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        柱芳烴與稀有氣體分子間相互作用的理論研究*

        2020-08-12 11:09:16
        廣州化工 2020年14期
        關(guān)鍵詞:主客體結(jié)合能色散

        孫 濤

        (貴州大學(xué)網(wǎng)絡(luò)與信息化管理中心,貴州省高性能計(jì)算化學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,貴州 貴陽 550025)

        最近幾年,稀有氣體(Ng)主客體復(fù)合物發(fā)展迅速,許多研究者已經(jīng)從理論計(jì)算和實(shí)驗(yàn)上研究稀有氣體的主客體復(fù)合物。Frenking等[1]通過理論計(jì)算發(fā)現(xiàn)在C60內(nèi),Xe-Xe 能夠形成共價(jià)鍵,而He-He 和Ne-Ne之間為弱非鍵相互作用。Chattaraj等使用密度泛函(DFT)方法,從結(jié)合能、解離能和焓變研究了六元瓜環(huán)(cucurbit[6]uril,CB[6])與Ne、Ar、Kr分子間相互作用,結(jié)果表明CB[6]可以與3個(gè)Ne原子形成主客體復(fù)合物,經(jīng)零點(diǎn)能校正后,解離能在3.4~4.1 kcal/mol之間;而CB[6]只能與1個(gè)Ar或1個(gè)Kr形成復(fù)合物[2]。柱芳烴是冠醚、環(huán)糊精、杯芳烴和葫蘆脲后一類新型的大環(huán)化合物,由于其結(jié)構(gòu)獨(dú)特和優(yōu)異的主客體化學(xué)已逐漸成為超分子化學(xué)研究和發(fā)展的熱點(diǎn)之一[3]。

        稀有氣體與C6H6之間存在弱的非鍵相互作用[4],而甲基柱[5]芳烴5個(gè)苯環(huán)單元,甲基柱[5]芳烴的靜電勢如圖1所示,分子靜電勢圖能更直觀地反映出原子荷電的情況,其紅色區(qū)域表示負(fù)電區(qū),藍(lán)色區(qū)域表示正電區(qū),電子聚集在柱芳烴腔內(nèi)苯環(huán)和端基氧區(qū)域。柱芳烴與稀有氣體能否以非鍵相互作用形成主客體復(fù)合物,如果二者之間能形成主客體復(fù)合物,結(jié)合能是多大?二者的相互作用是靜電占主導(dǎo),還是色散占主導(dǎo)?因此本文應(yīng)用量子化學(xué)計(jì)算方法研究MeP5…Ng(Ng=He、Ne、Ar、Kr、Xe)復(fù)合物分子間非鍵相互作用,計(jì)算其結(jié)合能,并分析其相互作用本質(zhì)。

        圖1 MeP5分子靜電勢圖

        1 計(jì)算方法

        Head-Gordon發(fā)展的雜化泛函ωB97X-V[5]在計(jì)算分子間非鍵相互作用結(jié)果較準(zhǔn)確,為了驗(yàn)證該方法是否適合計(jì)算MeP5…Ng(Ng=He、Ne、Ar、Kr、Xe)。將MeP5…Ar復(fù)合物的柱芳烴進(jìn)行裁剪,如圖2所示。首先垂直移動Ar,距離C10H14O2苯環(huán)平面在3.2~4.0 ?之間;找到Ar距C10H14O2的平面穩(wěn)定距離為3.4 ?,保持該距離,水平向外移動Ar。使用ωB97X-V/def2-svpd[6]計(jì)算C10H14O2…Ar復(fù)合物的結(jié)合能,并與金標(biāo)準(zhǔn)的CCSD(T)/CBS(計(jì)算方法如公式1) 作比較,探討ωB97X-V的可靠性。C10H14O2…Ar復(fù)合物計(jì)算結(jié)果如圖3所示。

        (1)

