董葉萍,費思力,洪立輝,杜來玲,王穎
(浙江樹人大學(xué)醫(yī)學(xué)院 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)專業(yè),浙江 杭州 310015)
circRNAs 是一種非編碼RNA,在哺乳動物的細(xì)胞質(zhì)中含量豐富。目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)存在3 種形式的circRNAs,分別為外顯子環(huán)狀RNA、內(nèi)含子環(huán)狀RNA 和外顯子-內(nèi)含子環(huán)狀RNA。其中外顯子環(huán)狀RNA 是最普遍的一種存在形式,大約占據(jù)全部環(huán)狀RNA 的80%,其主要是剪接體聚合后內(nèi)含子切除然后環(huán)化形成。與傳統(tǒng)的線性RNA 相比,circRNAs的形成通過反向剪接將下游5’位剪接供體與上游3’剪接受體連接,以共價閉合環(huán)的形式構(gòu)建,因此能夠抵抗RNA 外切酶介導(dǎo)的降解,保持較高的穩(wěn)定性。同時,circRNAs 的表達具有普遍性、保守性、組織特異性、細(xì)胞特異性、發(fā)育階段特異性等特征。
circRNAs 一度被認(rèn)為是轉(zhuǎn)錄過程中的偶然錯配,不具備生物學(xué)功能。直到2012 年Salzma 等[1]首次采用高通量RNA 測 序(RNA-sequencing, RNA-seq) 對circRNAs進行深入研究, 發(fā)現(xiàn)circRNAs 具有多種生物學(xué)功能,廣泛存在于人類組織中,與人類生命活動存在密切聯(lián)系。
近年來測序和生物信息技術(shù)的進步也推動了對circRNAs 的深入研究。多項研究表明,circRNAs 可以作為miRNA 海綿發(fā)揮間接調(diào)控miRNA 靶基因表達的功能[2],從而影響靶mRNA 的穩(wěn)定性或降解過程。我們將此稱為競爭性內(nèi)源性RNA(ceRNA)假說。例如研究發(fā)現(xiàn),ciRS-7 與miR-7 有超過70 個結(jié)合位點,ciRS-7 為miR-7 的一種抑制劑,結(jié)合后使miR-7 的直接靶基因(CCNE1 和PIK3CD)的表達水平增高。此外,Cdr1as 的下調(diào)通過靶向miR-7 抑制肝癌細(xì)胞的增殖和侵襲。這些數(shù)據(jù)表明,Cdr1as 在HCC 中通過靶向miR-7 而部分扮演癌基因的角色[3]。
肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是世界第四大惡性腫瘤,是全球第三大癌癥相關(guān)死亡原因,也是我國常見的惡性腫瘤之一。盡管近些年在HCC 的診斷和治療方面取得了進展,但由于HCC 的高轉(zhuǎn)移率及高復(fù)發(fā)率,它仍然是一種高度致命的疾病。目前臨床上最常用來檢測肝細(xì)胞癌的標(biāo)志物是甲胎蛋白 (α-fetoprotein, AFP) , 但臨床發(fā)現(xiàn)不少肝細(xì)胞癌患者的AFP 幅度變化并不大, 診斷效率不理想。肝癌患者常用的治療方法為外科手術(shù)治療,但由于供體肝臟供應(yīng)有限, 導(dǎo)致大部分患者在等待供體的過程中因腫瘤進展而失去手術(shù)機會。而在長時間等待期間,腫瘤負(fù)荷增加極有可能對肝移植后生存率產(chǎn)生不利影響。
表1 在HCC 中差異表達的circRNAs 及其相關(guān)機制
因此,找到一個靈敏度更高的HCC 診斷標(biāo)志物和可行的靶向治療方法十分有必要。近期大量研究顯示circRNAs在肝細(xì)胞癌中存在明顯的表達豐度改變,見表1,其中某些circRNAs 可以抑制腫瘤細(xì)胞的增殖,誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,發(fā)揮抗癌作用,這表明circRNAs 極有可能是癌癥中的新型治療靶點,這為HCC 的治療提供了一個方向。下表列舉了部分在HCC 中表達顯著改變的circRNAs 及其可能機制,見表1。
2.1 circ-ITCH。據(jù) 報 道,circ-ITCH 通 過 抑 制Wnt/β-catenin 通路抑制多種癌癥的增殖。Wnt/β-連環(huán)蛋白途徑在調(diào)節(jié)細(xì)胞過程的一些關(guān)鍵方面,癌癥的發(fā)生過程中起著重要作用,ITCH 可以高表達促進磷酸化Dvl2 的泛素化和降解,從而抑制Wnt/β-連環(huán)蛋白途徑。在HCC 相關(guān)研究中發(fā)現(xiàn)HCC 組織中circ-ITCH 表達水平明顯低于癌旁組織,且circ-ITCH 高表達的HCC 患者的預(yù)后較好。這些結(jié)果提示circ-ITCH 可能對HCC 有抑制作用,可以作為HCC 患者易感性和預(yù)后評估的生物標(biāo)志物[4]。
