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        利用CHD基因鑒定鴿子性別的研究

        2020-08-14 06:23:42王玲彩董萌萌王青杭柏林劉保國胡建和趙坤徐彥召
        畜牧與獸醫(yī) 2020年8期
        關鍵詞:雄性條帶鴿子

        王玲彩,董萌萌,王青,杭柏林,劉保國,胡建和,趙坤,徐彥召

        (河南科技學院動物科技學院,河南 新鄉(xiāng) 453003)

        鴿子屬于單態(tài)性鳥類,其性別(尤其是在幼鳥時期)在外貌行為上都很難做出判別。和其他鳥類或家禽相比,鴿子屬于“一夫一妻”制的鳥類[1],在性成熟以后,會有選擇性的尋找配偶,配對成功就不再接受其他異性。但這一特性在實際生產(chǎn)中也成為了一種制約,對產(chǎn)業(yè)化的飼養(yǎng)管理和繁殖育種是極為不利的。因此如何能快速鑒別出鴿子性別就顯得尤為重要。以前,鑒別鴿子性別,多采用一些傳統(tǒng)方法,如觀察鴿子外形、叫聲、腹腔鏡檢查、染色體分析、測定糞便中雌激素與睪酮的比例等方法[2~3]。以上方法雖然也能辨別出鴿子性別,但往往存在準確性不高、操作復雜、成本高昂、對動物傷害較大等缺點,目前應用最多的是利用分子手段對鴿子進行性別鑒定[4],為鴿子的產(chǎn)業(yè)化養(yǎng)殖奠定了技術基礎。

        許多研究表明,鴿子的性別是由Z染色體和W染色體決定的,其中ZZ為雄性,ZW為雌性[1,5]。目前,鑒別鴿子性別應用最多的是CHD基因,原因在于它的進化速率緩慢且保守[6]。CHD-Z和CHD-W為CHD基因在非平胸鳥類中的2個同源拷貝,其外顯子在序列和大小上極其相似,而內(nèi)含子的長度卻相差很大[7],由此導致該基因在2條性染色體上的長度也不同,證明了利用CHD基因能夠準確地對鴿子進行雌雄鑒定[8]。因此,根據(jù)內(nèi)含子兩側(cè)的保守序列來設計特異性引物,對CHD基因片段進行特異性的擴增,即可實現(xiàn)對鴿子的性別鑒定。

        本試驗通過血液樣本提取鴿子的基因組基因,利用2550F/2718R引物,對CHD基因的特異性片段進行擴增,并將PCR產(chǎn)物純化后回收目的片段,回收片段與VecterPMD-19T相連接,然后轉(zhuǎn)入感受態(tài)細胞,對轉(zhuǎn)入后的菌液進行PCR鑒定,并將呈陽性的克隆進行序列測定,通過DNASTAR進行序列比對,從而獲得了鴿子CHD基因的具體序列,增加了性別鑒定試驗的準確性。

        試驗在對PCR程序的退火溫度進行優(yōu)化的過程中,發(fā)現(xiàn)雌性鴿子600 bp處條帶易受PCR退火溫度影響,而400 bp處條帶穩(wěn)定,或也可作為鴿子性別鑒定的一種方法。

        1 材料與方法

        1.1 血液樣本與主要試劑

        血液樣本采自河南某鴿場。取已知性別的2羽雄鴿和2羽雌鴿,分別采集翅下靜脈血100~200 μL;隨機取23羽性別未知的健康雛鴿,分別采集翅下靜脈血100~200 μL,用于性別鑒定。采集好的血液樣本均用抗凝劑處理,-20 ℃冷凍保存。

        血液基因組DNA提取試劑和抗凝劑為本實驗室自制,PCR產(chǎn)物純化回收試劑盒購自新鄉(xiāng)智寶科儀儀器有限公司,2×TaqPCR Master Mix購自康為世紀生物科技有限公司,DL-2000 DNA Marker購自北京百泰克生物技術有限公司。

        1.2 鴿子基因組DNA提取與質(zhì)量檢測

        取鴿子全血,加入適量抗凝劑,獲得鴿子抗凝血;將100 μL鴿子抗凝血加入250 μL裂解液中,用渦旋儀充分混勻,于58 ℃水浴鍋中放置20~30 min,獲得鴿子裂解血;將鴿子裂解血加入600 μL分離液中,渦旋混勻,于76 ℃水浴鍋中放置20~30 min后,以4 000 r/min離心分離10~15 min,取200 μL上清液轉(zhuǎn)移到另一干凈EP管中,獲得鴿子分離血;在鴿子分離血中加入400 μL析出液,以4 000 r/min離心分離1~2 min,留沉淀,加入600 μL洗滌液后渦旋混勻,獲得鴿子初級DNA提取液;將鴿子初級DNA提取液于4 000 r/min離心機中離心分離1~2 min;小心棄上清,收集沉淀室溫干燥,加入30~50 μL ddH2O溶解沉淀,即得鴿子DNA提取液。使用紫外分光光度計對DNA的濃度進行測定,并通過分析OD260/OD280比值來判斷DNA的純度。

