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        KNDC1功能的研究進(jìn)展

        2020-05-12 02:01:02孫靖玉林雅軍北京醫(yī)院國家老年醫(yī)學(xué)中心衛(wèi)生部老年醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室北京100730
        中國老年學(xué)雜志 2020年9期
        關(guān)鍵詞:樹突結(jié)構(gòu)域磷酸化

        孫靖玉 林雅軍 (北京醫(yī)院國家老年醫(yī)學(xué)中心 衛(wèi)生部老年醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100730)

        激酶非催化C-葉結(jié)構(gòu)域蛋白(KNDC)1又稱V-KNDC1(KIND)、RASGEF2、C10orf23、Very-KIND、bB439H18.3,是近年來發(fā)現(xiàn)的新基因,在腦的不同區(qū)域表達(dá)水平不同,尤其在小腦顆粒細(xì)胞中表達(dá)最高〔1〕。其在許多信號傳導(dǎo)通路的蛋白間分子識別和功能調(diào)控中扮演重要角色〔2〕。研究表明,KNDC1與神經(jīng)元樹突的生長、人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞(HUVEC)的衰老及纖維核心蛋白的修飾有關(guān),有望成為新的研究熱點(diǎn)。本文將 KNDC1 這一新調(diào)控因子的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)與其功能作用及其機(jī)制進(jìn)行綜述。

        1 KNDC1概況

        1.1KNDC1的發(fā)現(xiàn) KIND從催化蛋白激酶折疊進(jìn)化成用于信號蛋白的潛在蛋白質(zhì)相互作用模塊。 Spir家族肌動蛋白和13型非受體磷酸酶(PTP 13型)在蛋白質(zhì)的very-N-末端部分編碼KIND結(jié)構(gòu)域。Mees等〔3〕報道了KIND蛋白家族第三個成員的表征和克隆,由于其含有兩個KIND結(jié)構(gòu)域,將其命名為very-KIND(V-KIND)。其后,Huang等〔4〕也報道了KNDC1對神經(jīng)元樹突生長調(diào)節(jié)的機(jī)制。

        1.2KNDC1的分布 哺乳動物基因組中只有一個V-KIND基因,到目前為止只在脊椎動物中發(fā)現(xiàn)了該基因。為確定所有編碼蛋白質(zhì)基因的組織特異性,對代表27種不同組織的95個人類個體的組織樣本進(jìn)行RNA-seq檢測〔5〕,結(jié)果顯示KNDC1在腦、卵巢、腎上腺、子宮內(nèi)膜、睪丸、甲狀腺等均有表達(dá)。Mees等〔3〕發(fā)現(xiàn),在小鼠胚胎發(fā)生過程中,V-KIND基因在發(fā)育中的神經(jīng)系統(tǒng)中特異性表達(dá)。在成年小鼠中,V-KIND僅在腦中高表達(dá),在卵巢中可以檢測到低表達(dá)。V-KIND主要在小腦顆粒和浦肯野細(xì)胞層的神經(jīng)元細(xì)胞中特異性表達(dá)。李開濟(jì)等〔2〕在人臍血管內(nèi)皮細(xì)胞中也檢測到KNDC1的表達(dá)。

        1.3KNDC1的結(jié)構(gòu)特點(diǎn) 人KNDC1基因位于10q26.3,長約65 959 bp,共有4個轉(zhuǎn)錄變異體,其中變異體1最長,翻譯后的蛋白質(zhì)分子量約為54 191 kD,在239個有機(jī)體中具有人類基因KNDC1,其在恒河猴、小鼠、大鼠、雞和青蛙中保守性很強(qiáng)。KIND是公認(rèn)的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用模塊。迄今為止,發(fā)現(xiàn)的含KIND的蛋白質(zhì)有4種,肌動蛋白 -核因子(Spir-2),蛋白酪氨酸磷酸酶(PTPN13),支架蛋白(FRMPD2)和V-KIND(腦特異性Ras鳥嘌呤核苷酸交換因子)。 其中V-KIND有2個KIND域(KIND1和KIND2),而其他3個蛋白只有一個〔6〕。與蛋白質(zhì)家族的其他成員一樣,V-KIND在N末端具有KIND結(jié)構(gòu)域。第2個KIND結(jié)構(gòu)域位于蛋白質(zhì)的中心部分。 C-末端半編碼Ras樣GTP酶(RasGEF)和RasGEF N-末端模塊(RasGEFN)的鳥嘌呤核苷酸交換因子結(jié)構(gòu)示意圖如圖1。

        圖1 KNDC1結(jié)構(gòu)

