衡 周,孫小晴,2,黃俊霖,孫保娟,李植良,李 穎,李 濤
(1.廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所/廣東省蔬菜新技術(shù)重點實驗室,廣東 廣州 510640;2.華中農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝林學(xué)學(xué)院,湖北 武漢 430070)
【研究意義】茄褐紋擬莖點霉(Phomopsis vexansHarter)是真菌界半知菌類腔孢綱球殼孢目球殼孢科擬莖點霉屬真菌,是造成茄子褐紋病的病原菌[1]。此病菌可造成茄子苗期猝倒,生長期葉片病斑、干枝、結(jié)果期果腐等癥狀,最終導(dǎo)致減產(chǎn)20%~70%[2-3]。目前針對茄子褐紋病的研究主要集中在菌株分離培養(yǎng)、形態(tài)學(xué)及分子鑒定、基于離體接種的致病力鑒定等方面[2,4-12]。針對褐紋病菌致病分子機理的研究還十分有限。孢子萌發(fā)是致病菌侵染植株和完成生活史的關(guān)鍵步驟[13]。通過現(xiàn)代組學(xué)技術(shù)對孢子萌發(fā)過程中分子水平的變化進行研究有助于找到致病菌孢子萌發(fā)過程中的關(guān)鍵基因、蛋白,也有助于定位潛在抗菌劑靶點及致病菌效應(yīng)因子[14]。因此,孢子萌發(fā)機理研究是致病分子機理研究的重要組成部分。且已在水稻稻瘟?。?5]、大豆菌核?。?6]、香蕉枯萎?。?7]等病害的研究中得到有效應(yīng)用。針對孢子萌發(fā)機理的組學(xué)研究需要大量孢子作為實驗材料。因此,探索更高效的產(chǎn)孢方法對茄子褐紋病菌孢子萌發(fā)相關(guān)的組學(xué)研究有重要意義?!厩叭搜芯窟M展】羅立娟等[18-19]通過改變固體培養(yǎng)基配方、增加光照、降低溫度,使菌落長出分生孢子器,再通過無菌水沖洗培養(yǎng)皿,從中獲取孢子,此方法最快需要5~6 d。鐘彩虹等[20]在此基礎(chǔ)上,通過對固體培養(yǎng)基上的菌絲進行掃刷、無菌水沖洗、晾干等步驟將固體培養(yǎng)基大量產(chǎn)孢時間縮短到4 d。Rohini等[21]使用PDA培養(yǎng)基在28 ℃培養(yǎng)7 d產(chǎn)孢。Mudasir等[22]分析了30個茄褐紋病菌株的菌絲形態(tài)及顏色,并發(fā)現(xiàn)不同菌株在PDA培養(yǎng)基上25 ℃培養(yǎng)需要的產(chǎn)孢時間從5 d到30 d不等?!颈狙芯壳腥朦c】隨著生物技術(shù)的發(fā)展,利用基因組、蛋白組、代謝組等多組學(xué)為致病機制研究提供了新的技術(shù)手段,然而以上傳統(tǒng)產(chǎn)孢方法所獲孢子數(shù)量有限且無法滿足多組學(xué)分析研究的需求?!緮M解決的關(guān)鍵問題】本研究以優(yōu)化培養(yǎng)方法和提高褐紋病菌產(chǎn)孢數(shù)量為主要科學(xué)問題,建立了茄子褐紋病致病菌的分離鑒定和產(chǎn)孢條件的優(yōu)化方法,為茄子抗褐紋病種質(zhì)資源篩選鑒定、抗病機制及褐紋病菌致病機理研究提供技術(shù)支撐。
試驗于2019年3—12月在廣東省蔬菜新技術(shù)重點實驗室進行。褐紋病菌株(PV5)病株取自廣東省廣州市白云區(qū)鐘落潭鎮(zhèn)茄子種植基地(23°23' 24.5" N,113°26' 19.4" E)。
菌株及質(zhì)粒載體:TA克隆所用大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞、瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒購自天根生化科技(北京)有限公司,pM-18T質(zhì)粒購自購自寶生物工程(大連)有限公司。
酶及有關(guān)試劑:Primer STAR 高保真PCR酶、Loading Buffer購自寶生物工程(大連)有限公司,瓊脂粉、葡萄糖購自Sigma公司,馬鈴薯、燕麥、苜蓿桿購自當?shù)厥袌觥?/p>
