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        S100P在NSCLC中的表達、信號通路和預后關系生物信息分析及驗證

        2020-07-08 05:35:18湯山松劉娟
        國際呼吸雜志 2020年13期
        關鍵詞:組織化學腺癌例數(shù)

        湯山松 劉娟

        1資陽市人民醫(yī)院腫瘤科641300;2四川省人民醫(yī)院病理科,成都610000

        肺癌是臨床上最為常見的惡性腫瘤,其發(fā)病率在男性為第一位,女性為第二位,且病死率位居所有腫瘤的第一位[1]。一直以來,肺癌都是影響人類生存健康的重大難題之一。近期發(fā)布的全球癌癥統(tǒng)計報告顯示,肺癌、氣管和支氣管腫瘤發(fā)病率及病死率居各種癌癥之首位[2]。因此,找出特異度、敏感度更高的蛋白及基因標志物,對于肺癌的早期診治及評估預后具有重要價值。

        近些年的研究表明S100P 在人類多種惡性腫瘤中呈現(xiàn)明顯上調(diào)表達,并與患者腫瘤病理學特征存在一定的關系[3]。然而S100P 在非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者腫瘤組織和癌旁組織中的表達情況及其與NSCLC 患者生存關系研究鮮有報道。本研究采用生物信息學方法分析TCGA 數(shù)據(jù)庫中S100P的表達水平及其高低表達與NSCLC 患者總生存期 (overall survival,OS)和無疾病進展生存期 (disease free survival,DFS)的關系。同時,采用免疫組織化學法檢測48例NSCLC患者腫瘤組織中S100P 蛋白表達水平,并分析其與患者臨床病理特征的關系,對前述生物信息分析結(jié)果進行驗證。

        1 對象與方法

        1.1 S100P表達水平分析 在TCGA 數(shù)據(jù)庫中分析“肺癌”“非小細胞肺癌” “鱗癌” “腺癌”和“S100P基因”檢索物種為人類,分析S100P 基因在多種組織中的變動情況,并比較其在腫瘤組織和對應的癌旁正常組織中的差異表達情況。認為存在組織差異表達的條件為S100P基因m RNA 上調(diào)或下調(diào)表達超過2 倍 (|Log2FC|>1),且P<0.05[4]。

        1.2 S100P 蛋白網(wǎng)絡分析 采用STRING 數(shù)據(jù)庫,與S100P相互作用蛋白網(wǎng)絡,并分析其相關蛋白聚類情況,S100P 蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡構(gòu)建條件為置信度大于0.5,相互作用來源為共表達、基因功能和比鄰關系[5]。

        1.3 共表達及生存分析 在TCGA 數(shù)據(jù)庫中,依據(jù)與S100P基因共表達關系,選取正相關和負相關表達最為明顯的2個基因進行分析,計算相關系數(shù);根據(jù)S100P基因在NSCLC患者癌組織中表達的中位數(shù),分為高表達組和低表達組,采用Logrank檢驗分析比較S100P 基因表達與患者預后的關系。

        1.4 免疫組織化學檢測S100P蛋白表達 回顧性分析四川省資陽市人民醫(yī)院收治的NSCLC患者48例,采用免疫組織化學法檢測患者手術標本中NSCLC患者癌組織和癌旁正常組織中S100P蛋白表達水平,分析比較S100P 基因編碼蛋白表達與患者臨床病理特征的關系。本研究符合《赫爾辛基宣言》的原則。免疫組織化學檢測S100P 蛋白表達按試劑盒操作說明進行。S100P蛋白表達高低表達判定,在高倍鏡下隨機選取5個視野,根據(jù)著色強弱和陽性細胞比例綜合判定S100P 表達強度。按色強度評分:不著色 (0分)、淺黃 (1分)、棕黃(2分)、棕褐色(3分);按照每高倍鏡 (SP×200)下陽性細胞所占的比例分為<10% (0分)、≥10%且<25% (1分);≥25%且<50% (2分)、≥51%且<75% (3分);≥75% (4分)??傮w評分值=陽性細胞比例評分×染色強度評分。最終評判:<6分為低表達,≥6分為高表達。低表達率(%)=低表達例數(shù)/總例數(shù)×100%。高表達率(%)=高表達例數(shù)/總例數(shù)×100%。

        1.5 統(tǒng)計學分析SAS 9.1統(tǒng)計學軟件進行相關分析,計量資料以x-±s表示,數(shù)據(jù)比較采用t檢驗;計數(shù)資料采用例數(shù)(百分比)表示,數(shù)據(jù)比較采用χ2檢驗。S100P基因高低表達組生存期采用Logrank檢驗。P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結(jié)果

        2.1 S100P 基因表達 TCGA 數(shù)據(jù)庫中,S100P蛋白在大多數(shù)腫瘤組織中呈現(xiàn)高表達;在肺腺癌組織中S100P 基因表達水平顯著高于癌旁組織(P<0.05)。同時,S100P表達水平在NSCLC不同臨床分期差異有統(tǒng)計學意義 (F=3.74,P<0.05)。見圖1、2。