        圖2 C10H14O2…Ar 俯視和側(cè)面圖

        圖3 ωB97X-V/def2-svpd與CCSD(T)/CBS的計(jì)算結(jié)果

        由圖3可以看出,ωB97X-V/def2-SVPD與CCSD(T)/CBS計(jì)算結(jié)果相差不大,而且變化趨勢也一致,因此使用ωB97X-V/def2-SVPD進(jìn)行幾何結(jié)構(gòu)和結(jié)合能計(jì)算。使用Boys和Bernardi完全均衡校正法[7]進(jìn)行基函數(shù)重疊誤差(BSSE)校正后計(jì)算其結(jié)合能(E)。為了探討其相互作用本質(zhì),使用ALMO-EDA(Energy decomposition analysis based on absolutely-localized molecular orbitals)方法[8-9],對MeP5…Ng(Ng=He, Ne, Ar, Kr, Xe)分子間相互作用進(jìn)行能量分解分析,將結(jié)合能分解為“凍結(jié)密度”項(xiàng)EFRZ、極化項(xiàng)EPol和電荷轉(zhuǎn)移項(xiàng)ECT。凍結(jié)能量項(xiàng)進(jìn)一步分解為靜電能EElec、Pauli排斥EPauli和色散能EDisp。所有的計(jì)算工作在貴州省高性能計(jì)算化學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和貴州大學(xué)云計(jì)算平臺完成。

        2 結(jié)果與討論

        2.1 幾何結(jié)構(gòu)和結(jié)合能

        在ωB97X-V/def2-SVPD水平,對MeP5…Ng(Ng=He, Ne, Ar, Kr, Xe)體系的復(fù)合物幾何結(jié)構(gòu)進(jìn)行優(yōu)化,得到平衡結(jié)構(gòu)如圖4所示,在MeP5…Ng(Ng=He, Ne, Ar, Kr, Xe)體系的復(fù)合物中,稀有氣體在柱芳烴的空腔內(nèi),稀有氣體Ng到柱芳烴MeP5底部平面的距離在3.09~4.04 ?之間,隨著原子序數(shù)的增加,R逐漸變長,到Kr后不再改變,這是因?yàn)镵r,Xe均在MeP5的中心點(diǎn),二者均為4.04 ?。復(fù)合物中分子間主要存在眾多的Ng…π相互作用,結(jié)合能在-1.01~-11.20 kcal/mol,其相互作用能遠(yuǎn)大于C6H6…Ng(Ng=He, Ne, Ar, Kr, Xe)[4]。Ng(Ng=He, Ne)原子半徑較小,MeP5空腔半徑較大,在MeP5空腔內(nèi)偏向一側(cè),結(jié)合能也相對較小,理論計(jì)算表明MeP5還可以容納兩個(gè)Ng(Ng=He, Ne)原子。

        圖4 MeP5…Ng(Ng=He、Ne、Ar、Kr、Xe)的俯視和側(cè)面圖

        表1 MeP5…Ng(Ng= He, Ne, Ar, Kr, Xe)的結(jié)合能

        2.2 ALMO-EDA計(jì)算

        使用ALMO-EDA對MeP5…Ng(Ng= He, Ne, Ar, Kr, Xe)的結(jié)合能進(jìn)行能量分解分析,結(jié)果見表2,因Xe使用了ECP,目前還不能得到靜電項(xiàng)和Pauli排斥。ALMO-EDA計(jì)算結(jié)果表明EElec、EDisp、EPol和ECT(MeP5…Ne為排斥作用)都是吸引作用,而Pauli排斥能EPauli是排斥作用,對于MeP5…Ng(Ng=He, Ne, Ar, Kr, Xe)復(fù)合物,色散能起主導(dǎo)作用,約占總吸引作用的57%~73%,極化項(xiàng)和電荷轉(zhuǎn)移能約占總吸引相互作用的3%左右(MeP5…He約為11%)。隨著原子序數(shù)的增加,色散能所占比例也有遞增的趨勢。在能量分解項(xiàng)中,色散能遠(yuǎn)大于靜電能,起主導(dǎo)作用。

        表2 MeP5…Ng(Ng= He, Ne, Ar, Kr, Xe)復(fù)合物ALMO-EDA相互作用能及其各作用項(xiàng)

        3 結(jié) 語

        密度泛函理論ωB97X-V/def2-SVPD計(jì)算MeP5…Ng(Ng=He、Ne、Ar、Kr、Xe)復(fù)合物的幾何結(jié)構(gòu)和結(jié)合能,結(jié)果表明,ωB97X-V/def2-SVPD方法MeP5…Ng的計(jì)算結(jié)果是準(zhǔn)確的,在MeP5空腔內(nèi)與Ng(Ng=He、Ne、Ar、Kr、Xe)主要存在Ng…π相互作用;隨著原子序數(shù)的增加,結(jié)合能逐漸增大;二代ALMO-EDA能量分解分析結(jié)果表明,色散能是其主要吸引作用,起主導(dǎo)作用,而極化能和電荷轉(zhuǎn)移能較小。

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