        2 KNDC1與神經(jīng)元樹突的生長

        大腦特異性RasGEF V-KIND 是小腦顆粒細(xì)胞正常樹突生長和適當(dāng)?shù)倪\(yùn)動協(xié)調(diào)所必須的。

        2.1KNDC1負(fù)調(diào)控神經(jīng)元樹突的生長 V-KIND過表達(dá)和RNAi敲低實(shí)驗(yàn)表明,V-KIND在控制樹突生長中有重要作用,盡管潛在的分子機(jī)制仍然難以闡明〔1,6〕。前期研究表明,V-KIND的 RasGEF活性通過c-JUN氨基末端激酶(JNK)1和(或)細(xì)胞外信號調(diào)控激酶(ERK),經(jīng)由 Ras-Raf-MAPK通路誘導(dǎo)微管關(guān)聯(lián)蛋白(MAP)2的磷酸化,MAP2磷酸化后與微管結(jié)合的活性增加,可以促進(jìn)神經(jīng)細(xì)胞樹突的長度增加,研究還發(fā)現(xiàn)抑制或敲低V-KIND的表達(dá)可以促進(jìn)培養(yǎng)中的小腦顆粒細(xì)胞和海馬神經(jīng)元的樹突生長,這表明其作為一種信號分子在發(fā)育過程中調(diào)控或抑制神經(jīng)元樹突生長〔7〕。同時,KNDC1基因敲除小鼠運(yùn)動功能沒有顯著變化,但年輕的基因敲除小鼠的握力有明顯增加,且在平衡相關(guān)試驗(yàn)中運(yùn)動操作性能展現(xiàn)出更好的趨勢。

        2.2KNDC1調(diào)控樹突的生長的機(jī)制 最初研究假設(shè)KNDC1調(diào)控樹突的生長機(jī)制可能是V-KIND和MAP2之間的物理和功能關(guān)聯(lián),即V-KIND-MAP2相互作用和V-KIND誘導(dǎo)的MAP2 Thr磷酸化。MAP2是一種樹突狀微管相關(guān)蛋白,在神經(jīng)元樹突生長中起負(fù)調(diào)控作用。在樹突發(fā)展過程中,早期的樹枝狀伸長和后期的樹枝狀成熟都需要正常的MT結(jié)構(gòu)。 MAP2磷酸化水平在發(fā)育上受到樹突生長的控制〔8,9〕。 MAP2的磷酸化增加造成MAP2從MT分離,從而導(dǎo)致MT穩(wěn)定性降低和肌動蛋白束活性減弱〔10~14〕。Huang等〔4〕研究顯示V-KIND過表達(dá)促進(jìn)MAP2 Thr磷酸化并導(dǎo)致樹突生長受損,而V-KIND RNAi敲低降低MAP2 Thr磷酸化并誘導(dǎo)樹突生長增加。此外,MAP2結(jié)合結(jié)構(gòu)域KIND2單獨(dú)作為顯著的負(fù)調(diào)控因子,其過表達(dá)最終增加樹突長度和復(fù)雜性。以上表明V-KIND可能通過在樹突發(fā)育過程中控制MAP2磷酸化水平起作用。見圖2。

        圖2 KNDC1調(diào)控樹突生長的機(jī)制

        Huang等〔4〕通過生成一系列突變構(gòu)建體來分析v-KIND-MAP2相互作用的結(jié)構(gòu)-功能關(guān)系。在4種含KIND的蛋白質(zhì)(Spir-2,PTPN13,F(xiàn)RMPD2和V-KIND)中的KIND結(jié)構(gòu)域中,只有V-KIND的KIND2結(jié)構(gòu)域特異性結(jié)合MAP2。 值得注意的是,在海馬神經(jīng)元中表達(dá)的32個殘基的V-KIND MAP2結(jié)合核心多肽在促進(jìn)樹突分支方面非常有效,這與V-KIND過表達(dá)的效果相反,但類似于V-KIND的敲低效應(yīng)〔14〕,表明32個氨基酸核心多肽通過與內(nèi)源性V-KIND競爭MAP2結(jié)合位點(diǎn)而充當(dāng)顯性負(fù)調(diào)節(jié)分子。先前的體外研究表明,V-KIND的RasGEF活性通過激活Ras-Raf-MAP激酶途徑誘導(dǎo)JNK1和(或)ERK促進(jìn) MAP2 磷酸化〔7〕。JNK1對MAP2的磷酸化作用(如V-KIND過表達(dá)的下游〔14〕)增強(qiáng)了MAP2與微管的結(jié)合并促進(jìn)其組裝的活性〔15〕,并且對JNK1的抑制(如V-KIND 敲低下游〔14〕)增加了樹突分支的數(shù)量,但縮短了樹突的平均長度〔16〕。對V-KIND-MAP2相互作用關(guān)鍵的結(jié)合核心模塊定義在小鼠V-KIND KIND2的32個殘基內(nèi)和小鼠MAP2中心結(jié)構(gòu)域的43個殘基內(nèi)。 KIND2的MAP2結(jié)合核心模塊中氨基酸461、474和477處的3個Leu殘基促成了相互作用。 MAP2結(jié)合核心模塊本身作為海馬神經(jīng)元中V-KIND的顯性負(fù)調(diào)節(jié)因子促進(jìn)樹突分支。綜上,KIND2結(jié)構(gòu)域通過V-KIND RasGEF(Ras途徑的激活劑)靶向與樹突微管細(xì)胞骨架相關(guān)的MAP2結(jié)合來調(diào)節(jié)樹突復(fù)雜性。