1.2.1 褐紋病菌株的分離純化 無菌環(huán)境下,取1×0.5 cm大小的病健交界處組織,無菌水沖洗2次后,次氯酸鈉溶液消毒10 min,無菌水沖洗3次后,放入PDA平板28 ℃培養(yǎng)。
1.2.2 褐紋病菌株的分子鑒定 取培養(yǎng)基中菌絲約100 mg,使用CTAB法提取真菌基因組DNA。以此DNA為模板,使用真菌核糖體rDNA區(qū)通用引物ITS1:ITS1:5'-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3',ITS4:5'-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3'進行PCR反應(yīng),擴增ITS1-5.8S-ITS2 rDNA全序列及部分18S和28S rDNA序列。反應(yīng)體系為:模板1 μL,上下游引物各 0.5 μL,ddH2O 8 μL,PCR 酶 MIX10 μL。反應(yīng)條件為:95 ℃ 5 min;95 ℃ 30 s、55 ℃ 30 s、72 ℃ 2 min,30 個循環(huán);72 ℃ 10 min。對PCR產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳后,切膠回收DNA條帶,經(jīng)TA克隆后,送上海生工生物測序,將菌株ITS1-5.8S-ITS2 rDNA序列在NCBI網(wǎng)站上進行比對,下載比對結(jié)果中相似度較高序列,并使用MEGA軟件構(gòu)建進化樹。
1.2.3 培養(yǎng)基配制 馬鈴薯葡萄糖固體培養(yǎng)基(Potato Dextrose Agar,PDA)的配制:去皮馬鈴薯200 g、瓊脂粉17~20 g、葡萄糖20 g、蒸餾水1 000 mL,馬鈴薯洗凈后,稱取200 g,切成碎塊,放入鍋中加1 000 mL水煮沸30 min,雙層紗布過濾后,趁熱加17~20 g瓊脂粉和20 g葡萄糖使其充分溶解,補足水量,分裝到三角瓶并用封口膜密封,高壓濕熱滅菌(121 ℃,20 min)后冷卻備用。其他培養(yǎng)基方法相同,燕麥固體培養(yǎng)基(Oat Meal Agar,OMA):燕麥30 g,瓊脂粉14 g,水1 000 mL。苜蓿煎汁固體培養(yǎng)基:苜蓿桿100 g,燕麥30 g,瓊脂粉14 g,水1 000 mL。對應(yīng)的液體培養(yǎng)基在配方中去除瓊脂粉。
1.2.4 液體培養(yǎng)基產(chǎn)孢方法 使用PDB, 50%(10 g)葡萄糖PDB,25%(5 g)葡萄糖PDB,無糖PDB,苜蓿煎汁液體培養(yǎng)基,燕麥液體培養(yǎng)基,接種后,在28 ℃150 r/min光照12 h/d條件下培養(yǎng)1 d后分別放入20、22、24、26 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。
1.2.5 孢子的顯微鏡觀察 取液體培養(yǎng)基100 μL在干凈載玻片上,蓋上蓋玻片,顯微鏡觀察。產(chǎn)孢數(shù)量通過血球計數(shù)板顯微觀察測定。
2.1.1 形態(tài)學(xué)鑒定 從發(fā)病組織上分離得到菌株P(guān)V5,該菌株在PDA固體培養(yǎng)基上呈輻射狀生長,菌絲為白色絮狀。菌落整體呈同心輪紋狀,靠近菌落中心部位菌絲較密集,靠近菌落邊緣菌絲則相對稀疏(圖1 A)。生長后期菌落上產(chǎn)生黑色點狀分生孢子器,內(nèi)含大量孢子。光學(xué)顯微鏡觀察顯示孢子呈卵圓形,寬約5~6 μm,長約10~12 μm,兩端有油胞(圖1 B)。
圖1 茄子褐紋病菌菌落及孢子形態(tài)Fig. 1 Colonies and spore morphologies of Phomopsis vexans Harter