        1.3 設計與合成引物

        根據(jù)文獻報道,選擇1對引物[6]。引物是由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,上游引物為2550F:5′-GTTACTGATTCGTCTACGAGA-3′;下游引物為2718R:5′-ATTGAAATGATCCAGTGCTTG-3′。引物進行PCR擴增,擴增1條帶為雄性,擴增2條帶則為雌性。

        1.4 已知性別鴿子的PCR擴增

        用1.2所提取的DNA(已知鴿子性別)為模板,2550F、2718R為引物進行擴增。

        PCR反應體系:體積為20 μL。2×TaqPCR Master Mix 10 μL,ddH2O 7 μL,上游引物1 μL,下游引物1 μL,待檢菌液1 μL。

        PCR反應程序:95 ℃預變性3 min;95 ℃變性30 s,51 ℃退火30 s,72 ℃延伸45 s,共39個循環(huán);72 ℃終延伸8 min。取PCR產(chǎn)物5 μL進行1%瓊脂糖凝膠電泳檢測。

        1.5 未知性別鴿子的PCR擴增

        用1.2所提取的DNA(未知鴿子性別)為模板,2550F、2718R為引物進行擴增。PCR反應體系與程序如1.4,反應結(jié)束后取PCR產(chǎn)物5 μL,進行1%瓊脂糖凝膠電泳檢測。

        1.6 不同退火溫度對雌雄鴿子條帶的影響

        其他反應條件相同的情況下,將退火溫度設為49~59 ℃進行梯度PCR反應。取5 μL PCR擴增產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠進行電泳檢測,并進行結(jié)果分析。

        1.7 性腺觀察與PCR檢測的比對分析

        取1.5中進行PCR擴增的鴿子進行解剖并觀察性腺,發(fā)現(xiàn)睪丸為雄性,發(fā)現(xiàn)卵巢、輸卵管則為雌性;最后,將通過PCR進行性別鑒定的結(jié)果,與解剖后觀察性腺得到的性別結(jié)果作比較,以此來驗證采用PCR方法的準確性。

        1.8 PCR產(chǎn)物克隆、測序及比對分析

        分別取雌、雄鴿子的DNA各1條作為模板進行反應。PCR反應體系50 μL,包含2×TaqPCR Master Mix 25 μL,上下游引物各 1 μL,模板 1 μL,ddH2O 22 μL。PCR反應條件與1.4中相同。取擴增產(chǎn)物,經(jīng)1%的瓊脂糖凝膠電泳30 min,用凝膠成像儀進行拍照記錄。將雌、雄鴿子PCR產(chǎn)物分別進行切膠,隨后將目的片段用DNA純化回收試劑盒進行純化回收,用回收產(chǎn)物與VectoerPMD-19T相連接,然后轉(zhuǎn)入E.coliK12感受態(tài)細胞,將轉(zhuǎn)化后的菌液用三角涂布棒均勻的涂布在含有氨芐青霉素的LB固體培養(yǎng)基上,于37 ℃恒溫培養(yǎng)箱中過夜培養(yǎng);次日挑取單克隆于空白LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃、180 r/min培養(yǎng)6 h,隨后將培養(yǎng)的菌液進行PCR鑒定并將陽性克隆送往生工生物工程(上海)股份有限公司進行序列測定,并通過DNASTAR軟件將所獲序列在Blast中進行序列比對。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 已知性別的鴿子PCR擴增

        對已知性別的鴿子進行PCR擴增,結(jié)果見圖1。鴿子血液樣品進行PCR擴增后,雄性個體在600 bp左右出有1條亮帶,而雌性個體有2條亮帶,分別在約400 bp和約600 bp處。

        2.2 未知性別的鴿子PCR擴增

        對23羽未知性別鴿子進行PCR擴增,結(jié)果見圖2。所有雄性個體均顯示為1條帶,而雌性個體均為2條帶。

        M.DL2000 Marker;1、2. 雄性鴿子DNA;3、4. 雌鴿子DNA;5. 空白對照圖1 已知性別鴿子CHD基因的PCR擴增

        M.DL2000 Marker;1~23. 性別未知鴿子DNA;24. 空白對照;2條帶者為雌鴿,1條帶者為雄鴿圖2 性別未知鴿子CHD基因的PCR擴增

        2.3 不同退火溫度對雌雄鴿子條帶的影響

        在對退火溫度優(yōu)化的過程中,發(fā)現(xiàn)在600 bp處,雌鴿子的條帶較雄鴿子的條帶更易受退火溫度影響,而雌鴿400 bp處條帶則未受影響,如圖3所示。