        總之,V-KIND和MAP2相互作用核心模塊在調(diào)節(jié)海馬神經(jīng)元和小腦顆粒細(xì)胞樹突生長和分支的結(jié)構(gòu)和功能上起重要作用。對這些新鑒定的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用核心模塊的進(jìn)一步研究,包括三級結(jié)構(gòu)分析,將進(jìn)一步闡明V-KIND-MAP2相互作用調(diào)節(jié)樹突樹枝狀模式的分子機(jī)制,這對于塑造神經(jīng)元通路至關(guān)重要,同時也可能是為理解某些MAP2相關(guān)的神經(jīng)退行性疾病和精神疾病提供線索〔2,17〕。

        3 KNDC1對HUVEC衰老作用的影響

        KNDC1作為一種新型RasGEF蛋白,已被認(rèn)為 是一個與細(xì)胞衰老相關(guān)蛋白〔3〕。研究發(fā)現(xiàn),KNDC1過表達(dá)會加速HUVEC衰老〔7〕,而敲低則會延緩其衰老〔18〕。

        3.1KNDC1過表達(dá)促進(jìn)HUVEC衰老的作用機(jī)制 李開濟(jì)等〔2〕通過構(gòu)建人KNDC1腺病毒表達(dá)載體,觀察其在HUVEC中的表達(dá)及功能,證明了KNDC1過表達(dá)能夠誘導(dǎo)HUVEC衰老,且表現(xiàn)出明顯量效關(guān)系。姬勁銳等〔7〕在載體構(gòu)建成功的基礎(chǔ)上,進(jìn)一步對KNDC1促細(xì)胞凋亡的機(jī)制進(jìn)行了研究,研究表明,KNDC1過表達(dá)通過啟動p53信號通路增加活性氧簇(ROS)表達(dá)。p53-ROS 正反饋環(huán)在調(diào)控KNDC1介導(dǎo)的細(xì)胞衰老中發(fā)揮重要作用,通過增加磷酸化p53蛋白的表達(dá),KNDC1促進(jìn)p53表達(dá)并放大p53-ROS反饋環(huán)的作用,進(jìn)而加速細(xì)胞衰老的進(jìn)程。因此,KNDC1在介導(dǎo)細(xì)胞衰老過程中的完整信號通路應(yīng)該繼續(xù)研究,這將為衰老相關(guān)疾病提供新的治療方向。

        3.2敲低KNDC1能預(yù)防HUVEC衰老的作用機(jī)制 Zhang等〔18〕研究表明,敲低KNDC1促進(jìn)HUVEC的增殖并延緩衰老。 其作用機(jī)制為:KNDC1的敲低通過抑制p53-p21-p16信號傳導(dǎo)途徑增加了S和G2/ M期細(xì)胞的百分比。 此外,KNDC1的敲低增加了內(nèi)皮型一氧化氮合酶(eNOS)的表達(dá)并改善了毛細(xì)管網(wǎng)絡(luò)的形成。 因此,敲低KNDC1有助于延遲內(nèi)皮細(xì)胞衰老,表明KNDC1有可能成為藥物開發(fā)中的新靶點(diǎn),延緩衰老過程,延長人類壽命。

        4 KNDC1對禽蛋殼超微結(jié)構(gòu)的影響

        Duan等〔19〕發(fā)現(xiàn)KNDC1與乳頭密度(MD)顯著相關(guān),認(rèn)為KNDC1可能參與纖維核心蛋白質(zhì)修飾,這決定了纖維核心是否是成核位點(diǎn)。 KNDC1對MD的確切功能作用仍有待闡明。對此提出了兩種方法來說明KNDC1的功能:直接方式,KNDC1直接與纖維核心蛋白相互作用;間接方式,KNDC1通過參與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)來修飾纖維核心蛋白。MD可以通過KNDC1介導(dǎo)的在成核位點(diǎn)直接或間接修飾纖維核心蛋白來調(diào)節(jié)。研究KNDC1對蛋殼超微結(jié)構(gòu)的遺傳影響,有助于提高蛋殼質(zhì)量,有助于對雞蛋殼及其他生物礦化材料的超微結(jié)構(gòu)和生物礦化的理解。

        綜上所述,KNDC1功能與神經(jīng)元樹突生長、HUVEC衰老、禽蛋殼超微結(jié)構(gòu)密切相關(guān),深入研究其功能和作用機(jī)制有可能為治療神經(jīng)退行性疾病、抗衰老藥物研發(fā)、生物礦化材料提供更多信息。

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