2.1.2 分子生物學(xué)鑒定 使用PV5菌株ITS1-5.8S-ITS2 rDNA區(qū)段在NCBI網(wǎng)站上進行序列相似性比對,發(fā)現(xiàn)該菌株的ITS序列與已報道的多條茄褐紋擬莖點霉菌序列相似度達80%以上。因此可以確定菌株為擬莖點霉屬的茄褐紋病菌。使用Neighbor-Joining法對菌株以及擬莖點霉屬其他種病原菌的ITS序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果(圖2)顯示,PV5與Phomopsis vexans親緣關(guān)系最近。從草莓上分離的Phomopsis obscuransd單獨聚為一分支,從葡萄、櫻桃和沙梨上分離的Phomopsis viticola、Phomopsis perniciosa和Phomopsis fukushii親緣關(guān)系與PV5較近。黃瓜和楊桃上分離的Diaporthe phaseolorum和Phomopsis averrhoae與PV5親緣關(guān)系較遠。
2.2.1 培養(yǎng)基形態(tài)對菌絲生長的影響 經(jīng)過24 h培養(yǎng),PDA培養(yǎng)基和苜蓿煎汁+OMA培養(yǎng)基中菌斑直徑分別為1.5、1 cm,而OMA固體培養(yǎng)基中則未出現(xiàn)肉眼可見的菌落。液體培養(yǎng)基中部分菌絲由于搖床的搖動而呈小球狀,且3種液體培養(yǎng)基中的菌絲量遠遠大于固體培養(yǎng)基(圖3)。
2.2.2 充分營養(yǎng)生長對產(chǎn)孢數(shù)量的影響 茄褐紋擬莖點霉菌在液體培養(yǎng)條件下28 ℃培養(yǎng)1 d即可產(chǎn)生大量菌絲。一定的低溫條件能促進孢子產(chǎn)生,而低溫不利于菌絲生長。為了緩解這一矛盾,本試驗探索使用28℃培養(yǎng)1 d后再放入24 ℃培養(yǎng)產(chǎn)孢。為了證明效果,使用28 ℃培養(yǎng)1 d、24 ℃培養(yǎng)3 d的產(chǎn)孢量與24 ℃持續(xù)培養(yǎng)4 d的產(chǎn)孢量進行比對,結(jié)果(表1)表明,不提供充分營養(yǎng)生長的條件下,褐紋病菌培養(yǎng)3 d后才開始產(chǎn)孢,而提供1 d的營養(yǎng)生長時間,褐紋病菌培養(yǎng)2 d后就開始產(chǎn)孢并且培養(yǎng)4 d后的孢子數(shù)量為不提供營養(yǎng)生長的240倍。
圖2 基于ITS-5.8S rDNA 序列構(gòu)建的遺傳進化樹Fig. 2 An evolutionary tree based on ITS-5.8S rDNA sequence of Phomopsis vexans Harter
圖3 不同形態(tài)培養(yǎng)基中PV5菌株菌絲生長情況Fig. 3 Growth condition of PV5 in different media
2.2.3 培養(yǎng)溫度對產(chǎn)孢數(shù)量的影響 為了探索液體培養(yǎng)基培養(yǎng)的最佳產(chǎn)孢溫度,設(shè)置20、22、24、26 ℃ 4個溫度梯度,經(jīng)過28 ℃培養(yǎng)1 d后,將菌液放入相應(yīng)的溫度培養(yǎng)3 d并通過血球計數(shù)板觀察每培養(yǎng)1 d后的孢子數(shù)量,結(jié)果見表2。22~26 ℃條件下菌株在培養(yǎng)3 d后觀察到產(chǎn)孢。培養(yǎng)4 d后觀察產(chǎn)孢量發(fā)現(xiàn),24℃培養(yǎng)條件下孢子含量最高。因此可以判斷,24℃為最佳產(chǎn)孢培養(yǎng)溫度。
表1 不同培養(yǎng)步驟的產(chǎn)孢數(shù)量(個/毫升)Table 1 Spore production quantity under different culture methods(spores/mL)
2.2.4 培養(yǎng)基配方對產(chǎn)孢數(shù)量的影響 在已有的產(chǎn)孢相關(guān)研究中,不同培養(yǎng)基種類對產(chǎn)孢數(shù)量也有較大影響。且培養(yǎng)基中碳源含量也會影響產(chǎn)孢。針對這一情況,研究了相同培養(yǎng)條件下,PDB、減糖PDB培養(yǎng)基以及兩種較常見產(chǎn)孢培養(yǎng)基的產(chǎn)孢數(shù)量,結(jié)果見表3。25%葡萄糖PDB培養(yǎng)基和苜蓿培養(yǎng)基產(chǎn)孢效率相對較高??紤]到培養(yǎng)基配制的簡便性,25%葡萄糖PDB培養(yǎng)基產(chǎn)孢效率最高。
