升高,但隨即材料排出大量多酚,2~3?d后死亡。我們初步判斷,水曲柳形成層愈傷組織不適應(yīng)富含豐富有機(jī)物質(zhì)的培養(yǎng)基。WPM培養(yǎng)基中材料生長勢雖然不如MSB5培養(yǎng)基,但是生長狀態(tài)良好,顯微鏡下觀察到松散細(xì)胞團(tuán),繼代周期為21?d(圖8:A,C)。

        在對形成層愈傷組織和樹皮愈傷組織在WPM培養(yǎng)基中進(jìn)行繼代20?d左右后,觀察到極少數(shù)樹皮邊緣處出現(xiàn)與形成層愈傷組織完全不同的乳黃色團(tuán)狀緊密愈傷組織(圖8:B)。本實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步對兩種愈傷組織的生長量進(jìn)行統(tǒng)計(jì)(圖8:C)。結(jié)果表明,形成層愈傷組織的啟動(dòng)周期顯著優(yōu)于樹皮愈傷組織,并且前者的生長量是后者的4倍之多。

        由于水曲柳形成層愈傷組織具有生長迅速,細(xì)胞團(tuán)處于松散易分離狀態(tài)等類似于胚性細(xì)胞的優(yōu)良特性,我們決定通過探究芽再生關(guān)鍵基因FmPHV在其中的表達(dá)情況,為水曲柳芽再生體系的建立奠定基礎(chǔ)。

        2.4?FmPHV基因的表達(dá)分析

        2.4.1?FmPHV基因在水曲柳中表達(dá)分析?分別取實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)的水曲柳愈傷組織和水曲柳種子組培培養(yǎng)30?d的幼苗。根、莖、葉取自水曲柳3年生盆栽苗。5月—9月混合樣(包括根,莖,葉)及雄花雌花取自野生多年生水曲柳,以及以形成層為來源的形成層愈傷組織(圖9:A,B,C)。

        對水曲柳FmPHV基因在不同部位中定量表達(dá)分析結(jié)果表明(圖9:B),該基因在芽中高度表達(dá),而在其他組織中根、莖、葉、花以及種子中的表達(dá)量普遍不高。形成層愈傷組織中FmPHV基因的表達(dá)量是普通培養(yǎng)愈傷組織表達(dá)量的22.35倍,說明FmPHV對調(diào)控形成層的愈傷組織形成起到了重要作用。

        水曲柳快速生長期為每年的5月—9月,5月復(fù)蘇,6月萌芽,同時(shí)FmPHV表達(dá)量在6月達(dá)到最高,在9月表達(dá)量最低,6月表達(dá)量是9月的29.738倍(圖9:A)。可以推測該基因在水曲柳芽發(fā)生階段發(fā)揮著正調(diào)控作用。同時(shí)形成層愈傷組織中該基因特異性高表達(dá),推測該種愈傷組織具有芽再生潛力,可以作為水曲柳再生體系建立材料的來源。

        為進(jìn)一步證明FmPHV在芽再生過程中的正向作用,分別選取水曲柳種子萌發(fā)過程中0、2、4、6、8、10、12以及14?d的實(shí)生苗作為實(shí)驗(yàn)材料,對水曲柳種子萌發(fā)過程中的FmPHV表達(dá)情況進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析(圖9:C)。結(jié)果表明,在種子萌發(fā)過程中,F(xiàn)mPHV在第2天和第8天分別達(dá)到兩個(gè)峰值,分別是第0天的11.379倍和10.236倍。在芽再生過程中,關(guān)鍵基因的表達(dá)模式被發(fā)現(xiàn)為兩次峰值出現(xiàn)的現(xiàn)象,而這兩次峰值分別與水曲柳種子芽的發(fā)生階段和芽伸長階段相互對應(yīng)。FmPHV基因的表達(dá)與水曲柳,進(jìn)一步說明該基因在芽再生過程中的重要作用。

