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        利用質(zhì)譜技術(shù)鑒定馬鈴薯醇溶性致敏蛋白

        2020-03-19 02:15:48李佩華彭正松周曉利
        關(guān)鍵詞:麩質(zhì)乳糜麥麩

        李佩華,彭正松,趙 歡,周曉利,林 巧,鄧 迪

        (1.西昌學(xué)院農(nóng)業(yè)科學(xué)學(xué)院,四川西昌 615013;2.西華師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,四川南充 637002)

        食物過敏是指人們食用某種食物后出現(xiàn)皮膚瘙癢等不良反應(yīng),是一種對食物中抗原分子產(chǎn)生的不良免疫介導(dǎo)反應(yīng),主要由IgE(immunoglobulin E,免疫球蛋白 E)介導(dǎo)[1],即通過IgE 使抗體和抗原結(jié)合。約1%~3%的成年人及5%~8%的兒童對一種或多種食物過敏[2]。乳糜瀉(celiac disease,CD)是病人因攝入來自小麥的麩質(zhì)蛋白而誘發(fā)T 細胞介導(dǎo)的慢性腸炎,是一種特殊的過敏癥狀[3]。典型的乳糜瀉臨床癥狀包括腸黏膜損害和繼發(fā)的吸收不良,伴有頑固的腹瀉、體重下降、營養(yǎng)不良、骨質(zhì)疏松、貧血、乏力、手足抽搐等。由于人體胃蛋白酶、胰蛋白酶和小腸刷狀緣酶缺乏脯氨酸內(nèi)切酶活性,導(dǎo)致富含脯氨酸和谷氨酰胺的小麥麩質(zhì)蛋白不能被完全消化,形成的長蛋白肽段聚集在小腸上皮細胞[4],誘發(fā)易感人群產(chǎn)生過敏性免疫反應(yīng)[5]。小麥麩質(zhì)蛋白包括谷蛋白(高分子量谷蛋白和低分子量谷蛋白)和醇溶蛋白,其中醇溶蛋白是乳糜瀉的主要致敏蛋白[6]。

        馬鈴薯是世界上繼小麥、玉米和水稻之后的第四大糧食作物,其儲藏蛋白質(zhì)富含多種人體必需的氨基酸, 因此馬鈴薯對改善人們的膳食營養(yǎng)結(jié)構(gòu)非常重要[7]。但馬鈴薯塊莖中是否存在可引起乳糜瀉的麩質(zhì)蛋白,目前尚無相關(guān)的報道。

        本研究利用小麥麩質(zhì)蛋白的提取液提取馬鈴薯塊莖的蛋白,利用十二烷基磺酸鈉聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)分離目標蛋白,然后切膠收集目標蛋白,酶切后用質(zhì)譜鑒定蛋白種類,通過相似性比對鑒定包含乳糜瀉多肽的馬鈴薯蛋白。

        1 材料和方法

        1.1 材料

        供試馬鈴薯(品種)“西芋3 號”由西昌學(xué)院馬鈴薯重點實驗室提供。

        1.2 馬鈴薯塊莖醇溶性蛋白的提取

        將新鮮馬鈴薯薯塊研磨成細粉,取約30 mg 放入1.5 mL 離心管中,加小麥麩質(zhì)蛋白提取液[8]90 mL,振蕩器上充分混勻,95 ℃水浴 5 min,3 000 r/min 離心5 min,取上清液以普通小麥材料“中國春”為對照進行SDS-PAGE 分析(見圖1)。

        SDS-PAGE 方法參照文獻[8]進行:10%的丙烯酰胺分離膠含 1 mL 40% Acr、0.52 mL 2% Bis、1 mL Resolving gel、0.09 mL 10%(W/V)過硫酸胺、4.2 μL TEMED、5.2mL H2O;3%的丙烯酰胺濃縮膠含0.375 mL 40% Acr、0.2 mL 2% Bis、0.62 mL Stacking gel 緩沖液、0.04 mL 10% SDS(W/V)、0.05 mL 10%(W/V)過硫酸胺、5 μL TEMED、3.7 mL H2O。

        1.3 目的蛋白的質(zhì)譜分析

        真空干燥回收的蛋白膠塊,然后用胰蛋白酶膠內(nèi)水解蛋白成多肽,參照文獻[9]的方法進行LTQ-質(zhì)譜檢測(Thermo Finnigan;中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院生物化學(xué)與細胞生物學(xué)研究所蛋白質(zhì)研究分析中心)。使用BIOWORKS 軟件搜索NCBI 的Solanum tuberosum 質(zhì)譜數(shù)據(jù)庫(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/peptidome),查找與質(zhì)譜多肽相對應(yīng)的馬鈴薯蛋白,構(gòu)建本地馬鈴薯醇溶性蛋白數(shù)據(jù)庫。檢測參數(shù)為:當(dāng) Charge+1,Xcorr≥1.9;當(dāng) Charge+2,Xcorr≥2.2;當(dāng) Charge+3,Xcorr≥3.75;其中 DelCN≥0.1。

        1.4 生物信息學(xué)分析

        采用GO miner 軟件對蛋白進行基因本體(Geneontology,GO)聚類分析。在 WEGO 數(shù)據(jù)庫(http://wego.genomics.org.cn/)中進行生物學(xué)通路分析。