        2.4 性腺觀察與PCR檢測的比對分析

        取經(jīng)過PCR鑒定的23羽鴿子進行解剖,發(fā)現(xiàn)白色睪丸(圖4右箭頭所示)為雄性,發(fā)現(xiàn)卵巢、輸卵管(圖4左箭頭所示)則為雌性;這23羽鴿子中,雄性為14羽,雌性為9羽。將解剖結(jié)果與PCR檢測結(jié)果逐一對比,結(jié)果顯示,通過PCR進行性別鑒定的結(jié)果與解剖后觀察性腺得到的結(jié)果完全一致,其準確率100%。23羽鴿子性別PCR檢測結(jié)果和解剖結(jié)果對比見表1,該對比結(jié)果與預測結(jié)果完全一致,達到早期判定鴿子性別的目的。

        M.DL2000 Marker; 1~6. 依次為雌鴿在49~59 ℃時的擴增;7~12. 依次為雄性鴿子在49~59 ℃時的擴增圖3 梯度PCR擴增

        圖4 雌雄鴿子解剖圖

        表1 23羽鴿性別PCR擴增結(jié)果和解剖檢查結(jié)果的比較

        2.5 PCR產(chǎn)物克隆、測序及比對分析

        測序結(jié)果顯示,雌、雄鴿子PCR擴增產(chǎn)物的回收片段,成功地與VectoerPMD-19T連接,測序峰如圖5所示。將所測序列進行Blast,發(fā)現(xiàn)含有CHD-Z、CHD-W基因。通過去掉序列中的VectoerPMD-19T片段,分別獲得雌、雄鴿子各個片段的具體序列,其中:雄鴿只有1條帶,長度為657 bp;雌鴿為2條帶,長度分別為449 bp和657 bp。

        A.雄鴿600 bp片段;B.雌鴿400 bp片段;C.雌鴿600 bp片段圖5 PCR產(chǎn)物測序峰圖

        3 討論

        鴿子是單態(tài)性鳥類,即雌雄同型,即使在性成熟后,也很難從外觀上區(qū)別出雌雄。而一般家禽,如雞、鴨、鵝等,出生即可以通過翻肛鑒定性別,且準確率高,已經(jīng)在養(yǎng)禽業(yè)中廣泛應用[9]。鴿子作為晚成鳥,不能像一般家禽那樣進行性別鑒定,只能等到5月齡左右才可以鑒定性別,而在平常的養(yǎng)殖過程中,不同用途鴿子的飼養(yǎng)成本也是不同的。如果能盡早鑒定出性別,多余的雄鴿就可以作為乳鴿上市,可以很大程度上節(jié)約飼養(yǎng)成本,提高經(jīng)濟效益[10-11]。

        由于鳥類血液中紅細胞含有細胞核,血液中DNA的量比哺乳動物要多,因此國內(nèi)大部分家禽分子研究多采用采血的方法[12]。本試驗采用一種鴿子全血簡便快速DNA提取方法,成功提取了鴿子基因組DNA,該方法不僅簡便易操作,而且試驗成本低廉,并且試驗過程中沒有使用氯仿、酚等有毒、有害的有機溶劑,與傳統(tǒng)的苯酚-氯仿法提取DNA相比,更安全環(huán)保。

        由于CHD基因進化速率慢,對于非平胸鳥類非常保守[6],隨后此基因被廣泛應用于非平胸鳥類性別的分子學鑒定。近年來,許多學者都利用CHD基因成功的對非平胸鳥類進行性別鑒定,不僅過程簡便,而且結(jié)果可靠。本試驗通過PCR技術,對CHD基因進行特異性擴增,成功的鑒定出鴿子性別,這與呂夕超等[1]和張莉等[11]的研究結(jié)果一致。在PCR擴增的基礎上,對獲取的PCR產(chǎn)物進行克隆、測序和序列比對,獲得雌雄鴿子CHD基因各個片段的具體序列,進一步確證了性別分子鑒定方法的有效性和準確性。

        本試驗通過對PCR退火溫度的優(yōu)化,發(fā)現(xiàn)雌性鴿子600 bp處的條帶易受退火溫度影響,400 bp處的條帶則較為穩(wěn)定;雄性鴿子600 bp處的條帶在一定范圍內(nèi),退火溫度對其并無影響。雌鴿子和雄鴿子在一定退火溫度下,所擴增的條帶存在差異性,不一定表現(xiàn)為雌鴿2條帶、雄鴿1條帶,也可均為1條帶:400 bp處擴增出條帶即為雌鴿,600 bp處擴增出條帶即為雄鴿。研究結(jié)果為鴿子性別的分子學鑒定提供了一種新的參考。

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