        圖1 S100P基因mRNA 在肺腺癌、肺鱗癌及對應正常組織中的表達 A:肺腺癌與對應正常組織;B:肺鱗癌與對應正常組織

        圖2 S100P基因m RNA 表達與非小細胞肺癌患者臨床分期的關系

        2.2 S100P 蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡 蛋白-蛋白相互作用關系采用String數(shù)據(jù)進行分析,選取了與S100P 蛋白相互作用較為緊密的蛋白網(wǎng)絡節(jié)點數(shù)50個,相互作用關系236個,區(qū)域聚類指數(shù)為0.39,蛋白相互作用網(wǎng)絡富集顯著 (P<0.05)。

        2.3 相關分析 共表達分析顯示,與S100P基因正相關表達最顯著的基因為FURIN 基因 (r=0.55,P<0.05),與S100P 基因負相關表達最顯著的基因為CAMK1 (r=-0.38,P<0.05)。

        2.4 生存分析 生存分析顯示高表達組與低表達組OS 差異無統(tǒng)計學意義 (HR=1.1,P>0.05),高表達組患者DFS低于低表達組(HR=1.3,P<0.05),見圖3、4。肺腺癌中S100P高表達患者OS 和DFS 生存均低于低表達組 (P值均<0.05)。

        圖3 S100P基因m RNA 在非小細胞肺癌患者中總生存期的受試者工作特征曲線

        圖4 S100P基因m RNA 在非小細胞肺癌患者中無疾病進展生存期的受試者工作特征曲線

        2.5 S100P基因編碼蛋白表達情況 免疫組織化學顯示S100P 蛋白主要表達于肺癌或正常肺組織細胞核,呈現(xiàn)棕褐色顆粒 (圖5)。S100P 在NSCLC患者癌和癌旁組織中的陽性表達率分別為54.2% (26/48)和16.7% (8/48),癌組織中陽性標的率顯著高于癌旁組織 (χ2=14.76,P<0.05)。

        2.6 S100P 蛋白表達與NSCLC 患者臨床病理特征關系 S100P 蛋白在癌組織中的陽性表達與NSCLC患者的臨床分期和縱隔淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(P值均<0.05),而與患者年齡、性別、腫瘤大小、病理類型、病例分級和有無胸水無關 (P值均>0.05),見表1。

        3 討論

        S100P是介導鈣離子結(jié)合蛋白S100家族重要成員[6-7]。自1992 年S100P 被報道以來,這種相對分子質(zhì)量10 400的鈣結(jié)合蛋白就受到了研究這的廣泛的關注。雖然S100P 自身在人體組織中并非廣泛表達,但人體胚胎發(fā)育以及腫瘤發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮重要作用[8-10]。

        S100P在進化方面也相對較新,因為它只存在于脊椎動物的基因組中。在子宮壁激素節(jié)律性波動過程中觀察到這種蛋白的表達,它可能與胚胎著床以及發(fā)育中的胚胎有密切關系。然而,大多數(shù)已發(fā)表的研究認為S100P在多種人類惡性腫瘤的發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮重要作用。在人類惡性腫瘤中,S100P越來越被認為是一種潛在的診斷和治療靶點。

        相關研究顯示,S100P在多種不同類型的腫瘤中大多呈現(xiàn)高水平表達[11],這與我們生物信息分析結(jié)果也較為一致。此外,大量來自轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學分析實驗數(shù)據(jù)顯示S100P 在體外和體內(nèi)過度表達,腫瘤細胞的生物學功能發(fā)生明顯改變,包括增殖、遷移能力等。S100P的表達受多種激素的影響,并受多種轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)節(jié)。相關實驗證實S100P在雄激素[12]、smad、stat/creb和sp/klf[13]以及孕酮[14]等因子作用下明顯上調(diào)。在體外研究中,BMP4 也被確定為S100P 表達的調(diào)節(jié)因子,在這兩種蛋白質(zhì)之間觀察到正相關表達[15]。同時,在轉(zhuǎn)移性和雄激素難治性前列腺癌細胞中觀察到IL-6和S100P表達之間的相關性,并推測IL-6可刺激S100P表達[16]。

        表1 S100P基因編碼蛋白表達與非小細胞肺癌患者臨床病理特征關系 [例 (%)]

        S100P在NSCLC中的表達研究報道不多,其在NSCLC中的表達及其與患者預后關系研究鮮有報道。根據(jù)S100P 在其他腫瘤中的表達情況及生物學功能,我們推測S100P在NSCLC的預后和臨床病理特征中也可能發(fā)揮重要作用。因此,我們分別采用生物信息和免疫組織化學方法探討S100P的表達情況及其與NSCLC 的關系。本研究發(fā)現(xiàn),S100P在NSCLC患者,尤其是肺腺癌患者癌組織中的表達水平明顯上調(diào),并與患者預后相關。S100P高表達患者OS 和DFS 明顯降低,提示S100P 可能是NSCLC 預后不良的危險因素。同時,免疫組織化學檢測也證實S100P 高表達患者分期較晚,縱隔淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移率較高。也證實了其作為NSCLC預后不良的危險因素。

        因此,S100P基因在NSCLC 患者腫瘤組織中呈現(xiàn)高表達,并與NSCLC患者預后不良有關,有望成為NSCLC患者預后相關分子標志物,并成為NSCLC靶向治療的潛在靶點。

        利益沖突 所有作者均聲明不存在利益沖突

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