        1.5 馬鈴薯醇溶性致敏蛋白的鑒定

        從 NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)下載質(zhì)譜檢測到的馬鈴薯蛋白的全序列,然后通過序列比對明確這些蛋白是否含有已知的乳糜瀉多肽(見表1),具體方法如下:通過BioEdit(v7.2.5)軟件提供的本地BLAST-P 程序進行全序列比對,根據(jù)兩者之間的序列相似性篩選潛在的馬鈴薯醇溶性致敏蛋白,設(shè)置參數(shù)期望值(E-value)為 1,矩陣(Matrix)為BLOSUM62,其他參數(shù)為默認值。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 SDS-PAGE

        SDS-PAGE 表明,在馬鈴薯塊莖蛋白泳道觀察到3 條與“中國春”的低分子量谷蛋白和醇溶蛋白遷移率相似的蛋白,回收這3 條蛋白條帶,胰蛋白酶水解,用于質(zhì)譜分析。

        圖1 馬鈴薯品種“西芋3 號”和普通小麥“中國春”麩質(zhì)蛋白的SDS-PAGE 分析Figure 1 SDS-PAGE analysis of potato cultivar“xiyu 3”and common wheat“Chinese Spring”

        2.2 馬鈴薯中致敏蛋白的識別

        質(zhì)譜鑒定共檢測199 種不同的馬鈴薯蛋白(見表1)。下載這199 種蛋白的氨基酸全序列,并將其與已知的乳糜瀉多肽(見表1)進行比對,未發(fā)現(xiàn)其含有潛在的致敏多肽。

        表1 已知可導(dǎo)致乳糜瀉的小麥麩質(zhì)蛋白多肽Table 1 Reported celiac disease (CD) epitopes in wheat seed storage proteins

        2.3 蛋白的功能分析(GO分析)

        分析199 種馬鈴薯蛋白的GO 注釋結(jié)果(見圖2),發(fā)現(xiàn)參與細胞(cell,GO:0005623)、細胞部分(cell part,GO:0044464)和細胞器結(jié)構(gòu)組成(protein-containing,GO:0043226)的蛋白分別占 14.9%、14.9%、11.9%。在分子功能中,蛋白主要以催化功能(catalytic activity,58.4%,GO:0003824)和結(jié)合功能(binding,47.5%,GO:0005488)為主。參與生物學(xué)過程有7 個子類,其中大部分蛋白參與代謝過程(metabolic process,64.4%,GO:0008152)、其次是參與細胞過程(cellular process,41.6%,GO:0009987)和對刺激的響應(yīng)過程(response to stimulus,9.9%,GO:0050896)。

        圖2 質(zhì)譜檢測到的199 種馬鈴薯蛋白的GO 分析Figure 2 GO analysis of the 199 proteins identified by mass spectrum

        3 討論

        2015 年初,農(nóng)業(yè)部確定了馬鈴薯主糧化戰(zhàn)略,這意味著馬鈴薯的種植面積將會增加,有利于保障糧食安全。主糧化意味著馬鈴薯將實現(xiàn)由副食向主食的轉(zhuǎn)變,我國居民食用馬鈴薯的人數(shù)和頻率將顯著增加,這將改善我國居民的膳食結(jié)構(gòu)。但是,部分人群可能對馬鈴薯過敏,因此有必要系統(tǒng)研究馬鈴薯的致敏原。黃靜等[20]通過生物信息學(xué)方法初步分析了馬鈴薯的致敏蛋白序列,發(fā)現(xiàn)了11 條潛在的內(nèi)源性致敏蛋白。但是,仍有必要通過實驗進行驗證。

        乳糜瀉是一種危害嚴重的遺傳性疾病,最有效的治療方法是嚴格的無麩質(zhì)飲食[13]。但是,目前尚不清楚馬鈴薯是否含有乳糜瀉多肽。我們通過蛋白提取、純化、酶切、質(zhì)譜分析和相似性搜索,證明馬鈴薯不含有可導(dǎo)致乳糜瀉的麩質(zhì)蛋白,這為系統(tǒng)推進馬鈴薯的主糧化安全性評價提供了必要支持。

        目前已知的乳糜瀉多肽均來自小麥麩質(zhì)蛋白,尤其醇溶蛋白[3]。醇溶蛋白是一種特異溶解于70%乙醇溶液的蛋白。小麥醇溶蛋白有成熟的提取方法,已廣泛應(yīng)用于小麥的加工品質(zhì)研究[8]。本研究直接利用小麥的醇溶蛋白提取方法提取馬鈴薯的醇溶性蛋白,有利于借鑒小麥的成熟技術(shù),保證實驗順利開展。已報道的乳糜瀉多肽富含谷氨酰胺(Q)和脯氨酸(P)(表1),由于馬鈴薯和小麥的親緣關(guān)系較遠,同源蛋白的序列相似性較低,這導(dǎo)致不能排除小麥的提取液不能完全提取馬鈴薯醇溶性蛋白的可能性。因此,有必要繼續(xù)嘗試其他提取方法進一步驗證本研究的結(jié)果。

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