2.2 ciRS-7。與鄰近的非腫瘤組織相比,HCC 組織中Cdr1as 表達上調(diào)。此外,與鄰近的非腫瘤組織相比,HCC組織中miR-7 的表達下調(diào)。miR-7 的表達水平與HCC 組織的表達水平呈負(fù)相關(guān)。Cdr1as 的下調(diào)抑制了肝癌細(xì)胞的增殖和侵襲。過表達miR-7 可抑制肝癌細(xì)胞的增殖和侵襲。過表達miR-7 可抑制直接靶基因CCNE1 和PIK3CD 的表達。Cdr1as 的下調(diào)抑制了miR-7 的表達,也抑制了CCNE1 和PIK3CD 的表達。此外,Cdr1as 的下調(diào)通過靶向miR-7 抑制肝癌細(xì)胞的增殖和侵襲。這些數(shù)據(jù)表明,Cdr1as 在HCC 中通過靶向miR-7 而部分扮演癌基因的角色[3]。
2.3 circZKSCAN1。研究發(fā)現(xiàn)在HCC 樣本中,ZKSCAN1 mRNA 和circZKSCAN1 的表達均顯著低于相鄰非腫瘤組織中的表達。且沉默ZKSCAN1 mRNA 和circZKSCAN1均可促進細(xì)胞增殖、遷移和侵襲。更進一步的,這兩種形式的RNA 的過表達在體內(nèi)和體外都抑制了HCC 的進展。沉默或過表達兩種形式的RNA 互不干擾。RNA-seq 揭示了不同的分子機制:ZKSCAN1 mRNA 主要調(diào)控細(xì)胞代謝,而circZKSCAN1 介導(dǎo)多種癌癥相關(guān)信號通路,提示ZKSCAN1 mRNA 和circRNA 具有非冗余作用。綜上所述,揭示了兩種相互密切合作的翻譯后產(chǎn)物(ZKSCAN1mRNA和circZKSCAN1),它們可以抑制肝癌的生長、遷移和侵襲。提示cirZKSCAN1 可能是一種有用的HCC 診斷標(biāo)志物[5]。
2.4 其 他circRNAs。circRNA_100338 是HCC 中 上 調(diào) 的環(huán)狀rna 之一,其高表達與HCC 患者的低生存率和轉(zhuǎn)移進展密切相關(guān)。而且circRNA_100338 在HCC 中充當(dāng)miR-141-3p 的 內(nèi) 源 性 海 綿,circRNA_100338 和miR-141-3p在肝癌細(xì)胞侵襲性調(diào)控中起關(guān)鍵拮抗作用。以上結(jié)果表明circRNA_100338 是一種潛在的有價值的HCC 診斷生物標(biāo)志物和HCC 治療靶點[6]。
Hsa_circ_0016788 在HCC 組織和細(xì)胞系中均有上調(diào)。體內(nèi)外實驗表明,hsa_circ_0016788 沉默Hsa_circ_0016788在體外抑制了HCC 細(xì)胞的增殖、侵襲,促進了細(xì)胞的凋亡,在體內(nèi)抑制了腫瘤的生長。生物信息學(xué)工具和熒光素酶報告基因分析證實miR-486 靶向hsa_circ_0016788 和CDK4 表達呈負(fù)相關(guān),提示hsa_circ_0016788/miR-486/CDK4 通路。綜上所述,揭示了hsa_circ_0016788/miR-486/CDK4 軸在HCC 腫瘤發(fā)生中的作用,為HCC 提供了一個新的潛在的治療靶點[7]。
還有研究者通過qRT-PCR 對circ_0001445 在HCC及其鄰近非腫瘤組織中的表達水平,進行了檢測。數(shù)據(jù)表明,circ_0001445 在HCC 組織中表達水平顯著降低,并且與腫瘤病灶的數(shù)量顯著相關(guān)。此外,體外方法表明過表達circ_0001445 可以促進細(xì)胞凋亡,抑制HCC 來源細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲,這些結(jié)果均表明 circ_0001445 極有可能會影響HCC 的發(fā)生發(fā)展[8]。
由于HCC 的高發(fā)病率,高死亡率和低生存率,長期以來一直是困擾人類健康的一大難題。隨著研究的不斷推進,circRNAs 的功能不斷被揭示,它不再是錯誤剪接的副產(chǎn)品,而是具有重要生物學(xué)功能的小分子。circRNAs 是一種豐富、穩(wěn)定、保守、結(jié)構(gòu)多樣的非編碼RNA 且在多種疾病的發(fā)生發(fā)展中期重要的作用。各種研究表明circRNAs 最為潛在的生物標(biāo)記物和治療靶點將對HCC 的早期診斷、治療和預(yù)后等方面發(fā)揮重要作用,并且有望成為HCC 的預(yù)防及治療靶點,這將會給HCC 患者帶來福音。
但是,目前circRNAs 的研究尚處于起步階段,目前只闡明了circRNAs 在腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中的一小部分機制。雖然越來越多的circRNAs 被發(fā)現(xiàn)和研究,但成千上萬的circRNAs 的功能仍然不清楚。關(guān)于circRNAs 在HCC 的診斷與治療依舊停留在科研階段,離臨床應(yīng)用還有一段距離。這與環(huán)狀RNA 本身存在結(jié)構(gòu)特異性和低豐度的特點有關(guān)。亟需我們更深入的去研究circRNAs 的功能及其和HCC 發(fā)生發(fā)展的關(guān)系。