        2.4.2?FmPHV瞬時(shí)侵染水曲柳對芽再生通路基因表達(dá)的影響?前人的研究表明,PHV(ATHB14)受到包括WOX5,細(xì)胞分裂素通路相關(guān)的AHP6和生長素通路相關(guān)的YUC5等生長素以及細(xì)胞分裂素多個(gè)通路的關(guān)鍵基因的調(diào)控,此外,PHV能夠進(jìn)一步調(diào)控細(xì)胞維持與芽再生過程的重要基因,包括ARR1,ARR2,WIND1,ESR2以及WUS等(圖10:A)。為了揭示水曲柳中FmPHV對下游基因的調(diào)控關(guān)系,我們應(yīng)用35S:PHV-GFP過表達(dá)載體,對水曲柳實(shí)生苗進(jìn)行瞬時(shí)過表達(dá)實(shí)驗(yàn)。

        結(jié)果表明,瞬時(shí)過表達(dá)后,F(xiàn)mPHV表達(dá)量顯著提高,而FmPHV下游基因AHP6,ZPR3和MP呈現(xiàn)出顯著的下調(diào)表達(dá),與之對應(yīng)的是,包括ARR2,WOX5,ESR2,YUC和WUS?等基因表達(dá)量呈現(xiàn)出不同程度的升高(圖10:B)。值得注意的是通路中受PHV直接抑制的YUC表達(dá)量輕微上調(diào)現(xiàn)象,我們認(rèn)為PHV可能分別通過不同通路直接或間接地抑制生長素的積累。同樣引起我們注意的還有,與HD-ZIP?Ⅲ轉(zhuǎn)錄因子家族存在共同作用的B型ARRs家族成員ARR2的高表達(dá)情況,HD-ZIP?Ⅲ-B型ARRs復(fù)合物與WUS啟動(dòng)子結(jié)合,并起到進(jìn)一步激活WUS啟動(dòng)的重要作用。同時(shí)受PHV直接負(fù)調(diào)控和通過細(xì)胞分裂素間接調(diào)控等多種通路同時(shí)抑制的AHP6的低表達(dá),以及受生長素直接調(diào)控的MP的低表達(dá),我們認(rèn)為這表明在PHV高表達(dá)后,存在生長素表達(dá)水平下降,細(xì)胞分裂素表達(dá)水平上升的現(xiàn)象,這種變化在細(xì)胞微環(huán)境中更利于芽分化。

        3?討論與結(jié)論

        本研究通過生物軟件,對FmPHV蛋白進(jìn)行了預(yù)測和生物信息學(xué)分析。經(jīng)預(yù)測分析結(jié)果表明FmPHV蛋白為穩(wěn)定親水蛋白,亞細(xì)胞分析表明,其可能主要存在于葉綠體中。通過對?FmPHV蛋白進(jìn)行的結(jié)構(gòu)域分析,表明了FmPHV蛋白有一個(gè)保守START結(jié)構(gòu)域以及C末端序列高度保守氨基酸序列。與Ursache?et?al.(2014)的研究結(jié)果類似,

        PHV基因編碼植物特有的b-ZIP類轉(zhuǎn)錄因子,通過接受相關(guān)靶基因的調(diào)控或者蛋白之間的互作而發(fā)揮著重要的調(diào)控功能。

        將FmPHV的氨基酸序列應(yīng)用NCBI網(wǎng)站的Blastp進(jìn)行比對,比對結(jié)果表明,F(xiàn)mPHV蛋白與油橄欖、芝麻、煙草、馬鈴薯、番茄、葡萄、毛果楊、蓖麻、可可、擬南芥等物種的對應(yīng)蛋白的同源性較高。同時(shí)應(yīng)用比對結(jié)果構(gòu)建了系統(tǒng)進(jìn)化樹。進(jìn)化樹表明,水曲柳FmPHV?蛋白與同科同屬植物油橄欖中的同源蛋白在進(jìn)化上親緣關(guān)系較近。

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        (責(zé)任編輯?周翠鳴)

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