褐紋病是當前茄子生產(chǎn)上的重大病害,然而由于相關(guān)研究基礎(chǔ)薄弱,僅局限于病原菌的分離鑒定和抗病資源篩選等研究,且缺乏完備的產(chǎn)孢方法,嚴重阻礙了茄子褐紋病菌的致病機制研究和分子機理解析。微生物人工培養(yǎng)條件的篩選與優(yōu)化是開展相關(guān)機理研究的技術(shù)基礎(chǔ)[23-24]。通過培養(yǎng)條件的優(yōu)化、簡化技術(shù)流程,進而獲得致病菌孢子的富集,對于深入研究孢子發(fā)育、致病機理具有重要理論意義。前人研究發(fā)現(xiàn)能促進植物病原菌產(chǎn)孢的因素主要有營養(yǎng)控制、寄主組織誘導(dǎo)、光照、物理損傷等[25],目前針對褐紋病菌的研究多用PDA固體培養(yǎng)基對病菌進行培養(yǎng)。Akhtar等[26]曾使用馬鈴薯葡萄糖液體(PDB)培養(yǎng)基對茄子褐紋病菌進行培養(yǎng),并稱量了不同菌株的重量,但并未提及產(chǎn)孢相關(guān)內(nèi)容。本研究通過比較固體和液體培養(yǎng)基對菌絲生長量的影響,發(fā)現(xiàn)3種液體培養(yǎng)基(OMA培養(yǎng)基、PDA培養(yǎng)基、苜蓿煎汁+OMA)28 ℃培養(yǎng)1 d比固體培養(yǎng)基菌絲生長量增加。本研究通過6種液體培養(yǎng)基比較試驗發(fā)現(xiàn),25%葡萄糖PDB培養(yǎng)基產(chǎn)孢效率最高;并且使用28 ℃培養(yǎng)1 d 24 ℃培養(yǎng)3 d后的產(chǎn)孢量是24 ℃持續(xù)液體培養(yǎng)4 d產(chǎn)孢量的240倍。因此,在促進菌絲生長后,可以根據(jù)實驗條件綜合多個因素如光照、機械損傷等以提高產(chǎn)孢效率。
表2 不同培養(yǎng)溫度的產(chǎn)孢數(shù)量(個/毫升)Table 2 Spore production quantity under different culture temperatures(spores/mL)
表3 不同培養(yǎng)基的產(chǎn)孢數(shù)量(個/毫升)Table 3 Spore production quantity under different culture media(spores/mL)
本研究在前人研究的基礎(chǔ)上,使用液體培養(yǎng)基培養(yǎng)褐紋病菌,通過低溫光照提供的逆境,以及液體培養(yǎng)中搖床造成的機械力打斷菌絲,綜合了多種促進產(chǎn)孢的因素。同時,所產(chǎn)生分生孢子器中的孢子直接進入培養(yǎng)基,獲得的孢子液過濾后可直接使用,簡化了產(chǎn)孢過程。為茄子褐紋病菌的基因組及轉(zhuǎn)錄組研究[27]、深入挖掘茄褐紋病菌孢子萌發(fā)相關(guān)分子機制、開展褐紋病與植株的互作研究提供理論基礎(chǔ)。
本研究所產(chǎn)生的孢子均為α型孢子,未見β型孢子。在前人的研究中,PDA固體培養(yǎng)基培養(yǎng)的褐紋病菌能產(chǎn)生α、β兩種孢子[13-14],本課題組前期研究中也獲得了類似結(jié)果。但為何液體培養(yǎng)產(chǎn)孢只觀察到α型孢子,還需要進一步開展產(chǎn)孢機理研究。
本研究首次嘗試使用液體培養(yǎng)基促進茄子褐紋病菌產(chǎn)孢。產(chǎn)孢條件的優(yōu)化結(jié)果表明,液體培養(yǎng)基中菌絲生長多余固體培養(yǎng)基且可用于產(chǎn)孢。最佳產(chǎn)孢條件為:在150 r/min搖床中,使用25%葡萄糖PDB培養(yǎng)基,28℃培養(yǎng)1 d后24℃培養(yǎng)3 d。在此條件下培養(yǎng),產(chǎn)孢量可達到1.2×1010個 /mL。